Mannheimia sp. USDA-ARS-USMARC-1261: X781_21780
Help
Entry
X781_21780 CDS
T03026
Name
(GenBank) Autotransporter beta-domain-containing protein
Organism
mvr
Mannheimia sp. USDA-ARS-USMARC-1261
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Trypan_PARP
AC_1
Phage_fiber_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG74323
LinkDB
All DBs
Position
complement(2204462..2206591)
Genome browser
AA seq
709 aa
AA seq
DB search
MNGGNDDVTLSNTDVSELKILNGSSSNAPVSTPEVNVLNLKQKMNARSKPIKTVGTRIEN
WHNINIGNEGHLNLTQDLALNYIRDNKSGTTLLTPTNGETLTNKGIVTLNSTINSVNVNY
NKLVNEGTIDLNKGNSEPLNKFIQNGDYIGEQNSKLIVDSKWNNPDVQQNDQLIIKGNAL
GNTKIEVKEHISGDVLRSNIEKNGNWANPIVIIEKGDNGNSVFTGQANTQGAEEAQIARR
INPNTGFAEYTWVLDALPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQP
EPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQP
EPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPQPKGYVIYKATTSGYLQTNWINQEMGIEQLGRLYER
VGERAPQNADTRILNSWGRVGFNKNLTQGKHRFGFEADQRLVQVGQDIAITESDSGYARH
GLMLSYSWSNNDFYDKYRAENGRVIDNKYTSSGKSKMFSLGAYRTFYGNDNSYLDIVANL
SRLENKYYGKKVLRQTGIGAGLSIEMGKAYPIMEKWKVEPQVQLKAQYTHLNSFYDGIHN
VSGGDYLTMQGRLGLRLTNDYLYLATNIVQDLTPAKASVRIGTTSLEERYTRSQFEVSLG
STVPLNVAKTFTLYGDIKYSHALGGKHRVFSSRGSRESYSGRVGLRYQW
NT seq
2130 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatgggggtaatgatgatgttaccttatctaatacggatgttagtgaattaaaaata
ctaaatggtagctcttcaaacgcccctgtttctacacccgaagttaatgtgttgaatttg
aaacaaaaaatgaatgcacgatctaaaccaattaagacagtagggacgagaattgaaaat
tggcataatatcaatattggaaatgaaggacatttaaatttaacacaggatctagcactg
aattatattagggataataagagtggtactactttacttacacctacaaatggagaaact
cttactaataagggtattgttacgttaaattcaacaattaattctgtcaatgtaaattat
aataaattagttaatgaaggtactattgatttaaataaaggcaatagtgagccattaaat
aaatttatccaaaatggcgattatattggcgaacaaaactccaaattaattgtggatagt
aaatggaataatccagatgtacaacaaaacgatcaacttattattaaaggaaatgcttta
ggtaacacaaagattgaggtaaaagagcatatttcgggtgatgtccttcgtagtaatatt
gagaaaaatggaaattgggctaaccctatagttattattgaaaaaggtgataatggcaat
agtgtatttactggtcaagcaaacactcaaggggctgaagaggctcaaatagctcgccgt
atcaacccgaatactggttttgctgaatatacttgggtgttagatgcattacctgagcca
caacctcaacctgagccgcaacctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccgcagcct
caacctgagccgcagcctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccgcagcctcaacct
gagccgcagcctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccg
cagcctcaacctgagccacaacctcaacctgagccacaacctcaacctgagccacaacct
caacctgagccacaacctcaacctgagccacagcctcaacctgagccacagcctcaacct
gagccacagcctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccgcaacctcagcctgagcca
caaccccaaccccaacctaaagggtatgttatttataaagcaactacctcaggttatctc
caaactaattggataaaccaagagatgggaattgagcaacttggtcgtttatatgagcga
gtgggtgaaagagctccacaaaatgcagatactcgtatcttaaatagttggggcagagta
ggatttaataaaaaccttactcaaggtaaacatcgttttggctttgaagctgatcagcgt
ttagttcaagtagggcaagatattgcaattactgaatctgattcaggatatgctcgacac
ggtttaatgctgagttatagctggtcaaataacgatttttatgacaaatatcgtgcggaa
aatggtcgtgttattgataataaatacaccagttctggaaaaagtaaaatgttctcttta
ggtgcttatagaactttttatggcaatgataacagttatttagatattgtggctaactta
tcaagactagaaaataaatactatggtaaaaaagtgttacgccaaacagggataggtgct
ggattaagtattgagatgggtaaagcttacccgataatggaaaaatggaaagttgagcct
caagtacaattgaaagcacaatatacccatttaaatagcttctatgatggtattcataac
gtgagtggcggagattatttaacaatgcagggacgtttaggtttacgtttaacaaatgat
tatctgtatttagcaactaatatagttcaagatttaacgccagcaaaagcttctgtgaga
attggaacaacttcattagaagagcgttatacccgtagtcaatttgaggtaagtttagga
agtacggtcccgttaaatgtagcgaagacgttcacattatatggagatattaaatatagt
catgcattagggggaaaacacagagtatttagttctcgtggtagccgtgaaagttatagt
ggccgtgttggtttacgttatcagtggtga
DBGET
integrated database retrieval system
