Malus sylvestris (European crab apple): 126591126
Help
Entry
126591126 CDS
T09027
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1-like isoform X1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
msyl
Malus sylvestris (European crab apple)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
DUF445
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126591126
NCBI-ProteinID:
XP_050112651
LinkDB
All DBs
Position
11:complement(7808783..7874914)
Genome browser
AA seq
1063 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPALGGNEVSFGDEFENEIGMLLREQRRQDADDRESELNIYRSGSAPPTVEGS
LNAVGGLFAGGDGGSAGAAFSEFPGAKNGMGFASEEELRSDPSYIQYYYSNVNLNPRLPP
PLLSKEDWRSAQRMKGGGSSVLGGIGDRRKVNRVDEASGRSLFSMPPGFNSRKQERDAES
DKVRGSAEWGVDGLIGLPGLGLGNKQKSLAEIFQDDLGRAAPVSGHPSRPASRNAFDENA
ESVASAESDLAHLRRDLMTSDTLRSSANGLGSSAAQSMGPSSSYSYAAALGASLSRSTTP
DPQVVARAPSPCLTPIGGGRVGASEKRGFSSPSSFNAISSSMNESGDLVGAFSSMNLSAN
GVKDNESHLPSQIKQDVDDHQNYLFGLQGGENHARQLAYLKKSESGHMHMPSAPHSAKGS
YADLGKSNGGGPDSSDRHVELQKSAVSSGNLYSKGSPTSNLNGGGGLHHQYQRVDHANSS
FANYGLSGYSMNPALASMVASQLGTGNLPPLFESAMGSPGMDSRVLGGRMASGPNLAAAA
NESHNLAGLGSPIAGSGLQAPFVDPMYLQYLRTSEYAAAQLAALNDPSVDRNYLGNSYMN
LIELQKAYLGALLSPQKSQYGVPMGGKSGGSNHHGYYGNPAFGVGMSYPGSPPVIPNSPV
GPGSPMRHNELNMCYPSGMRNLAPWHLDGGCNIDESFASSLLEEFKSNKAKSFELSEIVG
HVVEFSADQYGSRFIQQKLETATIEEKHMVYQEIMPQALALMTDVFGNYVIQKFFEHGFP
SQRRELANKLFSHVLTLSLQMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIKMVEELDGHVMRCVRDQNGN
HVIQKCIECVPEEAIHFIISTFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCEDENTQSKVMDEIL
GAVSMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHERSAIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGG
PAERELLVNEMLGTTDENEPLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILSRIKVHLNAL
KKYTYGKHIVARVEKLVAAGGNHSSLCLFILCLQTAYLGAASP
NT seq
3192 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtcggaattaggaaggaggccagcgctcggaggaaacgaggtttcctttggggat
gaatttgagaacgagatagggatgctgctaagggaacagcgtaggcaagacgccgatgat
cgcgaaagtgagctgaatatatatagaagcggatcagcacctcccactgtggagggttct
ttgaatgcggttggtgggttgtttgctggtggcgatggtggcagtgctggtgccgccttt
tcggagtttcctggagctaaaaatggaatggggtttgcgtccgaagaggagcttaggtct
gatccttcttatattcaatactattactcgaatgtgaacctgaatccgcgacttcctcct
cctttgctgtcgaaggaggattggaggtctgcacaaaggatgaaaggaggagggagttcg
gtgttgggtgggataggagacaggaggaaagtgaatagggttgatgaggctagcggtaga
tcgttgttttcgatgccgccaggtttcaactcaaggaaacaagagagagacgctgagtcg
gacaaagtgcgtggctcagcagagtggggtgttgatggactgattggtttgccaggtttg
ggacttggtaacaaacaaaaaagccttgccgaaatctttcaggatgacttgggtcgtgca
gctcctgtttctgggcatccttctcgtccagcaagccgtaatgcatttgatgaaaatgca
