Mucilaginibacter celer: HYN43_026075
Help
Entry
HYN43_026075 CDS
T05668
Name
(GenBank) gliding motility-associated C-terminal domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
muh
Mucilaginibacter celer
Pathway
muh02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
muh00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
HYN43_026075
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Ig_7
PKD_5
CHU_C
PKD_4
PKD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYL98535
UniProt:
A0A494W4W9
LinkDB
All DBs
Position
6262964..6268291
Genome browser
AA seq
1775 aa
AA seq
DB search
MNKPLLVLFFLLICSFTGFCQNCTLNVNISSSANTICSGSKVTLTAALTGGTGPFTYLWN
TGENTASIDVNRAGNYTVTVTDKTPGCSPKTASKQVTASPTPDPPTVAGQIVCPGTPATL
RATAPGGTYQWYDANGNFLFTGNPYVTDPINGATIFYVETTVGGCTSFRSPVLVNVTGRP
NIVADPVCSGSPATLIASGADSYAWYANAQGTGTALSNSPTYQTPPLTKTTTYYLVAVIK
GCPGNPIPVVAKVTPPPDKPTVTGTYTVCAGSSVNLHADGVGVVEWYDVPTGGTPVISSP
DYTTPALNQTKTYYAQSTVGDCVSPRTAVPVTVTPVPQAPASQSPSTCYGTNITLAADAN
PTGSYAWYTTAVGGTAVSTSNNFTTPVLTNTTTYYVQHTNGSCTSERTAITVTITPAPAQ
PVVSEGPIICNGSQATLTATSAQGGTIRWFATASGGATAFTGSPFVTPALTKTTTYYAQV
TDAGGCVSSRASVTVTVLDAIPQPVVNTSPVCAGTSVTLTATGSPDDYEWYDQPTGGNLL
ITGDTYVTPELTTTTTYYVQSITNGCASPRTTVTITVNPLPGAPNVNGPSAVCPGTSAVL
STPATGTVQWYNAATGGTLLFTGNSYTTSPLFSQTTFYVQVSNGTCTSDRTPFTVSITPI
INPQFQYPSGTVCTSGANVKPVIFNPAGGTFTSSPAGLVFVDNKTGEIDVAASVPRTYNV
IFTFGGTCAGAASQKIAIVTTPDARFTYNGPFCQSDNNPLPVFTAGASAGVFSASSSNLV
FINTSTGEINLDKSAPGTYSVTNTIAASAGCAASTYTTQVTINAKVVVDAGPDRTVLQGT
PVQLQGSIKGGITTGKWTGGAGTFSNPARPRAIYTPAPGETEVTLTLTSDIPSGPCGPVS
DEVTITFNPVPPEPVVDAKPVCVGSPATLVAKAPGGTYRWYDAPTGGTLLKTGPIFTAPP
ITADITYYVTVTKGGITSARKAVLVKAIAQPAAPVVTTPVTVCEGSPATLVASGSTGTYR
WYDLPVGGSLVKQGDTFTTGALTTNKKYYVDATANGCTSPRTEVDVLVTPVPNITNTNNT
DVVCSGTALNYTLTADRADATFSWSRAAVTGISNPAVTNQTSGTITETLINTTAAPVNVT
YVITAYNGTCPGPSFNYKVTVNPTPVVTSPDPQPVCNGTSTNYAVTFNTAGTSFTWSRAA
VPGISNAPVLGQAAATIKEVLFNTTTAPVDVTYVFNYRTSLCPGEPREVKVTVNPEPQII
DDPTNGTPVCSNVPLAYTIQSSIPSSTFLWSRAAAGDNPAVDNQTDATINETLVNTSVFP
LRVTYIITPFAYGCAGKPFTYTRFVLSQIAKPVGNGTTPVCEGTPIHFDTAPVSGASYLW
TGPNNYQSTDRSPTIPGATAANAGTYRLFIKIGDCFSEPSEGVRIEVKPTPVVIAGPEVT
YCKTIPVIQLDGSIPTGGTGVWSGGSGQFTKVDDPKTTYTPSPADREKDFITLKLTSTGY
CDPVSSFVKINFAPSPGANAGPDQNNICNQNPMVQLQGTPLSGSTVTWSSASGKGRFIPS
ANVTNPTFEPDPADIAKGFVKLTLTATSADECHTPTDDMTINFVPPPTVEADAAGDTRYV
LKGHTITLNPVVSNENVSYTWTPATGLSDANIKNPEVTGDVDITYKLTITDLSNGCPNSS
FVNVKVAPNIVVKNTFTPNADGVNDYWEITGLIAYEDVTVDVYNRYGQPVFHSLGYPKPW
DGGVNGKLVPSGTYYYVINSKQEKLRLSGYVVVLK
NT seq
5328 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagccattacttgtactattctttttgctcatctgctcatttacgggtttctgt
caaaattgtacgctaaacgtcaacatatcttcttcggctaatactatctgttcgggtagt
aaagttactttaacagccgctctcacaggcggcaccgggccgtttacctacctttggaat
