Mannheimia sp. USDA-ARS-USMARC-1261: X781_7950
Help
Entry
X781_7950 CDS
T03026
Name
(GenBank) phage tail protein
Organism
mvr
Mannheimia sp. USDA-ARS-USMARC-1261
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FNIII-A_GpJ
Phage-tail_3
Phage_Tail_Tip
Ig_J
DUF1664
Ig_J_second
Baculo_PEP_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHG72943
UniProt:
W0Q6U1
LinkDB
All DBs
Position
complement(836935..842604)
Genome browser
AA seq
1889 aa
AA seq
DB search
MGGKKQGSARTPHEAPDSLKSAQRLRAIGLISLGPIKGPVNKWKSTFFDNTPIQNENGVD
DNDEASFNFKNTEVSFTLGTQDQLPLQGFEMSEREVSVSTEVKYTTPITRTVTDPDVTRL
RVTLGVNALYEQNDQGDTNGTSVWFRILINGLPRATYEINGKSSSRFYRSYIVDNLPERP
FTITVERTTTDSKSQRLQNATNWVSYTEIIDTKLSYPNMALVGIKTDSRYNPNFPNVNFL
LYGRLVKVPSTYDPETRTYSSALWKGDWKQAWTNNPVWVFYDLVTDPLAGLGKRVGDYGL
DKFQLYQIAKYCDELVDDGYGGKEPRMTANLWLTDQRSAYEVLSDMASVFRAIAVWNGTQ
FTAIQDRTADPVCTYSQANVIDGKFSRQYATMKSIYTAAEVEYADERNMYQKAVEYVADD
LMIERYGYNVKKMTAYATTSRGQAHRWGKWVLATSLLEQCTITFSVGRQGLLHLPGDIIE
IADNDYAGKTLGGRVVAVNSKVVTLDQPIEISGNSYLSYLNDEMKVVKVAISSVDSKNKA
VVTLATVPTGLEPMDDWVLKTPTVSTQLYRAIGITENDDGSYTITALQHEPQKESIVDGS
ASFIPVVTTAHTGGTQKVANAEASINENGVKLTWEMPSSNSIVKYEVRLYRNGVLYQTYL
DLETTELTFDDLQDGSYVAEIRSKNANGQLSDPVTRAFEINLTINRLTTKSLYFSIQLDW
DLPKTATVGNYTEIWRSVDNNISNAKKIATLPYPQNSYILNGIDLNESYYFFVRCGDKAG
NKGQFTEGVFGEADHNPDTLLNVLEGQITRSQLGSDLIASLQQDIDTAVAGEAGLRQSAV
ANAVSQIISESQARAKAIQDEANNRTKAIQAESVNLTKKIQAEAATRGNAVTQLQNVDAQ
QAQLISAVTAKANNALSGLEEERTARANGDKAESQAREALTARMGSAESNIATIQRTVAT
NAQSISEVSQNLNAKLDNLSMGGRNYLGYTKDFSSGWEFAQHANETALNGNGTIIDGCLY
FNSKTNKVSEWHQFSRESSVSQRLSSESLNRLESGTYTISFMAKSNIDNDRIWFSVRQYF
NNGESNNKAVWVTGISNEWGKFSAQIEIEDRASSDKTHKYWLAVLGCFTVGAEVWLKNIK
LEKGNIATDWTPAPEDVESSVSAVSADLTTYKQTQAAADSAQAQQLNQLSVNLTKAETNF
NAKITEEKKARVDADKVNADKLTDITSRVANAESSITGIQSTKASKTEVASLAQNSLQAI
WKADVQSAVNGFKVGGRNYLGYTKDFSSGWEFAQHANETALNGNGTIIDGCLYFNSKTNK
VSEWHQFSRESSVSQRLSSESLNRLESGTYTISFMAKSNIDNDRIWFSVRQYFNNGESNN
KAVWVTGISNEWGKFSAQIEIEDRASSDKTHKYWLAVLGCFTVGAEVWLKNIKLEKGNIA
TDWTPAPEDVESSVSAVSAKIDTIQQTLANSDSALSSRIDSVTASVNSNKAQISQVSNAV
AGVNGKLSATHTIKAQTIAGGRTAIAGIAMGASSDGVTTESSVIVMADKFGIVANANDGN
VKPVFSVANGQVGIRGDLIADGSIIGDKIRANTDLSSPNINGGNISGTNITGTTISGGTI
TGTTVSGGTVTGTTVSGGTVKGSRIEGGVISGSTILGDIVKAVILTKKGNDFEGTVPASE
ISSRTVVIPSISFNANSGETSTVTIYIDGSKVAESSVSGIRKEIPIMATIAPTEIRGSVS
VSVSGDVGGDLSGSVRGSVSGQASGMVSGQASGTVSGNVNGNVNGGFVSGHVSGMASGNL
SGTASGSLSGQVSGEAHGRATGRVTGTATGFATGTTPMTTIRTSFMLEVPTSGSISGYKQ
ITGESVLIKVTANNSTALSGQNSLVALVA
NT seq
5670 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggcggtaaaaaacaaggttcagcacgcacaccacacgaagcacctgatagcctaaaa
tcagcacagcgattacgtgcgattggtttgatttcactaggtccaattaaaggccctgta
aacaagtggaaatccactttttttgataatacaccaattcaaaacgaaaatggcgttgat
gataacgatgaagccagttttaactttaaaaataccgaagtgtcatttacgttaggcaca
caagatcaactcccattacaaggctttgaaatgtcggagcgtgaagtatcggttagcact
