Medicago truncatula (barrel medic): 11441852
Help
Entry
11441852 CDS
T01716
Name
(RefSeq) ABC transporter C family member 2
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
MMR_HSR1
DUF87
AAA_16
AAA_29
Dynamin_N
RsgA_GTPase
AAA_23
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11441852
NCBI-ProteinID:
XP_003593890
UniProt:
G7IP56
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(6171761..6191858)
Genome browser
AA seq
1619 aa
AA seq
DB search
MAFDPLVWYCQPVENGVWTRTVQNAFGAYTPCAVDSLVIGISHLVILGLCIYRIWLIQKD
FSVKRFRLRSNVYNYVLGVLAAYCVAEPLYRLIMGVSVLNLDGQSQLAPFEITSLIIEAL
AWCSMLILLGIETKVYIYEFRWFVRFGLIYAAVGGAVLFNFIISVQELYSRSVLYLYISE
VVCQVLFGILLLVYVPTLDPYPGYTPIASEIVNDAAYDELPEGELICPERRAGLWSKMVF
SWMNPIMKLGYERPLTEKDIWKLDTWERTEALQNKFQKCWAEESQKSKPWLLRALNASLG
GRFWFGGIFKIGNDLSQFTGPLILNQLLQSMQNGDPAGMGYIYAFAIFVGVVFGVLSEAQ
YFQNVMRVGYRLRSTLVAAVFRKSLRLTHEARKQFASGKITNLMTTDAESLQQICQSLHT
LWSAPFRITIAMVLLYQELGVASLLGALLLVLMFPLQTVIISRMQKLSKEGLQRTDKRIG
LMNEILAAMDTVKCYAWESSFQSRVVNVRNDELSWFRKASLLGACNSFILNSIPVFVTVI
SFGVFTLLGGDLTPARAFTSLSLFAVLRFPLFMLPNIITQVVNANVSLKRLEELLLAEER
ILLPNPPLEPGLPAISIRNGYFSWDAKAERATLSNINLDIPVGSLVAVVGSTGEGKTSLV
SAMLGELPPIADSTVVLRGTVAYVPQVSWIFNATVRDNVLFGSVFDPIRYERAINVTELR
HDLELLPGGDLTEIGERGVNISGGQKQRVSMARAVYSNSDVLVFDDPLSALDAHVARQVF
DKCIKGELRGKTRVLVTNQLHFLSQVDRIILVHEGMVKEEGTFEELSSQGLLFQKLMENA
GKMEEYEEEKVDIEATDQKSSSKPVVNGAVNDNAKSESKPKGGKSILIKQEERETGVVSL
NVLIRYKNALGGTWVILVLFACYFSTEALRVSSSTWLSHWTDQSAVDGYNPAFYNLVYAA
LSFGQVFVSLINSYWLIISSLYAARRLHEAMLHSILRAPMVFFHTNPLGRVINRFAKDLG
DIDRNVAPFVSMFLGQISQLLSTFILIGIVSTMSLWAIMPLLVLFYGAYLYYQSTAREVK
RLDSISRSPVYAQFGEALNGLSTIRAYKAYDRMADINGRSMDNNIRYTLVNISANRWLAI
RLETLGGLMIWFTATFAVMQNGRAENQQEFASTMGLLLSYALNITSLLTGVLRLASLAEN
SLNSVERVGTYIDLPSEAPSVIDDNRPPPGWPSSGSIKFDEVVLRYRPELPPVLHGLSFT
IFPSDKVGIVGRTGAGKSSMLNALFRIVELEKGRILIDDRDIAKFGLADLRKVLGIIPQS
PVLFSGTVRFNLDPFTEHNDADLWEALERAHLKDVIRRNSLGLDAEVSEAGENFSVGQRQ
LLSLARALLRRSKILVLDEATAAVDVRTDALIQKTIREEFKSCTMLIIAHRLNTIIDCDR
VLLLDGGKVLEYNTPEELLSNEGSAFSKMVQSTGAANAQYLRSLVHGGDKTEREENQHLD
GQRKWLASSRWAAAAQYALAVSLTSSQNDLQRLEVEDENSILKKTKDALITLQGVLERKH
DKEIEESLNQRQISSEGWWSSLYKMIEGLAMMSRLARNRLHQSDFGFEDTSINFDQIDM
NT seq
4860 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctttcgatccgttggtttggtattgtcagccggttgaaaatggagtgtggacaaga
acagttcagaatgcttttggtgcttacactccttgtgcggtcgactctttggtgattggt
atttctcatttggtgattctaggcttgtgcatctatcgtatatggttgattcagaaggat
tttagcgtcaagaggtttcgtttaaggtcaaatgtctacaattatgttcttggggttttg
