Methanococcus vannielii: Mevan_0450
Help
Entry
Mevan_0450 CDS
T00554
Name
(GenBank) RNA binding S1 domain protein
KO
K06959
protein Tex
Organism
mvn
Methanococcus vannielii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mvn00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09192 Unclassified: genetic information processing
99973 Transcription
Mevan_0450
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Tex_YqgF
HHH_3
Tex_N
Tex_central_region
HHH_9
S1
HHH_7
YqgF
S1_RRP5
OB_PDCD11
HHH_6
Spt6_S1
Spectrin_Anc-1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR54357
UniProt:
A6UPD5
LinkDB
All DBs
Position
502775..504943
Genome browser
AA seq
722 aa
AA seq
DB search
MDIFQKLQKEFNLKPFQVENTVNLIDEGNTIPFIARYRKEVTGSLDDVTLRNFFEKLNYL
RNLEDKKAQTIKLIDVLGKLTLEVKQKIENSETLTEIEDIYRPFRPKRKTRAIIAESKGL
KPLSEVILKQKLEKPVEELAKEFLNPKLEVNSIEDAIFGAQDIIAEEISDNPDYRKFIRE
KTYSKGIITVKAKDKDLKSVYEMYYEYNEQLSKIPRHRILAINRGEKEKILSVKIEPPVE
LILNWLNGQIIIENSETASILKDTIIDGYKRLISPSIEREIRNSLTEKAEEGAISVFSKN
LKQLLLQPPIKGKVVLGWDPAFRTGCKLAVVDETGKLLDKDVVYPTEPHNKTLETKKTVK
ELVNNYNIDIIAIGNGTASRESEIIVSELLKELDRNLKYVIVNEAGASVYSASELGFEEF
PEYDVGVRSAASIARRLQDPLAELVKIDPKSIGVGQYQHDMNQKKLSESLGAVVESCVNS
VGVDLNTASVSLLNYVSGINKEIAKNIVNYRIKNGKFNSRKELLNVKKLGKKAFEQCAGF
LRIQNGKNLLDNTSVHPESYKIAENLLNELNLSLNEINYNKMNKISEKIESIKDIKNIEK
LADKLNTGIPTLLDIIRELEKPGRDPRDDVEKPVLRSDVLKFEDLKEGMILKGTIRNIVD
FGAFVDIGVHHDGLIHISEVSDRFIKHPLEVISVGDVVNVFVLGIDFEKNRVSLSIKKAI
NF
NT seq
2169 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatttttcaaaaattacaaaaagaatttaatttaaaaccatttcaggttgaaaat
accgttaatttaattgacgaaggaaatacaattccatttattgcaagatatcgaaaagaa
gtaacgggctcacttgatgacgttactttgaggaatttttttgagaaattaaattattta
agaaatttagaagataaaaaagctcagactattaaattaatagatgttttaggcaaatta
actttagaagttaaacaaaaaattgaaaattcagaaactttaactgaaattgaggatatt
tatagaccatttagaccaaaaaggaaaacaagggcaataattgctgaaagtaagggttta
aaaccactttcagaagttattttaaaacaaaaactggaaaaaccagttgaagaacttgct
aaagaatttttaaacccaaaacttgaagtaaattcgatagaagatgcaatttttggagca
caggatattattgcagaagaaatttcagataatccagattatcggaaatttattcgtgaa
aaaacatattctaaaggaataatcactgtaaaagcaaaggacaaagatttaaagtcagtt
tacgaaatgtattatgaatataatgaacagttaagtaaaattccacgacacaggattctt
gcaataaatcggggggaaaaggaaaagatacttagcgtaaaaattgaacctcctgttgaa
ttaattttaaattggctaaatggccagataataattgaaaattcagaaacggccagtatt
ttaaaagataccataatagatggatataaacgattaatttcgccctcaattgaacgagaa
attagaaatagcttaacagaaaaggcagaagaaggggcaatttcagtattttcaaaaaat
ttaaagcagctgctacttcaaccgccaataaaaggaaaagttgttttgggctgggatcca
gcatttagaactggctgtaaattggcagttgttgatgaaaccggaaaattattggataaa
gacgtagtttacccgacagagccacataataaaactttagaaacaaaaaagactgttaag
gaactggtaaataattacaatatagatataattgcaattgggaatggaactgcttcaagg
gaatccgaaattattgtatccgaacttttaaaagaacttgatcgtaatttaaaatatgtt
attgtaaatgaagcgggagcatctgtatattctgcgtcagaactcggttttgaagaattt
ccagaatatgacgttggagttagaagtgcagcatctattgcaagacgacttcaagaccct
ttagcagaattggtaaaaattgaccctaaatcaatcggcgttggacagtaccaacatgat
atgaaccagaaaaaattatcagaaagtttgggcgcagttgttgaatcgtgtgtaaactcg
gttggtgttgatttaaatactgcatcagtttcacttttaaattatgtttctggaattaac
aaagaaattgcaaaaaatattgtaaattatagaattaaaaacggaaaatttaattcaaga
aaagaacttttaaatgttaaaaaactaggtaaaaaagcgtttgagcagtgtgccggattt
ttaaggatccaaaatggtaaaaacctgcttgataatacaagcgtacatcctgagtcgtat
aaaattgctgaaaatttacttaatgagttaaatctttccttaaacgaaattaactataat
aaaatgaataaaatttccgaaaaaattgaaagtattaaagatattaaaaatattgaaaaa
ttggcagataaattaaatactggcattccaacactattggatattattcgtgaacttgaa
aaaccaggaagagacccaagagacgatgtagaaaaaccagttttaaggagcgatgtctta
aaatttgaagatttaaaggaaggaatgattttaaaaggaacgattaggaatattgttgat
tttggcgcttttgtagacataggggtacatcatgacgggcttatccacatttctgaagtt
tcggacagatttataaagcatcctcttgaagtaatttcagttggcgatgttgttaacgtt
ttcgtattgggtattgactttgaaaaaaatcgggtatctctttcaattaaaaaggcaatt
aatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
