KEGG   Mesoplasma syrphidae: CXP39_00930
Entry
CXP39_00930       CDS       T05255                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
msyr  Mesoplasma syrphidae
Pathway
msyr03030  DNA replication
msyr03430  Mismatch repair
msyr03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:msyr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    CXP39_00930
   03430 Mismatch repair
    CXP39_00930
   03440 Homologous recombination
    CXP39_00930
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:msyr03032]
    CXP39_00930
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:msyr03400]
    CXP39_00930
Enzymes [BR:msyr01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     CXP39_00930
DNA replication proteins [BR:msyr03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     CXP39_00930
DNA repair and recombination proteins [BR:msyr03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     CXP39_00930
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger HHH_6 PHP tRNA_anti-codon tRNA_anti_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AUF83369
UniProt: A0A2K9C1L7
LinkDB
Position
212684..215647
AA seq 987 aa
MRYSPQFNIRSAYNFQQSFIKIDDYISFAQTHNFEYLFYSELRTMFGVAEFIKKARAANL
KPIIGLSIDINESIINLYPKTRQGYQQINRISANLNDGKNYNNDEIVNMIFENLNLEIIV
VSNLSNEINLKLSSRILSDDFYDVKKLKLFFNEINYFDIGDEDDYYALVALKNNLLINEV
PLLQPTNYWDDSEISQQYSLSKTSQVAQEIYQKVKFELFDNSELHLIAFKAPQNIPSDKY
LEKICFSSLENYFKFVKRKEIPNTYTERLNYELKIIFSMGFENYFLVVWDYVKYAKERNI
LVGPGRGSAAGSLVAFLLQITQVDPIAYNLLFERFLNPERITMPDIDIDFQDDRREEVIE
YLFEKYGLYNVATITTYQSIGVKSAIRDVARVHGLDLNIVNTITKQIPSIFLNDLDGAIK
SNTKLKQYFDEYTHIFKTVKKLIGLPRQTGTHAAGVILVDNDLRDYVPIKVGYNGIYQTQ
FDMNHLEELGLIKMDLLGLRNLTTLQEIRYAIYRNRKQNVIFAKIPLNDKQTFAMLAQGN
TSGIFQLESPGMTKVIKNMQVANIEDISAASALFRPGPQEMIPEYIKRKNSSNKNYLIDS
SLGDILNSTYGIIVYQEQVIQILQRVANFSLGKADIVRRAMGKKNHQYMLSVKTEFLQGA
VANKYTIEKAEEIWNWIDRFAAYGFNKSHSIAYSYISYWLAYFKTHYTEEFYCSLLNGVI
GNAEKTSQYLKEIAQYGVQVRLPSVKNVNYSYVGKSKQIFMPLILIKGIGKDFIKRIRLL
FEEDHSAFDSIFSFVTRMINNGLNKTNYLVLAKAGAFDIFGYNRQTLIDNMELIIAFAEF
NYGVKKLDPLTYPLLEETEIQNEIISEYEKEIYGFYLTSHPITKIKIDNAGLKPTDINKA
KSFKGYSNVIGYVAMIRTKKDKNNQEMAFLNLIDDTDEIDITIFAGTYQKIKYDLQAGII
LGLEIQTEEYQGKISGKLNRIIKVIKK
NT seq 2964 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagatattcaccgcagtttaatattcgcagcgcatataattttcagcaatcattcata
aaaattgatgattacatttcgtttgctcagactcataattttgaatatttgttttattct
gaattgagaacaatgtttggagtggctgaatttattaaaaaagcaagagcagcaaatctt
aagccaattattggattatcaattgacataaacgaaagcatcattaacttgtatcctaaa
acacgtcaagggtatcaacaaattaaccggatttctgctaatttaaatgatggcaaaaat
tataataatgatgaaattgtaaatatgatttttgaaaatcttaatttggagatcattgta
gtttccaacttatccaatgaaattaatttaaaactatcaagtagaattttatctgatgat
