Metamycoplasma subdolum: R9C05_00810
Help
Entry
R9C05_00810 CDS
T09522
Name
(GenBank) valine--tRNA ligase
KO
K01873
valyl-tRNA synthetase [EC:
6.1.1.9
]
Organism
msud
Metamycoplasma subdolum
Pathway
msud00970
Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
msud00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
R9C05_00810
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01007 Amino acid related enzymes [BR:
msud01007
]
R9C05_00810
09182 Protein families: genetic information processing
03016 Transfer RNA biogenesis [BR:
msud03016
]
R9C05_00810
Enzymes [BR:
msud01000
]
6. Ligases
6.1 Forming carbon-oxygen bonds
6.1.1 Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
6.1.1.9 valine---tRNA ligase
R9C05_00810
Amino acid related enzymes [BR:
msud01007
]
Aminoacyl-tRNA synthetase
Class I (U)
R9C05_00810
Transfer RNA biogenesis [BR:
msud03016
]
Eukaryotic type
Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
Other AARSs
R9C05_00810
Prokaryotic type
R9C05_00810
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA-synt_1
Anticodon_1
tRNA-synt_1g
tRNA-synt_1_2
tRNA-synt_1e
Val_tRNA-synt_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPB50683
LinkDB
All DBs
Position
191765..196624
Genome browser
AA seq
1619 aa
AA seq
DB search
MAKKIMNSLRVTNLSKIVYEKQNPKIAINNLSFLANQNSIVGFLGKDSETKNLIYNLLTN
NSLPYSTYLGFIECKIDNHYYLCKDTPFYSKGLSFGFDHEFINNNEDTLFQKLLNYFKQN
NVLQIGVQSFLTSWEKSFEDYRILLENNCAKYSYELELKNETSLNKISSTIRKIHEKTKD
SFFHLSFIEEDLKTILSQFKNVLLNFQNYEYELMELAYAINNSYDQSKSFLNQKDYIEAR
NNYESLKNKFYKSYDLKKIIKQTKADQINKIKNEVWYEHKHVLKLLKKTCEDLVLRSNIS
KIKFKSTDNPTSFIFNYKNYILSKKIRNFINKNLVNLSWFTRKNFTNFLSDINLLKNTIS
NEINLISTQQNWRKIAKEIDYVVKHNFSLKVSQYEGIINQNKEDYWNKIEEIYNQEVQAF
QGEQGLITLEKVKIAEEIYLNAKHEYEWNLRSVGKRLEHKTLQIRYNFDKLVNKNKNKFS
IIANFLKTLSNIIQSYSKSVDDNSEKRVKATSEKIRKIIPTIREQFNDFLNFTQLFTNGK
IVSESMLQKFISKSLFYTILKRANISLDKLKFKISDLTLNERINIEIEKILISKPSLIIV
GNEINILTQEKQLEILSKLNKYVLENHIIGIYFLSDYKVAEKVTTQLYIVNNSKVIEEGS
TQQIIKNPINPLVKKELQHHDEQTIKLYNEYISHNDNFENINCYQIDENHFIWSTYSELN
KWVNEGNLKNEKLKKIFIVTTDNLLTSKTTQIKNKETFEETTIFSLEGLEFEKGDDEMDK
QFNHKLVEKGRNEKWIKAKFFMTHDINKKPFTVILPPPNVTGKLHIGHALDTYIPDTIIR
YKKLQGYDVMWVAGKDHAGIATQAVVEKKLKEKGLTKYDLGREAFIKEVWKWKDEFSDNI
TKQWNKLGLALDFESERFTLDKDANEAVLKVFIDLYNDGLIYRDTKPINWDCKFETALSN
IEVEAKETKQKMYYIKYPIQGSKSFLEIATTRIETMFSDVAIAIHPEDPRTKTLLNKKIV
HPLTKKVIPVITSDLIDMKFGTGLMKVSAHAMDDFEIIKHNHLQIIECINKKGKLNQNAM
EFQGLDRFEARAKIEEKLKKEGFLIKTEEVISSVGCSERSKDPIEILVQPQWFVRMNVLA
KKLLKHFASPEAVKFVPERFGQVLTKWMENVLDWTISRQIWWGHRIPAWYKDDEIKVQIE
SPGEEWTQDQDVLDTWFSSALAPFVFLGWPQNLNKIKRYFPTSLLVTGVDIIFFWVARMY
FQSLYFMEDKPFEKVYIHGLVRDNEGRKMSKSLGNGVDPIDIINQHGSDVLRMSLVFNLS
PGQDLNYGEEKIKTAKLFLNKFWNIARLIKGINVDLTKAYDSSLNDEFDLWIIDKFLTLK
