Methanobrevibacter smithii: Msm_1586
Help
Entry
Msm_1586 CDS
T00539
Name
(GenBank) adhesin-like protein
Organism
msi
Methanobrevibacter smithii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Beta_helix
NosD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ87791
UniProt:
A5UNL3
LinkDB
All DBs
Position
1633725..1639220
Genome browser
AA seq
1831 aa
AA seq
DB search
MRFNKCILLVIYAIIAIIVFTPLYAENSNNTIFTLPSDDVIVCDNVYTGNVITITDDNYG
DYFDVYSGEMNPESNINDGDRIHIGNVTDKTFVINKQLEITTMHNGDIIKNGYIKLVKGS
DGSSIHGLTIINDKVNYVVDGIPSIDLSGIGLFYTNNNYVYNNSVQLADSRGVFALPMGS
SSNNKIYKNKFVSTLSTCVPMSECDNNLFYDNYFQSTAANVIYYNPWGHAGYSGSGKCFN
NSFINNYMCSLNRNSPWVIGMSLLSNCNVNIVNNTIFNVRDGVSGLGVNSTINGNKFIGV
SNLALSVSSANLTIENNSFSDTSMAIAILSSNITVKNNIIENSSIGIWVFGKNASLISNT
ISLVDGYYAVNVESENVLILNNNIKVSNFGEGIRVAENNVSIINNTIRTAVDSGIYILSS
NNVISGNRISSNLYGVYIDAVSDLYYYTRGVLGVSYYAKIDQGKINHNNITNNIINSASY
GVYLVGTVYNTTIINNNITTNAAVGIVENITDPFSNNIKDNVVNGVLLNYSGIVISDDNF
NVYFDEKGCFKFEDINSIVLVITKLSNKDMLINQKMTLLNGGLVNILTNVTISLVTGSNG
TLIKSLNFKNTDKNAIIINNVSDITLEDNNIMSVSQMKDIFGISLNLSNNTELIDNDVYI
TGENTLIQGILLNNSDNLTFVKNSVILEANKIAQGIIINLLNSSNLVNNTIHLQGNGVFD
CVLINGSNNLNILGNNIIARSISNVISPLAISSSKDIVLDKNNISAIGDLVKSLNFSNTS
NVVIESSFINLIGLSKTEVIFANDDLNNIEITNCVIYSNALGLISGNITLKENKYVIYDD
NVETYFDSNGMFSNKLITQKDVLMFDNLKSKHYTLTFNQVVILTSYYKNSLIDATLNFNS
KSSNSTIKNLNFDLVENVAFNLYFALNITIENNNINLVSSKDVSAIIITGESFNNLINNN
TVKIRGNGTLTGITIYNYYDEYYGLSPKNNVISNNDIVINSNNDVIAIYNAMADNTIIRN
NNIRIDARDHAYGVYNIYSQDFKVFMSTIWTTNTKIIHNIIEGNGSIVCLINSIEAKNTL
VDNNTLIAIANGSYGYVGYKTSGDVLRYNDFTINGTGNNDLFISNVSQTGIYLSNSSSNA
LILENSIISNYAPGNDYAIYVEVNSSKISIVDNYLISDNWNRYADNAIYAPSATLTNNEL
YYVYVSPEGSDELGNGSINNPFKTIKHALNKVINKGIVYVLGGNYTEDYITISKTLTLKG
LGKVIVDCKGSLFNITKSGSLKVFNIKFMNANATTGSTFYNLGKLYLENVSVINSTALTY
GGAIVNYGELIIRNSTFSSNKAKNGGAITNYNKLDIKSSNFTNNSCYIKGSGGAIYNLEK
ATLSIEDCNFVNNKVDAEYLIEEDDFGVRLGSGGAIYNRGNLYIINSNFKSNRAFNYGGA
ILSASTQKHDLKVINSTFDKNTCFAGGGGAMYIVNANLDIANSSFTSNEIGENSGGALCI
SESEGKIYNSTFFKNSASFGGGAIQFWSSDITMDLCNITDNNAGKGGAISYYGQRIGNHV
VGSLNIYNSTIYNNKGFDSGGAFYVRNLNMNVKNSNIYDNFGGDGKHTLSVEINYPTKPV
NNIDLNGNWWGSNSGPGEDVWLNAQYYREWIKDKISWDVLNPNPNPNPNKPGSNTRPGQS
NNNPIVGPSTGGLLNPGRPGQNGFGTGIGTGTGSGFGSGSGNGMGSGSGTNAGGSSGSHG
GRFGSGSGFNGTAYSNQGTLGDLGSSSSSGAGGSEAGSPSSASSNNAIYELNKDVKKALS
GYNIIYGIIFLIVIILLIIFGYKRNSKEEDE
NT seq
5496 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtttaataaatgtatattattagtaatatatgcaattatagctattatagtattc
acaccattatatgctgaaaatagtaataatactatatttacgttaccaagtgatgatgtt
attgtatgtgataatgtttatactggtaatgtaattactattactgatgataattatggt
gattattttgatgtttattcaggtgagatgaatcccgagtctaatatcaatgatggagat
agaatacatattggtaatgttacagataaaacatttgttatcaataaacaactagaaatc
actactatgcataatggtgatattattaaaaatggttatattaaattagttaaaggtagt