accggcgaaaacaccgcatcaattgatgtaaaccgcgcaggcaactatacggttacggta
actgataaaactccgggctgctcgcctaaaacggccagcaaacaggtaaccgcctcaccc
acacccgatccgcctacggttgcggggcaaattgtttgcccgggaaccccggccacgctt
agagctacggcaccgggcggtacctaccaatggtatgatgccaatggtaattttcttttt
acgggtaacccttacgttaccgaccctataaacggagccactattttttatgttgaaacc
accgttggcggttgtacaagctttcgcagcccggtactggtaaatgtaaccggcaggcct
aacattgttgccgatccggtatgttcgggcagcccggctacgttaatagcttcgggtgct
gatagctatgcgtggtatgccaacgcgcagggtacgggtactgctttgagtaattcacct
acataccaaactcctcctttaaccaaaaccacaacttattacctggtagcggttattaag
ggctgtcctggtaatcctatacccgttgttgcaaaggtaaccccaccacccgataagcct
accgttacgggtacttatacagtatgtgcaggctcttcggtaaacctgcacgccgatggt
gtgggggttgttgagtggtatgatgtaccaaccggcggcaccccggtaatttccagtcct
gattataccacgcctgcccttaatcaaaccaaaacatactacgcacaatcaaccgttggc
gattgcgtaagcccccgtacagctgtgccggtaacggttacacccgtaccacaggcccct
gcttcgcaatcgccttcaacctgctacggcacaaatattacgttagcagccgatgccaat
ccaaccggaagttatgcctggtataccactgctgttggcggtactgcagtatcaacttca
aataactttacaacgcccgtattaaccaacacaactacctattacgtacagcacacaaac
ggtagctgcaccagcgaacgcacggccatcaccgtaaccatcacacctgcgccggcgcag
ccggttgtttcagaagggccgattatctgcaacggatcgcaggctacattaacagccacg
tcggcccagggcggtaccatcaggtggtttgcaacggcaagcggtggggcaacagcattt
accggctcgccctttgtaacgccggctttaaccaaaacaactacttactatgcccaggtt
actgatgccggcggctgcgttagctcacgtgcatctgtaacggtaacagtacttgatgcc
ataccgcagcctgtagtaaatacttcgcctgtttgtgcgggtacatcggttacattaacg
gctacgggctcgcccgatgattatgagtggtatgatcagccaacaggtggcaacctgctt
attaccggcgatacctatgtaactcccgaacttaccaccacaaccacttactatgtgcag
agtattaccaatggctgcgcaagccccagaacgactgttacgataaccgttaaccctttg
ccgggtgcacccaatgtaaatggccccagtgcggtttgcccgggcacttcggcagtttta
agtacaccggcaacaggaaccgtacaatggtataacgcggcaacaggcggtacgctttta
tttaccggtaattcgtataccacatcgccattatttagccagacaactttttacgtgcag
gtatcaaacggcacatgtacaagcgaccgcacgccttttaccgtatctataacgccgatt
atcaatccgcagtttcagtatccttcgggcacggtttgtacctcgggagccaatgttaaa
ccggttatttttaacccggccgggggcacatttaccagttcaccggcaggtttggtattt
gtggataacaaaacaggcgaaatagatgtagccgcaagtgtaccacgcacctacaacgta
atatttaccttcggcggaacctgcgcaggtgcagcgagccagaaaatagctattgtaacc
acgccggatgcccgcttcacgtataacggccccttttgccaaagcgataataatccgcta
ccggtttttactgcgggggcaagtgcaggcgtgttcagtgcatcatcgtcaaatcttgtt
tttataaatacaagcacgggcgaaattaatcttgacaagagtgctcccggaacctattca
gttaccaacaccatagctgccagtgcgggctgtgctgcaagcacctatactacacaggtt
actatcaacgccaaggttgttgttgatgccggacccgaccgtacagtactacagggaaca
cctgtgcagttgcagggttctatcaagggcggtattacaacaggcaaatggacaggtgga
gccggaactttttcaaacccggccaggccgagggctatttacacaccagccccaggcgaa
acggaggttacgctaactttaacttcagatattccttcgggcccctgcgggccggttagc
gatgaggtgactattacctttaaccccgttccgcccgagccggtagttgatgccaaaccg
