Methanobacterium subterraneum: BK009_07290
Help
Entry
BK009_07290 CDS
T05275
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
msub
Methanobacterium subterraneum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF11
TRAP_beta
DUF7619
DUF7507
bMG10
CarboxypepD_reg
CarbopepD_reg_2
bMG3
SdrD_B
CARDB
MetallophosN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUB60499
UniProt:
A0A2H4VQX2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1520677..1530315)
Genome browser
AA seq
3212 aa
AA seq
DB search
MGNKKNKVGLSFIIILAIFLTCGIVSAAENVDEVSNNNSTTLNNLTNSTNLTLETISNYT
SNSSVPDQVSNSSISLNSNIISGNVITCTNGSPFPGVTITITSTDGSTITQTTTDTTGHY
ELNFTSIEGKFYVTASYPGHMSIQKLVTTELSSNPSDLNLYGWMNFQLGPEPTLSIDAPG
EQFLNESFNFTLTFNNNGNETGFGPIVQLILPPEIEFNSANFLGAPVSVTSVGTFTLSGT
LIDPLSGLTVTGTPGYSLYIIEYPLGSFTSGQPSAVLQINAFLRGNSTLGLPLNITAYPV
FRFGANETGGTPIRGNQTTAQVTPTVIKIIKNTVAPHEDETATGSNYPWDYTLTVDVANG
QTVTDVNVKDLLPGNLQFVQVVDADGGSIVQQPSTSTPGGLLWIHFSNITGVLGSDKTII
YRVYAPKFDNNSQYVLDPNTGAWVNATNTASVTGNYTNINVSSTDNYTLILKPLAIQKSA
NDESTDPIQPRPTDILRYTLSFQVSDYFSINNLVLYDVLGDGQSFLNSLIYNPRLNLHLP
GIDISNLFVNLTNPNQFYYYHNSTTGITYLVFNVTRILIDNGYSGIVEGGNYTGTNYGAT
TGNLTFWARINEYYEGVTPPTPHPIVSNDPINNAVVADGVLTQNGSQIEDSSGSQVVIVA
PIPSKDIIKINGNDPVAPYLVKPGDSVTFSLLIDVPTSNLHDFNLIDYLPIPLLRASQFT
TGQAQNTSQVIPAAGQWRLGEDDTLSSLTGVIPTLIVDVTQNTITFQYGNVYNATQPNAT
VHILFTLTATGDPMADGLWLTNLLNINYENSPGEIFCDNRIVSLKTGEPQLTINKTATPT
TELQAGDMVTYTLTINNTGNAPAYNVMVTDDLLSSNPGYISSISGITANYLNGATITGLN
LMDLFTSTGLNFGSLYPIYGVNGTNSTIIITYNATLNSTVYPRQIINNTVNITKFTSLTP
PESPNYVGNPGVDQSHFSDNASVQVRDVDFKKTYVKSLDSSGPNLTIGETGLFQLAVTLP
AGQINDLVINDVLPSGLTFVSYVLDQSNFNGILAPLTFTQINNNLKFLFTGLTNTTSNST
FYINIIVRANNNTAYPGSTNVTARNSATMDWNNPGHTPITKQATVYIVQPVLNVTKSFNP
STIQGGETTTVTIAVTNNGRSTAYNVIITDPLSYSSNIFDLSSSSVVASSPQNGFVFNYN
STSQVVSFTGGNIPRGQTLYFTFNITALQTPYIGPTYNNTVNAFYWSLPWVSGVPDPDSR
NYTSSAWAVVRTGDPKITKIVENSTIHGNSGNLTIGETVTYKITVTLPQGLKTNLTIIDT
LPAGFSYNLGEYILNTTGFSGTLGTLLVSVNGQNVTFTFSELTNSTKTNNTFYILLNATV
LNSTNNTNGTIKTNNASLNWTENTKPPFTASVNTTIVEPNLAVTKNVTPTTVDGGDLITV
NLTVTNNGTSPAYQIELRDVLDPVLFNSSTITQVSIPSGFSFTVSGNTVIIKSLLDTNIT
AGNALNFIFTVLVNDNVPTGSIFQNQANISFSSMSVGYDNARNYTNKSNVVNINTVTPGI
NKTVINTSEPDSATPNVMVGEVVTYQFVLTVPEGETFNVSLIDNLLSNLGYNAGTAFIKR
SDTNIIASGFDFGSSFDEFLTINYTSLSPLTFYLGNVTYLGGQGLKNGTITLIFNTTVLN
IAGNQAGTKIPNNATLSFTNATGGNRNVTGVCPTTLNVIVPQISSTKTANQTILTNSDTA
