Mannheimia sp. USDA-ARS-USMARC-1261: X781_3540
Help
Entry
X781_3540 CDS
T03026
Name
(GenBank) Autotransporter beta-domain-containing protein
Organism
mvr
Mannheimia sp. USDA-ARS-USMARC-1261
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
Trypan_PARP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG72503
UniProt:
W0Q5L4
LinkDB
All DBs
Position
365021..368023
Genome browser
AA seq
1000 aa
AA seq
DB search
MATKLVTAALASCYVLPTYAEISTTVETGENGYKKTTIKDTDADSLEVIVSGDQGPYRKS
LNLGSAKHLVLRNSAHLDSPDYKAFSNGKPIQSIEIENSGKLISSGSRPTSSIDYQWTTV
TDRFSVVNTGEISTTGSGYNENAIIVNGSKDTVYEIKNLGSNSLISAKTIAVSLKNGQSA
TLLNEGTIHAPTAVNFASLQETLLENTGTIDGNIYGSSGKDHLISSSGKIIGNVFMNDGS
DEVTLSNTDISKLKILNGDSRFTSAPTYDEVSDVVNVLNLNQKIDAYTMWGGKEQAGTEI
INWHNINIGREGHLNLTNGLELNNGKEVGPLARPTKTNGNILTNNGIVTLTPSFNSVWTW
IGYDKIVNNGIIDLNKGDSKPNNKLALNGNYIGEQNAKLIVDSEWNNPDVQQNDQLIIRG
NALGNTNIEVKDRISGDVLREKVEKNGNWQNPIVIIEKGDNGNNVFTGKANTQGAEEAQI
ARRINPTTGFAEYTWVLDALPPEPEPQPQPEPQPQPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEP
QPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEP
QPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPKPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEPQPQPEP
QPQPKPEPQPQPEPQPQPKYAIYKATTSGYLQTNWINQEMGIEQLGRLYERVGERAPQNA
DTRILNSWGRVGFNKNLTQGKHRFGFEADQRLVQVGQDIAITESDSGYARHGLMLSYSWS
NNDFYDKYRAENGRVIDNKHTSSGKSKMFSLGAYRTFYGNDNSYLDIVANLSRLENKYYG
KKVLRQTGIGAGLSIEMGKAYPIMEKWKVEPQVQLKAQYTHLNSFYDGIHNVSGGDYLTM
QGRLGLRLTNDYLYLATNIVQDLTPAKASVRIGTTSLEERYTRSQFEVSLGSTVPLNVAK
TLTLYGDIKYSHALGGKHRVFSSRGSRESYSGRVGLRYQW
NT seq
3003 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggcaacaaagctggttactgcagctcttgcttcatgttatgttcttcccacttatgct
gaaatctccacaactgtagagacaggtgagaatggctataaaaaaacaactattaaagat
actgatgctgattcattagaagttatcgtaagtggcgatcagggaccatatcgtaaaagt
cttaatttaggctccgctaaacatctggtattacgtaattctgctcacttagatagccct
gattataaagccttttcaaatgggaaaccaattcaatctattgaaatagaaaatagtggt
aaattaatttcttctggaagccgacctactagcagtattgattatcaatggacgacggta
acagatcgcttttctgtagtgaataccggtgaaattagcacaaccggttcgggttacaat
gaaaatgctattatagtaaacggaagtaaagatacggtttatgagattaaaaatctgggc
agtaattcacttatttctgcgaagactatagcagttagcttaaaaaacgggcaaagtgcc
acgctcttaaatgaaggaactattcatgctcctactgctgttaattttgcttctttgcaa
gaaacgctactagaaaatacaggtacaattgatggaaatatttacggtagtagtggtaag
gatcatttaatttctagctcaggtaaaattatcggcaatgtttttatgaatgatgggagt
gatgaggttaccttatctaatacagatataagtaaactgaaaatactaaatggtgattct
agatttactagcgctcctacatatgatgaagtttctgatgtagttaatgtattgaatttg
aaccaaaaaatagatgcttatacgatgtggggaggcaaggagcaagcaggtacggaaatc
ataaattggcataatattaatattggacgtgaaggacatttaaatttaacaaatggtcta
gaactaaataatggtaaggaggttggtccgcttgcgagacctacgaaaactaatggaaat
atcctcactaataatggtattgttactttaactccatcattcaattctgtttggacttgg
ataggttatgataaaattgttaataatggcattattgatttaaataagggcgacagtaag
ccaaacaataaacttgccttaaatggtaattacattggtgaacaaaatgctaaattaatt
gtggatagcgaatggaataatcctgatgtgcagcaaaatgatcaacttattattagagga
aatgcattaggtaacacaaatattgaagtaaaagatcgtatttctggtgatgttcttcgt
gaaaaagttgagaaaaatggaaattggcagaatcctatagttatcattgagaaaggtgat
aatggtaataatgtgtttaccggtaaagcaaatactcaaggtgcggaagaagctcaaatt
gctcgccgcattaatcccactacgggctttgctgaatatacttgggttttagatgcattg
ccaccagagcctgaaccgcaaccacagcctgagcctcagccacagccacaacctcagcct
gagccacaacctcagcctgagccacaacctcagcctgagccacaacctcagcctgagccg
caacctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccgcagcct
caacctgagccacagcctcaacctgagccacagcctcaacctgagccacagcctcaacct
gagccgcaacctcaacctgagccgcagcctcaacctgagccacagcctcaacctgagccg
caacctcaacctgagccgcaacctcaacctgagccgcaacctcaacctgagccgcagcct
caacctgagccgcagcctcaacctgagccgaagcctcaacctgagccgcaacctcaacct
gagccgcaacctcaacctgagccgcaacctcaacctgagccgcaacctcaacctgagcca
cagcctcaacctaagcctgagccgcagcctcaacctgagccgcaaccccaacctaaatat
gctatttataaagcaactacctcaggttatctccaaactaattggataaaccaagagatg
ggaattgagcaacttggtcgtttatatgagcgagtgggtgaaagagctccacaaaatgca
gatactcgtatcttaaatagttgggggagagtaggatttaataaaaaccttactcaaggt
aaacatcgttttggttttgaagctgatcagcgtttagttcaagtagggcaagatattgca
attactgaatctgattcaggatatgctcgacacggtttaatgctgagttatagctggtca
aataacgatttttatgacaaatatcgtgcggaaaatggtcgtgttattgataataaacac
accagttctggaaaaagtaaaatgttctctttaggtgcttatagaactttttatggcaat
gataacagttatttagatattgtggctaacttatcaagactagaaaataaatactatggt
aaaaaagtgttacgccaaacagggataggtgctggattaagtattgaaatgggtaaagct
tacccgataatggaaaaatggaaagttgagcctcaagtacaattgaaagcacaatatacc
catttaaatagcttctatgatggtattcataacgtgagtggcggagattatttaacaatg
cagggacgtttaggtttacgtttaacaaatgattatctgtatttagcaactaatatagtt
caagatttaacgccagcaaaagcttctgtgagaattggaacaacttcattagaagagcgt
tatacccgtagtcaatttgaggtaagtttaggaagtactgttccgttaaatgtagcgaag
acgttaacattatatggcgatattaaatatagtcatgcattagggggaaaacacagagta
tttagttctcgtggtagccgtgaaagttatagtggccgtgttggtttacgttatcagtgg
tga
DBGET
integrated database retrieval system