Mucilaginibacter sp. cycad4: SNE26_12430
Help
Entry
SNE26_12430 CDS
T10709
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
muy Mucilaginibacter sp. cycad4
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
muy00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
muy02000
]
SNE26_12430
Transporters [BR:
muy02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
SNE26_12430
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
Dockerin_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPV02586
LinkDB
All DBs
Position
complement(3096940..3100050)
Genome browser
AA seq
1036 aa
AA seq
DB search
MIKIYSNPDKGFSKQIYLGRHKNGLFKLMCCCLLLLLPVLANAQTIISGNVKDKDGPIIG
ATVTQKGVKNTTSTDVNGKFKLTLKSNSTVLVVSYVGFKTQEVSVGNSTDITITLQEDLN
KLNEVVVVGYGTVKKGDLTGSISSIKSDNLTLGGTTSNIGQAIQGKAAGVQVQQASFAPG
SGINITVRGGNSINTSTAPLYVVDGFISEAGSQVNPNDIEDIQVLKDASATAIYGSRGGN
GVVLITTKKGKNGKVSLDADISGGTQYLTYKPALLTGQQYTDIQNATALEDGKPQPYPSS
FQVANTNWLKLATRNATVQNQSLSLSAGDQNSKLYIAGNHIKQVGVLQHTGFERYTARIG
AEKTVNENIKISGNFYGANSTSTLQSYTGDITAPLFSLLTAPPNVAPYNADGTYNYYVTQ
GTKTNALAGLLEPTNNSGNKLINANVGLDYKIINGLTYHLTAGTEYNQTTTGQYLPTTTI
AGAKQGGVAAEQIYSNFRWIAENYFTYKFNIKKDHDFTVLLGTSNQKDVAESLLSGAKGF
STDAFLYYNLNAGSLSNGYGSNKAEAFLTSYFTRLNYAYKDKILASFSYRDDRSSQFGSN
RRSGFFPAGAVAYKLTDEDFVKDLNTFSNLKARVSYGVTGNDRIPASLYLATFGPYSTVL
NGSGQLQTGIEPKNLANPNLKWEATRQLDIGLDMGFANGRINASIDYYSKKTTDLLIQVP
IGAQWGATNGTQWINGGAIQNRGIELSVNTSNLRSKNLSWNTTVTFGYNKQKALDLGPGV
TIISTNTANPSGTVSGQEFTRVVPGIELGELYGYVYQGVIKTGESYAPQPNSKAGDPKYK
DVNGDGVITPADRTYLGNSNPHYMAGFGNDFHYKGIDLGIFFQGAFDYYLYNMNNMVLES
TTGAAALNRFVAGKNENTAIPREGYYLSTYGSYVNSRFVENASYVRLKSLTLAYNFPASL
FQNMKILQGIRIYAEAQNLWTITGYKGTDPEANVHADDTGAHPGQVPIRSALGGGLDFNS
FPAFKTVTFGIKASIH
NT seq
3111 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaatttactcaaaccccgacaagggcttcagcaaacagatttatttagggagg
cataagaatggcctttttaaattgatgtgctgttgcctgcttttattattgcctgtgctt
gcaaacgcgcaaacaattatcagtggtaatgtaaaagataaagacggccccatcattgga
gctaccgtaacccaaaaaggcgttaaaaatactacctctaccgatgttaacggcaagttc
aagcttacattaaagagtaattcaacggtattggttgtttcttacgtaggattcaaaaca
caggaggtatccgtaggaaattctaccgatataactattaccttacaggaagaccttaac
aaattgaacgaagtagtagtagtaggttacggtaccgttaaaaaaggcgaccttaccggt
tctatcagttcaattaaaagtgataacctcacgctcggcggtactacatctaatatcggc
caggccattcagggtaaagcagctggggtacaggttcagcaagccagttttgcaccaggt
tcaggtatcaatattaccgtgaggggtggtaactccatcaatacttctacagcaccactt
tatgtagttgatggttttatcagcgaagccggcagccaggttaacccgaacgacatcgaa
gacatccaggtactgaaagacgcatcggcgacggccatctacggttcaaggggcggtaat