TFNIQIRNNNITNGAPVYDLIIIDPMNGFTMDYLHMIITPSDPSIIFTNYSTANLINITV
SKLNPGQYLNITYNATVKSDVVFNTTLNNTVNATGTSLPGPHGTNNATPGDPGTSTGERT
GDPTQPAGPVNNINTTATAPVTTRAPRVSKTVNGTETVNLTIGETATESININLPVGSTT
ELKIVDVIPNGLGINGGINGFTYATTAGVNVNQFLVTYLGGNTYQISFGNVTITQEGNIT
INYTVLVQNVNGNYNGQNLVNNATLYYNNKTGQGVNGGSDIATVHVVEPNLQIIKTPSKT
NLNVGEEFTYTINVTHTSSSTSDAYNITITDVIPSGLHYVAGSAVLPSGWLLNVSGNTLI
FTSSSLTLISHSATLLFNCTVDNNYLLAGGNITNTANLNYTSLPIDGRNYTTNNSTQIHV
IGADLEVRKNGDAQVNAGEQVTYTITVTNKGPDTAVNAVLTDTILAQWFNMLIHPQYSVN
SGSWVNILSNPFTIFLGNLTPGNITTILIRATVNASAPVGILNNTANVTSNTTDPNPNNN
NSTATTNVTQSSELTLIKSNNPTGTVIAGNNLIYTLTLTNTGPSVARNVILRDDSLSSWL
TNTYYQYSLNGISWSGLALFTGPLVLDVTNIIGGPMNVSQVFWVMINGTVNASTPNGTTL
LNNATANSSTSSHNVTSNTVNNTVETLATLNVTKTAPETVIAGESSPIIYTITLTNNGPS
DALNVKVSDTLDPRLTSPEYSLDNVNWFSWNNLFEYIFNRINASQTVHLYLRGWVPSSAL
GLINNTVVVSSNATNLTGNLTDNTTTKINTTSVLNVTKSAPESVVAGQSGPVVFTIVVTN
YGPSDALNVKVSDTLDPRLTNQEYSLEGVNWSVWLAPYEYVFSRLNATQTLYLYLRGWVP
SSALGLINNTVVVSSNATNLTGNLTDNTTTKINTTSVLNVTKSAPESVVAGQSEPLVFTV
TVTNFGPSDALNVKVSDTLDSRLTGQEYSLDNVYWLAWNSPFEYVFSRLNTTQTVYLYLR
DWVPSSALGLINNTVVVSSNETNLTGNLTDNTTTQINTTSALNVTKSAPESVVAGQSEPL
VFTVTVTNFGPSDALNVKVSDTLDSRLTGQEYSLDNVSWSVWLAPYEYVFSRVNATQTVY
LYLRGLVPSNATGLINNTVIVSSNATNLTGNLTDNTTTGINTLAILNITKTSVTGGSDVN
NIVRGYPIHYTILITNEGPSDALNVNFDDYYTPDLLENTYYSTSTGIPWTAYSNPLNITP
IIDRLAPGQNVTIWINGTVISNATQGLNNTGGTSSETDPEGRKTASVYNDIQTSHVTIEK
TVSNPQPYLHETIYFTLIVQNWGPDTAIDVYVLDKLPAGLIYIGSIANYGSYNSETGIWT
IGNLPANTIAQLILTVGVEKLGPIENHAHVYTASYDPVLDQRNATAAIYVREQPQPENNT
IGMQNTGMPISALIMALIILVTSLSAVTLRKK
NT seq
9639 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaataaaaaaaataaagttggactatcttttataattattttggcaattttttta
acatgtggtatagtttcagccgcagaaaacgttgacgaggtttcaaataacaattcaaca
acccttaataatttaacaaattcaactaatttaactttagagacaatatcaaattacacc
agtaactcaagtgtccctgatcaagtttcaaattcttccatttctcttaattctaatata
atcagtggtaatgtgattacttgtaccaatgggagtcccttccctggagttactattact
ataacttctactgatggttccactattacccagaccaccaccgacaccactggacattat
gaactcaacttcacgagtattgaaggaaaattttatgtcaccgccagttaccccggacac
atgagcatccaaaaactggtgacaactgaactcagctccaacccatctgatctgaattta
tatggatggatgaacttccaactgggtcctgaacccactttatccattgatgcccctgga
gaacaattcttaaacgaaagttttaacttcacactcactttcaataacaatgggaatgaa
actggttttggtcccatagtacagttgatcttacctccggagatagagttcaacagcgcc
aacttcctgggggcaccggtgagtgttacatctgtaggaacattcaccctgagtggaaca