ttttacgatgttaaaaaactcaagttattctttaatgaaattaattattttgacattgga
gatgaagatgattattatgctttagtggctttaaaaaataacttgttgattaatgaagtt
ccgcttctgcaaccaactaattattgagatgattcagagatttctcaacagtattcttta
agtaagacttctcaagtagcacaagagatttatcaaaaagtgaaattcgagttatttgat
aatagtgaacttcacttaattgctttcaaagctccgcaaaatattccatcagataaatac
ttggaaaaaatatgtttttcgtcgttagagaattactttaaatttgttaaacgtaaggaa
atccccaatacctatactgagcgtttaaattatgaattaaaaattatttttagcatgggt
tttgaaaattattttttggtagtttgagattacgtaaaatatgctaaagaaagaaatatt
ttagttggcccaggccgcggaagtgctgcaggttcattagtagcatttctactacaaatt
actcaagttgacccgatagcatataacttactatttgaacgttttttaaatccagagaga
ataacaatgccggatattgatattgattttcaagatgaccgtcgagaagaagtaattgaa
tatttatttgaaaaatatggtttatacaatgttgctaccattactacatatcaatcaatc
ggagttaaatcggcaattcgtgatgttgctagggttcatggactggatttaaatattgtt
aacactattactaaacaaattccatcaatttttttaaatgaccttgatggagcaattaaa
agtaatactaaattgaaacagtattttgatgagtatacccatatttttaagacagtcaaa
aagctaattggattgccacgtcaaactggaactcatgcggctggagtaattcttgtagat
aatgatttacgagattatgtgccgattaaagtcggctacaatggaatttatcaaactcaa
tttgatatgaatcatttagaagaacttggattaattaaaatggatttactgggattacgt
aacctaacaacattgcaagaaattcgttatgcaatttatcgaaatcgcaaacaaaatgtt
atttttgcaaaaattccgttgaatgataagcaaacatttgcaatgttggcacagggaaac
acgtcaggaatttttcagcttgagtcaccaggaatgacaaaggttattaaaaatatgcaa
gtggccaatattgaagatatttctgcggcttcagctttatttaggcctggacctcaagag
atgattcctgaatatattaaacgcaaaaactcaagcaataaaaattatttaattgattcg
agcttaggtgatatattaaattcaacttatggaattattgtttatcaggagcaagttatt
caaattcttcaacgtgttgctaatttttcattgggaaaagctgatattgttcgtcgagca
atgggaaaaaagaatcatcaatacatgctttcagtaaaaacagaatttttacaaggagca
gttgcaaataagtacactattgaaaaagctgaagaaatatggaattgaattgatcgtttt
gcagcttatggatttaacaaatctcattcaattgcttattcatatattagttattgattg
gcctattttaaaactcattatacagaagagttttattgctcattactcaatggagtgatt
ggaaacgctgaaaaaacttcacagtacttaaaagaaattgctcaatatggagtacaagtt
agactgccaagtgttaaaaatgttaattatagctatgttggtaagagtaaacaaattttc
atgccgttaattttaattaagggaattggcaaagattttattaaaagaattcgtctatta
tttgaagaagatcattcggcatttgattcaatcttttcatttgttacacgaatgattaat
aatggtttgaataaaactaattatttagtgttggcaaaagctggagcatttgatattttt
ggttacaatcgtcaaactttaattgataatatggaattaattattgcgtttgcagaattt
aattacggtgttaaaaagttagatccgttaacctaccctttgctagaagaaacagaaatt
caaaatgaaattatttctgaatatgaaaaagaaatttatgggttttatttaacatctcat
ccaataacaaaaattaaaattgataatgccggtttaaaaccaacagatattaataaggca
aagtcattcaaaggatatagtaatgttattggatatgttgcaatgataagaactaaaaaa
gataaaaataatcaggaaatggcatttttaaatttaattgatgatactgatgaaattgac
attacaatctttgcaggaacataccaaaaaattaaatatgacttacaagctggaataatt
ttgggattggaaattcaaactgaggaatatcaaggtaaaattagtggtaagttgaatcga
attattaaagtaataaaaaagtag

DBGET integrated database retrieval system