Mesitornis unicolor (brown roatelo): 104539333
Help
Entry
104539333 CDS
T08455
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
mui
Mesitornis unicolor (brown roatelo)
Pathway
mui04510
Focal adhesion
mui04512
ECM-receptor interaction
mui04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mui00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
104539333 (COL1A2)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
104539333 (COL1A2)
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
104539333 (COL1A2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mui00536
]
104539333 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
mui00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
104539333 (COL1A2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104539333
NCBI-ProteinID:
XP_010181131
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1339 aa
AA seq
DB search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NT seq
4022 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtgaatcaggcacctgaagggcagaagggccctagaggagacaaagggccacagggag
aaaggggtccaccaggtccaccaggcagagatggagaagatggtccaccaggtcctccag
gcccccctggtcctccaggtcttggcggaaacttcgctgctcaatatgatccatctaaag
cagctgattttggcccaggacctatgggtttaatgggacctagaggcccacctggagcat
ctggaccccctggtcctcctggttttcaaggtgtccctggtgagcctggtgaacctggtc
aaacaggtccccagggtcctcgtggtccccctggtcctccaggaaaggctggtgaagacg
gtcatcctggcaaacctggaagacctggtgagagaggtgttgctggccctcagggtgctc
gtggtttccctggaactcctggtctgcctggctttaagggaattaggggacataacggtc
tggatgggcaaaagggacaacctggtactcctggaaccaagggagaacctggtgcccctg
gtgaaaatggtaccccaggacaacctggtgctcgtggtctccctggtgagagaggaagag
taggtgcccctggaccagctggtgctcgtggaagtgatggcagtgctggccccactggac
ctgctggtcctattggtgctgccggtcctccaggcttcccaggtgctcctggtgctaagg
gtgaaatcggaccggctggtaatgttggtcctagtggtcctgctggtccaagaggagaga
ttggacttcccggttccagtggtcctgttggccctccaggcaaccctggtgctaatggtc
ttccaggggctaaaggtgcagctggtcttcctggtgttgctggtgctcctggtctgcctg
gtccccgtggtattcctggtcctcctggccctgctggtcctagtggtgctagaggacttg
ttggtgaaccaggccctgctggtgccaagggagaaagtggtaacaagggtgagcccggtg
ctgctggacccgctggccctcctggtcctagtggtgaggaaggcaagagaggcagcactg
gtgaacctggctctgctggtcccccaggccctgctggtctaagaggtgtgcctggatctc
gtggtctccctggagctgatggcagagctggtgtcatgggacctgctggtaaccgtggtg
ctagtggtcctgttggtgctaagggtcctagtggtgatggtggccgtcctggtgagcctg
gtcttatgggtccaagaggtctcccaggtcagcctggaagcccaggccctgctggcaagg
aaggccccgttggtttccctggagcagatggtagagttgggccaattggtccagctggta
atagaggtgagcctggcaacattggattccctggaccaaaaggtcccactggtgaacctg
gcaaacctggtgaaaaaggcaatgttggtgttgctggcccacggggtgctcctggtccag
agggaaacaacggtgctcaaggtcctcctggagtcactggcaaccaaggtggaaagggtg
aaacaggtcctgctggccctcctggcttccagggtctgccaggtccctcgggtccagctg
gtgaagctggtaaaccaggcgaaaggggtcttcatggtgaatttggtgtccctggacctg
ctggcccaagaggtgaacgtggtcttcctggtgaaagcggtgctgttggtcctgctggtc
ccattggaagccgtggtccatctggcccaccaggccctgatggtaacaagggtgagcctg
gcaatgttggtgctgctggtggtcctggtcctgctggccctggtggaatcccaggagaga
gaggtgttgctggtgttccgggaggcaagggtgaaaagggtgccccaggtctgagaggtg
atactggtgcaactggaagagatggtgctcgtggtctccctggtgctattggtgctcctg
gccctgctggtggtactggtgatcggggtgaaggaggtcctgctggtcccgctggtcctg
ctggtgcccgtggtatccctggtgaacgtggtgagcctggtcccgtaggtcctagtggat
ttgctggacctcctggtgcagctggtcagcctggtgctaaaggcgagcgtgggcctaaag
gacctaagggtgaaagtggaccaacaggtgctattggcccaattggtgcttctggaccac
caggtcctgctggtgctgctggtcctgctggccctcgtggtgatgctggtcctcctggca
tgactggtttccctggtgctgctggaagagttggtcctccaggccctgctggcatcagtg
gtccccctggtcctcctggcccagctggcaaggatggtcctagaggtctacgtggtgacg
ttggtccagttggccgcactggtgaacaaggtattgctggcccacctggttttgctggtg
agaaaggtccatctggagaggccggtgctgctggacctcctggtaccccaggtcctcagg
gtattcttggtgctcctggtatccttggtctgcctggctctcggggagaacgtggtcttc
caggcatctctggagcaacaggtgaacctggtcccctgggtgtttctggtcctcctggtg
cccgtggtccctctggtccagtgggttctcctggtccaaatggtgctcctggtgaagctg
gtcgtgatggcaatcctggaaatgatggtcctccaggccgtgatggtgctcctggtttca
agggtgagcgtggtgctcctggtaaccctggtcccagtggtgctctgggtgctcccggtc
ctcatggccaagttggtccttctggaaagcctggaaaccgtggtgatcctggtcccgctg
gtgttgtcggtcctgctggtgcttttggtccaagaggtcttgctggcccacaaggtccac
gtggtgagaagggtgaacctggcgataaggggcctagaggtctgcctggcttgaagggac
acaatggattgcaaggacttcctggtcttgctggccaacatggtgatcaaggtcctcctg
gtaacaccggccctgctggcccaaggggtcaacctggtccttctggtcctcccggtaaag
atggtcgcaatggtctccctggacctattggccctgccggtgtgcgtggctctcatggta
gccaaggtcctgctggtcctcctggtcctcctggtccccctggtcctcctggtcccaatg
gtggtggatatgaagttggttttgatgcagaatacttccgggctgatcagccttccctca
gacctaaggattatgaagttgatgccactctgaaaacattgaacaaccaaattgagaccc
tgctgacccctgaaggctccagaaagaacccagctcgcacctgccgtgacctaagactta
gccacccagaatggagcagcggcttctactggattgatcctaaccaaggctgctctgcag
atgccattagagcatactgtaactttgctactggtgagacttgcatccatgccaaccctg
accatattcccgctaagaactggtatgtcaacaagaatcccaaggacaagaagcacgtat
ggtttggtgaaactatcaatggtggcagccagtttgaatacaatagtgagggtgtgacga
caaaggatatggccacccagcttgccttcatgcgtctgctggccaaccacgcctcccaga
acatcacctaccactgcaagaacagcattgcctacatggatgaggaaaccggcaacctta
aaaaggctgttatactgcagggatccaacgacgttgaactgcgagctgaaggcaacagca
gattcacttacagtgttcttgtggacggctgctctagaaagaacaatgaatggggcaaaa
caatcattgaatacagaacaaataagccatctcgcttgcccattcttgacattgcacctt
tggatattggcagccctgaccaagaagttagtttggacattggcccagtctgttacaaat
ga
DBGET
integrated database retrieval system