ttaatcgatccactatctggactaaccgtgactggaactcctggatacagtctttacata
attgagtatccactgggcagtttcactagtggccagcccagtgcagtcctgcaaatcaat
gcatttttaagaggaaactccactctgggattacctctaaatatcacggcatatccagta
ttcaggtttggtgctaatgaaacaggaggaacacctattcgagggaatcaaaccactgca
caggtaactcctactgtgatcaaaattattaaaaatacagttgcaccccatgaagatgaa
actgccacaggttcaaattatccctgggattataccctcactgttgatgtggccaatggc
cagacagtcactgatgttaacgtgaaagacttacttcctggaaacctgcagttcgtgcaa
gtggttgatgctgatggtggcagtatagtgcagcaaccatccaccagcacccctggtggt
ttactgtggatacactttagcaatatcacaggagtactcggttctgataaaactatcatc
tatcgagtttatgctccaaaattcgataacaactcccagtatgtgttggatccaaataca
ggagcctgggttaatgccactaacactgccagtgttactggaaattacaccaatattaat
gtttcatctactgataattacacccttatcctgaaaccactggccatacagaaaagtgcc
aatgatgagagcacggacccaatacaaccccgacccacagatatactgcgatacacactc
agcttccaggtttcagattatttttcaataaacaacctggtactctatgatgtactgggt
gatggtcagagtttcctgaattctttaatatacaacccccgactcaatttacaccttccc
ggtattgatatcagtaatctttttgtcaatttaaccaaccctaaccagttctattattac
cataactccaccacaggaatcacctatttagtattcaacgtcaccagaatacttattgat
aatgggtacagtggtattgttgaaggtggaaattatactggaacaaattacggggcaacc
actggaaacttaactttctgggcccgcatcaatgaatactatgaaggagtgacaccacca
actccacatccaatagtttccaatgaccccataaataatgcagtggttgctgatggggtg
ttaactcagaatggcagtcaaatagaggatagcagtggaagtcaggttgtaattgtggcg
cccataccatcaaaagacataattaaaattaatggaaatgatccggttgctccttatttg
gtaaaacctggagactctgtgactttctccttactgatagatgttcccaccagcaatctg
cacgactttaatctaattgattacctgcccatacctttgctgagggcctcccaatttacc
acaggccaggcacagaacactagccaggtaatacctgctgctgggcaatggaggctaggt
gaagatgataccttaagtagtttaactggtgtgatacctacactgattgtggatgtcacc
cagaacaccatcaccttccaatatggtaatgtctacaatgccacccagcccaatgcaact
gttcacatattattcaccctcaccgccactggagatccaatggccgatggtctctggcta
accaacctactgaacatcaactatgaaaacagtccaggggaaatattctgcgataatcgt
atagtctcattgaaaactggagagccacaactcaccataaacaagaccgccacacccacc
actgaactacaggcaggtgacatggtcacctacaccctaaccattaataacactggtaat
gctcctgcttacaacgtaatggtcactgacgatcttctctcatccaatccaggatacata
tcatcaatcagtggtattactgctaattaccttaatggggcaacaatcactggtttaaac
cttatggaccttttcacaagtactggtttgaatttcggttcattatatcctatctatgga
gttaatggaaccaacagcaccataataataacctacaatgccaccttaaacagcacagta
taccccagacagataatcaacaacacagtcaacatcaccaaatttacatcgttaaccccg
cctgaaagtcccaactatgttggaaatccaggagttgatcaatcccacttttcagacaat
