Musa acuminata (dessert banana): 104000436
Help
Entry
104000436 CDS
T03447
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
mus
Musa acuminata (dessert banana)
Pathway
mus03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mus00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
104000436
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mus03019
]
104000436
Messenger RNA biogenesis [BR:
mus03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
104000436
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
104000436
NCBI-ProteinID:
XP_009420757
UniProt:
A0A804KU74
LinkDB
All DBs
Position
BXJ2-10:complement(22974343..22981078)
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MDSDEGKLFIGGISWETTEDKLKDHFGNYGEVLDAVIMRDKVTGRPRGFGFVVFADPSLL
DRVLQDNHTIDGRTVDAKRALSREEQQMSARSGNTTSGNPTSGRSAGAGAGANIRTKKIF
VGGLPPTLTEDGFRQYFESFGTVTDAVVMYDQNTHRPRGFGFISFDSEDTVDKVLQKTFH
DLNGKPVEVKRALPKDANPNTGSGRSMGGGSHQSYGGSSGNASSYDGRPDANRYMQPQAP
AYSSSAYGAPGYGYGTANSGVGYAGYGVGGYGSAGAGYNGPAGAYGNPNAPMAGYVGGPP
GAQRNLWSNQAPSGYGPAGYGGSAAYGPAASWNASAASGGSGAVPTGQSGTPGYVSQGYG
YGAYGGSEGPYGTQGGYGSLGGRGSSGPGGSPAGNTGEQGAGSAYMGGSYGIPNANSGYP
NAWRPDPSQAGPYGASQVNGAPGGPASYGGGYGGPHGRQVQQQ
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagacgaggggaagctcttcattggggggatctcgtgggagaccaccgaggac
aagctcaaggatcacttcggcaactacggcgaggttctagacgctgtcatcatgagggac
aaggtcacaggccggcccaggggcttcgggttcgtcgtcttcgcggatccctccctcctc
gatcgcgttctccaggacaaccacaccatcgatggccgcaccgtggatgctaaaagggct
ctttcaagagaagaacagcaaatgtctgccagatctggcaataccacttctggaaacccc
acttccggaagatcagctggagcaggtgccggtgcaaacataaggaccaaaaagattttt
gttggaggtttgcctcccaccctaacagaggatgggtttcgacagtacttcgagtccttc
ggcactgtgactgatgcagttgtgatgtatgaccaaaacacccatcgccctcgaggcttt
gggttcatctcctttgattcagaagatactgtagataaagttcttcaaaagacttttcat
gatttgaatggcaagcctgtggaagtgaagcgtgcccttccaaaagatgcaaatccaaac
actggcagtgggcgatcaatgggaggtggatcccatcaatcttatggtggttcgagtggt
aatgctagctcttatgatggtagaccggatgccaataggtacatgcaacctcaagcacca
gcttacagctcctctgcctatggtgcacctggttatggctatggaactgcaaacagtggt
gttggttatgccggttatggtgttggtggctatggaagtgccggtgctgggtacaatgga
cctgctggggcctacggaaatccaaatgctcctatggctggttatgtaggtggtcctcca
ggtgctcaaaggaacctttggagtaatcaggctccaagtggttatggccctgcaggctat
ggtggaagcgcggcctatggtccagccgcctcatggaatgcttcagctgccagtggagga
tctggtgcagtgccaacaggtcaaagtgggacccctgggtatgtgagtcagggttatggt
tatggtgcatatggaggatcagaagggccttatggtactcaagggggctatggttctctc
ggcggacgaggcagcagtggtccaggtggtagccctgcaggcaatacaggagaacaagga
gcaggttctgcttacatgggtggtagttatggaattcctaatgcaaactcgggttatcca
aatgcttggaggccagacccttcacaagcagggccctatggagcttctcaggtgaatggg
gcccctggtggtccagctagttatggaggtggttatggtggccctcacggcaggcaagtc
caacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