SSIDKSMENYEFTLIFKSIQTFIMNDFSGWYLEFLKLKNNNFLIHILFREILILLHPFMP
FITDYLFENMYGEELLEAKKTLLSLPQENTKIVKVQKLIELITTLRKYREDKNISKSETL
YFFADFGLSYEELNIIRKLANFEIKENNDFVINLSFGKIKIKQDEKQKKKDIEALNKLIE
FSKQEIAFNEKLLNNKNFISKAAKDKIQEKQDNLKLHQKNLETYEQELAKKLEQNKENK
NT seq
4860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggctaagaaaataatgaattctttgagagttactaatctctcaaagattgtttatgaa
aaacaaaatcctaaaattgcaatcaataacctttcttttttagctaatcaaaacagcata
gtaggttttttgggtaaagatagtgaaactaaaaacttaatttacaatcttttaacaaac
aactctttaccttacagcacctatttaggttttattgaatgcaaaattgacaatcattac
tatttatgtaaagacacacccttttattcaaaagggttaagttttggttttgaccatgaa
ttcattaataacaatgaagatactttatttcaaaaacttttaaattactttaaacaaaat
aacgttcttcaaattggtgttcaatcatttcttacgagttgagaaaaatcatttgaagat
tatcgcattttacttgaaaataattgtgccaaatactcatatgaacttgaactcaaaaat
gaaacaagtctcaataaaataagtagcactattcgtaaaattcatgaaaaaactaaagac
tctttctttcacttaagttttatcgaagaagatttaaaaacaatcttatctcaattcaaa
aatgttcttttaaactttcaaaattatgaatatgaacttatggaacttgcatatgctatt
aataatagttatgatcaaagtaaatcatttctaaatcaaaaagattatattgaagctaga
aataattatgaaagtttaaaaaacaaattctacaaatcttatgatttgaaaaagatcata
aaacaaactaaagctgatcaaattaataagataaaaaacgaagtttgatatgaacacaaa
cacgttttaaaattattaaagaaaacatgcgaagatttagttttaagatcaaatataagc
aaaataaaatttaaaagtacagacaatccaacatcatttatttttaattacaaaaactac
attttatctaaaaaaatacgaaattttattaacaaaaacttagtcaatttatcttgattt
actagaaagaattttactaactttttatccgacataaacctcttaaaaaacacaatttca
aatgaaattaacttaatttcaacgcaacaaaattgaagaaaaattgccaaagaaattgat
tatgttgtaaaacacaactttagtttaaaagttagtcaatatgaaggaatcattaatcaa
aataaagaagattattgaaacaagattgaagaaatttataatcaagaagttcaagcattt
caaggcgaacaaggtttaatcactcttgaaaaagtaaaaattgctgaagaaatttattta
aacgctaagcatgaatatgaatgaaatttacgttcagttggtaaaagacttgaacataaa
actcttcagatccgttataactttgataagcttgtaaataaaaacaaaaacaaattttct
attattgcaaactttctaaaaacactttctaatattattcaatcatatagcaaaagcgta
gatgataatagtgaaaaaagagtaaaagcaacaagcgaaaaaataagaaaaataatacca
acaataagagaacaattcaatgattttttgaacttcacacaactatttaccaatggcaaa
attgtaagtgaatcaatgctgcaaaaatttatttcaaaatcactattttatacaatctta
aaaagggcaaatatatctttagacaagttgaaattcaaaatttcagaccttactttaaat
gaaagaattaatattgaaattgagaagattttaattagcaaaccaagtcttataattgtt
ggaaatgaaatcaatattttaactcaagaaaaacaacttgaaattttaagtaaactaaat
aaatatgttcttgaaaatcatattattggaatttactttttaagtgattataaagttgct
gaaaaagtaacgactcaactatacatagtaaataattcaaaggttattgaagaaggatca
actcaacaaattatcaaaaatccaatcaaccccttggttaaaaaagaacttcaacatcat
gatgaacaaactattaaactttacaatgaatatatttcacataatgataattttgaaaat
atcaactgttatcaaattgacgaaaatcactttatttgatcaacttattctgaacttaat
aagtgagtaaatgaaggaaacctaaaaaacgaaaaacttaagaaaatttttatcgttacg
accgataatttattaacaagcaaaactacccaaattaaaaacaaagaaacatttgaagaa
