Medicago truncatula (barrel medic): 25486268
Help
Entry
25486268 CDS
T01716
Name
(RefSeq) proline-rich extensin-like protein EPR1
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Hydrophob_seed
Tryp_alpha_amyl
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
25486268
NCBI-ProteinID:
XP_013462949
UniProt:
A0A072V4R6
LinkDB
All DBs
Position
2:9797439..9800462
Genome browser
AA seq
923 aa
AA seq
DB search
MGLKGAASISIMLPLSFLFFSTLASAHSGRKPPPPPRFRTPPPPTLPSTKPPPHSMTPPK
QTPMKAPPTPTRLQPILSPSTQPPHPTIPPPKKPPTISPSTPTTPPQTLTPSKQPIRPMT
PPPKNPPTTAPPTRYTPPTLPPSKQPPHSMTPPTKQAPMKAPPTPTTLQPILSPTQPPRP
TTPSPKITPITPPTPTKSQPPKTTPAKPPTLTTPPPTLTPSGQPPRPVTQQPRNPPTSTL
PTLRPSTPPPHSLTSPPKTAPTKAPPTPSTLPPRPMTPPPKKPPTISPSTPTTPPPTMFN
SPPPRTIAPSPKMPPTTSPPTPITSPSKLPPTQPPRPTTSPPKITPITPPTPTTSQPPKT
TLAKPPTLTTPPPSLTPSGQPPRPVTQQPRNPPTSTPPTPSTLPTLRPSTPPPHSLTSPP
KTAPTKAPPTPSTLPPRPMTPPPKKPPTISPSTPTTPPPTMFNSPPPRTIAPSPKMPPTT
SPPTPITSPSKLPPTQPPRPTTSPPKITPITPPTPTTSQPPKTTPAKPPTLTTPPPTLTP
SGQPPRPVTQPPRNPPTLTPPTTSTIPPLRPSTPPPHSLTSPPKKAPTKAPPTPSTLPPR
SMTPPPKKPPTISPSTPTTPPPTMSNSPPPRTIAPSPKMPPTTSPPTPITPPSKLPHTPP
PRAMTPSPKITPITPPTPITSQPPKTTPAKSPTLTPSGQPTRPVTQPSRPTTPPPKLTPT
SPTSTPTTTPPTFPPPTPPSRPFTPPPKLTPTTPPPPPMSPPSTPPPNIGSPPIFTTPPP
KLPSITPPFTPTPPSSPPPPPPPPPMFPPSIPPPKIVSPPILMTPPPKLPSTTPPPPPSI
PRNCPMGNLHVCANLLNIVIGRPQNQPCCSLINGLADFEASVCLCAAIKTNSIPGVIRIN
HSIALNTLISRCGRKMPNGFACS
NT seq
2772 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggttaaagggtgctgcatctatcagcataatgctcccccttagcttcctttttttc
tccactcttgcctctgcccattcgggtcgtaaaccaccaccaccacctcgttttaggaca
ccaccaccacctactttgccttccactaaacctccacctcattcaatgacaccaccaaag
caaactcctatgaaagcgccgcctactcctacaagactacaacctattttgtctccttct
acccaaccacctcatccaacgataccaccacctaagaagcctcctacgatttcaccatct
acacctaccacaccaccacaaaccttgactccgtctaaacaaccaattcgtccaatgaca
ccaccacctaagaatcctcctacgacggcaccacctactcgttacacaccacctactttg
cctccttcaaaacaaccacctcattcaatgacaccaccaacaaagcaggctcctatgaaa
gcgccgcctactcctaccacactacaacctatcttgtctcccacacaaccacctcgtcca
acgacaccatcacctaagataactcctataacaccaccgactcctaccaaatcacaacca
cctaagacgactcctgccaaaccaccaactctaaccacaccaccaccaactctgactcct
tctggacaaccacctcgtccagtaacacaacaacctaggaatcctccaacttcaacactt
ccaactttgcgtccttctacacctccacctcattcattgacatctccacctaagacggct
cctaccaaagcgccgcctactcctagcacactacctcctcgtccaatgacaccgccacct
aagaagcctcctacaatttcaccatctacacctaccacaccaccaccaaccatgtttaat
tcaccgccacctcgaacaattgcaccatcacctaaaatgccaccaacaacatcgccacct
actcctatcacatctccgtcgaagctacctcccacacaaccacctcgtccaacgacatca
ccacctaagataactcctataacaccaccgactcctaccacatcacaaccacctaagacg
actcttgccaaaccaccaactcttaccacaccaccaccatctctgactccttctggacaa
ccacctcgtccagtaacacaacaacctaggaatcctccaacttcaacaccaccaactcct
tcaacacttccaactttgcgtccttctacacctccacctcattcattgacatctccacct
aagacggctcctaccaaagcgccgcctactcctagcacactacctcctcgtccaatgaca
ccgccacctaagaagcctcctacaatttcaccatctacacctaccacaccaccaccaacc
atgtttaattcaccgccacctcgaacaattgcaccatcacctaaaatgccaccaacaaca
tcgccacctactcctatcacatctccgtcgaagctacctcccacacaaccacctcgtcca
acgacatcaccacctaagataactcctataacaccaccgactcctaccacatcacaacca
cctaagacgactcctgccaaaccaccaactcttaccacaccaccaccaactctgactcct
tctggacaaccacctcgtccagtaacacaaccacctaggaatcctcctactttaacacca
ccaactacttccacaattccacctttgcgtccttctacacctccacctcattcattgaca
tctccacctaagaaggctcctaccaaagcgccgcctactcctagcacactaccacctcgt
tcaatgacaccgccacctaagaagcctcctacaatttcaccatctacacctaccacacca
ccaccaaccatgtctaattcaccgccacctcgaacaattgcaccatcacctaaaatgcca
ccaacaacatcgccacctactcctatcacaccaccgtcgaagctacctcacacacctcca
cctcgtgcaatgacaccgtcacctaagataactcctataacaccaccaactcctatcaca
tcacaaccacctaagacgactcctgccaaatcaccaactctgactccttctggacaacca
actcgtccagtaacccaaccatctcgtccaaccacacctccacccaaattgacacccact
tcaccaacatctactcccaccacaacaccacctacgtttcctcctccaacaccaccatct
cgtccatttacacctccacctaaattgacacctaccacaccgccaccaccacctatgtcg
cctccttctacacccccaccaaatataggatcaccaccaatttttacgacacccccacct
aagttaccttctatcacaccaccatttactcctacaccaccatcttcgccgccaccgccg
ccaccaccaccacctatgtttcctccttctatacccccacctaagatagtatcaccacca
attcttatgacacccccacctaagttaccttctaccacaccaccaccacctccttccata
ccacgtaattgtcccatgggaaacttgcatgtttgtgccaatttgttgaatatagtgatt
ggtcgtccacaaaaccaaccttgttgttctcttatcaacggtcttgccgattttgaagca
tcagtttgcctttgtgctgcaataaagacaaatagtataccgggagtaattcgtattaac
catagtattgccttgaacacactcatcagcaggtgtgggcgcaaaatgcctaatggattc
gcatgcagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
