Malus sylvestris (European crab apple): 126619096
Help
Entry
126619096 CDS
T09027
Name
(RefSeq) extensin-2-like isoform X1
Organism
msyl
Malus sylvestris (European crab apple)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pollen_Ole_e_1
Extensin_2
HCV_NS4a
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
126619096
NCBI-ProteinID:
XP_050143326
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(3203674..3209065)
Genome browser
AA seq
1351 aa
AA seq
DB search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NT seq
4056 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggagtgtgggcggcggcccctcttggggtcggttttggcctcaaatggcagtggcg
ttagctgccacactggtggtgatttcaagcaatgtgggttcagtagaagcaagtgcttat
ccctactcttcaccaccaccaccaccttacgtttacagctcaccaccaccaccaccatat
gtctacaagtctccaccaccaccatcgccttcaccgccaccgccttatgtctacaagtct
ccgccacctccatcaccatcaccaccaccaccttatgtgtacaagtccccgccaccgcca
tcaccttctccaccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccgtcaccatctcct
ccaccaccatatgagtacaagtctccaccaccaccatcaccgtctcccccaccaccgtat
gagtacaaatcaccacctcctccatcaccctccccaccaccaccatatgtttacaagtct
ccaccaccaccttccccttcaccgccaccaccatattactacaagtctccaccaccacct
tctccctctccacctcctccttactactacaagtctccaccacccccggagtactcccca
ccaccaccatactactacaaatccccaccacctccttctccttcacctcctcccccttac
tactacaaatcaccacccccaccatcaccaaaaccaccaaccccgtactactacaagtct
ccaccacccccagaatactccccaccaccaccatactactacaaatccccaccacctcct
tctccttcacctcctccaccttactactataaatccccacccccaccatcaccaaaatca
ccaaccccatactactacaagtcgccaccacccccagaatactccccaccaccaccatac
tactacaaatccccaccacctccttctccttcacctcctccaccttactactacaaatcc
ccacctccaccatcaccaaaaccaccaaccccatactactacaagtctccaccaccacca
ccaccttcacccaaaccaccaactccatactattacaaatcaccaccaccaccagcccca
aaacccccaaccccatactattacaagtctcctcctccaccctcaccgtatcctccttct
ccttactattacaagtctccaccaccaccaaccccttactactacacttctccaccacca
ccagctccttactatccgaagccaccattggtgaaggttgtcggaagggtctactgctac
agatgctatgactggaagaatccatcgaagtcacacgacaagaagcactccacaggctca
gttgttgtggtaacttgctggaatggcaagaaggaaatcaaggcctacggtaaaactaag
aacaatgggaaattcagcgtagttatccctggctttgagtatggcaaatatggagccaag
gcttgcacggccaagctctacgcagcaccaaagggttcgaaatgcaacattcccactaag
ctaaacaagggtgacaagggtgccaaactcaaagtgaaatccaagactaaatatgaagtt
gtgctcgaggctggcaaattagcttatgcttccaagactccgtacgaggagtgtgaaaag
tccaagccccaatatcctcctccttacgtttacaagtcaccgccaccgcctacgcctact
tacgtctacaagtcaccacctccaccgccacccaagtactactacaagtcaccaccacca
ccggtttactactacaagtcaccaccacctccggcatacgtttacaagtcaccaccacca
ccatcacccaagccaccaaccccatattactacaagtcccctccaccgccatcacccaag
ccgccaaccccatactactacaactctcctcctccaccatcacctaagccaccaacccca
tattactacaagtctcctccaccgccatcacccaagccgccaaccccatactactacaac
tctcctcctccaccatcacccaagccaccaaccccatattactacaagtctcctccaccg
ccatcgcccaagccgccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaag
ccgccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaagccgccaacccca
tactactacaagtctcctccaccgccatcgcctaagccgccaaccccatattactacaaa
tccccaccaccaccatcgcccaagccgccaaccccatactactacaagtctcctccaccg
ccatcgcctaagccgccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaag
ccaccaaccccatattactacaaatccccaccaccaccatcgcccaaaccaccaactcca
tactactacaaatccccaccaccaccatcgcccaagccaccaaccccatactactacaaa
tccccaccaccaccatcgcccaaaccaccaaccccatactactacaaatccccaccacca
ccatcacccaagccaccaaccccatactactacaaatcccctcctccaccatcacccaag
ccaccaaccccatactactacaaatcccctcctccaccatcgcccgaaccaccaactcca
tactactataaatctcctcctcccccatcacccgagccaccaaccccatactactacaaa
tctccaccaccaccatcaccaaaaccaccaacaccatactactacaagtctcctccacca
ccatcacccaagccaccaactccatactactacaagtctcctcctccgccatcacccaag
ccaccaactccatactactacaaatccccaccgccaccatcaccaaaacctccaacccca
tactactacaagtctcctcccccaccaaccccatactactacaaatccccaccaccccca
tccccaaaactaccaaccccatactactacaagtctcctccaccaccgtctcattctccc
ccaccaccatactactacaaatcaccaccaccaccatcaccatcacccccacccccatac
tactacaagtctcctccaccaccgtctccttctctcccacctccatattactacaaatca
ccgccaccaccttcaccttctcctccacctccatactactacaagtctcctccaccacca
tctccttctcccccacccccttattactacaagtctccaccacccccaaaatactcccca
ccaccaccatattattacaaatccccaccacctccttcatcttcacctcctccaccttac
tactacaaatcaccaccaccaccatcaccatcacctccacccccttactattacaagtct
cccccaccaccttcaccttctcccccacctccatactactacaagtcccctcctccaccc
tcaccgtctcccccaccaccctactactacaaatctccacctccaccatcaccctcccct
cctctcccttacatctacaaatccccaccacccccagaatactcaccaccaccaccatac
tactacaaatctccacctccaccatcaccgtctcctcctcccccttacatctacaaatct
ccaccacctccagaatactcaccaccaccaccatactactacaaatccccaccacctcct
tcttcttcacctcctccaccttactactacaaatcaccaccaccaccatcaccctcccct
cctcccccttacatctacaagtctccaccaccaccttcttcatctccaccaccaccatac
aaatacaactcaccaccaccaccttccccatctcctccactgccatacaaatacaactcc
ccaccaccaccttccccatctcctcctccaccatacaaatacaattccccacccccacct
tccccatcacctcctccaccatacaaatacaactccccaccaccaccatcaccctctcct
cctccaccttacatctacaagtcccctccacctccggtggaaacaccaccgccggtttac
atttatggatctcccccacctccaattcattattaa
DBGET
integrated database retrieval system