gctgcatattgtgtggcagagcctttatacagattgattatgggagtatcggttctaaat
ttagacgggcagtctcaacttgctccgtttgagataacatcgctgattattgaggctctt
gcttggtgctctatgctgattttgcttgggattgaaactaaagtctacatctatgaattc
cgatggtttgtccgatttggtttgatttatgctgctgtagggggtgctgttttgttcaat
ttcatcatttctgtccaggaactttatagcagatcagtgttgtatttgtacatcagtgag
gtggtctgccaggttttgtttggaatacttttgcttgtgtatgtccctactttggatcct
tatccaggctatacccccattgctagtgaaattgttaatgatgctgcatatgatgaactc
cctgaaggagagctcatttgtccagaaaggcgagctggcttatggtcaaagatggttttt
tcttggatgaatcccattatgaaactaggatatgaaagaccacttacagagaaagatata
tggaaattagatacatgggagcggacagaggcattgcagaataaattccagaaatgttgg
gccgaggagtctcagaaatcaaaaccttggcttttgagagcattaaatgcaagccttgga
ggaaggttttggtttggaggcattttcaagattggcaatgatctttcccaatttacgggc
ccacttatattgaaccagcttctacagtctatgcaaaatggtgatccagccggaatgggc
tacatttatgccttcgcaatatttgtcggagtggtctttggggtgttaagtgaagctcaa
tattttcagaatgtcatgcgtgttggttatcgtctgagatcaacgctggtagcagcagta
tttcgcaagtctctaaggcttactcacgaagcgcgaaaacaatttgcatctggaaaaata
accaacttgatgactactgatgctgagtcacttcagcaaatatgccaatcacttcacact
ttgtggtcagctccctttcgaattactattgcaatggttcttctttaccaagaattaggc
gttgcttcccttcttggtgctttgttgctagttcttatgtttccattacagacagtaatc
atcagcagaatgcagaagctgtctaaggaaggattacaacgcacagacaagagaatcggt
ctcatgaatgaaattttggctgctatggacactgtaaaatgctacgcgtgggagagtagt
ttccagtctagagtagtgaacgtacgaaatgatgaattatcatggtttcgaaaagcatca
ttacttggagcgtgtaattcatttatactaaatagcattccagtttttgtaactgtgatt
tcgtttggagttttcaccttgcttggaggggatttgacacctgcaagagctttcacatca
ctttctctgtttgctgtgcttcgatttcctctcttcatgcttcctaatattataactcag
gtggttaatgcaaatgtatcgttgaaacgtctagaggagttgctcttagctgaagagaga
atacttctaccaaatccacctcttgagccagggttaccagccatctcaatcaggaacgga
tacttttcttgggatgcaaaggcagagagggcaacattgtcgaacataaatttggatatt
cctgttggtagcctagttgctgttgttggcagcacaggagaagggaagacatcgctcgta
tctgcaatgcttggagaacttcctccaattgcggattctactgttgttttaagaggaaca
gtagcttatgtacctcaagtttcatggatttttaatgcaactgtacgggataacgttttg
ttcggttctgtctttgacccaataagatatgaaagggcaataaatgtgactgaactgcga
catgaccttgagttactacctggcggtgatcttactgaaattggggaaagaggggtaaac
atcagcggtggtcagaagcaaagagtatccatggctagagctgtctactccaattcggat
gtactcgtctttgatgaccctctaagtgctctggatgcacatgtggctagacaggttttt
gataaatgtatcaagggagaattgagagggaagactcgagttcttgttacaaatcagctg
catttcctttcacaggttgatagaatcattttggtccatgaaggtatggtgaaggaggaa
gggacttttgaggaactctccagccaggggcttttgttccaaaagctgatggaaaatgcg
ggtaaaatggaggagtacgaagaagaaaaggtagatatcgaagctactgatcagaagtcc
