Mucilaginibacter celer: HYN43_001150
Help
Entry
HYN43_001150 CDS
T05668
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
muh
Mucilaginibacter celer
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
muh00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
muh02000
]
HYN43_001150
Transporters [BR:
muh02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HYN43_001150
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
Plug
CarbopepD_reg_2
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYL93982
UniProt:
A0A494VSR8
LinkDB
All DBs
Position
296501..299554
Genome browser
AA seq
1017 aa
AA seq
DB search
MKKHLLTILLLCTCIAFGFAQTKVITGKVTDQKDGSPIPGASVTVKGSSIGTQTDINGGY
KLTVPETAKVLNFKFLGYLSLDVAIKGTTVNAQLTTDSKILNEVVVVGYGTQSKRSLTGS
VSKIKGGDIENIPVPSLESAIQGRSPGVYIQAQNGKLGQGIQVRIRGASSVSAGNQPLYV
VDGLPITVDDFSSNGASTNPLVDLNQNDIESIDILKDASAAAIYGSRASNGVVLVTTKKG
KAGATKITYNQYYGFSKPTGEREFLNAQQYVTLLREAGKAGGYSTATIEGRLLRYSAGND
DYKTYKVNTDWQQQIIQHAPVQNYNLVFSGGTEKTKFYISGTYNDQKGWILKNQINQYSL
RTNIENQANSWLTIGANLSVSRTVNHRLDNDNAFSTPEQIVALAPITPVIDPRTGLLSGA
LDPATGNPNGNFPTYFNPLLNSESSYFITTDYRNLGNVFGEIKLVPSLTFRTEVGMDILN
STEDNYSGSLTLRNSGTSNGVGFNSSVTSLNFNTNNFFHFLKDLGKSSIDAVGGMTYQRQ
QNDLNSINGQQFPSDAYKKLNSAADITGAASNSTAYSLLSYFARANYKFDDKYLLTLSGR
VDGSSRFGDSHRYGFFPAGSVGWVISQEGFMKNQKLVSDLKLRASYGITGNSEIGNFPSR
GLFSAFGYAGVAGARPTQLPNPDLKWETTATSNLGVDVGFFNGRLSGSFEVYLKKTKDLL
LNVQVPATSGFTTITQNLGKLQNKGLEIQIDSKNLVGKVTWSTSFNLSFNKNKINDLKGQ
VLLGGGDQVNRAIEGQPLGIFYAPEFAGADPSNGDALYYKNTDLGNGKRDRTKTSDYNEA
VPVVVGDPNPKYIAGLNNSVSYMGFDLSFLLQQVHGNKIYNGGGQYMSVGFNNGFDNQTV
DQLQSWKKAGQITNVPEARLFGGNGISPSSRFLDDGSYVRLKNVILGYNFPKALLSKIKL
SSLRVYAQATNLLTWTKYKGWDPELNSDAFSGNITQGYDFYAAPQAKTITFGINVGF
NT seq
3054 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagaaacatctactaacaatcctgttgttatgtacttgtattgcctttggttttgcc
caaaccaaagttattacaggtaaggtaacagatcagaaagacggatcgcccatacccgga
gcgagcgtaaccgtaaaagggtcgtcgataggcacccaaactgatattaacggtgggtat
aaacttaccgtgccggaaaccgcaaaagtgctcaactttaaatttttgggatatctttcg
ctcgatgttgccatcaagggaacaacagttaacgcacaactaactaccgattcaaaaatt
ttgaacgaagtagtggtagtgggctacggtacgcagagcaaacgatcattaacaggttcg
gtttcaaaaataaaaggcggcgatattgagaacatccccgtgccgagtttggaatcggct
atccaaggccgcagcccgggtgtttatatccaggcgcagaacggtaaactggggcagggc
atacaggtgcggattcgtggtgcctcatctgtatcagcaggtaaccaacctttatatgtg
gttgacggtttgccgataacagttgatgatttttcaagcaatggcgcttcaaccaatccc
ctggttgatttaaatcaaaacgatatcgaatctatcgacatccttaaagatgcatcggcg
gccgctatttacggttcaagggcatcaaacggtgttgtattggtaactactaaaaagggt
