Mycobacterium tuberculosis CCDC5180: CCDC5180_1526
Help
Entry
CCDC5180_1526 CDS
T01992
Name
(GenBank) polyketide synthase
KO
K12435
polyketide synthase 8
Organism
mtl
Mycobacterium tuberculosis CCDC5180
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mtl00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01004 Lipid biosynthesis proteins [BR:
mtl01004
]
CCDC5180_1526
Lipid biosynthesis proteins [BR:
mtl01004
]
Others
Multifunctional type
CCDC5180_1526
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Acyl_transf_1
Ketoacyl-synt_C
PKS_DH_N
PS-DH
KAsynt_C_assoc
SpnB_Rossmann
ADH_zinc_N
ADH_N
CurL-like_PKS_C
ADH_zinc_N_2
Thiolase_N
Docking
RhiE-like_linker
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEJ50363
LinkDB
All DBs
Position
1871594..1876402
Genome browser
AA seq
1602 aa
AA seq
DB search
MSGTTTHVDYLKRLTADLRRTRRRLSDLEAKLSEPVAVVGMGCRYPGGVDSPETLWELVA
QGRDAVSDFPADRGWDVDGLFDPDPDACGKMYTRRGTFLEHAGDFDAGFFGIGPSEALAM
DPQQRLLLEVSWEALERTGIDPTKLRGSATGVFAGVIHAGYGGQLSGELEGYGLTGSTLS
VASGRVAYVLGLEGPAVSVDTACSSSLVALHLAVQSLRSGECDLALAGGVTVMATPAAFV
EFSRQRALARDGRCKVYAGAADGTAWSEGAGVLVVERLVDARRLGHPVLALVRGSAVNQD
GASNGLTAPNGPSQQRVIRAALASARLRAVEVDVVEGHGTGTMLGDPIEAQALLATYGQD
RVEPLWLGSIKSNIGHTSAAAGVAGVIKMVQAMRHGVMPKTLHVDVPTPHVDWSVGAVSL
LTQPRAWSVHGRPRRAGVSSFGISGTNAHVILEQAPVVESVVPEVASPTAASAVPWVLSA
RSEQALAGQAQRLLAFVAANPDLDPIDVGWSLVKTRAMFEHRAVVVGADRGALLAGLAAL
AAGESGAGVAVGRARSVGKTVFVFPGQGAQWVGMGAQLYAELPLFALAFDAVAEELDRHL
RLPLRNVLWEGDEALLTSTEFAQPALFAIEVALATLLQHWGISPDFLIGHSVGEIAAAHL
AGVLSLTDAAGLVAARGRLMAELPAGGVMVVVAASEEEVLPVLVDGANLAAVNAPHSVVV
SGCEAAVSDIADHFARRGRRVHRLAVSHAFHSLLMEPMLAEFTRIAAGISVSKPRIPLVS
NVTGQMAGAGYGDGQYWVEHARRPVRFAEGVQLLNAVGATRFVEVGPGGGLTALVEQSLP
LGEALSVAMMRREHPEVSSVLGAVATLFTAGAQMDWPAVFGSPGRRIELPTYAFQRQRYW
LPPTSAGSADISGVGLLAARHGLLGAVVEQPDSDVVVLTGRLSVGEQRWLADHVIAGVVL
LAGAAFVELALRAADQVDCGVVEELTVVTPLVLPTVGGVQLQVVVGVGEMGQRPVSIYSR
NAESDSGWVLHARGVLGAKAVAPAADLSVWPPLGAAPVDVDGAYQRFAELGYEYGRAFQG
LTAMWRRESELFADVAVPDDVDVTLSGFGIHPLVLDAALHAMGMVGEQAATMLPFSWQGV
SLHAAGASRVRARIAPAGDGTVSVELADQAGLPVLSVQALVMRSVSSQLLSAAVAAADAA
GRGLLEVAWLPVELAHNDISADLVVWEVESFQDGVGPVYSATHRVLVALQSWLAQERAGR
LVVLTQGSVGQDATNLAGAAVWGLVRSAQAEHPGRVMLVDSDGSMDVGDVIGCGEEQLMI
RNGTAYAARLAQLRPQPILQLPDTNSGWRLVAGGAGTLEDLTLASCPAKELAPGQVRIEV
RALGVNFRDVLVALGIYPGAAELGAEGAGVVTEVGPGVTGLAVGDPVMGLLGVAGSEAVV
DARLVVKLPNRWPLTDAAGVPVVFLTAYYALRVLAQVQPGESVLVHAAAGGVGMAAVQLA
RLWGLEVFATASRGKWDTLHTMGCDNTHVADSRTLAFEETFWLTTEGRGVDVVLNSLAGE
FTDASLRLLPRGGRFIEMGKTEFGTPRSLPRTILGWPTGLST
NT seq