ggtgttgttttgatcaccactaaaaaaggaaaaaatggcaaagtgtctttagatgctgat
atatcaggaggtacgcaatacctgacgtacaagccggctctgttaaccggtcagcagtat
accgatattcaaaatgctaccgctcttgaagacggtaagccacaaccatatccatcaagt
ttccaggtggccaataccaattggctaaaattggcaacccgcaatgctaccgttcaaaat
caaagcctcagcttaagcgcaggcgatcagaactcaaaattatatatcgccggtaaccac
atcaaacaggtaggggtgctgcagcataccggctttgaaaggtatactgcaaggataggc
gctgaaaaaacagtgaatgaaaatattaagatcagcggtaacttctatggtgcaaattca
acctcaactttgcaatcatacacgggcgatattaccgcaccgttgtttagcctgcttacg
gcaccgcctaacgtagcgccttataatgccgatggtacttataactattacgttacccag
ggcacaaaaaccaacgctttggccggcctgttggaacccacaaataatagcggtaataaa
ttaattaatgccaatgttggtttggattataagatcatcaacgggttaacatatcacctt
actgcaggtaccgaatataaccaaaccactaccggtcaataccttccaacaactacaatt
gccggtgcaaagcagggtggtgtagctgccgaacagatctattcaaacttcaggtggatt
gctgaaaactattttacttataaattcaatatcaaaaaagaccacgattttaccgtattg
ttaggtacatcaaaccaaaaagatgttgccgaatcattgctttcaggtgccaagggcttt
tcaaccgacgcttttttatattataacctaaatgcaggttcattaagtaatggctatgga
agcaacaaggcagaggcttttcttacatcatactttacaaggttaaattacgcttacaaa
gacaaaattttggcgtcgttttcttatcgcgatgacaggtcgtcacagtttggttcaaac
agacgctctggctttttcccggccggcgctgtagcttacaaattaactgatgaggatttt
gtaaaagacctgaatactttctcaaatttaaaagcccgtgttagttatggtgttaccggt
aatgaccgtatcccggcaagtttatatcttgcaacttttgggccatatagcacagtgctt
aacggaagcggtcagttacaaacaggcatcgaacctaaaaatcttgctaaccctaacctt
aagtgggaagccacaaggcaactggatattggtttggatatgggcttcgctaacggccgt
attaacgcaagtattgattattacagcaaaaaaactaccgacttgctgatccaggtaccg
attggggcacaatggggggctactaacggaacacaatggataaatggcggcgctatccaa
aacaggggtattgagctttcggtaaataccagcaacctgcgcagcaaaaacctgtcatgg
aatactacagttacatttggctacaataaacaaaaggcgttagatttaggtccgggggtt
acaataataagtactaataccgccaacccaagcggcaccgtttcgggccaggagtttaca
agggttgtaccaggtattgagcttggcgagctttatgggtatgtataccagggtgttata
aaaacaggggaaagctatgccccgcaaccaaattcaaaagcaggtgaccctaaatataaa
gatgttaatggcgatggtgtaattaccccggccgaccgtacctacctgggcaattcaaac
ccgcattatatggctggttttggtaacgattttcattacaaaggcattgatctgggtata
tttttccagggagcatttgattactacctgtacaatatgaacaacatggtactggaatca
acaaccggagcagccgcgttgaacaggtttgttgcaggtaaaaatgaaaataccgctatc
ccgcgtgaaggttattacctgagcacctatggtagctacgtaaattcacgttttgttgaa
aatgcctcttatgtgcgtttgaaatcgcttacgctggcatacaactttccggcctcgtta
tttcaaaatatgaaaattttacagggcatcaggatttatgccgaagcgcaaaacctgtgg
accattaccggttataaaggtactgacccggaagcaaacgtacatgccgatgacactggc
gcacaccctggtcaggttccgatccggtcggctctcggaggcggtttggattttaactcc
ttcccggcatttaaaacggtaacattcggtattaaggcatctatccattaa
DBGET
integrated database retrieval system