gcatcagttcaggttcgtgatgttgatttcaagaaaacctatgtaaaatcacttgatagt
tccggacctaatttgacaataggagaaacaggattattccaactggctgtcacccttcct
gcaggacaaataaatgatctggtaataaatgatgttttaccctcaggtctcacctttgtt
tcttatgttttggatcaaagtaacttcaacggaatactggcaccattaacctttactcag
ataaacaacaatctaaagttcctgttcacagggcttaccaacaccaccagcaacagcaca
ttttacattaacatcattgtaagggctaataacaacacagcttatcctggatcaaccaat
gtaactgcacgaaacagtgccaccatggactggaacaacccaggacatacaccaatcact
aaacaggcaacagtttacatagtacagccagtattaaatgttaccaaatcattcaacccc
agcaccatccagggtggagagacaacaacggttactatagccgtaaccaacaatggaaga
tcaacggcttataatgtaattataactgatccactatcatattcaagtaacatatttgac
ttaagcagtagtagtgtggttgcaagcagcccccaaaatggttttgtgttcaattacaac
tcaacttcacaagttgtcagtttcaccgggggaaatataccccggggtcaaacattgtat
tttacattcaacataactgccctccaaacaccttacattggacccacctacaacaacaca
gtcaatgcattttattggtcccttccatgggttagtggagtacctgatcctgatagtaga
aattacacatcttctgcttgggccgtagttagaactggtgatccaaaaatcaccaaaatt
gtggaaaattctaccatacacggaaacagtggaaacctcactataggagaaacagtaacc
tataaaataacggtcacattaccgcaaggtcttaaaaccaacctcaccattatcgataca
ttaccagcaggttttagctacaacctcggagagtacatcctgaataccacaggctttagt
ggtactttaggaacattattagtttccgtgaatggtcagaatgtaacattcactttcagc
gaactcaccaacagcacaaaaaccaacaacacattctacatactcctgaatgccacagta
ctcaacagtaccaacaacaccaatggaaccataaaaactaacaatgcatcccttaactgg
acagaaaacaccaaacctccattcacagcatcggtgaatactaccattgtagaacctaac
ttggcagttactaaaaatgtaacacctactacagtggacggaggggacctgataactgtt
aacttaacagtcaccaataacggtacttcaccagcttatcaaatagaattacgtgatgtt
ttagatccagtactcttcaactcatccacgatcacgcaagtatctataccttctggcttc
agtttcacagtatctggaaacactgtaataatcaaatcccttcttgacaccaacatcact
gctggaaatgctttaaactttatcttcacggttctggtaaatgacaacgttccaacaggg
tccattttccagaatcaggctaatatttcattctcatccatgtccgtaggatatgataat
gcccgaaattacaccaacaaatccaacgtggtgaatatcaacaccgttacacctggaatt
aataaaactgtaattaacacttctgaaccggattctgccacaccaaatgtgatggtggga
gaagtggtaacatatcagtttgtgttaacagtcccagaaggtgaaacattcaacgtatcc
ttaattgataatttattatctaatttaggatataatgccggaactgcatttattaaaaga
agcgataccaacatcatagcttctggatttgactttggaagttcatttgatgaattttta
accatcaattacacttcactttcacccctgactttctaccttggtaatgtaacttacctg
ggaggtcagggccttaagaatggaactataactttaatatttaataccacagtcctgaac
atagctgggaaccaggcagggacaaaaatacccaacaatgccacactgagttttaccaat
gccacgggaggaaatcgcaatgtgacaggggtatgcccaaccacattgaatgtgattgtt
ccccaaatatcatccaccaaaacagcaaaccagaccatattaactaattcagacacagca