aaagccggcgcaactaaaattacctacaatcaatattacggtttcagtaaacctaccggc
gagcgtgagtttttaaatgctcagcaatatgttaccttattaagagaagcaggcaaagcc
ggtggctattctaccgctactatcgaaggcaggttactgcgctattcggccggtaatgat
gattacaaaacttataaagtaaataccgactggcagcaacaaattattcaacacgctccc
gtacagaattacaaccttgtattttctggcggtaccgagaaaactaaattttatatttcg
ggtacctataatgatcaaaaaggctggatccttaaaaaccagatcaatcaatacagctta
cgtaccaatattgaaaaccaggcaaacagctggttgaccattggtgctaatttaagcgtt
tcgcgcacggtaaaccatcgtttggataatgataacgcgttttcaactccagagcaaatt
gttgcattagcgccgataacgcccgttatcgaccctcgtaccggtttattgagcggagcg
cttgacccagccacaggtaaccctaatggcaactttccaacttattttaaccccttgcta
aattctgaaagcagctattttatcactactgattaccggaaccttggtaacgtttttggt
gaaattaaactggtgccatctttaactttcagaacagaggttggcatggatatcttaaac
tctacagaagataattattcaggcagccttacgctccgtaactcgggcacaagtaatggt
gtcgggttcaactcatcagttacttcgttaaactttaataccaataactttttccacttt
ttaaaagatttgggtaaaagcagcattgatgcggttggcggtatgacttatcaaaggcag
caaaatgatcttaattctattaacgggcagcaatttccctctgatgcttataaaaagctg
aatagcgcagcagatatcaccggtgctgcatcaaactcaactgcttattcattgctttca
tattttgcaagggcaaattataagtttgatgataaatacctgcttaccttaagcggtcgt
gtagatggttcgtccaggtttggtgatagtcatcgctatggtttcttcccggcaggttct
gttggctgggtaatttcgcaggaaggatttatgaaaaaccaaaagctggtatctgatttg
aaacttagggccagctacggtataaccggtaactccgaaattggtaactttccttcgcgt
ggtttattttcggcatttggatatgcaggtgtagcaggtgcgcgcccaacacaattgcct
aaccccgatttaaaatgggaaactacagctacctcaaaccttggtgtggatgtaggattt
ttcaacggcaggttatcaggttcatttgaggtttacctgaaaaaaactaaagacctttta
ttgaacgtgcaggtgcccgccacttctggttttacaacaataacccaaaaccttggcaaa
ctgcaaaataaaggtttggagattcagatcgattcgaaaaaccttgtgggtaaggttacc
tggtcaacaagctttaacttatcattcaacaaaaacaagattaatgatctgaaaggccag
gtattgcttggcggtggcgaccaggtaaaccgtgcaattgaggggcaaccgctgggtatt
ttttatgcgccggaatttgccggtgccgatccttctaatggagacgcgctctactacaaa
aacaccgatttgggtaatggcaaaagggacagaaccaaaacaagtgattacaatgaggca
gtaccagtagtggttggcgaccctaaccctaaatatatagccggtttaaacaactcagta
agctatatgggctttgatttaagtttccttttacaacaggtacacggtaacaaaatatac
aacggcggcgggcagtatatgtctgttggtttcaataatggtttcgataatcaaactgtc
gatcagctccaatcgtggaaaaaggcaggacaaatcaccaatgttcccgaggcgcgtttg
tttggcggtaatggcattagcccaagctcgaggtttttggatgatggatcatacgtgcgt
ttaaagaacgttatcctgggttataatttccctaaagctttacttagcaaaatcaaatta
tccagtttaagggtgtacgctcaggcaacaaacttactaacctggacaaagtacaagggt
tgggatcctgagttaaactcggatgccttttcgggtaatattacgcaagggtatgatttt
tatgccgctccgcaggccaaaacaatcacctttggtattaacgtaggattttaa
DBGET
integrated database retrieval system