Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1296: X808_19460
Help
Entry
X808_19460 CDS
T03027
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
mvi
Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1296
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
DUF4573
CAP_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG76464
UniProt:
W0QC40
LinkDB
All DBs
Position
complement(2056757..2061751)
Genome browser
AA seq
1664 aa
AA seq
DB search
MQLSRGNTKYIQAEESTQYQIFNEQGELVLNPKVEKVNKDDLAIYVEGETQPSLILEDYY
DTYPIEDRAYLAEHSASLATSSREAVLATEVTSGVSSKVVYGLGAAALIGGLFALGGGSG
GAKSSKPNDPEKPVDPTTPEEPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTT
PVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTTPVQPTT
PVQPTTPTEPKPVDKEITHSIITLNDVTADNIINISESGEVIKVSGKVANVTNSEAKSGD
KVTVQIGNEKFETTLKADLSFEVNASGQLLATNSKVTVTVETSDAAGNTLSTLEEKVYTV
DTVLENPIITLKDVTIDNIVNIAESNEAAIKVGGTVENVANSNAKVGDKVTVQIGNEKFE
TTLKADLSFEVNASGQLLAANSTVTVTVETSDAAGNSLSTVESHDYQVDTDIAAPTLVID
KIATDDIINAVEARADTITITGSAINGASAEAKAGDKVVLQVGGLRVEGTLDAQLKFSIP
VSTIALVNHKSVAATLVTSDSAENSTTATANRSVEGDTGFNLSVSVDRIAIDDVVNRAES
QNNVTLSGTYTADSDVKNGSVVIKILVNGLEHQAVVNETNKTWTLSVSGQDLATEQGDHS
ITAKIQAQDKAGNENSAISSHQYRVDTVIDKPVVTITSIATDNVIDAAEARGSITIKGLV
ANAEGDRPVVLLCPCTACASGWREVEAQVVDGKFEVVVNISETDLASARLKSSERKIKAN
YTAEDDVGNTEKADETSLNYEVDLYRDINITKIDDRFTQQLDGTTRVTGTITEFGTTTGA
NANAYNIGQNARLIRTVKLVIGDKSYQAGFNGVTKTFSVDIPNADLVGLSGKNVSIDFND
MITNNPIPYTFYAFTNVNMLRTNAAGKQEIFTANRLTPTAKAFTLESDVLVKNADNNYSM
KTFTPEKTEISGVVNNNIAVGAEIEVKVGSYTTTTVVRDDRTFTVEVDSSHLKNNPAHIV
TAKLVNSGADVVMDKEYYIAPKAVSGNFVSQHSEVPVAARKMDHTQDDYNFFYPIHLLET
ETTKRGALKDYAVGGTETPLTIKYHFLRNDEVASLPAGSQGARNRESAAGSIKEATETMK
QMFRYAYNKIAEYTNIKFEEVGSWQEANGNNSDMRTGTDGTLIYVGNLNGGQYNGASAIG
FQGGNIIWNEAVSSATPAYNDFNTYTAIHEILHTLNLRHAHDAFSGIRTLGAAVPQPTAQ
NHISEASAEFSNMSYWGTNGMFIGMRDLRLYDLAYLHYRFGVNREHRAGNDTYTFKTYDA
RKADGDVYIWDGNGVDTFDASMEKEGVTVNLTPGSWNYRGTERKFNFLTDDRAVYNKQAF
FGLDPATEILGNLNNSHRIRFDEIPAGNAEFKNYHEGQSFIGYGTQIENLIGSKFGDTLT
GNNADNNIFGGAGVDTIAGGAGDDFINGGEGDDLMFGNLGNDIFVVDAAGDVVTEKLGEG
DADHIYSFINYELSDDATSHIENLTLVGTTATQATGNALNNEIRGNDVGNTLKGMDGNDT
LIGGLGADTLTGGNGNDIFVFESTLNGKADTITDFVVGEDKIKLSADIFSSLNAGLTNLN
DHLFYDQATGELSYNSAATGINNSVHFATVTGLQSLEADRFILG
NT seq
4995 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagcttagccgtggtaatacgaaatacattcaagcagaagagagtacccaataccaa
attttcaatgagcagggtgagctagtacttaacccaaaagtagaaaaagtaaataaagat
gatttagccatttatgttgaaggtgaaactcagccatcattaattttagaagattattac
gacacttacccgattgaggacagggcttacttagcagagcattctgccagtttggcgact
