Microcaecilia unicolor: 115468695
Help
Entry
115468695 CDS
T09142
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-2(I) chain
KO
K06236
collagen type I alpha
Organism
muo
Microcaecilia unicolor
Pathway
muo04510
Focal adhesion
muo04512
ECM-receptor interaction
muo04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
muo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
115468695 (COL1A2)
09140 Cellular Processes
09144 Cellular community - eukaryotes
04510 Focal adhesion
115468695 (COL1A2)
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
115468695 (COL1A2)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
muo00536
]
115468695 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
muo00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
115468695 (COL1A2)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
COLFI
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115468695
NCBI-ProteinID:
XP_030056470
UniProt:
A0A6P7Y0C3
LinkDB
All DBs
Position
1:135172805..135255826
Genome browser
AA seq
1361 aa
AA seq
DB search
MLSFVDTRILLLLAVTSYLATCQYENEIRRGPRGDRGPRGERGPAGPPGKDGEDGPPGPP
GPPGVGGNFAAQYDPSKAAMPEAGAMGIMGPRGPPGPPGSPGPHGFQGLAGEPGEPGQTG
PVGSRGPAGPPGKAGDDGHSGKPGRPGERGTVGTQGARGFPGTPGLSGFKGIRGHNGFDG
QKGGPGEAGVKGETGAPGENGSPGQQGARGNSGDRGRIGGPGPAGSRGSDGSPGPLGPAG
PIGSAGVPGLPGAPGIKGEIGPAGSVGPSGAAGARGEIGPGGPVGPVGPAGNPGANGLPG
AKGAAGVAGVAGAPGLPGARGIPGPQGPAGAAGARGLSGDPGSAGGKGDGGAKGEPGAAG
PAGPSGPSGEEGKRGPNGEAGPSGPSGPAGIRGVPGSRGLPGPDGRAGGMGPAGSRGASG
PAGGRGPSGDAGRPGEPGALGHRGLPGNPGHGGPTGKEGPAGLQGSEGRSGPAGPAGPRG
EPGSTGFPGPSGPSGEPGKNGERGNAGSTGPRGAHGPDGHNGAQGPAGIAGGQGSKGEQG
AAGAPGFQGLPGPGGPAGEVGKPGDRGIPGEFGLPGPGGPRGERGPPGESGGVGPAGSFG
SRGPSGPPGPDGNKGEAGIGGPPGAVGPAGSGGIPGERGIAGGPGGKGEKGETGARGELG
NPGRDGGRGPAGTAGAPGPSGGPGDRGESGPSGPAGHVGSVGAAGERGEDWSRWSPGFAG
PPGAAGHAGAKGERGVKGSKGEVGPGGPVGPVGSTGPAGPSGPSGAPGIRGEVGPAGATG
FPGAAGRIGTAGPSGISGPPGPSGHAGKDGPRGPRGDSGPVGSPGEQGPVGPLGLPGDKG
PSGEAGPAVSAPGSSGPSGVLGARGIVGLPGTRGERGLPGGPGGNGESGPSGPSGVPGPR
GTSGPVGSMGLNGAPGEAGRDGNPGHDGAPGRDVIQAPRVNVGYPGGPGHVGSAGAPGGP
GAVGPAAQSGNRGEACKLHGPQGSQGPSGHAGPRGPAGAQGIRGEKGEHGEKGARGLDGR
KGHNGLQGLPGLAGPSGESGSPGNLGPSGPRGPAGPSGPSGKDGRAGQPGPIGPSGVRGS
NGHQGPAGPPGPPGPPGPPXTSGGGYDGFDGGDSYRADQPSLRPKDYEVDSTLKSLNNQI
ETLLTPEGSRKNPVRTCRDLRLSHPEWPSGYYWIDPNQGCVXGAIRAYCDFSTGETCIHS
NPDTFPAKNWYSKNPRKRSTQWFGEVMNGGTQFEYNDEGLTSKDMATQLAFMRLLANHAS
QNITYHCKNSIAYKDDETGNLKKAVILLGSNDVELRAEGNSRFTFSVLEDGCTKHTGEWG
KTVIEYRTNKPSRLPFLDIAPLDIGGADQELGVDVGPVCFK
NT seq
4086 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcagctttgtggatacacggattttgttgctgcttgcagtaacttcatacctagca
acatgccaatatgaaaatgagattcggaggggtcccagaggagacagaggcccaaggggg
gagaggggtccagcaggcccaccaggcaaagatggtgaagatggtccacccggcccacct
ggtccccctggtgttggcggaaactttgcagctcagtatgatccctccaaagccgcaatg
cctgaagccggagccatgggtataatgggaccaagaggcccaccaggtccacctggatct
ccaggtcctcatggcttccaaggtcttgctggtgagcccggtgaacctggtcagactggt
cctgttggttccagaggtcctgctggtccacctggaaaggccggtgatgatggtcactct
ggcaaacctggaagacctggtgagaggggtacagttggtactcagggtgctcgtggtttc
cctggaactcccggtctgtctggctttaaaggaatcagaggacacaatggttttgatggt
cagaagggaggtccaggagaagcaggtgttaagggtgaaactggagctccaggtgaaaat
ggcagcccaggacaacagggtgctcgtggcaactctggtgaccgaggacgcataggcggt
cctggccctgctggttctcgtggaagtgatggcagcccaggtccccttggtccagctggc
cctattggttcagctggtgttccaggtctccccggtgctcctggtatcaagggagaaatt
ggacctgctggaagtgtaggtccttctggtgctgctggtgcaagaggtgagattggtcct