acattcaatatacaaatccgaaataacaacatcaccaacggtgctccggtttatgatttg
atcatcattgatccaatgaatggtttcaccatggattacctccacatgatcatcaccccc
agcgacccatccataattttcaccaactactccactgcaaatttaatcaatataacagta
agcaaactgaaccctggccagtacctgaacataacctacaatgccacagtcaaatcggac
gttgtattcaacaccacactgaacaacacggttaatgccactggaaccagcctgcccggt
ccacatggtactaacaatgccaccccgggtgatccaggtaccagtactggtgagcgaact
ggagaccccacacaacccgcaggcccagttaacaatataaataccacagcaacagctcct
gtgaccaccagagcaccacgtgtgtctaaaacagttaatggaaccgaaactgtgaatttg
accataggagaaacagccacagaatcaataaacataaacttaccagttggaagtacaact
gaacttaaaatagttgatgttatacctaatggtctgggaataaatggaggaataaacgga
tttacatatgccacaacagctggtgtaaatgttaaccagttcctggtaacttatctcggt
ggaaacacttaccagataagctttggaaatgtaaccataacacaggaagggaacataacc
ataaactacacagtactggttcaaaatgtcaatggaaactacaatggacagaacctggtt
aacaatgccacattgtactacaataataaaaccggacagggagtcaacggaggatcagac
atagccacagtacacgttgttgaacccaacctgcagataatcaagacaccaagcaaaacc
aacctgaacgttggagaagagttcacctatacaattaatgtcacacacacctcttccagc
acatcagatgcatataacattacaataaccgatgtgattccatccggacttcattatgtt
gcaggttcagctgttttaccctctggatggcttttaaatgtttcaggaaatactttaatc
tttacttcatctagtttaaccctgataagtcacagtgccactttactcttcaactgcaca
gtggacaacaactatctgttggcgggtggaaacatcaccaacaccgccaatttgaactac
acctcactacctattgatggaagaaattacaccaccaataacagcacccagatacatgtt
ataggtgctgatctggaagtgcggaaaaatggagatgcccaggtaaatgcaggagaacag
gttacttacaccataaccgttactaacaaaggtccggatacagcagtaaacgcagtttta
accgatactatactggcacaatggttcaacatgcttattcacccacaatattctgtgaat
tcaggatcttgggtaaatattttatctaacccattcaccatatttttaggaaatttaact
cctggaaacatcaccactatcttgataagggcaacagtaaacgcttcagcacctgtaggg
atcttgaacaacactgccaatgtaacttcaaacaccacagatccaaacccaaataataac
aacagcacagccacaaccaacgtaacccagagttcagaattaacattaatcaaatcaaat
aatccaactggcacagtaatagctggaaataatctgatttatacattaactttaaccaac
actggcccaagtgtggccaggaatgtgattttaagggatgattcgttgtcttcatggtta
accaacacttactaccagtacagtctcaatggaattagctggagtggattggctctattc
actgggccactggttttagatgtcacaaatattattggcgggccaatgaatgtgagtcag
gttttctgggtaatgataaacggtactgtgaatgcatccacacccaacggaacaaccctc
ctcaacaatgcaactgccaatagttcaaccagttcccacaatgtaacttccaacacagta
aacaacactgtggaaaccctggcaacattaaatgtaaccaaaacagcaccagaaacagtc
attgctggagaaagcagcccaatcatctacactatcactcttaccaataacggtcctagt
gatgctcttaatgtaaaagtcagtgatacacttgatccaaggttaaccagcccggaatac
