Mycoplasmopsis synoviae ATCC 25204: VY93_02980
Help
Entry
VY93_02980 CDS
T04518
Name
(GenBank) RNA-binding protein S1
KO
K06959
protein Tex
Organism
mso
Mycoplasmopsis synoviae ATCC 25204
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mso00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
VY93_02980
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
Tex_N
HHH_3
Tex_central_region
S1
HHH_7
HHH_9
HHH
YqgF
HHH_5
HHH_6
DUF7645
DUF7398
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKB11273
LinkDB
All DBs
Position
complement(683247..685370)
Genome browser
AA seq
707 aa
AA seq
DB search
MAMESKNYEIVAKELNITVSQVETVLNYFKEGATVPFIARYRQSQTNNLNEEQIYAIQSL
YLYASELSKRKEKIIEKLKELNLLNNDLEQKINSCTKKSELESIYEPYKSGKITKAKMAI
ELGLMPLALKIWNNKNSRFDLNFEARKFLSDKLKTLDEVILNVNYILSQKISEDFDLREK
LKENILAYGKLICKKTKEQDENDRFKNYYQYSTPIKYVKNHNIMAINRGSNLKKIKWDVY
LNFEILERISLRKITKFKFNEALLKDAVNDALKKLILPSLKNKIFSDLFDEAEKKSIEIF
SNNVETLLSAPAVSGHNILAIDPGYVSGCKLAALSEKGSVLEIATIYPNEPRSNVSQAKT
KVLELIKKHNITIIVIGNGTASRETEQFINNLIQENNLDNIYFCIVSEAGASVYSASEIA
IEEFPNLSVEKRSAINIGRKFLDPLNELVKIDPKSIGVGQYQHDVNQKELQNYLNFKVQK
VVNNYGVDLNSASREILSYISGLGKKTSQNIINYRNKNKSFKSRDEVLKVDGIGPKTFEQ
SIGFLRVFNSSNFLDKTAIHPESYSLANKIISEYKLIPSEEGIKNLELNAKELSEKYSSS
IEEINLILSSLKNPTKIIRSSKQGYLLKKNLINLENLKIGDIVDATIDNITDFGLFCYIG
LKESLFVHISNLAKKGNIYESYNLNNLIKVEITEINKENKKISGKEI
NT seq
2124 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attgctatggaatcaaaaaattacgaaatagttgcaaaagagctaaatattactgtttca
caggtagaaacagtactaaattacttcaaagaaggagccacagtgccttttattgcaaga
tatcgtcaaagccagaccaataatttaaacgaagaacaaatttatgccattcaaagccta
tatttatatgccagtgagcttagcaagcgtaaagaaaaaataatcgaaaagcttaaagag
cttaatttattaaacaatgatcttgagcaaaaaattaattcttgcaccaaaaaaagcgaa
ctggaatctatttatgaaccatataaatcaggaaaaataactaaagctaaaatggcaatt
gaattaggattaatgccgctagctttaaaaatttgaaacaataaaaattctagatttgat
ttaaattttgaagctagaaaatttttaagcgataaactaaaaactttagatgaagttatt
ttaaatgttaactatattttgagccaaaaaattagtgaagattttgatcttagagaaaag
ctaaaagaaaatattttagcttacggaaaactcatttgcaagaaaactaaagaacaagac
gaaaatgatagatttaaaaattattatcaatattcaacacctattaaatatgttaaaaat
cacaatataatggcaattaatagaggaagcaatttaaagaaaataaagtgagatgtttac
cttaattttgaaattttagaaagaatttccttaagaaaaattactaaatttaaattcaat
gaagccttattaaaagatgcagttaacgatgctttaaaaaaactaattttacctagtttg
aaaaataaaatatttagcgatttattcgatgaggcagagaaaaaatcaattgaaattttt
tctaataatgttgaaactctactaagcgctcctgcggtatctgggcacaacatattagct
atagatcctggttatgtaagtggatgtaaactggccgctctttcagaaaaaggaagcgtt
ttagaaatagcaaccatttatccaaatgaacctagaagtaatgtttcacaagccaaaacc
aaagttttagaattaatcaaaaaacataatattactatcatagtaataggtaatggaacc
gcttcaagagaaaccgagcaatttattaataatttaattcaagaaaataatcttgataat
atttacttttgcatagtttcagaagcaggagcttcggtatattcagctagtgaaattgca
atcgaagaatttccaaatttaagcgttgaaaaaagatctgcaattaatattggaagaaaa
tttttagatccattaaatgaacttgtaaaaatagatccaaagtcaattggagtaggtcaa
tatcaacacgatgtaaatcaaaaagaacttcaaaattatttaaattttaaagttcaaaaa
gtagttaataattacggagttgatttaaatagcgcatcaagagaaattctttcgtatata
tcaggtcttggcaaaaaaacttcccaaaatataattaattatagaaacaaaaataaaagt
tttaaatcaagagatgaagttttaaaagttgatggaataggcccaaaaacttttgaacaa
tctattggttttttaagagtttttaattcaagtaattttttagataaaaccgcaattcat
ccagagtcatatagccttgccaacaagataattagtgaatataaattaattccatctgaa
gaaggaattaaaaacttagaattaaatgctaaagaattatcagaaaaatatagctcttca
attgaagagataaatttgattttatcttcacttaaaaatccaactaaaataattagatct
tcaaagcaaggatacctcttaaagaaaaatttaattaatttagaaaatttaaaaattgga
gatatagtagatgcgacaattgataatatcaccgattttggattattttgttatataggt
ttaaaggaaagtctttttgttcatatttctaatttagctaaaaaaggaaatatctacgaa
tcttataacttaaataatttaattaaagttgaaataactgaaataaacaaagaaaataaa
aaaatttctggcaaagaaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
