KEGG   Mesoplasma tabanidae: MTABA_v1c06220
Entry
MTABA_v1c06220    CDS       T05273                                 
Symbol
rnj
Name
(GenBank) ribonuclease J
  KO
K12574  ribonuclease J [EC:3.1.-.-]
Organism
mtab  Mesoplasma tabanidae
Pathway
mtab03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mtab00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    MTABA_v1c06220 (rnj)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mtab03019]
    MTABA_v1c06220 (rnj)
Messenger RNA biogenesis [BR:mtab03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Ribonucreases
     MTABA_v1c06220 (rnj)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_J_b_CASP RNase_J_C Lactamase_B Lactamase_B_2 RMMBL Shikimate_DH
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATZ21814
UniProt: A0A2K8P4Y3
LinkDB
Position
712336..714102
AA seq 588 aa
MEKEKITSTNQIIEKEDFEPFVFKQKEVQRKYIKTESPTKVFALGGLEEIGKNTYCIEHE
NEIIMIDAGVKFPDDSMLGINAVIPDYSYLKENESKIKALFITHGHEDHIGGIHYLVKQV
NIPVIYAPELAAALIRDRLKEHKLTDKTIVKEYVADDIWATKNLRVSYAALNHSIPDAFG
ILVETPNGNIFSTGDYKFDWSPLGHFAELSKLASMGDKGIELLMSDSTNAEVEGYTPGEK
GIIENIDKLFLKAKGRIFITTFASNVHRIQQIVELANKYDKKVVILGRSIERIIKIIRQM
GHLKINDKMFIKANDIEKHPANKIMIISTGSQGEPMAALSRIATNRHQSISIIPGDTVIF
SSSPIPGNRADVEILINRLTRIGANVIESSPSNRIHTSGHASQEEQKLLFTLLRPNYFMP
MHGEFRMLKKHIETAESVNLKQGNGFVMANGDQLELLQGNAQIGKRVDADAIYVDGKDMT
AHASNIIRERDILSKDGLISVVVSIDSQTNKLLCAPRIISRGSFYVKDSGNVISEAITIV
TEAINEVLNSSKPTFGAIKKAIKQSLSPYIFKTKRRNPLIIPVILNKK
NT seq 1767 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaaaaggaaaaaataacttctacaaatcaaattattgaaaaagaggattttgaacct
tttgtttttaaacaaaaagaagttcaaagaaaatacattaaaactgaatctccaactaaa
gtttttgctttaggtggacttgaagaaattggtaaaaacacttattgtatagagcatgaa
aatgaaattatcatgatagatgctggagttaagtttccagatgattcaatgcttggaatt
aacgctgttattcctgattactcatatttaaaggaaaatgaatcaaaaattaaagcatta
tttattactcatggtcatgaagaccatataggtggaatacattatttagttaaacaagtt
aatatacctgttatttatgcgcctgagttagctgctgctttaattagagacagattaaaa
gaacacaaattgacagataaaacaattgttaaagaatacgttgctgatgatatctgagca
actaaaaatttaagagttagttatgctgcattaaaccactctattcctgatgcttttggg
attttagtggaaactccaaatggaaatattttttcaacaggagattataaatttgactga
tcacctttaggtcattttgctgaattaagtaaattagcaagtatgggtgataaaggaatt
gaacttttaatgtcagactcaactaacgctgaagttgaaggttatacgcctggtgaaaaa
ggaattattgaaaacattgataaacttttcttaaaagctaaaggtagaatttttattaca
acttttgcttctaatgttcaccgtattcaacaaattgttgagctagctaataaatacgat
aagaaagttgttattttaggtagatcaattgaaagaattatcaaaattattcgtcaaatg
gggcatttaaaaattaatgacaaaatgtttattaaggctaatgacatagaaaaacaccca
gcaaacaagataatgattatttcaacaggtagtcaaggtgaaccaatggctgcactttca
agaattgctacaaatagacatcaatctatttcaattattcctggagatactgttattttc
tcatcatcaccaattcctggtaacagagctgatgttgaaattttaattaatcgcttaaca
agaataggtgctaatgttattgaatcttcaccaagcaatagaattcatacttctggtcat
gctagtcaagaagagcaaaaattattgtttacattattaagacctaactatttcatgcca
atgcatggtgaatttagaatgctaaaaaaacatattgaaactgctgaatcagttaacctg
aaacaaggtaatggatttgtaatggctaatggtgatcaattagaattattacaaggtaat
gctcaaattggaaaacgtgtagatgctgatgctatttatgtagacggtaaagatatgact
gcacatgcttcaaatataattagagaacgcgacatattaagtaaagatggtttaatatca
gttgttgtttcaattgattctcaaactaataaattattatgtgcacctagaattatttca
cgtggaagtttttatgtaaaagattcaggaaatgttattagtgaagctatcacaattgtt
actgaggctataaatgaagtattgaattcttcaaagccgacttttggagcaattaaaaaa
gcaattaaacaatcactttcgccttatattttcaaaactaaacgtagaaatccgctaatt
attccagttatattaaacaaaaaataa

DBGET integrated database retrieval system