Microcaecilia unicolor: 115473034
Help
Entry
115473034 CDS
T09142
Symbol
NOTCH1
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
muo
Microcaecilia unicolor
Pathway
muo04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
muo00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
115473034 (NOTCH1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_TEN
EGF_CA
Ank_2
Ank
Notch
NOD
NODP
EGF_2
Ank_3
Ank_5
Ank_4
EGF_3
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
115473034
NCBI-ProteinID:
XP_030063501
UniProt:
A0A6P7YEY2
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(282189171..282349642)
Genome browser
AA seq
2527 aa
AA seq
DB search
MRWFLVYVLLLSLPAFTRGLRCTQPTETCLNGGKCETALDGTGECRCNSDYVGERCQFSN
PCQSSPCRNAGTCHPVISGNAVDYICKCPVQFTDKLCVTPDNNICLHNPCRNGGTCELIT
LADYKCRCPPGWTGETCQQADPCASNPCGNGGQCVPFEAQYVCKCASGFHGQTCKQDVNE
CMQNPCKNGGTCTNEVGSYRCDCKQTFTGRNCELLYVPCNPSPCQNGGTCRQTSDTTYDC
TCLPGFSGQTCEENIDDCPGHACMNGGACVDGVNTYNCQCSPEWTGQFCTEDVDECQLMP
NACQNGGTCHNIHGGYNCVCVNGWIGEDCSDNIDDCANAACYHGATCHDRVASFYCECPH
GRTGLLCHLDDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYMGPACNQDVDECSLGANPC
EHGGKCINTQGSFQCQCGQGYTGPRCEIDVNECLSSPCQNDATCLDQIGGFQCICMAGYE
GVYCEINTDECASSPCLHNGKCIDKINEFQCKCPTGFSGPLCQVDIDECASTPCKNGAKC
LDGPNMYTCECREGFTGTHCEEDIDECSPDPCYYGTCSDGIASATCLCDLGYTGHRCEIN
INECQSMPCQNGGECQDQIAGYICKCPKGTTGPNCETNLDDCASNPCDYGRCIDKINSYE
CACEPGYTGRMCNINIDECASYPCHNGGTCKDAINGFTCICPEGYQDPVCLSEVNECNSN
PCIHGKCHDGVNGYNCDCDLGWSGTNCDINNNECESNPCMNGGTCKDMTSGYICTCREGF
SGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCMLPYTGTTCDTVLAPCTSSPCKNGGT
CQESEDYESFSCQCPTGWQGQTCEIDMNECIISPCRNGAGCVNTAGSYRCNCVDGYTGRN
CETDVNDCQPNPCQNGGSCSDGISTFFCSCLAGFRGPRCEEDINECASNPCKNGANCTDC
VNSYTCTCPCGFSGIHCENNTPDCTESSCFNGGTCMDGINTFTCLCPTGFTGSYCEHDIN
ECDSKPCLNGGTCQDSYGTYKCTCPQGYTGLNCQSLVPWCDSAPCKNGGKCWQTNNLYRC
ECDSGWTGLYCDIPNVSCEVAARQQDVDVTNLCRNSGFCVDTGNTHYCRCSVGYTGSYCE
EQVDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCECVPGYHGINCSEEINECLSHPCQNGGTCIDLIN
TYKCSCPRGTQGVHCEINVDDCTPFFDTINLEPKCFNNGKCTDKVGGYSCICPPGFVGER
CEGDVNECLSNPCDTRGAQNCIQLVNDYRCECMQGYTGRRCESVVDGCKGKPCRNGGRCS
IASNTGRGFICRCLPGFDGASCEYDSRTCGNLRCLNGGTCISVHKTSKCMCPAAFTGLEC
QHPVNNSPCNSSPCYNGGTCQPSSEAPFYQCLCPVNFNGLFCHILDYRFFGGLGQNITSP
KIEEHCENAVCTEYAGNKICDRKCNNHACEWDGGDCSLDFYDPWKNCTDSLQCWTYFNNG
KCDSQCNNAGCLYDGFDCQKVEVQCNPLYDQYCKDHFQDGHCDQGCNNAECEWDGLDCAN
NMPKNLADGTLVLVVLLSPEKLKNNSLNFLRELSRVLHTNVVFKKNAKGEYMIFPYYGNK
EELKKHRMKRSTEDWSNVPGTIFEKVTSSFFSSSGGRQHRELDEMEVKGSIVHLEIDNRQ
CLHSSSQCFQSATDVAAFLGALASRGTLNIPYRIEAVKSETKDPDKASQIYFVYVGLAFL
VVLGFSLVGVLFRKRRREHGQLWLPDGFKMTESSKKKRREPLGEDSVGLKPLKNSTDGSL
MDDNQNEWGDEETLDSKRFQFEEQVMLPELDDQTDHRQWTQQHLDAADLRNPSMAPTPPQ
GEIDVDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLETANSEEEEDVSGNVISDFIYQGASLHNQ
TDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDHMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRN
RATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDA
AIVLLKNGANKDMQDNKDETPLFLAAREGSCETIKVLLDHFANRDITDHMDRLPRDIAQE
RMHHDIVQLLDSYNLVRSPPMSNGTLGAPTLSPPICSPNGYLGNMKPAVQGKKARKPSTK
GLGCNGKDSKDMKARRKKSQDGKGSLLDSASVLSPVDSLESPHGYMSDIASPPLLTSPFQ
QSPSMPMNHLPGMTDAHISLNHLNLPGKQDLGMGGSNRMGFESVPPRLSHLPVSSPNTIL
GSGSMNFTVGGTSMNGQCDWLSRLQNGMLQNQYNPVRSNIQQGSHQSTQALQHGMMTSLH
NGLPTTTLSQMMSYQAIPTTRLANPPHLIQAHQLQQIQQQNLQQQIQQQNLQQQHHTSNT
TANGHITQPFCSSDISQSDLQQSMSVHTVLPQDPQILTTLPTSLTQSIQTTQFLTPPSQH
GYSSPMDNTPNHQLQVPDHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNISDWSEGISSPPTSIQAQMG
HIPEAFK
NT seq
7584 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggtggtttttggtgtacgtcttgctactgtcactacctgccttcacacgaggttta
cgatgtacgcagccaactgaaacctgcttgaatggaggaaagtgtgaaacagcccttgat
gggactggagaatgtagatgtaacagtgattatgtaggtgagagatgtcagttctccaat
ccttgccaaagttcaccgtgcaggaatgctggaacgtgccatcctgtgatcagtggaaat
gcagtggattacatctgtaaatgcccagtacaattcacggacaaactgtgcgtcacacct
gataacaacatctgtctgcacaatccctgccgcaatgggggcacctgtgaactcatcaca
ctggcagattacaagtgcagatgtcccccaggctggacaggtgaaacatgtcagcaggct
gatccttgtgcatccaacccctgcggcaatggtggacagtgtgtgccattcgaagcccag
tatgtctgcaagtgtgcttctggcttccatgggcagacctgcaagcaggatgttaatgaa
tgtatgcagaatccgtgcaagaatggtggaacgtgtaccaatgaggttggatcctacaga
tgtgactgcaagcagaccttcacgggtcgcaactgtgagctcctttatgtgccttgcaac
ccttcaccttgtcagaatgggggtacctgtcgtcagaccagtgataccacttatgactgc
acttgcctcccaggtttttctggtcagacctgtgaggaaaacattgatgactgccctgga
catgcctgtatgaatggaggagcttgtgttgatggtgtgaacacatataactgccagtgt
tcacctgaatggacaggccagttctgcaccgaggatgtggatgaatgtcagcttatgcca
aatgcctgccagaatggaggaacttgccacaatatccatggaggatacaactgtgtctgt
gttaatggctggattggcgaggactgcagtgataacattgatgactgtgctaatgccgcc
tgctaccacggagccacatgccatgaccgggtagcatctttctactgcgagtgcccgcat
ggacgtacaggtttgctctgccatcttgatgatgcatgcatcagtaacccttgcaatgaa
ggatccaactgtgatacaaaccccgtcaatggaaaggccatctgcacatgtccttctggt
tacatgggacctgcctgcaatcaagatgttgatgagtgctcccttggtgctaacccttgc
gagcatggcgggaaatgcataaacacacagggatccttccagtgccaatgtggccaggga
tacactggtcctcgctgtgagattgatgtcaatgagtgcctgtctagtccctgtcagaat
gatgctacctgcctagaccaaattggaggattccaatgtatctgcatggcaggatatgag
ggagtgtattgtgaaatcaacacagatgagtgtgccagcagcccttgcttgcataatgga
aagtgcatcgataaaatcaatgaatttcaatgcaagtgccccacaggtttcagtggccct
ctctgtcaggttgatattgatgagtgtgccagcactccatgcaagaatggtgccaagtgc
ctggacgggcccaacatgtacacttgtgaatgcagagaaggatttactggtacccactgc
gaggaggacatcgacgagtgctccccagatccttgttattatgggacctgtagtgacggg
attgcttccgccacttgtctctgtgatcttggttacaccggccaccggtgtgaaattaat
atcaatgagtgccagagtatgccatgtcagaatggtggagagtgccaggatcagattgct
ggctatatttgcaagtgcccaaaaggaaccacagggccaaattgtgaaaccaacttggat
gattgtgccagcaacccctgtgactatggcagatgtattgacaagatcaatagctatgag
tgcgcatgtgaacctggatatacagggagaatgtgtaacattaatattgatgaatgtgcc
tcctacccatgtcataatggagggacatgcaaggatgccatcaatggtttcacctgcatt
