KEGG   Methanosphaera stadtmanae: Msp_0473
Entry
Msp_0473          CDS       T00313                                 
Name
(GenBank) type III restriction-modification system, restriction subunit
  KO
K01156  type III restriction enzyme [EC:3.1.21.5]
Organism
mst  Methanosphaera stadtmanae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mst00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02048 Prokaryotic defense system [BR:mst02048]
    Msp_0473
Enzymes [BR:mst01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.21  Endodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.21.5  type III site-specific deoxyribonuclease
     Msp_0473
Prokaryotic defense system [BR:mst02048]
 Restriction and modification system (R-M system)
  Type III R-M system
   Msp_0473
SSDB
Motif
Pfam: RE_endonuc ResIII DEAD PhoH S6PP DUF7294
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABC56873
UniProt: Q2NH30
LinkDB
Position
554686..557673
AA seq 995 aa
MELNFESNLEYQQDAIGSIVDLFNGQASDNSPFQLGGFYRTTTLDDYGKTASNIGIGNRL
DLREDIILENIRKVQLKNEITPTDNINKSKLKFTVEMETGTGKTYVYLRSIFELNKNYGF
TKFIIVVPSLAIKEGVKKTLDITRNHFKGLYDNPIYNYFVYNSSRLNDIHNFVVDNNINI
MIINIDSFNKDLNLINQPQDTLQGNRPIDLIAQTNPFIIIDEPQSITAKKDGKGEQAIER
LNPLCTVSFSATPPDNSENYIYKLNAVDAYNKKLVKQIEVDSILSHNDHNSPYMKLVEVK
AKPYSAKIEIDANVKGVTKRKTVKVKNKTDLSDLSKREIYTGYIVDNIICSEGRESVEFT
NGERIKLNLAVGETNEKLIKRELIHYTIKEHLDKELRLLKKGIKVLSLFFIDKVANYRIY
DKEGNPNLGDYAVIFEEEYKKLIKEDKYKSLMEYNNINVDISQVHNGYFAQDKKGFKDTN
GKGKLDNDAYNLIMKDKERLLNMKTPLRFIFSHSALREGWDNPNVFQICTLNETRSKMKK
RQEIGRGLRLCVDQDGNRIKNNPNINILTVMANESYDQFAEGLQKEIEEDTGIKFNRITD
TSFSFTKYTNRKGDEEELGDQKSKLIYKYLEANGYIKKDGKILPQLEIDIEKGEFKLAPI
VEDIASDKEELRNNIINEIRTLTAPPIVKKRGDRKTIKLDYDKYKKEDFYKIWNKIKHKS
MYKVQFDTERLIEECSKRLHEELNIGNPTVIFTKAGYKIEYSGIEPQEEIWDVIESQGDS
VDLPNILQYLQNETTLTRKTLARILIQSETLNQFKKNPEEYKEQTLLIIKEELRRFLVDG
IAYTKIEDCYDEDEFERHELFRYVNELGEDDKSERSYKSPYEYTIFDSGIEKSFQEKLEF
SNLIKFYMKLPGWFEIDTPIGKYNPDWAILVEREGKEELYFIVETKGTSNIKELKPSEQY
KIKCGIEHFKALDESIQFEVESDFEEFKMDTISKY
NT seq 2988 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaattaaattttgaatcaaatttggaataccaacaagatgctattggttctattgta
gatttgtttaatggccaagcttctgataattccccttttcaacttggtggtttttataga
acaactactttagatgattatggtaaaacagccagtaatattggtattggaaatcgtctt
gatttacgtgaggacataatattagaaaatattagaaaggtacaattaaaaaatgaaatt
actcctacagacaacattaacaaaagtaaattaaaatttactgttgaaatggaaacagga
actggtaaaacttacgtttatcttagaagtatttttgaattaaataaaaattatggtttc
actaagtttattatagttgttcctagtcttgctatcaaagaaggagttaaaaaaacatta
gatataacacgaaaccacttcaaaggattatatgataatccaatttataattattttgtt
tataatagcagtagattaaatgatattcataattttgttgtggataacaatattaatatt