agcctggacaatgtgaactggttctcatggaataatctatttgaatacatattcaacaga
attaacgcatcacaaacagtacacctttacctgcgtggatgggtaccatccagtgccctg
ggtcttattaataatactgtggttgtttccagtaatgccactaatttaactggtaacctg
acggataacaccacgacaaaaatcaacaccaccagtgtgttgaatgtgactaagtctgct
ccggagagtgtggttgcgggtcagagtgggccagttgtgtttacaattgttgtgacgaat
tatgggcctagtgatgcattgaatgtgaaggttagtgatactctggatccacgcttgact
aatcaggagtatagtttggagggtgttaactggagtgtttggttggctccttatgagtat
gtgttcagtcgtttgaatgctactcagactttgtatctgtatttacgtggttgggtgcct
tccagtgctttgggattgattaataatactgtggttgtttccagtaatgccactaattta
actggtaacctcaccgataacactacgaccaaaattaacactaccagtgtgttgaatgtg
actaagtctgctccggagagtgtggttgcgggtcagagtgagccattggtcttcacagtt
actgtgactaattttggtcctagtgatgctttgaatgtgaaggttagtgacactttggat
tcacgtttaactggtcaggagtatagtttggataatgtgtactggttggcttggaatagt
ccgtttgaatatgtgtttagtcgtttgaataccacgcagacagtgtatttatacttgcgt
gattgggtgccttctagtgctttgggattgattaataatactgtggttgtttccagtaac
gagactaatcttacgggtaatttgactgataatactacgactcagattaacactacgagt
gctttgaatgtgactaagtctgctccggagagtgtggttgcgggtcagagtgagccattg
gtcttcacagttactgtgactaattttggtcctagtgatgctttgaatgtgaaggttagt
gacactttggattcacgtttaactggtcaggagtatagtttggataatgtgtcttggagt
gtttggttggctccttatgagtatgtgttcagtcgggtgaatgccacccagactgtttat
ctgtatctaagaggattagtaccctccaatgccacaggactcattaacaacaccgtgatc
gtctccagtaatgccactaatctaactggtaacctaaccgacaacaccactacagggata
aacaccctagccatcctgaacattacaaaaacatccgtaacagggggatcagatgtaaat
aacatagtaagaggttatccgatccattacactatattaataaccaatgaagggccatct
gatgccctgaatgtgaactttgatgattattacacaccagacttgctggagaacacatat
tactccacatcaacaggaataccatggactgcatacagcaatcccctgaatataactcca
ataatcgacaggctggcacctggacagaatgtaaccatatggattaacggcactgtaatt
tcaaacgctacacaaggtttgaacaacactggcggaacctcatcagaaactgatcctgag
ggcaggaaaacagcatcagtttataatgacatccaaacatcccatgtaaccattgaaaaa
acagtcagtaatccacaaccatatctccatgaaacaatctacttcaccctcatagtgcaa
aactggggaccagatactgctatagatgtttacgttcttgataaactccctgcgggactc
atatacattggatccatagctaattacgggtcatacaactctgaaacaggtatatggacc
attggaaacctaccggcaaacacaatagctcagctaatactaactgtgggagttgaaaag
ttaggaccaatcgaaaaccacgcccatgtatacactgcatcctatgatccagtactggat
caaaggaatgcaactgcagctatttacgtcagagaacaaccacaaccggaaaacaatacc
atagggatgcaaaatacgggtatgcctatatctgcactgataatggcactaataattctc
gtgacaagtctatctgcagttactttgagaaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
