Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1296: X808_5110
Help
Entry
X808_5110 CDS
T03027
Name
(GenBank) TrkA domain protein
Organism
mvi
Mannheimia varigena USDA-ARS-USMARC-1296
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CitMHS
Na_sulph_symp
TrkA_C
DctM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG75034
UniProt:
W0Q818
LinkDB
All DBs
Position
552542..554311
Genome browser
AA seq
589 aa
AA seq
DB search
MSWDIVATLAVTFIAVFLFATEKIRMDAVAILVLSSLVLLGQIDTKSALSGFSNSATVTV
TAMFVLAAGLQNSGALDSIGGLLAKVKTPWLFILVLCGVNAVISPFVNNTAVVAVLIPIV
IAAAQNINLAPSKALIPLSFSSQMAGVCTLIGTSTNLLVNAIAQQQGHPGFGMFEFAPLG
IIFLLVGVAYLLITSRFLLPESRLQLEDGEGFGKYVSELKVNKDSVLIGKTVSDSGLMDE
FNLFTIAVLRDGERLSTPSHQVLQKHDILLLRGESENLASAREKYGLHHVVYGRRDLDEE
SFDDLVLTEVMISPTSRWVGGTIPILQQRWNKNATVLGMQRRSRVIRERLRGIRFKMGDI
LLVTLPREDMVSLRKNKDFIVLSSELVKTERSWRAKFALVVMAAVVATAALDIVPISISS
LVGAVAMCIAGCLTADEAYQSIDWKIILVLAGLLPLGEAMANSGAAQFIVDNTLGKVGAF
GPLVVLAVLYLLTSTLTEFMSNAGTAVLLTPIAISTAKILGVDASPFIIAVMFAAATSFM
TPVGYQTNTMVYGAGGYKFTDFIKIGLPLNLIYWVLAVLLIPIFFPFYP
NT seq
1770 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcttgggatattgtcgcaacattagcagtaacttttattgcggtgtttttatttgca
acagaaaaaattcgaatggatgcggtagctattttagttttatcgtccttggttttatta
ggacaaattgataccaaatccgcattaagcggattctctaattccgcaacagttactgtt
actgcaatgtttgtgttagctgcaggtttacagaatagtggagcgttagatagcataggt
ggtttgctggcaaaggtgaaaacgccttggttatttattttggtattatgtggcgtaaat
gctgtcatttctccttttgtgaataatacagcagttgttgcggtattaattccaattgtg
attgctgctgctcagaatattaatttagcgccttctaaggcattaattcctctctcattt
tcatctcaaatggctggggtttgtactcttattggtacatctactaacttattagttaat
gcaattgctcaacaacaaggacatcctgggtttggtatgtttgagtttgcacccctggga
atcattttcttattagtaggggtggcttatctattaattacaagtcgtttcctattacca
gaatctcgattacaactagaagatggagagggttttggtaagtatgtatctgagcttaag
gtaaacaaagattctgtattaattggaaaaacagtatctgattcaggcttaatggacgaa
tttaatctatttactattgcggtattgcgcgatggcgagcgtttatccacaccaagtcat
caagtactgcaaaaacacgatattttattattacgtggtgaatcggaaaatttagcgagt
gcacgtgaaaaatatggtctacatcatgttgtgtatggcaggcgtgatcttgatgaagaa
agttttgatgatttagttttaacagaagtaatgatttcaccaacttctcgctgggtagga
ggtaccatccctatcttgcaacaacgctggaataaaaatgcaacggtattgggtatgcag
cgccgtagtagagtaattcgtgagcgtttgcgtgggataaggtttaaaatgggagatatt
ctattagtcaccttacctcgtgaagatatggtgagtttgcgtaaaaataaagattttatc
gttttgtcttccgaattagtcaaaacagagagatcatggcgtgcgaaatttgctctagta
gttatggctgctgtagtagctactgccgcattggatattgttcctatctcaattagttct
ttagttggtgcggtggcaatgtgtattgctggatgtttaacggctgatgaggcttaccaa
tcaatagactggaaaattattcttgtgttagccggtttattaccattaggtgaagcgatg
gcaaatagtggagctgctcaatttattgtagataatacacttggaaaagttggtgcattt
ggtccattggttgttctagcagtactttacttacttacatcaaccttaacagagtttatg
agtaatgctggtactgctgtgttattaacgcctattgctatttcaacagccaaaatactt
ggggtagatgcttcgccatttattattgcggtaatgtttgctgcagcaacgagttttatg
acacctgttggttatcagactaatacgatggtttatggtgcgggtggttataaatttact
gattttattaaaatcggattgccattgaatttaatctattgggttctagctgtgctgtta
attccaattttcttcccattttatccataa
DBGET
integrated database retrieval system