4809 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcgggaaccaccacgcatgttgactacctgaagcgtctcacggcagatctgcggcgc
acccgcagacgcctgtccgacttggaagccaagttgtccgagccggttgcggtggtcgga
atgggatgccgttatccaggtggggtggattcgccggagacgttgtgggagctggtggcc
cagggccgtgatgcggtatcggattttccggcggatcgcgggtgggatgtggacgggttg
tttgatcctgacccggatgcatgcgggaagatgtatacccgccgcgggacgtttctggag
catgcgggtgacttcgacgccggattctttggaatcggtcctagcgaggcgctggcgatg
gacccgcaacagcgcctgctattggaagtgtcgtgggaagcgttggagcgtacgggaatt
gacccgaccaagttgcggggttcggcaacgggtgtgttcgccggtgttatccatgccggc
tatgggggccagctatccggcgagctggaaggctatgggttaacgggttcgacgctgagt
gtggcctccgggcgggtggcgtatgtgctggggttggagggtccggcggtgtcggtggac
acggcgtgctcgtcgtcgttggtggcgctgcatttggcggtgcagtcgctgcggtcgggg
gaatgcgatttggcgctggccggtggggtgacggtgatggccacccccgccgcattcgtc
gagttcagccggcagcgggcgctggcgcgcgacggtcggtgcaaggtatacgccggtgcc
gccgacgggaccgcgtggtcagaaggcgccggggtgctggtggtggagcggctggtggat
gcacggcggttggggcatccggtgctggccctggtgcgcggatcggcggtcaatcaggac
ggcgcctccaacggtttgacggcacccaatgggccatcccagcagcgggtgattcgggcg
gcgttggccagtgcgcgactgcgcgcggttgaggtggatgtggtcgaggggcacgggacc
gggaccatgctgggggatccgattgaggcgcaggcgcttttggcgacctacggtcaggac
cgcgttgagcccctgtggttggggtcgatcaaatcgaacatcggtcatacatcggcggcg
gcgggggtggccggggtgatcaagatggtgcaggcgatgcggcatggggtgatgcccaag
acattgcatgtggatgttcctacgccgcatgtggattggtcggtgggggcggtgtcgttg
ttgactcaaccgcgggcgtggtcggttcacggccggccgcggcgggccggggtgtcgtcg
ttcgggatcagcggcaccaatgcgcatgtgattcttgagcaggcaccggtagttgaaagt
gttgtgccagaagttgcatccccaacagcggcgtccgccgtgccgtgggtgctgtcggcc
cggtcggagcaggcgttggccggtcaggcgcagcggctgctggctttcgtcgcggccaac
ccggatttggatccgatcgatgtggggtggtcgttggtcaagacgcgggcgatgttcgag
catcgggcggtggtcgtgggtgctgatcgcggggccctgctggcggggttggcggcgttg
gccgctggtgagtcgggtgcgggcgtggcagtgggtcgagcgcggtcggtggggaagacg
gtgttcgtgtttcccgggcaaggggcccaatgggtaggcatgggagcgcagttatatgcc
gaattacccctgttcgccctggcttttgacgcggtggccgaagagctggatcggcacctg
cggctgccgctgcgaaacgtgctctgggaaggtgacgaggcgctgttgactagcaccgag
ttcgcccagccggcgttattcgcaatcgaagtggcgttggcaacgttgttgcagcactgg
ggtatcagcccggatttcctgatcggacattcggtgggcgagatcgcggcagcacatttg
gccggggtgttgtcgttgaccgatgcggcgggtttggtggctgcccgcggcaggttgatg
gcggagttgcccgccggtggggtgatggtggtggtggccgccagcgaagaagaagtgctg
ccagtgctggtcgacggggcgaatctcgcggcggtcaacgcgccgcactcggtggtggtt
tcagggtgcgaggcagcggtcagcgatattgccgatcactttgcccgcaggggccgccgg
gtgcatcggctagcggtatcacatgcgtttcattcgttgctgatggaaccgatgcttgcc
gagttcacgcggatcgctgccggtatttcggtgtcgaaaccgcggattccgttggtgtcc
aatgtgaccgggcagatggccggcgcaggctacggcgatggacagtactgggtggagcat