tcttcaaaaccagtggtcaatggagcagttaatgataatgcaaagagtgaaagcaaacca
aaaggaggaaaatctatccttattaaacaggaagaacgggaaacaggtgttgtcagtttg
aatgttctaataaggtacaaaaatgcattaggaggcacttgggttattctagtactattt
gcatgctatttctcaactgaagcgttacgagtgtcaagtagcacatggttaagccactgg
actgatcagagtgctgtagatggttataatcccgccttctacaatctcgtatatgcagct
ctatcatttggtcaggttttcgtgtctctaataaattcttactggttaatcatatcaagt
ctttatgctgccagaaggttgcacgaagccatgcttcactcaatcttacgagctcccatg
gtctttttccacacaaatccactcgggagggtcatcaacaggtttgcaaaagatctaggt
gacatcgatcgtaatgtggctccatttgtgagcatgtttttaggtcaaatttcacaactt
ctttcgaccttcatcctgatagggattgtaagcacgatgtccctttgggcaataatgcca
ttgttggtattgttctatggagcatatctatactatcagagcactgctcgtgaagtaaag
cgattggattcaattagcagatctcctgtttatgcacaatttggggaagcactaaatggt
ctatcaacgattcgtgcttacaaagcctacgaccgaatggcggatataaacgggagatcc
atggacaacaatattcggtacacgctggtgaacataagcgcaaaccggtggcttgcaatc
cgattggaaaccctaggaggcctcatgatatggttcactgcaacctttgctgtgatgcag
aatggtagggcagagaaccagcaagaatttgcatccaccatgggattacttctcagctac
gctttgaatattaccagtttgctcaccggtgtgctcagacttgcaagtttggctgagaat
agtttaaattctgttgagcgggttggaacctacatcgatttgccttcggaggctccttct
gtgattgatgataatcgccctcctcctgggtggccttcctcaggctccatcaaatttgac
gaagttgttcttcgctacaggcctgaacttcctcctgttcttcatggtctatctttcacg
atttttccgagtgataaggttggcatcgttgggaggactggcgcgggaaaatccagcatg
ttaaatgccctgtttcgaattgtggaattggaaaaaggaagaatattaattgatgatcgt
gatattgcaaagtttgggctggctgatttgcggaaagttcttggcattataccacaatct
cctgttctcttttctggaactgtgagatttaatcttgatccatttactgaacacaatgat
gctgacctctgggaagctctggagagagcacatttgaaggatgtgatacggaggaactct
ttggggctggatgctgaggtatccgaggcaggcgagaacttcagtgttggacagaggcaa
ctgttgagtcttgccagggctttgttgcggagatcaaagattttagtacttgacgaggca
actgcagcagttgatgttagaacagatgcactcatacagaaaacaatcagagaggaattt
aaatcctgtacaatgctcattattgctcatcgcctcaacaccattattgattgtgatcgg
gttcttttgcttgatggaggcaaggttcttgaatataatacccccgaggagctactgtca
aatgagggtagtgcgttctctaagatggtgcaaagtacaggtgctgcaaatgcccaatac
ttacgcagcttagtacatggtggggacaagacagaaagagaagagaaccaacatctggat
ggtcagagaaaatggctagcttcttctcggtgggctgctgcggcccagtatgctcttgct
gtcagtctcacttcgtcacagaacgacctacaacgattggaagtagaagatgagaatagt
attctcaagaagacaaaggatgctctgattactttgcaaggtgttttggaaaggaagcat
gataaagaaattgaggaatctttaaaccaacgccagatatcctcggagggatggtggtca
tccctttacaagatgattgaaggtcttgctatgatgagcagattggccaggaacaggctc
catcaatcagattttggttttgaggacacatcgattaactttgatcaaattgatatgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