gaagtgaaatacaccacgccaatcactcgaaccgttaccgatcctgatgttactcgttta
cgtgtaactttgggcgtaaatgctctctatgaacaaaacgatcagggcgatactaatggc
acatcggtttggtttcgtattttaattaacggtttgccacgtgctacctatgaaattaac
ggtaagtcatcatcacgtttttatcgtagctacattgttgataatttacctgaacgccct
ttcactattacggtagaacgtacaacgacggattctaaaagccaacgcttacaaaatgcg
acgaactgggtcagctatacagagattattgacactaaattgtcttatccaaatatggca
ttggttggcattaaaactgattcacgctacaaccccaacttcccgaatgtgaatttcttg
ctttatggacgtttggttaaagtgccaagcacttacgatcctgaaactcgtacctattct
tctgcactttggaaaggcgactggaaacaagcttggacaaataaccctgtttgggtgttt
tacgatttagtaaccgaccctttagctggattaggtaaacgtgtgggcgattatggtttg
gataaattccagctctaccaaattgccaaatactgcgacgagttggttgatgacggctac
ggtggcaaagaaccacgaatgacagctaatttatggctgaccgatcaacgttctgcctat
gaagtgctttctgatatggcatcggtatttcgtgcgattgccgtatggaacggtacgcaa
ttcacagcaattcaagaccgtacagccgatccagtttgtacttatagccaagcaaacgta
atcgacggtaaattctctcgccagtatgcgacgatgaaatccatctataccgctgccgaa
gttgagtatgccgatgaacgcaatatgtatcaaaaggcggtggaatatgtcgctgatgat
ttaatgatcgagcgttacggctacaacgtcaagaaaatgaccgcttacgccacaacaagt
cgtgggcaagcccaccgttggggtaaatgggttttagccacatcactactagaacaatgt
accattacatttagtgttggtcgccaaggcttattacatttaccaggggatattatcgaa
atcgctgataacgattacgcaggcaaaacgcttggcggtcgtgttgtagcggttaatagt
aaagtagttacgcttgatcagccgattgaaatttcaggtaatagttatttgagctacctc
aacgatgaaatgaaagtcgtaaaagtggcaatttctagcgtagatagcaaaaataaagcc
gtagttacattggcaacagttccaacagggcttgagccaatggatgattgggtactaaaa
acaccaaccgtttctactcagctttatagagcgattggtattacagaaaatgacgacggc
agttataccattaccgctctccaacacgaaccgcaaaaagagtcgattgttgatggtagt
gcgagtttcattcctgttgtgacaacagctcatactggtggtactcagaaagtagcaaat
gcggaagcaagcattaacgaaaacggtgtgaaattaacgtgggagatgccatcatctaat
agcattgtaaaatatgaagttcgcctatatcgcaatggcgttctttaccaaacctattta
gatttggaaaccaccgagcttacttttgatgatttacaggatggtagttatgttgcagaa
attcgctctaaaaatgctaatggtcaattatctgatcctgttactcgtgcgtttgaaatc
aatcttacgatcaaccgtttaaccacaaaatcactttatttctctattcaattagactgg
gatctaccgaaaacggcaaccgtaggtaattacaccgaaatttggcgtagcgtggataat
aatatcagcaatgcgaaaaaaattgcgacattgccgtatccacaaaatagctatattctc
aacggcattgatttaaacgaaagttattatttctttgttcgttgtggcgataaagcaggg
aataaagggcaatttacagaaggcgtatttggcgaagcagatcataatcctgacactttg
ctaaatgtgcttgaaggtcaaattactcgtagccagttaggttcagatttgattgcctca
ttacagcaagatattgatactgctgttgcaggtgaagcaggattaagacaatcagctgtc
gctaatgctgtttcacaaatcatatcagaatctcaagctagagctaaagccattcaggac
gaggctaataatcgcaccaaagcaattcaagcagaaagtgtaaatttaacgaaaaaaatt
caagccgaagcagcgacccgagggaatgctgttacacagttacaaaatgttgatgctcaa
caagcacaactcatttctgctgtcacggcaaaagctaataacgctctatcaggtttggaa
gaagaaagaaccgcccgagcaaacggcgataaagctgaatctcaagcccgtgaagcatta
acagcaagaatgggatctgctgaaagcaatatcgcaactattcaacgtacggtagcaact
aatgcccaaagcattagtgaagtcagccaaaatttaaatgcgaagctggataatttaagt
atgggtgggcgaaattatttaggctacactaaagatttttcttccggctgggagtttgct