actacaatctttagtttagaaggacttgaatttgaaaaaggagatgatgaaatggataaa
caattcaatcacaaactagttgaaaaaggaagaaatgaaaaatgaattaaagcaaaattt
ttcatgacccacgatattaataaaaaaccattcacagtcatcttgcctcctccaaacgtt
accggaaaacttcacataggacatgcacttgatacatatattcctgacaccataattaga
tataaaaaacttcaaggctatgatgttatgtgagttgccggaaaagatcatgccggtatt
gctactcaagccgttgttgagaagaagctaaaagagaaaggcctaacaaaatatgatctt
ggcagagaagcatttattaaagaagtctgaaaatgaaaagatgaattttcagacaatatt
actaaacaatgaaataagttaggtttagcacttgactttgaaagtgaacgctttactttg
gataaagatgctaacgaagctgtcttaaaggtattcattgatttatataatgatggatta
atttatcgtgatacaaaaccaataaattgagattgcaagtttgaaacagcactttcaaat
attgaagttgaagcaaaagaaactaaacaaaaaatgtattacattaaatatccaattcaa
ggaagcaaaagttttcttgaaattgccaccacaagaattgaaactatgttttcagatgtt
gcaattgcaatacatcctgaagatccaagaactaaaactttattaaataaaaagattgtt
catcctttaaccaaaaaagtaattccagttattacttcagatttaattgatatgaaattt
ggaactggacttatgaaagtttcagctcatgctatggatgactttgaaattattaagcat
aatcatttgcaaattattgaatgtattaacaaaaaaggtaagttaaatcaaaatgctatg
gaatttcaaggcttagatcgctttgaagcaagagcaaaaattgaagaaaaacttaaaaaa
gaaggttttttaataaaaacagaagaagttatttccagtgttggttgctcagaaagatca
aaagatccaattgaaatcttagttcaacctcaatgatttgtcagaatgaatgttttagcc
aaaaaacttcttaaacacttcgcttcacctgaagcagttaaatttgtgccggaacgtttt
ggccaagttttaacaaaatgaatggagaatgttttagattgaacaattagccgtcaaata
tggtgaggacatagaattcctgcatgatataaagacgatgaaataaaagttcaaattgaa
agtcctggcgaagaatgaactcaagaccaagatgttcttgatacttgatttagttcggca
cttgctccatttgtatttttaggttgacctcaaaacttaaataagatcaaaagatatttc
ccaacatcgctcttagttacgggagttgatattatcttcttctgagttgcaagaatgtat
ttccaaagtttatattttatggaagataaaccatttgaaaaagtttatattcacgggctt
gtacgagataatgaaggcagaaaaatgtctaaatctcttgggaatggtgtggatccaatt
gatatcattaaccaacatggatctgatgttttaagaatgtcattagtgtttaatttatca
ccaggtcaagacttaaattatggcgaagaaaaaattaaaactgcaaaattattcttaaac
aaattctggaatatcgcaaggctaattaaaggcatcaatgttgatttaacaaaagcttat
gattcatccttaaatgatgagtttgatttatgaattattgataagtttttaaccttaaaa
tcaagcattgataaatcaatggaaaattatgaatttaccttgattttcaaaagcatacaa
acatttataatgaatgatttttcaggctgatatttagagtttttaaaactaaaaaataac
aactttttaattcatattttatttagagaaattctaattttattacatccatttatgcca
tttattactgattatttatttgaaaatatgtatggcgaagaacttcttgaagctaagaaa
actttactttctcttcctcaagaaaatacaaaaattgttaaagttcaaaaattaattgaa
ctaattacaaccttaagaaaatatagagaagacaaaaatatttctaaatcagaaacactt
tatttctttgcagattttggtctaagttatgaagaattaaatattattagaaaacttgca
aactttgaaattaaagaaaataatgactttgtaattaacctttcatttggcaaaattaaa
atcaaacaagatgaaaaacaaaagaaaaaagacattgaagcacttaataaattaattgaa
ttttctaagcaagaaatagcattcaatgagaaacttttaaataacaaaaactttatttca
aaagcagcaaaagataagattcaagagaaacaagataaccttaaacttcaccaaaaaaat
cttgaaacttatgaacaagaactagctaaaaaacttgaacaaaacaaagaaaataaataa
DBGET
integrated database retrieval system