Mesoplasma tabanidae: MTABA_v1c06220
Help
Entry
MTABA_v1c06220 CDS
T05273
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
KO
K12574
ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mtab
Mesoplasma tabanidae
Pathway
mtab03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mtab00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
MTABA_v1c06220 (rnj)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mtab03019
]
MTABA_v1c06220 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:
mtab03019
]
Prokaryotic type
Bacterial mRNA degradation factors
RNA degradosome components
Ribonucreases
MTABA_v1c06220 (rnj)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNase_J_b_CASP
RNase_J_C
Lactamase_B
Lactamase_B_2
RMMBL
Shikimate_DH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATZ21814
UniProt:
A0A2K8P4Y3
LinkDB
All DBs
Position
712336..714102
Genome browser
AA seq
588 aa
AA seq
DB search
MEKEKITSTNQIIEKEDFEPFVFKQKEVQRKYIKTESPTKVFALGGLEEIGKNTYCIEHE
NEIIMIDAGVKFPDDSMLGINAVIPDYSYLKENESKIKALFITHGHEDHIGGIHYLVKQV
NIPVIYAPELAAALIRDRLKEHKLTDKTIVKEYVADDIWATKNLRVSYAALNHSIPDAFG
ILVETPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELSKLASMGDKGIELLMSDSTNAEVEGYTPGEK
GIIENIDKLFLKAKGRIFITTFASNVHRIQQIVELANKYDKKVVILGRSIERIIKIIRQM
GHLKINDKMFIKANDIEKHPANKIMIISTGSQGEPMAALSRIATNRHQSISIIPGDTVIF
SSSPIPGNRADVEILINRLTRIGANVIESSPSNRIHTSGHASQEEQKLLFTLLRPNYFMP
MHGEFRMLKKHIETAESVNLKQGNGFVMANGDQLELLQGNAQIGKRVDADAIYVDGKDMT
AHASNIIRERDILSKDGLISVVVSIDSQTNKLLCAPRIISRGSFYVKDSGNVISEAITIV
TEAINEVLNSSKPTFGAIKKAIKQSLSPYIFKTKRRNPLIIPVILNKK
NT seq
1767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaggaaaaaataacttctacaaatcaaattattgaaaaagaggattttgaacct
tttgtttttaaacaaaaagaagttcaaagaaaatacattaaaactgaatctccaactaaa
gtttttgctttaggtggacttgaagaaattggtaaaaacacttattgtatagagcatgaa
aatgaaattatcatgatagatgctggagttaagtttccagatgattcaatgcttggaatt
aacgctgttattcctgattactcatatttaaaggaaaatgaatcaaaaattaaagcatta
tttattactcatggtcatgaagaccatataggtggaatacattatttagttaaacaagtt
aatatacctgttatttatgcgcctgagttagctgctgctttaattagagacagattaaaa
gaacacaaattgacagataaaacaattgttaaagaatacgttgctgatgatatctgagca
actaaaaatttaagagttagttatgctgcattaaaccactctattcctgatgcttttggg
attttagtggaaactccaaatggaaatattttttcaacaggagattataaatttgactga
tcacctttaggtcattttgctgaattaagtaaattagcaagtatgggtgataaaggaatt
gaacttttaatgtcagactcaactaacgctgaagttgaaggttatacgcctggtgaaaaa
ggaattattgaaaacattgataaacttttcttaaaagctaaaggtagaatttttattaca
acttttgcttctaatgttcaccgtattcaacaaattgttgagctagctaataaatacgat
aagaaagttgttattttaggtagatcaattgaaagaattatcaaaattattcgtcaaatg
gggcatttaaaaattaatgacaaaatgtttattaaggctaatgacatagaaaaacaccca
gcaaacaagataatgattatttcaacaggtagtcaaggtgaaccaatggctgcactttca
agaattgctacaaatagacatcaatctatttcaattattcctggagatactgttattttc
tcatcatcaccaattcctggtaacagagctgatgttgaaattttaattaatcgcttaaca
agaataggtgctaatgttattgaatcttcaccaagcaatagaattcatacttctggtcat
gctagtcaagaagagcaaaaattattgtttacattattaagacctaactatttcatgcca
atgcatggtgaatttagaatgctaaaaaaacatattgaaactgctgaatcagttaacctg
aaacaaggtaatggatttgtaatggctaatggtgatcaattagaattattacaaggtaat
gctcaaattggaaaacgtgtagatgctgatgctatttatgtagacggtaaagatatgact
gcacatgcttcaaatataattagagaacgcgacatattaagtaaagatggtttaatatca
gttgttgtttcaattgattctcaaactaataaattattatgtgcacctagaattatttca
cgtggaagtttttatgtaaaagattcaggaaatgttattagtgaagctatcacaattgtt
actgaggctataaatgaagtattgaattcttcaaagccgacttttggagcaattaaaaaa
gcaattaaacaatcactttcgccttatattttcaaaactaaacgtagaaatccgctaatt
attccagttatattaaacaaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system