gtatgcgttggcagcccggcaacactggtggccaaggcacccggcggtacctatcgctgg
tatgatgcccccaccggcggtacgcttttaaaaaccgggccgatatttaccgcaccgcca
attacagccgatataacttattatgttaccgttaccaaaggcggtataaccagcgcccgg
aaagcggtattggtaaaagccatagcacaacctgcagcgccggtagttactacaccggta
actgtttgtgaaggttcgccggctacgctggtggcctccggatcaaccggaacttacagg
tggtatgatttaccggttggcggcagcctggtaaaacaaggcgatacatttaccaccgga
gcattaaccaccaacaaaaagtactatgtagatgcaactgctaacggctgtaccagcccc
cgaacggaagttgatgttttggtgacacctgtgcctaatataaccaacaccaataatact
gatgtcgtatgcagtggcaccgcattaaattataccttaactgccgacagggccgatgct
acattttcgtggagccgcgctgccgtaacgggtatcagtaacccggcggtaacaaaccaa
acttcgggtaccattaccgaaactttaattaacaccacagctgctcccgtaaatgttact
tatgtgataacagcttataacggcacctgcccgggcccttcatttaattataaagttacg
gtaaacccaacaccagtggttaccagtcccgatcctcagcctgtgtgtaatggcacaagt
acaaattatgcggtaactttcaataccgccggtaccagctttacctggagcagggctgcg
gtgccgggtatcagcaatgccccggttttggggcaggcggctgctaccatcaaagaggtt
ttgtttaataccacaacagcccctgttgatgtaacttatgtatttaattacagaacaagc
ctgtgccccggcgaaccgcgtgaggttaaggtaaccgttaaccccgagccccagattata
gacgacccaacgaacggtacgcctgtttgcagcaatgttccgttagcatatactatacaa
tcaagtattccttcgtcaacctttttatggagccgtgctgcagccggcgacaaccctgcc
gtagacaatcaaaccgatgcaacaattaacgaaacgcttgtaaataccagtgtattcccg
cttagggtaacttacattataacgccttttgcctacggttgtgccggcaagccgtttacc
tataccaggtttgttttatcgcagatagcgaagcccgtgggtaacggaaccacaccggtt
tgcgaaggcacacccatacattttgataccgccccggtttcgggagcttcctatttatgg
acagggccaaataattatcaatcaacagatcgttcgccaaccataccaggtgcaacagca
gccaatgctggtacatacaggctttttattaaaataggcgactgtttcagcgaaccatct
gaaggtgtacggatagaggtaaaacctacaccggtagtaattgccggtcccgaggttacc
tattgtaaaacaatacccgttattcagcttgatggttcgataccaaccgggggcaccggc
gtatggagcggaggcagcggacaatttactaaggttgatgatcctaaaactacctacacc
ccctcgccggctgatagagaaaaagattttataacacttaaattaacatccaccggttat
tgcgatcctgtttcatcttttgttaaaattaattttgccccaagccctggtgccaatgcc
gggcccgatcaaaataatatctgtaatcaaaacccgatggttcagttacagggcacaccg
ctttcgggcagcacggtaacctggagttcggcctcgggcaaaggcaggttcattccatcg
gccaatgtaaccaatcctacattcgagcctgatccggccgatatagccaaaggttttgtt
aagttaacacttactgctaccagtgcagatgaatgccatacacctaccgatgatatgacc
ataaactttgtaccgccgccaactgttgaggccgatgctgcgggcgatacaaggtatgtt
ttaaaaggccacaccataaccctcaacccggtagtaagcaatgaaaacgtaagttataca
tggaccccggctacaggcctgagcgatgctaacattaaaaaccccgaagtaaccggtgat
gtagatataacctacaagcttaccattaccgatctgtcgaacgggtgccctaacagcagt
tttgtaaatgtaaaggttgcgccaaacattgttgtaaaaaacacctttacgcctaatgcc
gatggcgtgaatgattactgggaaattacgggcctgatagcttatgaggacgttaccgta
gatgtgtataaccgctacggccagcctgtattccattcgttaggttatccaaaaccctgg
gatggcggcgttaatggtaagctggtaccaagcggtacctactattacgtaattaacagc
aagcaggaaaaactgcggctatctggttacgtggtggtattaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