tgcccagagggataccaggaccctgtgtgcctctctgaggttaatgagtgcaacagcaac
ccctgcattcacgggaagtgccacgacggagtcaatggttacaattgtgactgtgacctg
ggttggagtggcaccaattgcgacattaacaacaatgagtgtgagtccaacccttgcatg
aatggtggaacctgcaaggacatgaccagtggatacatctgtacctgccgagagggcttc
agtggtcctaactgccagactaatatcaatgaatgtgcgtccaacccatgtctgaaccag
gggacctgcatagatgatgtggctgggtacaaatgtaactgcatgctgccctacacaggc
accacctgtgacacagtgctggctccttgtacctcaagtccttgtaagaatggaggtaca
tgccaggaatccgaagactacgagagcttttcgtgccagtgtccaacaggatggcaaggt
caaacatgtgagatagacatgaatgagtgcattataagcccctgccgcaatggtgcaggg
tgtgtgaacacagcagggagttacaggtgtaactgcgtggatggctacacgggccgcaac
tgtgaaaccgatgtcaatgactgccagccaaacccttgtcagaatggtggatcctgttcc
gatggtatcagcactttcttctgcagttgtctggcaggattccggggtccaaggtgtgag
gaggatatcaatgagtgcgccagcaacccgtgcaagaatggtgccaactgtactgactgt
gtcaacagctacacatgcacctgcccctgtgggtttagtggtatccactgtgaaaataat
actccagactgcactgagagctcctgttttaatgggggcacttgtatggatggcatcaac
accttcacctgcctatgtccgaccggcttcacgggtagctactgtgaacatgacattaat
gaatgtgattccaagccatgcctgaatggtggaacctgtcaggatagttacgggacctat
aagtgtacttgtccccaaggatacactggtctgaactgtcagagccttgtgccgtggtgt
gattctgctccctgcaaaaacggaggcaaatgctggcaaaccaataacctgtaccgctgt
gagtgtgacagtgggtggacaggtctctactgcgacatccccaatgtttcctgcgaagtg
gctgccagacagcaggatgttgatgtcacaaatctctgtaggaactctggtttctgtgtg
gacacgggtaatacacattactgccgctgctcggtggggtacactggcagctactgtgaa
gaacaagttgatgagtgctctccaagtccctgtcagaatggagccacatgcacagactat
ctgggaggctactcctgtgagtgtgttcctggctatcatggtattaactgctcagaagag
atcaacgagtgtctatctcacccgtgccagaatggcgggacctgtatcgatctcattaat
acctacaaatgctcctgccccagaggaactcaaggtgttcactgtgaaatcaatgttgat
gactgcactccatttttcgacacgatcaatctggagcccaaatgttttaacaacgggaag
tgtactgataaagtgggcggctacagctgtatctgccctcctggctttgtgggcgagcgc
tgtgagggggacgtcaacgagtgcctgtcaaacccctgtgacacccggggggctcagaac
tgcattcagctggtgaatgactacaggtgtgaatgcatgcaaggatatacaggtcgccgc
tgtgaatcggtagtggatggttgtaaagggaaaccttgcaggaatggtggcagatgttct
attgctagcaacactggacgtggctttatttgcaggtgccttcctggctttgacggtgcg
tcttgtgagtatgattcacgcacgtgtgggaacctgcgctgtctgaatggtgggacttgc
atctctgtgcacaagacctcaaaatgcatgtgcccagctgcatttacaggacttgagtgc
cagcaccctgtcaacaacagcccttgcaattccagcccatgctacaatggtggcacttgc
caacccagctctgaagcccccttctaccaatgtctctgcccagtcaatttcaatggcctc
ttctgccacatcctggactatagattctttggaggtctagggcaaaacatcacctcaccc
aagattgaagagcactgtgagaatgcagtgtgtacagagtatgccggcaacaagatctgc
gacaggaaatgcaacaaccacgcttgtgagtgggacggaggggactgctctctggatttc
tacgacccctggaagaactgcacagattccctgcaatgctggacatatttcaataatggg
aaatgtgactcccagtgtaacaatgctgggtgtctctatgatgggtttgactgccagaaa
gtcgaagtccagtgcaaccctctctatgaccagtactgcaaagaccactttcaggatggc
cactgtgatcagggctgtaacaatgccgagtgtgaatgggatggcttggattgcgccaac
aacatgccaaagaacctggcagatggcaccttggttctggtagtgctcctgtcgccagaa
aagctgaaaaacaactccttgaattttctgcgggagctcagtcgtgtgttgcacactaat
gtggtgttcaagaagaatgccaagggagagtacatgatcttcccttactatggcaacaaa
