Mucilaginibacter sp. cycad4: SNE26_10985
Help
Entry
SNE26_10985 CDS
T10709
Name
(GenBank) OmpA family protein
KO
K03286
OmpA-OmpF porin, OOP family
Organism
muy Mucilaginibacter sp. cycad4
Brite
Transporters [BR:
muy02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
SNE26_10985
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPV02301
LinkDB
All DBs
Position
complement(2760459..2761835)
Genome browser
AA seq
458 aa
AA seq
DB search
MKTNLKKASLLLTGVMIGSKLFAQSTDTSATAKDYVRPFSGGGELRTWSIGVHGGLLTPF
TIFGRNSRQDFTNPTEQFGYGGYIKKQILPSLGLQADFLRGKLTSSNSQPDVTGTSPYGS
YSTKLNWSAALSANITLANINWRHEKPFVQPYLTAGVGNLNYTPRITPVGGQQENFKKTD
NGHINELFIPVGLGLKFDLAPGINLDLGYQVNFVQADNLDGYNHGAGDDRFSYAHIGLEF
ALGSKKKHQMATHNPVSSMRTEYQWENQRTRTELQQQIDAEKAKNAQLASDLATTNANLA
KLTTDSDGDGVVDVNDKCPNTPAGQKVDGSGCPLAKPVVYVTEEDKKVVKDAIKNLEFDL
GKATIRAHSLPSLDRVARLLVDKNFSLKLAGHTDNTGSDELNMRLSKDRAESIKAYLVSK
GANASRIEATGYGETQPIATNKTAAGRQANRRVEFTLY
NT seq
1377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaacaaatttaaaaaaagcctcattgcttcttaccggagtcatgattggcagtaaa
ttattcgctcagtcaacagatacctcagctacagcaaaagattacgttaggccattttcg
ggtggcggcgaattacgtacatggtcaataggtgtacatggcggtttattaacgcccttt
accatatttggacgcaatagcagacaggattttaccaaccccaccgaacagtttggttat
ggcgggtacattaaaaaacaaatattaccgtccttaggcttacaagccgacttccttcgc
ggtaaattaacttcatcaaacagccagcctgacgtaacaggtacttctccttatggttca
tactctactaaacttaactggtcggcagctttaagcgctaacattacgctggctaatatc
aactggcgccatgaaaagccgtttgttcagccttatttaaccgcgggtgttggtaatttg
aactatacgccaaggattacaccggtcggcggacaacaggaaaacttcaagaaaaccgat
aatggccatatcaatgaattgtttatccccgttggcttaggtttgaaatttgaccttgcc
ccaggcataaaccttgatttaggttaccaggttaactttgtacaggccgataatcttgac
ggatacaaccatggtgcaggcgatgacaggttttcatacgcacatattggtttagagttt
gcccttggcagcaagaaaaagcaccagatggcaacccataatcccgtatcgtcaatgcgt
acagagtaccaatgggaaaaccagcgtacccgcaccgaattacagcaacagattgacgct
gaaaaagctaaaaacgcgcagctggccagcgaccttgcgacaaccaatgccaacctggcc
aaattaaccacagatagcgacggtgacggtgttgttgatgtgaacgataaatgtcctaat
actcctgcgggacaaaaagtagatggttcaggctgtcctttggcaaaaccggtagtttat
gttaccgaagaagataagaaagtagttaaagacgctatcaaaaaccttgagtttgatttg
ggtaaagccactatccgtgcacattcattgccaagcctggatagggtagcccggttgctg
gttgataaaaacttcagccttaaattggccggacataccgataatacaggttcggatgaa
ctgaacatgcgtttatcaaaagaccgtgccgaatcaattaaagcatacctcgtaagcaaa
ggcgcaaatgcttcgcgtattgaagcaaccggctatggcgaaacccagccaattgctaca
aataaaactgccgccggccgccaggctaaccgcagggttgaatttactttgtattaa
DBGET
integrated database retrieval system