tcaagccgtgaggctgtgcttgcaacagaagttacatcaggcgtatcctctaaagttgtt
tatggtttaggtgctgctgccttgattggtggtttatttgctttaggtggcggtagtggt
ggtgctaaatcgtcaaaaccgaacgatcctgaaaaaccagtcgatccaactacacctgaa
gaaccgacaacgccagttcagccgacaacgccagttcagccgacaacgccagttcagccg
acaacaccggttcagccgacaacgccagttcagccgacaacaccggttcagccgacaaca
ccggttcagccgacaacaccggttcagccgacaacaccggttcagccgacaacaccggtt
cagccgacaacaccggttcagccgacaacgccagttcagccgacaacgccagttcagccg
acaacaccggttcagccgacaacgccagttcagccgacaacgccagttcagccgacaaca
ccggttcagccgacaacgcctactgagccaaagcctgtagataaagagattactcattca
attatcactttgaatgatgttacagcggacaatatcattaatatctcagaaagtggtgaa
gtgataaaagtaagtggaaaggtggcaaatgttaccaattcagaagccaaatcaggcgat
aaagtgaccgttcaaattggtaacgagaaatttgaaactacgctgaaagctgatttaagt
tttgaagtcaatgcaagcggtcaattattagcaacaaatagcaaagtgacagtaacggta
gaaacttctgatgctgcaggcaatacgcttagtacactggaggaaaaagtctacactgtt
gatactgtgttagagaacccaatcatcacattgaaagatgtgacaatcgacaatatcgtc
aacattgccgaaagcaacgaggcagcaatcaaggttggcggaacagtcgaaaatgtagca
aattcaaatgccaaagttggcgataaagtgaccgttcaaattggtaatgagaaatttgaa
actacgttgaaagctgatttaagttttgaggtcaatgcaagcggtcagttattggcagca
aatagcacagtgacggtaacggtagaaacttctgatgctgcaggtaatagtctaagtacg
gtagaaagccatgattaccaagtagatactgatattgctgcgccaactttagtgatcgat
aaaattgctacagacgatatcattaacgcagttgaggctcgtgccgatactatcactatc
acaggttctgctattaatggtgcatctgcggaagctaaagcaggtgataaggttgtattg
caagtaggcggattacgtgttgaaggtacgcttgatgctcaactgaaattcagtattccg
gttagcactattgcgttggtaaaccacaaatcggttgccgcaaccttagtgacgagtgat
agtgcggaaaatagtacgaccgcaacagcaaaccgctcagtagaaggcgatacagggttt
aatttatcggttagcgtagatcgtattgcgattgatgatgttgttaatcgtgccgaatca
caaaacaatgtaacactaagcggaacttatacagcagatagtgatgtcaaaaatggttct
gtagttatcaagatattggtgaacgggctagagcatcaagcagttgtgaatgaaactaac
aaaacatggacattatctgtatcagggcaagatttagcaactgagcagggtgatcattca
atcacagcgaagatccaagcacaagataaagcaggaaatgaaaattcagcaatctctagt
catcaatatcgtgttgatacggtaattgataagcctgtggttactattactagtattgcc
actgataatgtgattgatgcagcagaggcgagaggctcaatcacaattaaaggtttagtc
gctaatgctgaaggtgatcgtcctgtggttttactttgtccttgtactgcttgtgcaagt
ggctggcgagaagttgaggctcaggttgtagatggtaaatttgaggtagtagttaatata
tctgaaacagatttagcgagcgccagactgaaatcgagcgagcgtaaaatcaaagctaat
tacaccgctgaagatgatgtagggaatacagagaaagctgatgaaacaagtttaaattat
gaggtggatttatatcgtgatattaatatcactaagattgatgatcgttttacccaacaa
cttgacggcacaactcgtgtaacgggaactattactgagtttggtaccacaacgggagcc
aatgctaatgcttacaatataggacagaatgcacgcttaattcgtacggtgaagttggtt
attggagataaaagctaccaagcgggctttaatggtgttacaaaaacattttctgtagat
