Medicago truncatula (barrel medic): 25484388
Help
Entry
25484388 CDS
T01716
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
Pathway
mtr03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mtr00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
25484388
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mtr03019
]
25484388
Messenger RNA biogenesis [BR:
mtr03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
25484388
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
25484388
NCBI-ProteinID:
XP_013468648
UniProt:
A0A072VX62
LinkDB
All DBs
Position
1:36618972..36622760
Genome browser
AA seq
469 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTNEEKLKEHFSNYGDVLNTSVMREKNTGKPRGFGFVVFSDPSVL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKRAFSREDQQISVSSRSGNSNSGMNSGNGGNMRTKKIFVGGLP
PTLAEEKFRQYFEAYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFITFDTEEAVDRVLHKTFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGANSRMGGAGGGSGGMGGYQGYGASGGNQNAYDGRSDSRYMQPQSA
AGGFPPYGSSAYSAAAGYGYGSASNGLGYGAAYGSYGGAAAGYGGPAAATYGNPNVPNAA
YAGGGPRSSWPAQAPSGYGSMGYGNTAPWGAPSGGAGSGAATAGQSPSAAAGYGNQGYGY
GGYGGGYGASDNSYGNPGVYGAVGGRTGSAPNSNASGQGGSELQGSGGSGSYMGSGYGDT
NGNSGYGNAAWRSEQAQASGNYGTPQGNGGQAGYGGGYGAAQSRQAQQQ
NT seq
1410 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggaaagcttttcatcggtgggatttcatgggatacgaatgaggag
aagctgaaggagcatttcagcaattatggtgatgttttgaacacttctgttatgagagag
aagaacactggtaaacctagaggctttggtttcgtggttttctcagatccttctgttctt
gatagggttcttgaagacaaacatgttattgatggcagaacggttgatgccaagagggct
ttctcaagagaggaccaacagatttctgtctcttcaagatctggaaactccaattctggt
atgaattctgggaatggtggaaatatgagaaccaaaaagatatttgttggagggttgcct
cccactctggctgaagaaaaattccgtcagtactttgaggcttatggacatgtaactgat
gtcgtagttatgtatgaccagaatactggacgaccacgaggatttgggtttattactttt
gatactgaggaggcagttgatagggttttgcacaagacatttcatgatttaaatggtaaa
caagtagaggtaaagcgtgcactcccaaaggatgccaatcctggtgcaaatagtcgtatg
ggtggtgctggaggtggtagtggcggaatgggtggttatcaagggtatggagcttctggt
ggaaaccaaaatgcatatgatggtcgttcagattctaggtatatgcagcctcaaagtgct
gcaggtggattcccaccttatggatcctctgcatacagtgctgctgctggatatgggtat
ggttcggctagcaatggccttggttatggtgcagcatatggaagttatggtggtgccgct
gctggttatggcggacctgctgctgcaacatatgggaacccaaatgtccctaatgctgct
tatgctggtggtggcccaaggagttcatggcctgctcaggctccctctggctatggctct
atgggttacggtaacactgctccttggggtgctccaagtggtggtgctggatctggtgca
gcaactgcaggtcaatctcccagtgcagcggctggatatgggaatcaaggttatgggtat
ggtggttatggtggcgggtatggtgcaagtgataattcttatgggaatcctggtgtatat
ggtgctgttggtgggcgtactgggagtgctccaaatagtaatgctagtggtcagggtggt
agtgaactgcaaggtagtggtggcagtggcagctatatgggcagcggctatggggacaca
aatggaaattctggctatggaaatgcagcttggagatctgaacaggctcaagcatctggt
aattatgggactcctcagggaaatggggggcaagctggttatggtggtggctatggtgct
gcccagtctcgacaagcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
