Methanobrevibacter smithii: Msm_1747
Help
Entry
Msm_1747 CDS
T00539
Name
(GenBank) predicted type II restriction enzyme, methylase subunit
Organism
msi
Methanobrevibacter smithii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Eco57I
MmeI_Mtase
T6SS_VgrG3-like_C
UPF0020
DUF2153
Cytotoxic
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ87952
UniProt:
A5UP24
LinkDB
All DBs
Position
complement(1802791..1806309)
Genome browser
AA seq
1172 aa
AA seq
DB search
MDKTAIKTFAINSRKKLMEDVEYKMSLVGIDKDNIYEPISSANGIETYQLGGSTNSIYDN
DISKRERLVKEVKQKGFENVVEEVAYTWFNRIIAIRFMEINNFLPTKTRVLSSETAGKIE
PDIITEAFDVDLDYTQEDKELIFKLKDENKLDELFRFLFIKQCNKLNEILPGLFEKTDDY
LELLLNISFTNEDGVVRQLIDTIPEKDFESQVEVIGWLYQFYNTELKDETFANLKKRIKI
SKERIPAATQLFTPDWIVKYMVENSVGRLWLEGHPNNELKSKWKYYVDEAKQEPEVEQQL
ITIRKESEILKPEDITVIDPCMGSGHILVYVFEVLMDIYVSEGFTEKDACESILKNNIYG
LDIDKRAYQLAYFAVLMKARKYNRRILTKGISPLLCSIEETNSISKEFIEELISQDRTIE
DAFNYLISSFKNGKEFGSILTIKPIDFEKINNLISKFESNNNLTKLKYLDEINLLKNIIN
QSILLSKKYDVVVTNPPYMGNNGMNPNLKDYIKSKFPLTKTDLFAVFLEKGLEMIKDYGF
NCMVTMQSWMFLSSFEKFRKKLIETTTISNLLHMDNMVMKIAFGTSATVFRKINLMNYNS
TFYHVKLSDVENDIVNPLFFNDKNKYIIKQFNFDKIPGSPIAYWIDDNLIACFNNTNLSS
LGDIKVGLQTGENTRFLRYWWEVDFNNIGFSSINCEDSKNTNKKWFPYNKGGSFRKWWGN
QEFIINWENDGEELRNFKKSVLRNSQFYFHQSLSWSKISSGKIAFRYYPNGFLFDVAGCS
VFVDDYLNYIFGFLNSNVCGNILDLISPTLNYEIGHIASLPIIIDENKVEEINNIVLENI
KICKDDWDDYETSWNFKKHPLLKFNENNLKNSFKSWESYKKEQFNQLKSNETKLNNIFSE
IYDIDSNYNVEDKHVSINSSNYEMDIKSFVSYAIGCMFGRYSLDDDCLISTNSNFNIENY
SRFIPDDDNIIPILDTEYFEDDMVGRFVEFVKICFGEETLEENLEFIANALIKNNKTSRE
KIREYLLKHFFNDHKKLYKKCPIYWQFSSGSNNAFNCLIYSHRIDSQIIARIRTEYLHKT
QKAIEQRLLDCENLLNTSDSSSEKAIITKEKNKLIKQLEETIGYDEALNHVSNLNLSFNL
DDGIKENYSMLQDIIISREGMKNKKINLLKKI
NT seq
3519 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaaactgcaattaaaacatttgccattaattctcgtaagaagttaatggaagat
gtagaatataaaatgagtttagttggaattgataaagataacatttatgaaccaataagc
tcagccaatggaatagaaacatatcaacttggtggatcaactaatagtatatatgataat
gatatttcaaaaagagaaagattagtaaaagaagttaagcaaaaaggttttgaaaatgtt
gttgaagaggtagcttatacatggtttaatcgtataattgctataagatttatggaaatt
aataatttcctaccaactaaaacaagagttttatcctctgaaactgcaggtaaaatagaa
cctgatataataactgaagcatttgatgttgatttggattacactcaagaagataaagag
ttaatttttaaacttaaagatgaaaataaattagatgaattattcagattcttatttata
aaacaatgtaataaattaaatgaaatacttccaggtttatttgaaaaaaccgatgactat
ttagaactattattaaacatttcatttaccaatgaagatggggttgtaagacaattaatt
gatacaattcctgaaaaagactttgaaagtcaagttgaagtaataggatggttatatcaa
ttttataacacagaattaaaagatgaaacttttgcaaatcttaaaaaacgaataaagatt
tctaaagagagaattcctgctgcaacacaattatttacacctgattggattgtaaaatat
atggttgaaaattctgtaggaagattgtggttagaaggccatcctaataatgaattaaaa
tcaaaatggaaatattatgttgatgaagcgaaacaagagccagaagttgaacaacaatta
attacaattagaaaagaatctgaaatattaaaaccagaagatattactgttattgatcct