gcgcggcgccccgtgcgatttgccgagggcgtccagttgctgaatgcggttggggccaca
aggtttgttgaggtgggtcccggcggtggcctgacagcattggtcgagcagtcgctgcct
ttaggcgaggcgctatcggtggcgatgatgcgtagagagcaccccgaagtgtcgtcggtg
ctcggcgccgtggcgacattgttcactgcgggtgcccaaatggattggccggcggtgttt
ggcagtccgggtcgacggatcgaattgccgacctatgcgtttcagcggcagcggtattgg
ttgccgcctacgtcggcgggttcggcagacatcagcggtgttggtctgctggcagcccgg
catggtttgttgggtgcggttgtggagcaaccggattcggacgtggtggtactgaccggc
cggctatcggtgggggagcagcggtggttggccgatcacgtgatcgctggagtggtgttg
ctcgccggtgcggctttcgtggaactggcgctgcgagccgccgaccaggtggattgtggg
gtggtcgaggagctgacggtggtgactccgttggttttgccgacggtgggcggggtgcag
ctacaggtggtggtgggtgtcggtgagatgggtcagcggccagtgtcgatatattcacgc
aacgctgagtcggattccgggtgggtgttgcatgcccggggcgtattgggggcaaaggcg
gttgccccggcagcggatttgtcggtgtggccgccgctgggtgctgccccggttgatgtc
gatggcgcctatcagcgattcgccgaactgggctatgaatatggccgggcgtttcagggt
ctgacggccatgtggcggcgggaatcggagctcttcgccgatgttgccgtccccgacgat
gtcgatgtgacgttgagtgggttcggaattcacccactggtgctggatgcggccttgcat
gcaatgggcatggtgggcgagcaggcagctaccatgctgcccttctcctggcaaggggtc
tccctgcatgccgcgggtgcgtcccgggttcgggcgcggatcgcgccggccggtgatggc
acggtgtcggtggagttggccgatcaggcggggttaccggtgttgtcggtacaggcattg
gtcatgcgttcggtgtcgtctcagctgttgtcggcggccgtcgccgctgccgatgccgca
ggtcgcgggttgttggaagtggcgtggttgccagtggaattggcgcacaacgacatcagc
gccgacctcgtggtctgggaggtggagtctttccaggacggtgtgggtccggtgtattcg
gctacgcatcgggtgttggtggcattgcagtcctggctggcccaggagcgggccggccga
ctggtggtgctgacccaagggtcggtcggccaggatgccacgaacttggccggcgccgcg
gtgtgggggttggtgcggtcggctcaagccgaacatccgggtcgggtgatgttggtcgat
tcggacggctcgatggatgttggagatgtcattggctgtggtgaagagcaattgatgatc
cggaacggcacagcctatgccgcccggctggcacagcttcgaccacagccgatcctgcag
ttgcccgataccaactcgggctggcggttggtcgccggcggcgcgggcacccttgaggat
ttgacgttggcatcatgccctgcaaaggaattggcacctggacaggttcgaatagaggtg
cgggctttgggtgtcaatttccgggatgtgttggtggcgttgggaatatatcccggtgcc
gcggagttgggggccgaaggggcaggggtggtcaccgaagtcggtccaggcgtgaccggt
ttagcagttggtgatccggtgatgggtctgttgggggtggcggggtcggaagcggtggtc
gatgcgcggctggtggtcaagctgccgaaccggtggccgctgaccgatgctgcgggtgtg
ccggtggtgtttctgacggcctactacgcgttacgcgtgctggcgcaggtgcagccgggc
gagtcggtgctggtacacgccgctgcgggcggggtgggtatggcggcagtgcaactggct
cggctgtggggattggaggttttcgctactgccagtcgcggcaagtgggacacgttgcac
acaatgggatgtgacaacacgcatgttgccgattcacgcacactggcattcgaggagacg
ttttggctgaccaccgagggtcgcggcgtggatgtggtgctcaactcgctggccggtgag
ttcaccgacgcatcgttgcggttactgccgcgaggcggtcgcttcatcgagatgggcaaa
accgagttcgggacgcccaggtcgttgcccaggaccatcctggggtggcctaccgggctt
tcgacttga
DBGET
integrated database retrieval system
