Medicago truncatula (barrel medic): 11407644
Help
Entry
11407644 CDS
T01716
Name
(RefSeq) probable beta-D-xylosidase 2
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_3_C
Glyco_hydro_3
Fn3-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11407644
NCBI-ProteinID:
XP_003591420
UniProt:
G7IDS0
LinkDB
All DBs
Position
1:42884570..42888424
Genome browser
AA seq
765 aa
AA seq
DB search
MDSILITIVFLLLLMSSEARDPFACDPKNTSTNNFPFCKASLPIPTRVNDLIGRLTLQEK
VSMLVNNAAAVPRVGIKGYEWWSEALHGVSNVGPGTKFAGQFPAATSFPQVITTVASFNA
SLWEAIGRVASDEARAMYNGGTAGLTYWSPNVNIFRDPRWGRGQETPGEDPILAGKYAAS
YVRGLQGTDSSRLKVAASCKHFTAYDLDNWNGVDRFHFNAKVSKQDMEDTFNVPFRMCVK
EGNVASVMCSYNQVNGVPTCADPNLLKRTIRGQWHLDGYIVSDCDSVGVFYTNQHYTSTP
EEAAADAIKAGLDLDCGPFLAQHTQNAVKKGLLTETDVNGALANTLTVQMRLGMFDGEPS
AQPYGNLGPTDVCTPTHQELALDAARQGIVLLKNTGPSLPLSTKNHQTVAVIGPNSNATV
TMIGNYAGIACGYTSPLQGIGKYARTIHEPGCANVACNDDKQFGSALNAARQADATVLVM
GLDQSIEAEMVDRTGLLLPGHQQDLVSKVAAASRGPTILVLMSGGPIDITFAKNDPRIMG
ILWAGYPGQAGGAAIADILFGTTNPGAKLPMTWYPQGYLKNLAMTNMAMRPSSSTGYPGR
TYRFYNGPVVYPFGYGLSYTNFVHTLASAPKVVSVPVDGHRRGNSSNKAAIRVTHARCGK
LSIRLDIDVKNVGSKDGTNTLLVFSVPPTGNGHWAPQKQLVAFEKVYVPAKAQQRVRINI
HVCKLLSVVDKSGTRRIPMGAHSIHIGDVKHFVSLQEQKLGIIKT
NT seq
2298 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcgatcctcatcaccattgtatttctccttctcttaatgagtagtgaagcacgt
gacccttttgcatgtgacccaaaaaacacctccacaaataactttccattttgcaaggca
tcactgcctataccaacaagggtgaatgacctcattggaagattgacattgcaagaaaag
gttagcatgttggtgaacaatgctgccgcggttccaagggttgggatcaaaggctatgag
tggtggtcagaggctcttcatggagtttcaaatgtgggaccaggaactaagtttgctggc
caattcccagctgccactagcttccctcaagtcatcactaccgttgcttcattcaatgct
tccttgtgggaagcaattggacgggttgcttcggacgaagcaagggcaatgtacaacgga
ggaacggcagggttgacatattggagtccaaatgtgaacatttttcgggacccacgatgg
ggtcgtggacaggagactcccggtgaggatccaattctagcaggtaaatacgctgccagt
tatgtgagaggactacagggaacagacagtagccggttaaaggtggctgcttcatgtaaa
cactttaccgcttatgatctcgataattggaatggtgtggatcgctttcactttaatgca
aaggttagcaaacaggacatggaagacacgttcaatgtgccatttaggatgtgtgtgaag
gaaggtaatgtggctagtgtgatgtgttcttacaatcaggttaatggtgtccctacttgt
gctgaccccaatcttctaaagagaacaattcgtggtcaatggcatcttgatgggtacatt
gtatcagattgtgactctgttggggtattttacactaaccaacattatacatcaacacca
gaagaagctgctgctgatgccattaaagcaggtttggatttggattgtggacctttcctt
gcacaacatacccaaaatgctgttaaaaaaggcctgttaaccgaaactgatgtaaatggt
gctttggcaaacacacttacagtccaaatgaggttaggaatgtttgatggtgagccatca
gctcaaccatatggcaaccttggtccaactgatgtgtgcactccaactcaccaagagcta
gctcttgatgctgcaagacaaggaattgtgcttcttaagaacactggtccttctttgcct
ctctccacaaagaatcatcagactgtggcagtaattgggcctaattctaatgctactgtc
accatgatcggcaactatgctggtattgcttgtggatacacaagtccactacaaggaata
gggaaatatgcaaggactattcacgagcccggttgtgcgaatgtggcatgcaatgatgat
aaacaatttgggtcggctctaaatgcagcccgtcaagcggatgctactgttctagtgatg
ggattggatcagtcaattgaggctgaaatggtagataggactggtttacttcttcctgga
catcaacaagaccttgtttcaaaggtagcggctgcctcgagaggcccaaccattttggtc
ttaatgtctggtgggcctatagatataacttttgcaaagaatgatcctcgaattatgggc
attttgtgggctggttatcctggtcaagccggtggtgctgccattgcggatatattgttt
ggaaccactaacccaggagctaagctacctatgacatggtacccacaaggttacctcaaa
aacttggcaatgacaaatatggcaatgagaccaagctcatccacagggtaccctgggaga
acctatcgtttttacaacggccctgtggtatatccatttggttacggattatcttacaca
aactttgttcacacattagctagtgcaccaaaagtggtgtcagttccagtagacggacac
cgccgtggaaacagctcaaacaaagcagcaattagagtgacacatgcacgatgtggcaag
ctttcaattagacttgacattgatgttaaaaacgttggttcaaaagatggtactaacact
ttgttggtgttctcagtaccacctacaggtaatggtcattgggcaccacagaagcaacta
gtggcttttgagaaagtttatgttcctgctaaggctcagcaacgagtgaggatcaatatt
catgtatgtaagcttttgagtgtggttgataagtctgggactaggagaattccaatggga
gcacatagtattcacattggtgatgttaaacattttgtatcacttcaagaacaaaaacta
gggatcatcaagacctga
DBGET
integrated database retrieval system