tgtatgggttcaggccatattttagtttatgtttttgaagttcttatggacatatatgtt
tcagaaggattcacagaaaaagatgcttgtgaatcaatcttaaaaaacaatatttatggt
ttagatattgataaaagagcatatcaactagcttattttgcagttttaatgaaagctaga
aaatataatcgtagaatattaacaaaaggtatttcaccattattatgctcaattgaagag
acaaattcaatttctaaagagtttattgaagaattgatttcacaagacagaacaattgaa
gatgctttcaattatctaatatcttcttttaaaaatggaaaagaatttggaagcatatta
actataaaacctattgattttgaaaaaataaataatttaatttctaaatttgaatcaaat
aataatttaactaaacttaagtatttagatgaaattaatcttttgaaaaatattattaat
caatccatattattatctaaaaaatatgatgttgtagtaacaaatcctccttatatggga
aataatggtatgaatccaaatttaaaagattatattaaatctaaatttcctttaactaaa
acagatttatttgctgtatttttagaaaaaggtttagaaatgataaaagattatggattt
aattgtatggttacaatgcaatcatggatgtttttgtcaagttttgagaagttcagaaag
aaattaattgaaacaacaaccatttcaaatttattgcacatggataatatggtaatgaaa
attgcatttggaacatcagcaacagtatttagaaaaataaacttgatgaactacaacagt
actttttatcatgtgaaattatctgatgttgaaaatgatattgtgaatccattgtttttt
aatgataaaaacaagtacataataaaacaatttaattttgataaaatccctggaagtcca
atagcatattggattgatgataatttaatagcttgttttaataatacaaacttaagttca
ttaggagatattaaagttggattacaaactggtgaaaatacaagattcctaagatattgg
tgggaagttgattttaataatattgggttttcttcaataaactgcgaagattcaaaaaac
actaataaaaaatggtttccttataataaaggtggatcatttagaaaatggtggggaaat
caagaatttattatcaattgggaaaatgatggtgaggaattaagaaactttaaaaaatct
gttttaagaaattcccaattttattttcatcaatcattaagttggtctaagatttcaagc
ggaaaaattgcatttagatattatccaaatggatttctttttgatgtagcaggatgttct
gtatttgttgatgattatttgaattatatttttggttttttaaattcaaatgtttgtgga
aatattttagacttaatttcaccaacattaaactatgaaataggccatattgcttcatta
cccattattattgatgaaaataaagttgaagagataaataatattgttttggaaaatatt
aagatttgtaaagatgattgggatgattatgaaacttcatggaactttaagaaacatcca
ttattaaaatttaatgaaaataatcttaagaactcatttaaatcttgggaatcttataaa
aaagaacaatttaatcaacttaaatcaaatgaaacaaaattaaataatatttttagtgaa
atatatgatattgattcaaattataatgttgaggataaacatgtttcaataaatagttca
aattatgaaatggatataaaatcatttgtttcatatgcaattggatgtatgtttggtaga
tatagtttagatgatgattgtttaatatctacaaattcaaattttaatattgagaattat
tctaggtttattcctgatgatgacaatattattccaatattggatactgaatattttgaa
gacgacatggttggtcgttttgttgaatttgtaaaaatttgctttggagaagaaactctt
gaagaaaacttggagtttatagctaatgcattaattaagaataataaaacaagtagagaa
aaaataagagaatatttacttaaacattttttcaatgaccataagaaattatataaaaaa
tgcccaatctactggcaattttctagtggaagtaataatgcatttaactgtttaatctat
tctcatagaattgattcacaaataattgctagaattagaacagaatatttacataaaacc
caaaaagcaattgaacagagattattagattgtgaaaatttgctaaatacttctgattca
agttctgaaaaagcaattatcacaaaagaaaaaaataaattaattaaacaacttgaagaa
acaattggatatgatgaagcattaaaccatgtttcaaatttaaatttatcttttaattta
gatgatggaataaaagaaaattattcaatgcttcaagatattattatttcaagagaagga
atgaaaaataaaaaaattaatcttctaaaaaagatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
