Methanosphaera stadtmanae: Msp_0422 Help Entry Msp_0422          CDS       T00313                                  Name (GenBank) predicted helicase   KO K07012   CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3 [EC:3.1.-.- 5.6.2.4] Organism mst  Methanosphaera stadtmanae Brite KEGG Orthology (KO) [BR:mst00001]  09180 Brite Hierarchies   09183 Protein families: signaling and cellular processes    02048 Prokaryotic defense system [BR:mst02048]     Msp_0422 Enzymes [BR:mst01000]  5. Isomerases   5.6  Isomerases altering macromolecular conformation    5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation     5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase      Msp_0422 Prokaryotic defense system [BR:mst02048]  CRISPR-Cas system   Type I CRISPR-Cas system    Type I signiture cas proteins     Msp_0422 BRITE hierarchy SSDB OrthologParalogGFIT Motif Pfam:  Cas3-like_C_2 DEAD ResIII Helicase_C PhoH HD AAA_22 SNF2-rel_dom Motif Other DBs NCBI-ProteinID:  ABC56823 UniProt:  Q2NH80 LinkDB All DBs Position 485917..488304 Genome browser AA seq 795 aa AA seqDB search MLSYTDKINELYSHPQKPLTEHLLNVAENSRSIFENLNIENNSFYASLSFLIGLCHDFAK CTSFFQKHLFGIENSEKAYHSFLSAIFGYYVIKKYIKENEIKEELNYPIIGYICIINHHG NLKDVYNTEKSEFNKINQIPQYLDEQIKDIKSRNISSLKEFYLKYNISIDDFLEEYEEIK SVIKKDLKIIYREKRIDNYFNVLILFSVLLDSDKLDASYTETYPRQELNANLVDLYKQEK FGQYEGINEIREEAYQELTSSLENIDLNNKIYSITLPTGSGKTMSAFSFALKLRRKIKNE KNIIPRIIYTMPFLSIVDQNEEVLRKILNYSNYDTSDILIKHNSTSELSYVVNKNGTTKI QDDPTEKAELDVDKAEMLLEGWYSEIVITTFYQLAYTLISNKNKALRKFHNISNSIIIVD EAQSIPAKYNQIFKTALDYLSKKFNVWIIFMTATQPEIFKESDGILPLITNEQKYFDCFD RVNYVFHHTPMTIDDFKEKIVDIIQENNKDIMIVLNTISSSTEIFEYIQGYFDEEGIELY YLSGNIIPKEKLERIKKIKESNNRKVIVTTQLIEAGVNIDVDIIYRDFAVMDSIIQTAGR CNRNDKKEKGTVNIIHLINENKREYSSFIYDSTLLRLTEELTKDYTEISEKDFNLKISKK YYTEVNNRISHDASHNLEKIISTLKISNITHEFKLIEDDIEKIDVFIEINDEATEIWDKY NEIYSDKNLKNYEKKLKLKKINRQFNNYVLSIPTNLIGTVNYDKFIFHVGKNDIERKYNL NTGFIAQENENAYMI NT seq 2388 nt NT seq  +upstreamnt  +downstreamnt atgttatcttatactgataaaattaatgaactttattcacaccctcaaaagcctttaaca gaacatttgttaaatgtagcagaaaattcaagaagtatctttgaaaatcttaacatagaa aataattctttctatgcctccctttcttttttaattggattatgtcatgattttgctaaa tgcaccagtttttttcaaaaacatctatttggaatagaaaatagtgaaaaggcatatcat agctttttatctgcaatttttgggtattatgtgataaaaaagtacataaaagaaaatgaa attaaagaagaactaaattatcctatcataggttacatttgtataatcaatcatcatgga aatttaaaagatgtttataatacagaaaaatcagaatttaataaaataaatcaaattcca caatatcttgatgaacaaattaaggatattaaatcaagaaacatatctagtcttaaagaa ttttatttaaaatacaacatttccatcgatgattttttagaagaatatgaagaaattaaa tcagttattaaaaaagatttaaaaataatatatcgagaaaaaagaattgataattacttc aatgtattaatactattttcagtattattagatagtgataagttagatgcttcttacact gagacatatcctagacaagaacttaatgctaatttagttgacttatataaacaagaaaaa tttggtcaatatgaaggtattaatgaaattcgagaagaagcttatcaagaattaacaagt tctcttgaaaatattgatttaaacaataaaatctattcaattacgttacctactggttct ggtaaaacaatgagtgcattttcttttgcattaaaattacgaagaaaaataaaaaacgaa aaaaatattatacctcgaataatatataccatgccttttttaagtattgttgatcaaaat gaagaagtattaagaaaaatattaaattattccaattatgatacttctgatattttaatt aaacataattccacatctgaattatcttatgtggtaaataaaaatggaactacgaaaata caagatgatcctactgaaaaagctgaattagatgtagataaagctgaaatgctacttgaa ggatggtattcagaaatagttataactacgttttatcaattagcatatactctcatatca aataaaaataaagcattaagaaaatttcataatataagtaattctatcataatagtagat gaagcacaatctattccagcaaaatataatcaaatattcaaaacagcattagattatttg tctaaaaaatttaatgtatggattatattcatgactgctactcaaccagaaattttcaaa gaaagtgatggaatattacctttaattactaatgaacagaaatactttgactgttttgat agagttaactatgtatttcatcatacaccaatgacaattgatgattttaaagaaaaaata gttgatataattcaagaaaataataaagatattatgatagtattaaatactatatcatca tcaacagagatatttgagtatatacaagggtattttgatgaagaaggtatagaattatac tatttatctggaaatataattccaaaagagaaactagaacgaattaaaaaaattaaagaa tctaataatagaaaagtcatcgttacaacacaattaattgaagcaggagtaaatattgat gtagatataatctacagagattttgctgtgatggatagtattattcaaactgcaggtaga tgtaataggaatgataaaaaagaaaaaggaacagtaaatataatacatttaattaatgaa aataaaagagaatatagtagttttatttatgactcaacacttcttaggcttactgaagaa ttaacaaaagattatacagaaatttcagaaaaagatttcaatttaaaaatatcaaaaaaa tattatacagaagtaaataatcgtataagtcatgatgcatcacataatttagaaaaaata atatcaacacttaaaatatcaaatataacacatgaatttaaattaattgaagatgatatt gaaaaaatagatgtttttattgaaataaatgatgaagcaactgaaatatgggataaatat aatgaaatatattcagataaaaatttaaaaaattatgaaaaaaaattaaaacttaaaaaa ataaatagacaatttaacaattatgttctttctatacccacaaatctcataggaacagtt aattatgataaattcatatttcatgtaggaaaaaatgatattgaacgaaaatataatcta aatacgggttttatagcacaagaaaacgaaaatgcatatatgatataa

DBGET integrated database retrieval system