Medicago truncatula (barrel medic): 11417028
Help
Entry
11417028 CDS
T01716
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62930, chloroplastic isoform X1
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR_1
PPR
PPR_3
TPR_24
MSC6_N
PPR_long
MRP-S27
ECSIT_N
Clathrin
AEP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11417028
NCBI-ProteinID:
XP_013447397
UniProt:
Q1SMZ4
LinkDB
All DBs
Position
8:complement(49352599..49357787)
Genome browser
AA seq
695 aa
AA seq
DB search
MLNPIRYAIPKFSISSRFFGHFQPQNPHKNCRFRNVDDAVTCFNRMVRVFPPPPTSVFDK
LLGAIVRMGHYPTAISLFTQLQSKGISPSIATFTILINCYFHQSHTAFAFSLLATILKSG
YQPNLVTFNTIINGFCINGMIFKALDFCQNLLAQGYLFDQFTYGTLINGLSKNGQIKAAL
HLLQEMEKSSVQPNLVMYSALIDGLCKDGFVSDALGLCSQIGERGILLDAVTYNSLIDGC
CSVGRWQEVTQLLTKMVRENVDPDDYTFNILIDALCKEGRILEAQGVLAMMSKRGEKPDI
VTYNALMEGYCSRENVHEARELFNRMVKRGLEPDVLNYNVLIDGYCKTKMVDEAMVLFKE
LCNKNLVPTIASYNSLIDGLCNSGRISHVKKLLDEMHGSAQPPDVVTYNILIDALCKEGR
ILEALGVLVMMMKKGVKPNIVTYNAMMDGYCLRNNVNVAKDIFNRMVKSGLEPDILNYNV
LINGYCKTEMVDEAIVLFKEMRHKNLIPDIASYNSLIDGLCNLGRIPHVQELLDEMCDSG
QSPDVITYNILLDAFCKTQPFDKAISLFRQIVEGIWPDFYTNHAIVDNLCKGEKLKMAED
ALKHLLMHGCSPNVQTYTILINALCKDGSFGEAMLLLSKMEDNDRPPDAITFEIIIGVLL
QRNETDKAEKLREEMIARGLVNIEKRLMYEEGGNL
NT seq
2088 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcaatccaataaggtatgccattcccaaattctctatttcttctcgtttctttggt
catttccaaccccaaaatccccacaaaaattgtagatttcgtaatgtagatgatgctgtt
acttgtttcaatcgcatggttcgtgtttttcctcctccgcccacttctgtatttgacaag
cttttgggtgctattgtcagaatgggtcattatcccactgccatttcactctttacgcaa
cttcaatcaaagggaatttccccttccattgctactttcaccatcttgattaattgttac
tttcatcaatctcacacggcttttgctttttcattattggctaccattcttaagagtggt
tatcaacccaatttggtcacttttaatacaattatcaatggtttttgtatcaatggtatg
atcttcaaagctttagacttttgccaaaacctactagcccaagggtatctttttgatcaa
tttacttatgggactttgattaatgggttatccaaaaatgggcaaataaaagctgccctt
catttgctacaggagatggagaaaagctccgttcaacccaatctagtaatgtatagtgca
ctcattgatggactctgcaaagatggatttgtttcggatgcccttgggttgtgttctcaa
attggtgagagggggattttacttgatgctgttacctacaactctctaatcgatggttgt
tgtagtgtgggtcgatggcaagaggttactcaattactaacaaaaatggtgcgggagaat
gttgacccagatgactatacctttaacatattgattgatgcattatgtaaagaagggagg
atcttagaagcacaaggtgtgcttgcgatgatgtcgaaaagaggcgagaaaccggacatt
gttacttacaatgctctgatggaggggtattgttcaagagaaaatgtccacgaggcaaga
gaactattcaatagaatggtcaaaagaggcttggaacctgatgtcttgaattataatgtc
ttgattgatggttattgcaagactaaaatggtggatgaagccatggttctctttaaagag
ctatgtaataaaaatttagtccctactattgcttcttacaattctcttatcgatggctta
tgcaattcgggaagaatatcacatgtgaagaagcttcttgatgaaatgcatggtagtgct
caaccccctgatgtagtcacgtataatatattgattgatgcattatgtaaagaaggaagg
atcttagaagccctaggtgtgcttgttatgatgatgaaaaaaggcgtgaaacctaacatt
gttacctacaatgctatgatggatgggtattgtttaagaaataatgttaacgtggcaaaa
gacatattcaatagaatggtcaaaagtggcttggaacctgatatcttgaattataatgtc
ttgattaatggttattgcaagactgaaatggttgatgaagccattgttctctttaaagag
atgcgtcataaaaatttaatacctgatattgcttcttacaattctcttattgatggctta
tgcaatttgggaagaataccacatgtgcaagagcttcttgatgaaatgtgtgatagtggt
caatcaccagatgtaatcacttacaatatattgttagatgcgttttgtaaaacccaacct
tttgacaaggcaatttcattattccgacagattgttgaagggatttggcctgatttttac
acaaaccatgcaattgttgacaatttgtgcaaaggtgaaaaattgaagatggcagaagat
gctcttaaacatcttttgatgcatggctgttctcccaatgtacaaacatatactattctt
atcaatgcactttgtaaagatggctcttttggtgaagctatgctcttactttcaaaaatg
gaggacaatgatcgcccccctgatgctataacttttgaaataattattggtgtactgcta
cagagaaatgagactgataaggcagagaaacttcgtgaagaaatgatcgccagaggtcta
gtaaatattgaaaaaaggttgatgtatgaagagggagggaatctgtga
DBGET
integrated database retrieval system