ggcggccctgttggtcctgttggccctgcaggtaaccctggagctaatggtttgcctggt
gctaaaggtgctgctggtgttgctggtgttgctggtgctcctggtctacctggtgcacgt
ggtattcctggaccacaaggccctgctggtgccgctggtgcaagaggactttctggtgat
cctggttcagctggtggaaagggagatggtggcgcaaagggtgaacctggtgctgctggt
cctgctggcccttctggtccctctggtgaagaaggcaagagaggccccaatggtgaagct
ggtcctagcggtccttctggccctgcaggcataaggggtgttcctggatctcgtggtctg
cctggacctgatggaagagctggtggaatgggtccagctggcagtcgtggtgcttctggt
cccgctggtggcagaggcccttctggtgatgctggtcgccctggcgagcccggtgcatta
ggtcatagaggtcttcctggaaaccctggacatggaggtcctacaggcaaagagggtcct
gctggtctccaaggtagtgaaggtcgttccggccctgcaggcccagctggtccaagagga
gagcctggtagcacaggattccctggtccatcaggccctagtggtgaacctggcaagaat
ggtgaaagaggcaatgctggatctactggaccaaggggtgctcatggccctgatggccac
aatggtgctcaaggtcccgctggtattgctggaggtcaaggttcaaaaggtgaacaaggt
gcagctggtgctcctggcttccaaggtcttcctggacctggtggtcctgctggagaagtt
ggcaaaccaggagacaggggtattcctggtgaatttggtttgcctggtcctggtggtcca
agaggtgagcgtggtccccctggtgaaagtggtggtgtaggacctgctggatcttttgga
tcccgtggtccatctggtccacctggccctgatggaaacaagggtgaagcaggtattggt
ggcccacctggcgctgttggcccagcaggctctggcggaatccctggtgagaggggtatt
gctggtggtcctggaggtaaaggagaaaagggtgaaactggtgccagaggtgaacttggc
aacccaggaagagatggtggacgaggtcctgctggtacagctggagctccaggtccttca
ggtggtcctggtgataggggagaatctggtccttctggtcctgctggtcatgttggttct
gttggggctgctggtgaacgtggtgaggactggtcccgctggtcccctggcttcgctggt
cctcctggtgcagctggccatgctggagctaagggtgaaagaggtgttaaaggatctaaa
ggtgaagttggcccaggaggtcctgtgggtcctgtaggttctactggtccagcagggcct
agtggtccttcaggagctcctggtattcgtggtgaagttggcccagctggtgcaactggc
ttccctggagctgctggcagaattggtactgctggtccctcaggcatttctgggccacct
ggtccttctggtcatgctggtaaagatggacctagaggaccacgtggtgacagtggtcca
gttggtagtcctggtgaacaaggtcctgttggcccgttgggtcttccaggtgacaaaggt
ccatctggcgaagctggtcctgctgtaagcgctcctggcagttcaggcccttcaggtgtt
cttggtgctcgtggtatcgttggtctgcctggtactagaggtgagcgtggtctcccaggt
ggtcctggaggaaatggtgaaagtggtccttcaggtccttcaggtgtacctggtccccgt
ggtacttctggtccagttggttctatgggtttgaatggtgctcctggtgaagctggccgt
gatggcaatcctggtcatgatggtgctccaggccgtgatgtcatccaggcgccaagggtg
aacgtgggttatcctggtggtcctggacatgttggaagtgcaggtgcccctggtggtccc
ggagctgttggacctgcggcacaaagtggcaatcgtggtgaggcatgtaagttgcacggt
cctcaaggttcccaaggtccatctggtcatgctggcccacgaggacctgctggtgcacaa
ggcatacgtggtgagaaaggtgaacatggtgagaagggagcaagaggtctggatggccgg
aaaggacacaatggattgcagggtctgccaggtcttgctggaccatcaggcgaatcaggt
tctccaggtaatcttggcccctccggtccaaggggtcctgctggtccttcaggtccttct
ggtaaagatggtcgggcaggacaaccaggtcccattggcccttctggtgttcgtggttct
aatggccaccaaggccctgctggtccaccaggcccacctggtcctcctggtcctccgngt
acatctggaggtggctatgatggttttgatggtggtgattcctacagggctgatcagcct
tcactcagaccaaaagattatgaagtggactccactctgaaatctctgaataaccaaatt
gagactctgctgacccctgaaggatcaagaaagaacccagttcgcacctgccgtgactta
agactcagccatccagaatggcccagtggctactactggattgatcctaaccaaggatgt
gtcnccggagctatcagagcctactgtgatttctctactggtgaaacttgcatccattcc
aatccagacaccttcccagccaagaactggtacagtaagaacccaaggaaaagaagcaca
caatggtttggtgaagttatgaatggtggtactcaatttgaatacaacgatgaaggttta
acctccaaggacatggccacacaacttgccttcatgcgtctgctggccaatcatgcttct
cagaacattacttaccactgcaagaacagcattgcctacaaggatgatgagactggcaac
ctgaagaaggcagtcattctgctgggctccaatgatgttgaactacgagctgaaggcaac
agcaggttcactttcagtgtgcttgaagatggctgcactaaacacaccggcgaatggggc
aaaacagttattgaatacagaacaaataaaccatctcgcttgcccttcctcgatattgca
cctttggacattggtggcgctgaccaggaactcggagtggacgttggcccagtctgtttc
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system