attccaaatgctgatttagtaggcttatctgggaaaaatgtatcgatcgattttaacgat
atgattactaataatccaatcccttatactttttatgcttttactaatgtgaatatgcta
cgtaccaatgctgcaggaaaacaggaaatttttactgctaataggctgactcctacagcg
aaagcatttactttagagagtgatgtgttagtgaaaaatgctgataacaattacagcatg
aaaacttttacccctgagaaaacagaaattagtggtgtggtaaataataacattgctgtt
ggtgcggaaattgaagtaaaagtaggtagctatacgacgactacagtggttagagatgac
agaacatttactgttgaagtagatagtagtcatttgaaaaataacccagctcatattgtt
acagcaaaattagtcaatagtggtgctgatgtagtaatggataaagaatattatattgcg
ccgaaagctgtttcaggtaactttgtatctcaacatagtgaagtacctgttgctgcacgt
aaaatggatcatacgcaagatgattataatttcttctatccgattcatttacttgaaact
gaaacaacgaaacgtggtgcattgaaagattatgcggtaggtggtacagaaacccctctg
acaatcaaataccatttcttgcgtaatgatgaagtagcgagtttgccggcaggttctcaa
ggtgcaagaaatagagagtctgcggcgggatcaattaaagaagctacagagacaatgaaa
caaatgttccgttatgcttataacaagattgcggaatatactaatatcaagtttgaagag
gttggcagctggcaagaggcaaatggtaataacagtgatatgagaacaggtaccgatggc
actttgatctatgtcggtaacttaaatggtggacagtataatggtgcatcagccattggt
ttccaaggtggtaatattatttggaatgaagcagtttctagtgctacgcctgcatacaat
gattttaacacttatactgcgatacacgaaattttacatacgttgaatttacgtcatgca
catgacgcattttcaggtatcagaaccttaggtgctgcagtgcctcaacctactgcccaa
aatcatatttctgaggcatccgcagagttctctaatatgtcttattggggtacgaatggt
atgtttatcggtatgcgtgatttacgcctatatgatttagcctatttgcattaccgtttt
ggtgtaaatcgtgagcatcgtgcaggcaatgatacttataccttcaaaacttacgatgca
cgtaaagctgacggtgatgtttatatttgggatggtaacggtgttgatacttttgacgcc
tcaatggaaaaagagggggtaacggtgaaccttaccccaggctcttggaactatcgtggt
acggaacgtaagttcaacttcttaaccgatgatcgcgcagtctataataagcaagcgttc
tttggtttagatcctgctacagaaatacttggaaacctcaataacagtcaccgtattcgt
tttgatgaaattccagcagggaatgcggagtttaaaaactaccatgaaggacagtcattt
atcggttatggtacacaaattgaaaatctaattggttcaaaatttggtgatacgctaacg
ggtaacaatgcggataacaatatctttggtggcgcaggtgttgatactattgctggcggt
gctggtgatgattttatcaacggtggtgaaggtgacgatttaatgtttggtaaccttggt
aacgatatttttgtagtagatgcagctggagatgttgtgactgaaaaattaggtgagggg
gatgcagatcatatctacagttttattaactatgagttgagtgatgatgcaacatctcat
attgagaacttaacacttgtcggtacaactgcaactcaggcaacaggtaacgccctaaac
aatgaaatccgtggtaatgatgttggcaatacactaaaaggtatggatggtaacgatacg
cttatcggcggcttaggtgcagatacgctgactggtggaaacggtaatgatattttcgtg
tttgaaagtacattaaacggcaaagcagataccattactgacttcgttgttggtgaagat
aagattaagctttcagcagatattttctcttcacttaacgcaggtttaactaacttaaat
gaccacttattctacgaccaagcaacaggtgagctaagctataacagtgcagcaacaggc
ataaataattctgttcactttgcaacggtgacaggtttacaaagccttgaggctgataga
tttatcttaggctaa
DBGET
integrated database retrieval system