Mycoplasmopsis verecunda: SAM46_02450
Help
Entry
SAM46_02450 CDS
T09525
Symbol
rlmD
Name
(GenBank) 23S rRNA (uracil(1939)-C(5))-methyltransferase RlmD
KO
K03215
23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase [EC:
2.1.1.190
]
Organism
mver
Mycoplasmopsis verecunda
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mver00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
mver03009
]
SAM46_02450 (rlmD)
Enzymes [BR:
mver01000
]
2. Transferases
2.1 Transferring one-carbon groups
2.1.1 Methyltransferases
2.1.1.190 23S rRNA (uracil1939-C5)-methyltransferase
SAM46_02450 (rlmD)
Ribosome biogenesis [BR:
mver03009
]
Prokaryotic type
rRNA modification factors
23S rRNA modification factors
SAM46_02450 (rlmD)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
tRNA_U5-meth_tr
TRAM
MTS
Methyltransf_25
Methyltransf_31
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WPB54327
LinkDB
All DBs
Position
complement(640588..641901)
Genome browser
AA seq
437 aa
AA seq
DB search
MSELKKYQVGDKLIINCSDISYEGLGVSRLNNYAIFTSNLFPDEQAQVTLSKVTSKYAFA
TVDKLIKVSPYRNKNQYDCYNSAPLINLNYQQQIEFKNNYFKTLLSWNLGNEILQVYKDF
SPSLVITNYRNKVRYPLIKQDHKLVLGEYDIKSNDLHIANNYIQNMHIINQCLDEVLAIV
NNYLESNKKKNAINFYNEIIIRANQDNKVSLAMDIHSDYDIPNSIIESIKDIEYIVDFNI
IKKHKVKNIFTKEEFVMQIANKEFICNINSFFQININVAQNIFKQIKEYISKSFENIILD
AYCGVGTIGQLVASDHKVIGSDIVQSAIINANRNKEINQVQASYFVGDSATIFKKQIKDL
TNTFLILDPPRSGITPQFIHWIKQNKIKNIIYMSCDVKTLVRDLKELNDLYEIKSIQGFD
MFPNTAHIEALSILKIK
NT seq
1314 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagaattaaaaaaatatcaagttggtgataaattaataataaattgtagtgatatt
agttatgaaggactaggagttagtcgattaaataattatgctatatttacctctaattta
tttcctgatgaacaagctcaagttactttaagtaaagtaacaagtaaatatgcttttgct
actgtggataaattaattaaagtatctccatatagaaataagaatcaatatgattgttat
aattcagctcctttaattaatttaaattatcagcaacaaattgaattcaagaataattat
tttaaaactttattatcgtgaaatctaggcaatgaaatattacaagtttataaggatttt
tctccttctttagtaattactaattatcgtaataaagttcgttatccattgataaaacaa
gatcataaattagtgcttggagaatatgatatcaagtcaaatgatttacatatagctaat
aattacattcaaaatatgcatattattaatcaatgtttagatgaggttctcgctattgta
aataattatctagaatcaaataaaaagaaaaatgctattaatttttataatgaaataata
attagagctaatcaggataataaagtttctttagctatggatatacattctgattatgat
attcctaattcgataattgaatctattaaagatattgaatatattgttgattttaatatt
attaaaaaacataaagtaaaaaatatttttactaaagaagaatttgtaatgcaaatagca
aataaagaatttatttgcaatataaattcttttttccaaattaatattaatgtagctcaa
aatatctttaagcaaattaaagaatatatttctaaatctttcgaaaacattattctagat
gcttattgtggagtaggaacaatcggacaattagtagctagtgatcataaagttattggt
agtgatatcgttcaatcagctattattaatgctaatagaaataaagaaataaatcaagtg
caagctagttattttgtaggggattctgcaaccatatttaaaaaacaaattaaagattta
accaatacatttttaattctagatccaccacgtagcggaataacaccgcaatttattcat
tgaattaaacaaaataaaattaaaaatattatttatatgtcttgtgatgttaaaacctta
gtaagagatttaaaagaattaaatgatttatatgaaattaaatcaattcaaggatttgat
atgttcccaaatactgcacatattgaagctttaagcatattaaaaattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