caacacgctaatgaaaccgctttaaatggcaacggtactattattgatggttgtttgtac
tttaactcaaaaaccaataaagtttcagagtggcatcaatttagccgagaaagttcagta
agtcagagattatcatcagaatcgctgaaccggttagagtctggcacatatacaattagc
tttatggctaagagcaatattgataatgaccgcatttggttttcagtacgccaatatttt
aataatggtgaaagtaacaacaaagcagtatgggttacaggtattagtaatgagtggggt
aaattttcagctcagattgagattgaagatagagcttcatctgataaaacacataagtat
tggctagctgttttaggttgttttactgtaggtgctgaagtttggttgaagaatatcaaa
ctggagaaaggcaatattgctacagactggacacctgcccctgaagatgtggaaagcagt
gtgagtgctgtatctgctgatttaaccacctacaaacaaacccaagcagctgccgattca
gcacaagcacagcaacttaatcagttatctgtgaacttgaccaaagcagagactaatttc
aatgccaaaatcacggaagaaaaaaaagctcgtgttgatgcagataaagtgaatgcagat
aaactcacagacataacaagccgtgttgcaaatgcagagtcaagcattaccggtattcaa
tccaccaaagcgagcaagacagaagtagcaagccttgctcaaaattcattgcaagcaatt
tggaaagcagatgtacagtctgcggttaatggatttaaagtcggaggtcggaattattta
ggctacactaaagatttttcttccggctgggagtttgctcaacacgctaatgaaaccgct
ttaaatggcaacggtactattattgatggttgtttgtactttaactcaaaaaccaataaa
gtttcagagtggcatcaatttagccgagaaagttcagtaagtcagagattatcatcagaa
tcgctgaaccggttagagtctggcacatatacaattagctttatggctaagagcaatatt
gataatgaccgcatttggttttcagtacgccaatattttaataatggtgaaagtaacaac
aaagcagtatgggttacaggtattagtaatgagtggggtaaattttcagctcagattgag
attgaagatagagcttcatctgataaaacacataagtattggctagctgttttaggttgt
tttactgtaggtgctgaagtttggttgaagaatatcaaactggagaaaggcaatattgct
acagactggacacctgcccctgaagatgtggaaagcagtgtgagtgctgtgtcagccaaa
attgataccattcagcaaactctagctaattctgattcagctttaagttctcgcattgac
agcgtaacagcatccgtgaatagcaataaagcacaaatttcacaggtgagtaatgcggtt
gcaggtgtaaatggtaaattatctgcaactcacactatcaaagcacagactattgcaggt
ggacgaactgctattgcaggtatcgcgatgggagcaagttctgacggtgtaactacagaa
tcatctgttatcgtaatggcggataaatttggcattgttgctaatgcgaatgatggaaat
gtgaaacctgtatttagtgtggcaaatggtcaagttggtattcgtggagatctgattgct
gatggttctattattggagataaaattcgagcaaataccgatttatcctctcctaatatc
aatggcggtaatatctcagggactaacatcactggtacaacaataagtggtggtactatt
acaggtacaaccgttagtggtggtacggtaactggtacgacagttagtgggggtacagtt
aaaggttctcgtattgaaggtggagtaattagtggttcaacaatccttggggatattgtg
aaagcagttattctgactaaaaaaggaaatgactttgaaggtactgtaccagcaagtgag
atttcctctcgtactgtagttattccatcaatcagttttaatgcaaatagtggtgaaaca
agtacggtcactatatatatcgatgggtcaaaagtagctgaatcaagtgtttcaggaata
aggaaagaaataccaattatggcaactattgctcccacagagattaggggaagtgtatca
gtatcggtttctggtgatgtcggtggcgatttatcaggaagcgttagaggttcagtttct
ggtcaagctagtggtatggtttcaggacaagctagtggtactgtttctggtaatgtaaat
gggaatgtcaatggaggttttgttagtggacacgtttcaggaatggcatcaggcaaccta
tcaggaacggcttcaggttctttatcaggtcaagtgagtggcgaggctcatggcagagcg
acagggagagttacaggaacagctactggctttgcgacaggaacaacgccaatgacaact
attaggacatcatttatgctggaagttcctacatcaggaagcatctcgggttacaaacag
atcacaggtgaaagtgttcttataaaagtaacagcaaataattcaacagcactaagcgga
caaaactctttagttgcgttagttgcatag
DBGET
integrated database retrieval system