Methanosphaera stadtmanae: Msp_0220
Help
Entry
Msp_0220 CDS
T00313
Name
(GenBank) predicted glycosyltransferase
Organism
mst
Methanosphaera stadtmanae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glycos_transf_2
Glyco_tranf_2_2
Glyco_tranf_2_3
Glyco_tranf_2_4
Asd-4
RNase_Y_N
Exonuc_VII_L
DUF4407
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABC56637
UniProt:
Q2NHJ6
LinkDB
All DBs
Position
complement(274777..277524)
Genome browser
AA seq
915 aa
AA seq
DB search
MNPKITLIISITTEKNIEQYLKNIKNQLLENIEVIFVYDKIDKNTNKILENFCKNDGAYL
KIISEKNRSHGFLKNKSLNIAQGDFITFIDSTDDIDFNFMEKLYKKAKNEDLDLLISVSY
EKIKDYSLSKNMCENVFNFQDMNKSIFYLSNTLKGNLYRRNLLDTYKIRFPTMLSFEDKP
FLLETFLTAKHVSILLREPALNMKSEYSSNELLDMIQISTLILNIFKKYDMFNTYKKLLL
NFKIYFLKKGYTKIKDKNDYFNLMKEDLINLSQNKKLCDAFLHELNEENLKFYKNCLKSQ
DFNQFNLNMTFTKINEKLDEKQQKLNFINGNLSKWTEKLNNKENKINNLKTKLDNEKKQM
KINEKNQNNREITIQIKEANLKDKETRITQLQENLDNKEKKLDNKIEKYNNLEKELIKKE
SSINTKFKELETEKELLNEKIKHLEDKETRITQLQENLDNKEKKLDNKIEKYNNLEKELI
KKESSINTKFKELETEKELLNEKIKHLEDKETNIIQLQEKLKVQEEKIDQKHVKYVDNLN
KITNNLEKNQKEYEKRLIKIDEDITLKKIEFEQMQNNNSNKKSNTPKISIIICAYNREEY
LKRCLNSVKNQTLKNIEIICADDGSTDNTLDVFRKYANKDHRFKFFTQKNSGPGVARNKA
IKMATGEYIMFLDSDDWIDLNTCEELYKKVKLNDLDILLFLMKNYSEETGEYYEDSYYNL
TPIPDDFENKVFSHEDISNIIFSISISACQKIYKRSLVKKVHFAEKLLFEDNPFFWGVML
QAKRMSLLKKHFYLRSRHTSSITSEYDNKYFDVIPISNKVISIFKELNLVNMYKYQLTNY
KINYISQWYHMMEEKYKNTFWDLMHDDFQKLHEDKKIDSLMLNNLNEPNKLFYLRTLKSR
SYVELDYLEKYSDEK
NT seq
2748 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcctaaaataacattaattatctccataactactgaaaaaaatattgagcaatat
ttaaaaaatataaagaatcaattattagaaaatattgaagtcatatttgtttatgataaa
atagataaaaatacaaataaaatactagaaaatttttgtaaaaatgacggtgcctattta
aaaattatttcagaaaaaaatagatcccatggatttttaaaaaataaaagtttaaatatt
gctcaaggagacttcattacctttatagattctacagatgatatagattttaattttatg
gaaaaactttataaaaaagcaaaaaatgaagatttagatctattaatttcagtatcttat
gaaaaaattaaggattattctttatctaaaaatatgtgtgagaatgtgtttaattttcaa
gatatgaataagagtatattttatttaagtaatactttaaaaggtaatttatatcgtagg
aatttattagatacatataaaataagattcccaacaatgttatctttcgaagacaaacca
tttctattagagacttttttaacagcaaaacatgtttcaatcctattaagagaacctgca
ttaaacatgaaatctgaatattcctctaatgaattactagatatgattcaaattagcaca
ttaatattaaatatatttaaaaaatatgatatgttcaatacttataaaaaattattactt
aatttcaaaatatactttttaaaaaaaggttatactaaaattaaagataaaaatgattat
tttaatttaatgaaagaagatttaatcaatttaagtcaaaataaaaaattatgtgatgct
tttttacatgaattaaatgaagaaaatcttaaattctataaaaattgtcttaagtcacaa
gattttaaccaatttaatttaaacatgacatttactaaaatcaatgaaaaactagatgaa
aaacaacaaaaactcaattttataaatggtaatctaagtaaatggactgaaaaattaaat
aacaaggaaaataaaataaataacctaaaaacaaaactagataacgagaaaaaacaaatg
aaaataaatgaaaaaaatcaaaataatagggaaattactatacagataaaagaagcaaac
ttaaaagataaagaaacacgcatcacacaattacaagaaaacctagacaataaagaaaag
aaactagataataaaatagaaaaatacaataacctagaaaaagaattaattaaaaaagaa
agttccataaatacaaaattcaaggaattagaaacagaaaaagaactcctgaatgaaaaa
attaaacacttggaagataaagaaacacgcatcacacaattacaagaaaacctagacaat
aaagaaaagaaactagataataaaatagaaaaatacaataacctagaaaaagaattaatt
aaaaaagaaagttccataaatacaaaattcaaggaattagaaacagaaaaagaactcctg
aatgaaaaaattaaacacttggaagataaagaaactaatattatacaactacaagaaaaa
ttaaaagttcaggaagaaaaaatagatcaaaaacatgtgaaatacgttgataatcttaat
aaaataacaaataatttagaaaaaaatcaaaaggagtatgaaaaaagattaattaaaata
gatgaagacataacacttaaaaaaattgaatttgaacagatgcaaaataataattcaaat
aaaaaatctaacacaccaaaaatatccatcattatctgtgcatacaatagagaggaatat
ctaaaaagatgtttaaatagtgtaaaaaatcaaacattaaaaaatattgaaataatttgt
gctgatgatggatctacagataatactttagatgtatttagaaaatatgcaaataaggat
catagatttaaattttttacacaaaaaaatagtggtcccggagtagctagaaataaagct
ataaaaatggctactggagaatatattatgtttcttgattctgatgactggatagactta
aatacatgtgaagaattatataaaaaagttaaattaaatgatttagacattttattattc
ttaatgaaaaattattcagaagaaactggtgaatattatgaggatagttactacaattta
acacctattcctgatgattttgaaaataaagttttctcacatgaagatatttctaacatt
atattcagtatatcaataagtgcatgtcagaagatatataaaagaagtttagtaaaaaaa
gtccactttgctgaaaaacttctttttgaagataatcccttcttttggggtgtgatgttg
caagctaaaagaatgtcgttattaaaaaaacatttttatttacgcagtagacatacatca
tctataacttctgaatatgataataaatactttgatgtaatacccataagtaataaagta
attagtattttcaaagaattgaatttagttaatatgtataaataccaattaactaattat
aaaataaattatatctcccaatggtatcatatgatggaagaaaaatataaaaatactttt
tgggatttaatgcatgatgattttcaaaaattacatgaagataaaaaaattgattctctt
atgttaaataatttaaatgaacctaacaaattattttatttaagaaccttaaaatcaagg
agttatgttgaattagactacttagaaaaatattctgatgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