gatggttctagtattcatgggttaactattattaatgataaagtaaattatgttgtagat
ggtatacctagtattgatttaagtggtattggtttattttatacaaataataattatgta
tataataattctgttcaattagcagatagtaggggagtatttgcacttcctatgggttca
tcatctaataataagatatataaaaataaatttgtaagtacattaagtacttgtgtgcct
atgagtgaatgtgataataatctattttatgataattatttccaatcaactgcagctaat
gtaatttattataatccgtggggtcatgcaggttatagtggttctggtaagtgttttaat
aattcatttatcaataattacatgtgttctttaaataggaactctccttgggttattgga
atgtctcttttaagtaattgtaatgtaaatattgtaaacaacactatttttaatgttcgt
gacggtgttagtggtttaggtgttaattctacaataaatggaaataaatttattggtgtg
tctaatttagctttatccgtaagtagtgctaatttaactattgagaataattcattttca
gatacatctatggctatagctattttaagtagcaatataactgttaaaaataatataatc
gaaaattcttcaattggaatttgggtatttggaaaaaatgcatctttaatatctaatact
attagtttagttgatggatattatgcagttaatgttgaaagtgaaaatgttttaatttta
aataataatattaaagtgagtaattttggtgaaggaattagagttgctgaaaataatgta
tctataataaataatactataagaactgctgttgactctggaatttatatattgtcttct
aataatgttattagtggaaataggatatcttctaatttatatggagtttatattgatgca
gtatctgatttatattattatactcgtggtgtactaggtgtttcttattatgctaaaatt
gatcaaggtaaaataaatcataataatattacaaacaatataatcaattcagcttcttac
ggagtttatctggtagggactgtgtataatacaactattataaataataatattactaca
aatgcagctgtaggtattgttgagaatattactgatccattttcaaataatattaaagac
aatgttgttaatggtgttcttttaaattatagtggtatagttatcagtgatgataatttt
aatgtctattttgatgaaaaaggatgttttaaatttgaagatattaattctattgttttg
gtaattacaaaactttctaataaggacatgttgattaatcaaaaaatgactttattaaat
ggaggtttagttaatatattaaccaatgttactatttctttagtaactggatcaaatgga
acattaattaaatcattgaattttaaaaacacagataaaaatgcgattatcataaataat
gtaagtgatataactttagaagacaataatataatgtctgtttctcaaatgaaagatatt
tttggaatttctttaaatttatcaaataatactgaacttattgataatgatgtatatatt
actggtgaaaatacattaattcaaggtattttacttaataattctgataatcttacattt
gtaaaaaatagtgtgattttagaagctaataaaatagctcagggaattattataaattta
ttaaattcatctaatttagttaataatacaatccatcttcaaggaaatggtgtttttgat
tgtgttttaattaatgggtctaataatttgaatattttaggcaataatattatagctagg
tctatttctaatgttatttcaccattagcaatttctagttctaaagatattgttttggat
aaaaataatattagtgcaattggtgatttagtaaaatcattaaatttctcaaatacatct
aatgttgttatagaatctagttttattaacttaataggattaagtaaaacagaggtgatt
tttgcaaatgatgatttaaataatattgaaataactaattgtgtaatttattccaatgct
ttaggtttgatcagtggaaatatcacattaaaagaaaataaatatgtaatctatgatgat
aatgttgaaacttactttgattcaaatggtatgtttagtaataagttaataactcaaaaa
gatgtgttgatgtttgataatttaaaatcaaaacattatactttgacttttaatcaggtg
gttattttaacttcttattataagaattcattaattgatgcaactttaaatttcaattca
aaatcaagtaattcaactattaaaaatttaaactttgatttagttgaaaatgttgcattt
aatttatattttgcattaaatattactattgaaaataataatattaatttagtgtcttct
aaagatgtttcagctatcattattactggagaaagttttaataatttaattaacaacaat
actgttaaaataaggggtaatggtaccctaactggaattactatttataattattatgat
