KEGG   Medicago truncatula (barrel medic): 11428326
Entry
11428326          CDS       T01716                                 
Name
(RefSeq) glycine-rich RNA-binding protein 3, mitochondrial
  KO
K12741  heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1/A3
Organism
mtr  Medicago truncatula (barrel medic)
Pathway
mtr03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mtr00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    11428326
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mtr03019]
    11428326
   03041 Spliceosome [BR:mtr03041]
    11428326
Messenger RNA biogenesis [BR:mtr03019]
 Eukaryotic type
  mRNA surveillance and transport factors
   Transport factors
    Other transport factors
     11428326
   mRNA cycle factors
    Common to processing body (P body) and stress granule
     11428326
Spliceosome [BR:mtr03041]
 Common components
  Common spliceosomal components
   hnRNP proteins
    11428326
SSDB
Motif
Pfam: RRM_1 RRM_7 RRM_MARF1
Other DBs
NCBI-GeneID: 11428326
NCBI-ProteinID: XP_024635751
LinkDB
Position
3:complement(8386887..8391398)
AA seq 447 aa
MAFFGRVGSLLRNAANTKITSELKLRSSPSVFQAIRCFSSTPNTKLFVGGISYNTDEQSL
SDAFSKYGQVLDARIIMDRESGRSKGFGFVTYNTVEEASSAIQALDGQDLYGRRVGVNFA
NERPRDGFDGPYGGGGGYSGGYGNSSYGGGYASNAAGGYGGGGYGNTYNDGTTSGGYGGN
NANYGAAVGGGDSNAVNYGSPPGVGGYGNNANYGAAVGGGESNAVNYGSPPGVGGYGNNA
NYGAAVNYGSAPAVGGYGGNNVSYGAAGTANYGSAPDVGGYGGGNSANYGADVGGGESNS
VNYGSAPVDGGYGGANNANYGAAVGARESNSVNYGSAPGGYGGGNSANYSDRESNSVNYG
SAPGVGGYGSGNNANYGAAVGGGESNSVNYGTAPVDGGYGAAAGFGNSDNHYSTGGVGGG
PSNGFSGNQYPGSATGYGSGGSAPGSS
NT seq 1344 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctttctttggtagagttgggagtttattaaggaatgcagcaaatacgaagatcact
tctgagttgaagttacgttcttccccatctgttttccaagccatacggtgcttctcgagt
actcccaataccaagctgtttgtaggaggtatttcgtataatactgatgaacaaagtttg
agcgatgctttttcaaaatatggccaagttcttgacgcaaggataattatggatcgcgaa
tctggtaggtccaaaggatttggctttgttacttacaatactgttgaggaggcatcaagt
gccattcaggccttggatggacaggatctgtatggtcgccgagttggtgtaaattttgca
aatgaaagaccccgtgatggttttgatggaccttatggtggtggaggtggatattcaggt
ggttatggtaactcttcatacggtggtgggtatgctagtaatgctgctggaggttatggc
ggaggtggttatggaaacacttacaatgatggaactactagcggaggttatggtggcaac
aatgcgaattatggtgctgctgtgggcggtggtgatagcaatgctgttaactatggtagt
cctcccggtgttggtggttatggaaacaatgcaaattatggtgctgctgtaggtggtggt
gaaagcaatgctgttaactatggtagtcctcccggtgttggtggttatggaaacaatgca
aattatggtgctgctgttaactatggtagtgctcccgctgttggtggttatggtggtaac
aatgtgagttatggtgctgctggtactgctaactacggtagtgctccggatgttggtggt
tatggtggtggtaacagtgcaaattatggtgcggatgtaggtggtggagaaagcaattct
gttaactacggtagtgctcctgttgatggtggttatggcggtgctaacaatgcaaattat
ggtgcggctgtaggtgctagagaaagcaattctgttaactatggtagtgctcctggtggt
tatggtggtggtaacagtgccaattacagtgatagagaaagcaattctgttaactatggt
agtgctcctggtgttggtggttatggcagtggtaacaatgcgaattatggtgctgctgta
ggaggcggagaaagcaattccgttaactatggtactgctcctgttgatggtggttatggt
gctgctgctggatttggcaacagcgataatcattatagtaccggtggtgttggtggtggt
cccagcaatggtttctccggtaatcaataccctggaagtgcaacggggtatggcagtggc
ggttcagctcccgggagcagctag

DBGET integrated database retrieval system