Malus sylvestris (European crab apple): 126595699
Help
Entry
126595699 CDS
T09027
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
msyl
Malus sylvestris (European crab apple)
Pathway
msyl03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
msyl00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
126595699
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
msyl03019
]
126595699
Messenger RNA biogenesis [BR:
msyl03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
126595699
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
S1CSD-TOTE-2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126595699
NCBI-ProteinID:
XP_050117962
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(20336150..20339697)
Genome browser
AA seq
467 aa
AA seq
DB search
MDSDRGKLFIGGISWETSEDKLKEYFSNYGDVLQTVVMRDKISGRPRGFGFVVFVDPAVL
DRVLQDQHTIDGRTVEAKRALSREEQQTTGRVGNANPTRSAGSGGNVRTKKIFVGGLPPT
LSEEGFREYFEAYGHVTDVVVMYDQSTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGSRSMGGGQGGGGAAGGGYQGYGASAGNPNSYDGRMDSNRYMQSQS
TGGGFPPYGSSGYSAPGYGYGPTSNGIGYGSYGSYGGTNTGYGGPAAAAYGNPNAANAAY
ASGPPGAPRSAWSSQPPSGYGAMGYGNTAPWGVSGGSAGTGSGGPGSAPAGQSPSAVAGY
GTQGYGYGGYSATDASYANPSGYGAVGGRSGSVPNNNVGAPGGEQGNAGGYGGSGYGDSN
GNAGYGNAGWRSDPSQASGNYGGPANGGQVGYGGGYGSAQARQSQQQ
NT seq
1404 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattccgatcgggggaagctttttattggtgggatttcatgggagacctcggaggat
aagcttaaagagtacttcagcaactacggcgatgttttgcagacggtggtcatgagggat
aagatctccggccgccccaggggttttgggtttgtggtttttgtagatcctgctgttctc
gatagggttcttcaggatcagcacaccatcgatggtagaacggttgaggctaagagagcc
ctatcaagagaggagcagcaaaccaccgggagagttggaaatgctaatcctactagaagt
gctggaagtgggggaaatgttaggaccaagaagatatttgttggagggttgccccccact
cttagtgaggaaggattccgtgaatattttgaagcttatggccatgtaactgatgtagta
gtaatgtatgaccaaagtactggacgtcctcgtgggtttgggtttatttcatttgacact
gaagaagctgttgatagggttttgcacaagacatttcatgatttaaatgggaagcaagtg
gaagttaagcgggctcttcctaaagatgccaaccctggtgggggtagccgtagcatgggt
ggtggtcaaggtggcggaggtgctgctggaggtggttatcaaggctatggggcatctgct
ggtaacccaaattcatatgatggtcgaatggactccaacaggtacatgcaatcgcagagt
actggaggtgggtttccaccttatggttcttctgggtatagtgcacccggttacgggtat
ggtcctaccagtaatggaattggctatggcagttatggaagttatggaggtactaatacc
ggttatggaggtccagcagctgctgcatacggaaaccctaatgcagcaaatgctgcttat
gctagtggtccaccaggtgcccctagaagtgcatggagctctcaacctccctctggatat
ggtgctatgggttatgggaatactgctccttggggtgtttcaggtggcagtgcaggtaca
ggaagtggtggccccggttctgcacctgctggtcaatcacctagtgcagtggctgggtat
ggaactcaaggttatggttatggtgggtacagtgcaacagatgcatcctatgcaaatcca
tctggatacggtgctgttggaggacgttcggggagtgtcccaaataacaatgttggtgct
ccaggtggggagcaaggtaatgctggtggctacggtggaagtggctatggcgattcaaat
ggaaatgcaggttatggaaatgctggttggagatctgatccatcacaagcttctggaaat
tatggtggtccggcaaatggtggacaagttggttatggtggtggatatggcagtgctcag
gcacggcaatcccagcagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