gaatattatggtttaagtccaaaaaataatgtaatttcaaataatgatattgtaatcaat
tcaaataatgatgtaattgctatttataatgcaatggctgataatacaattattagaaac
aataatattagaatagatgcacgtgatcatgcttatggtgtttataatatttattcacaa
gatttcaaagtattcatgagtactatttggactacaaacacaaaaattatccacaatatt
attgaaggaaatggatctattgtttgtttaattaattcaattgaagctaaaaacacatta
gttgataataatacattaatagctatagctaatggttcttatggttatgtaggatataaa
acatcaggggatgtattaagatataatgattttacaataaatggaactggaaataatgat
ttatttatatctaatgtaagtcaaactggtatttatttatcaaatagttcttctaatgca
ttgattttggaaaatagtattatttctaattatgctcctggaaatgattatgcaatttat
gtagaggttaattctagcaaaatttctattgttgataattatttaattagtgataattgg
aacagatacgctgataatgcaatatatgctccatcagctactttaactaataatgaactt
tattatgtttatgtatcacctgaaggtagtgatgaattaggtaatgggtctattaataat
ccatttaaaacaataaaacatgcactaaataaggtaattaataaaggaatagtttatgta
ctgggaggtaattatactgaagattatattacaatttcaaaaacacttactcttaaagga
ttaggtaaggttatagttgattgtaaaggtagtttatttaatattactaaatccggttca
ttaaaagtttttaatattaaatttatgaatgcaaatgcaactacaggttcaacattttac
aatttaggaaaactatacttagaaaatgtttcagtaatcaattccacagctttaacttat
ggtggagctattgttaattatggtgagttaattataagaaactctacattttcatcaaat
aaagctaaaaatggtggagctatcactaattataataaattagatattaaatcatcaaat
tttactaataatagttgttatattaaaggctctggaggggctatttataatttagaaaaa
gctactcttagtattgaagattgtaattttgtaaataataaagttgatgctgaatatctt
attgaagaagatgattttggtgttcgtttaggatctggaggagctatttacaatcgtgga
aatttatatattattaattcaaatttcaaatctaatagagcatttaattatggtggagct
attttaagtgcatctactcaaaaacacgatcttaaagtaatcaattcaacatttgataaa
aatacctgttttgcaggtggtggaggagctatgtatattgttaatgcaaatttagacatt
gctaattcatcatttacatcaaatgaaattggagaaaatagtggtggagctttatgcata
agtgaatctgaaggtaaaatttataattccacattctttaaaaactctgcaagttttggt
ggtggtgcaatacaattttggtcttctgatataactatggatttatgtaatattactgat
aataatgctggaaaaggtggtgctatatcttattatggtcaacgtattggaaatcatgtt
gtaggttctctaaatatttataattcaacaatttataataataaaggatttgatagtggt
ggagcattttatgttagaaatttaaacatgaatgttaaaaattctaatatttatgataac
tttggaggagatggtaaacatactctttcagttgaaataaattatcctacaaaaccagtt
aacaatattgatttaaatggtaattggtggggtagtaatagtggccctggagaagatgtt
tggttaaatgcacaatattacagggaatggattaaagataaaatttcatgggatgtactt
aatccgaatcctaatcctaatcctaataaacctggaagcaatacaagacctggtcaatca
aataataatccaattgtaggtccaagtactggaggattattaaacccagggagacctgga
caaaatggatttggaacgggtattggaacaggaactggaagtggttttggttctggatct
ggtaatggtatgggttctggaagtggaactaatgctggtggaagttccggaagtcatggt
ggaagatttggttctggtagtggatttaatggaacagcctattctaaccaaggcacatta
ggtgatttaggttcatcttcaagttctggagctggtgggagtgaagcaggatctccatct
tcagcttcatcaaataatgcaatttatgaacttaataaagatgttaaaaaagcattgtct
ggatataatataatttatggaattatatttttaatagtcattatattattaattatattt
ggatataaacgtaattctaaagaggaggatgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