atgattattaatatagattcatttaataaggatttaaacttaataaatcaaccacaagat
acattacagggtaaccgcccgattgatttaattgctcaaacaaatccatttattattatt
gatgaacctcaatctatcactgctaaaaaagatggtaaaggtgaacaagctatcgaaaga
ttaaatcctttatgtacagtgagtttttcagcaacccctccagacaatagtgaaaactat
atttataaattaaatgctgtggatgcatataataaaaaattagttaaacagatagaagtt
gattctattttatcacataatgatcataattctccatatatgaaactagttgaagttaaa
gctaaaccttatagtgctaaaattgaaatagatgctaatgttaaaggtgtaactaaaaga
aaaactgtgaaagtcaaaaataaaactgatttatctgatttatctaaacgtgaaatttat
acgggatatattgttgataatatcatttgttctgaaggcagagaatctgtagaatttact
aatggagaacgaattaaattaaatcttgctgttggagaaactaatgaaaaacttattaag
cgagaattaattcattacacaattaaagaacatttagataaagagttacgccttcttaaa
aaaggtattaaagttttatcattattctttattgataaagtagcaaattatagaatctac
gataaagaaggaaatccaaatttaggagattacgctgtcatatttgaagaagaatataag
aaactaattaaagaagataaatacaaatcactcatggaatacaataatatcaatgtagat
attagtcaagttcataacggttattttgctcaagataaaaaaggttttaaagatacaaat
ggtaaaggaaaactagacaatgatgcttataatcttataatgaaagataaagaaagatta
ttaaatatgaaaactcctttaagatttattttctctcattctgctttacgagaaggatgg
gataatcctaatgtgttccaaatatgtactcttaatgaaactaggtcaaaaatgaaaaaa
cgacaagaaattggtcgtggtttaagattatgtgtagatcaagatggaaatagaattaaa
aataatccgaatattaatattttaactgttatggctaatgaaagttatgatcaatttgct
gaaggattacaaaaagaaattgaagaagatactggaattaaatttaatagaataactgac
acatcatttagtttcacaaaatatactaatagaaaaggtgatgaagaagagttaggtgat
cagaaatcaaaattaatctataaatatcttgaagcgaatggttatattaaaaaagatggt
aagatattacctcaacttgaaattgatattgagaagggtgaatttaaattagctccaata
gtagaagatattgccagtgataaagaagaattacgtaataatataataaatgaaattcgc
acattaactgcacctccaatagttaaaaaacgtggtgatagaaaaactataaaactagat
tatgacaagtataaaaaagaagatttctataaaatatggaataaaattaaacataaatcc
atgtataaagtacaatttgacacggaacgattaattgaagaatgttctaaacgtttgcat
gaagaattaaacattggtaatcctacggtaatatttactaaagcaggttataaaattgaa
tatagtggtattgaaccacaagaggaaatttgggatgtgattgaatcacagggagatagt
gtagatttaccaaacatattacaatatttacaaaatgaaactacacttactagaaaaacg
cttgcccgaattttaattcaaagtgaaactttaaatcaatttaagaaaaatcctgaagaa
tataaagaacaaactcttctaataatcaaagaggaattaagaagattcttagtagatgga
attgcatataccaaaattgaagattgctatgatgaagatgaatttgaaagacatgaactt
ttccgttatgttaatgaactaggagaagatgataaatcagaaagaagttataaatctcct
tatgaatacactatatttgattcaggtattgaaaaatcattccaagaaaaacttgaattc
agtaatttaattaaattttatatgaagttaccaggatggtttgaaatagatactcctata
ggtaaatataatccagactgggcaatattagtagaaagagaaggtaaagaagagttatat
ttcattgttgaaacaaaaggaacgagtaatattaaagaactaaaaccatccgaacaatac
aaaattaaatgtggaatagaacatttcaaagcattagatgaaagtatacaatttgaagtt
gaaagtgattttgaagaatttaaaatggacacaataagtaaatattaa

DBGET integrated database retrieval system