Methanobrevibacter smithii: Msm_1420 Help Entry Msm_1420          CDS       T00539                                  Name (GenBank) helicase, UvrD/REP family   KO K03658   DNA helicase IV [EC:5.6.2.4] Organism msi  Methanobrevibacter smithii Brite KEGG Orthology (KO) [BR:msi00001]  09180 Brite Hierarchies   09182 Protein families: genetic information processing    03400 DNA repair and recombination proteins [BR:msi03400]     Msm_1420 Enzymes [BR:msi01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      Msm_1420 DNA repair and recombination proteins [BR:msi03400]  Prokaryotic type   Other factors with a suspected DNA repair function    DNA helicases     Msm_1420 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGene clusterGFIT Motif Pfam:  UvrD_C UvrD-helicase Zn_ribbon_Top1 UvrD_C_2 AAA_19 Viral_helicase1 Auto_anti-p27 Zn_ribbon_TFIIB DNA_ligase_ZBD AAA_12 AAA_30 DnaJ_CXXCXGXG Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ABQ87625 UniProt:  A5UN47 LinkDB All DBs Position 1446811..1448796 Genome browser AA seq 661 aa AA seqDB search MLNLTDIFEEYEIKDYLPDFYLDDYNIYIEHFGLNRNCENHLIGGKSSEEYVKEMEWKRK VHKKYGTTLIETFSYYQSENRLLTRLAEKLQAQGVEFNEIEYREVYRILLENKTIKEWED FIVLLKTFIELFKGNNYDETKFKEFYDYVGGLKDSFSKDRTIAFLKIVEEIYNDYEAYLL KIKKIDFNDMINKASDCIVKNGLDLPYKYIIVDEYQDTSFTRYNLLRNICDSIGAKIMVV GDDWQSIYSFSGCDVNIFTKFDNFFDVCETRYIEKTYRNSQQLIDASSNFVMKNPDQTRK ELKSSKSLKYPIKLVNFDNDFDEILKFELIIKNIINQSTFKNKKILILGRNNKDIFNLLK NFNVENEYGKRKFEILGDEDKLRRNKFVKIVYRESPDVNIEYRTVHQSKGLECDNVILIN LKNWKAGFPNKMVDDPVLNFVKRNGDSFSYAEERRLFYVALTRTKNNVYLLAPYFKSSVF VQELKTDANVELLNLEHNRLETLKNIEKNGERYVIPTKLKCPVCKTGVVLLESFWNKGKL NRVLKCSHNMAPPFNRCNWEGGYYGSELEDLDDIEYCPSCDGILIKRYRHSDGHPFLGCT NFRKTGCRGKGKKLEYIGKTCPKCGKPLVKRVNGEDNSLFVGCSGFPKCRHTEPFKKEMG I NT seq 1986 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt ttgcttaatttaacagatatctttgaagaatatgaaattaaagattatcttcctgatttt tacttagatgattataatatctatatagaacattttggattaaaccgtaactgtgaaaat catttaattggtggaaaatcatctgaggaatatgttaaagaaatggaatggaaaaggaaa gtacataaaaaatatggaactactttaattgaaactttttcatattatcaatcagaaaac agattattaacacgtttggcagaaaaattacaagctcagggtgttgaatttaatgaaatt gaatatagggaagtttatagaatattgttggaaaataaaactataaaagaatgggaagat ttcattgtattgttaaaaacatttattgagttatttaaaggaaataattatgatgaaact aaatttaaagaattttatgattatgttggtggattaaaagatagtttttcaaaagatagg acaatagcatttttaaaaattgttgaagagatttacaatgactatgaagcatatttatta aaaattaaaaaaattgattttaatgatatgattaataaagccagtgattgtattgtgaaa aatggattagatttgccttacaaatatataattgttgatgaatatcaggacacttcattt accagatataacttgttaagaaatatctgtgatagtattggtgccaagataatggttgta ggtgatgactggcagtctatttacagtttcagtggatgtgatgtaaatatttttaccaaa tttgataatttctttgatgtttgtgaaaccagatatattgaaaaaacatacaggaattct caacagttaattgatgcttcaagtaattttgtaatgaaaaatcccgatcaaaccagaaag gaattaaaatcttctaaatcattgaaatatccaattaaactggttaattttgataatgat tttgatgaaatattaaaatttgaattaataataaaaaatatcataaaccaatcaacattt aaaaacaaaaagattctgattttaggtagaaataataaggacatatttaatttactaaag aatttcaatgtagaaaatgaatatggaaaaagaaaatttgagattttaggagatgaagat aaattaagaagaaataaatttgtaaaaattgtttatagggagagtccggatgttaacatt gaatatcgtactgttcatcagtctaaaggtttagaatgtgataatgtaattttaataaat ttgaaaaattggaaggcgggttttccaaataaaatggttgatgatcctgttttaaatttt gttaaaaggaatggagattcttttagttatgctgaggaaagaagattgttttatgttgct ttaactagaacaaaaaataatgtttatttattagcaccttattttaaaagttcggtgttc gttcaggagctgaaaactgatgcaaatgttgaattgcttaacctggaacataataggctg gaaactcttaaaaatattgaaaaaaatggagaacgttatgtaattccaactaaattaaaa tgtcctgtttgtaaaacaggtgtggttttgctggaatctttttggaataagggtaaactt aatagggttcttaaatgttctcataatatggcgcctccatttaatcgctgtaattgggaa ggaggttattatggaagtgaacttgaggatttggatgatatagaatattgtccaagctgc gatgggatacttataaaacgttaccgacatagtgacgggcatccatttttaggttgtacg aattttagaaaaacaggatgtaggggaaaaggtaaaaaattggagtatattggtaaaacc tgtccgaagtgtggtaaacctcttgtaaaaagggttaatggtgaggataatagtttattt gtaggatgcagtggttttcctaaatgtagacacactgaaccatttaaaaaagagatggga atctag

DBGET integrated database retrieval system