Methanosarcina siciliae T4/M: MSSIT_0671
Help
Entry
MSSIT_0671 CDS
T03865
Name
(GenBank) sensory transduction histidine kinase
Organism
msw
Methanosarcina siciliae T4/M
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
PAS_9
HisKA
PAS_8
PAS
PAS_4
Diguanyl_cycl_sensor
PAS_3
HATPase_c_2
Spt5-NGN
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKB27390
UniProt:
A0A0E3P4D2
LinkDB
All DBs
Position
788663..790186
Genome browser
AA seq
507 aa
AA seq
DB search
MAKDEIYRALFEQSSDAIFITNKERILEANPKGCKLLGYDKAHLKNIPLFSLFTEESLPG
FKNALNATLESRSAFFETKIKRSDKKILDVEVSSCTMGDRKKTFLIIFRDITLRKESERL
VQKEREILSALLEKSLCGILLIEASGHKIVDVNPVAIKTIGRSKEEIVGNICHQFICPTE
AGKCPISDLGLNVDKSEKTIINAQKEVIPILKSVVPVTIEDKDYFVECFIDLSERKRTEE
NLLRAKLEAEAASRTKSEFLTNMSHELRTPLNSIIGFSDILLEKVFGELNGKQLKYVNNI
SVSGKHLLELINDILDLSKVEAGKMELNYSEFSIGSVFDEVKSTISPLAQVKNLEMEFKI
GPDFGDIKADRSRLIQILYNLVSNAVKFTPEGGKVSVYCNKNGNRAIFSVTDTGIGISSE
DQKYLFEPFNQIDSGMNRQYEGTGLGLALVKQFVDMHKGRVWFKSVQGKGSSFIFELPVN
GPDEMKKPNNVFNDNATEFGVSAHFSG
NT seq
1524 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaagacgaaatatatagggctctatttgaacagtccagtgatgcaattttcata
acaaataaggagcgtattctggaagctaaccctaaaggctgtaaacttctcggatatgat
aaagctcatcttaaaaatattccccttttctctctgtttactgaagaatctcttcccggc
ttcaagaacgcattgaacgcaactctggagagcagatcagctttttttgagacaaagatc
aaaaggtcagacaaaaaaatccttgacgtagaggtcagttcctgtaccatgggtgaccgg
aaaaaaactttcctgattatctttcgggacataactttgcgtaaagaatcagaacgtttg
gtgcaaaaagaaagagagatattgagcgctttactggaaaaaagcctttgcggaatattg
ttaatcgaagcttccggtcacaaaatagttgatgtaaaccccgttgcaattaaaacgatc
ggaagatcaaaagaagagattgtcggaaatatatgtcaccaatttatctgtcctacagag
gccggaaaatgtcctatcagtgatctcggactgaatgtggataagtccgaaaaaacgatc
atcaatgctcaaaaggaagtcataccgatccttaagagtgtggttccggtaaccatagag
gacaaagattattttgttgaatgtttcattgacctgtcagagcgcaaaagaaccgaagag
aaccttctccgggcaaaactggaagctgaagctgccagccgtacaaagagcgagttcctt
actaatatgagtcacgagttgaggacgcctcttaactcaattatcggtttttcggatatc
ctgctcgaaaaagtttttggggagctcaacggaaagcagctgaaatatgttaacaacatc
tctgtcagcggcaaacatctccttgaacttataaatgatatccttgacctctcaaaagta
gaagccggaaaaatggaacttaactacagtgagttttctatcggttcggttttcgatgag
gtaaaatccacgatctcgcctcttgctcaggttaaaaaccttgaaatggaatttaagata
ggtccggattttggggatattaaggcagatagaagtcgtctgatccagatcctttataat
ctcgtaagtaacgctgtcaagtttaccccggaaggaggcaaagtctctgtttactgtaac
aaaaacggaaacagagctatattttcagtcacggatacgggaataggtatatcttctgaa
gatcagaaatacctctttgagcctttcaaccagattgattcgggcatgaaccggcagtac
gaaggtacaggtcttgggcttgctctggtaaaacagtttgttgatatgcataagggcaga
gtgtggtttaaaagtgttcagggaaaaggttcgtctttcatattcgagctgcccgtaaat
ggtccggatgaaatgaaaaaaccgaataatgtatttaatgataatgccaccgaatttgga
gtatctgctcacttctcagggtga
DBGET
integrated database retrieval system