gaagaactgaagaagcaccgtatgaagaggtcaacagaagactggtctaatgtgcctggt
actatctttgaaaaggtgaccagctcattcttttcctcttctggtgggagacagcaccgt
gaactagatgagatggaagtcaaagggtccattgtacatctggaaattgacaatcgccag
tgcctccactcttcttcccagtgctttcagagtgcaacagatgttgctgctttcctgggt
gctctggcctcaagggggaccctgaacatcccctacaggatagaagctgtcaaaagtgag
acgaaggacccagataaggcatcccagatatatttcgtttatgtggggctagcttttctg
gtcgtgttaggtttcagtttggtgggcgtcctgtttcgtaagcggaggagggagcatggg
caactttggctccctgatggcttcaagatgacagagtccagcaaaaagaaaaggcgggaa
ccgcttggggaggattcagttggtctgaaacctctgaagaattctactgatggttccttg
atggatgacaaccaaaatgaatggggtgatgaggaaaccctggacagcaagagatttcag
tttgaggagcaggttatgctgccagagctagatgaccagactgaccatagacagtggact
caacagcacctggatgctgctgaccttcggaatccatccatggcaccaaccccacctcag
ggagaaatagatgtagactgcatggatgtcaacgtccgagggcccgatgggttcacccca
ctcatgattgcatcatgcagtggaggaggactggaaactgccaacagtgaagaagaggag
gatgtctctggcaatgtgatttctgatttcatctaccagggtgccagcctgcacaaccaa
acagaccgtacaggcgagacagcactgcacctggcagcacggtacgcccgctcagatgca
gctaagcgcctgctggaggccagcgctgatgccaacatccaagaccacatgggacggaca
cctctccacgctgcagtagccgccgatgcccagggtgtttttcagattctaataagaaac
cgagctacagacctggatgcccgtatgcatgatgggacaaccccattgattctggcagct
cgcttggcagtggagggtatggtggaggagctgattaactgccatgcagatgtcaatgct
gttgatgaactaggtaaatctgctttgcattgggcggctgctgtcaataatgttgatgct
gccattgtgctactgaagaatggtgcaaataaggatatgcaagataataaggatgaaaca
ccattattccttgcagccagggaagggagctgtgaaaccatcaaagttcttctagaccac
tttgcaaatcgtgacatcacagatcatatggataggctgcctcgtgacatcgcacaagag
cgcatgcatcatgacattgtccagttgttggatagctacaacctagtgcgaagtccacca
atgagcaatggtactcttggagcaccaactctctctccccccatctgctctcccaatggt
tacttgggcaacatgaaacctgcagttcaggggaagaaagcaagaaagccaagcacgaaa
ggtctggggtgtaatggcaaagattccaaagacatgaaggcaaggagaaaaaaatctcag
gatgggaaaggcagccttttggatagtgctagtgtattatcaccagtggattccctagaa
tcacctcatgggtacatgtcagatattgcatcgcctccattgttgacttcaccatttcag
cagtccccctcaatgcctatgaatcatctcccaggcatgactgatgctcatatcagccta
aatcaccttaacctgcctggtaaacaggatctgggaatgggcggttccaacagaatgggc
tttgaatcagtacctccacgtctttctcatcttcctgtatcaagtcccaacacaatatta
ggcagtgggtctatgaattttacagtgggtggaacttctatgaatggtcagtgtgactgg
ttatcaagattgcaaaatggaatgctgcagaatcagtacaatccagtgagaagtaacatt
caacaagggtcccaccagtcaacccaagccctccagcatggtatgatgacatcactacac
aatggtttgcccacaacaactttatctcagatgatgagctatcaagccatacctaccaca
aggctggccaacccacctcatttaatacaggctcatcaactacagcaaattcaacaacaa
aatctgcagcagcagatacaacagcaaaacttgcaacaacagcaccacacctccaatacc
acagctaacggtcacattactcagccattttgcagcagtgatataagccagtcagacctg
caacagagtatgtcggttcacacagttttgcctcaagacccccagattctgacaactcta
ccaacgtcactcacacaatctattcaaacaacccaatttttaactccaccgtctcagcac
ggttactcttcccctatggacaatacacccaatcaccaactgcaagttccagatcacccc
ttcttgactccatcccctgagtcacctgaccagtggtcaagctcctcccctcattccaac
atatctgattggtcagaaggtatatccagtcccccaacgagtatacaggcacaaatgggg
cacattccagaagcattcaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