gagtcagttgcttctgctgaatctgatctagctcatttgcgacgcgacttgatgacttct
gatactctacgatctagtgcaaatggtcttggatcatctgcagcccaaagtatgggcccg
tcttcttcatactcatatgctgcagctctgggtgcttccttatctagaagcaccactcct
gatccccaagttgtcgctagggctcctagtccttgccttacacctattggaggaggaagg
gttggtgcttcagaaaagagaggatttagtagtccaagctccttcaatgctatctcgtct
agtatgaatgagtctggggatctggtgggcgcgttttccagcatgaacttgtctgccaat
ggtgtaaaagataacgagagccatttgccatcacagattaagcaagatgtagatgatcac
cagaattatctcttcggtcttcaaggtggtgagaatcatgccaggcaacttgcctacttg
aagaagtctgaatctgggcatatgcacatgccctctgccccacactcagcaaaaggttca
tacgcagatttgggtaagagcaatggtggtgggccagattcctctgataggcatgttgaa
ctgcaaaagtctgctgtttcttctggtaatttatactcaaaaggatctcccacttccaat
cttaatggtggaggtggcttgcatcatcagtatcagcgagtggatcatgcaaactcatca
tttgctaactatggtttaagtgggtactctatgaatccagcattggcgtccatggtggct
agccaacttggcactggtaatcttccacccttgtttgaatcagctatgggatcccctgga
atggattcaagagtgcttggaggacgtatggcttccggaccaaacctagcagccgctgca
aatgaatcacataatctcgctggattagggagtccgattgcagggagtggtcttcaggct
ccttttgttgatcctatgtatcttcagtacttgaggacatcggagtatgctgctgcacag
cttgctgctcttaatgatccctctgtggataggaactacttgggtaattcatacatgaat
ttaattgaacttcaaaaggcatatcttggagccttgctgtcaccgcagaagtcacagtat
ggtgttccaatggggggaaagtctggtggttctaatcatcatgggtattacggaaatcct
gcatttggtgtaggcatgtcttatcctggaagtcctcctgttattcccaactctccagtt
ggaccaggtagtcctatgaggcacaacgaactcaatatgtgttatccctctgggatgagg
aatttagctccctggcacctggatggtggatgtaacatagatgaaagttttgcttcttca
ctcttagaagagttcaagagcaacaaagccaagtcttttgaactttcagaaatcgtcgga
catgttgtggagttcagtgcggatcagtatggaagtcgttttattcaacaaaaacttgaa
actgccactatagaagagaaacacatggtttatcaagaaatcatgcctcaagctcttgct
ctaatgactgatgtgtttggtaattacgtgattcaaaagttttttgagcacggatttcca
tctcagagaagggaattggccaacaaactgtttagtcatgtactgacacttagccttcaa
atgtatggttgtcgggtgatccagaaggcaatagaagttgttgatctggaccaaaagatc
aaaatggttgaagaacttgacggtcatgtaatgcgctgcgtacgtgatcaaaatgggaac
catgtcatccagaagtgcattgaatgtgtccctgaagaggccattcattttattatctca
acattttttgatcaagttgtgaccctttcaacccatccatatgggtgtcgtgtgatacag
agagttcttgagcactgcgaagatgagaatacacagagtaaagttatggatgagattcta
ggagctgttagcatgttggcacaagatcagtatggcaattatgttgttcagcatgtcctg
gagcatggaaaaccgcatgaacgctctgctatcataaaagaattagctgggaagatagtc
caaatgagtcagcagaagttcgcctccaatgtagtagagaagtgtttaacttttggcggt
cctgctgaacgtgaattgctagtgaatgagatgcttggcactactgatgaaaatgagcct
cttcaggcaatgatgaaggatcaatttgcaaattatgttgtacaaaaagtgttggagact
tgtgacgaccagcaacgtgaactgattctttcccgaattaaagttcatttgaatgcatta
aagaaatacacttacggaaagcatattgttgctcgtgtagaaaaacttgttgctgctggg
ggtaatcattcttctctttgcctttttattttatgtctgcagactgcatatttgggagca
gcctctccataa
DBGET
integrated database retrieval system