KEGG   Moritella viscosa: MVIS_0180
Entry
MVIS_0180         CDS       T03770                                 
Symbol
recC
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V gamma chain
  KO
K03583  exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
mvs  Moritella viscosa
Pathway
mvs03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mvs00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    MVIS_0180 (recC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:mvs03400]
    MVIS_0180 (recC)
Enzymes [BR:mvs01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     MVIS_0180 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:mvs03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     MVIS_0180 (recC)
SSDB
Motif
Pfam: Exonuc_V_gamma RecC_C XMAP215_CLASP_TOG
Other DBs
NCBI-ProteinID: CED58216
LinkDB
Position
1:203826..207218
AA seq 1130 aa
MFNLYHSNQLDILKELMAHFIAKDPLADPFVEEQVLVQSPGMAQWVKMELAKSMGISANI
TFPLPASFIWKMFQKVLPDIPDKSAFNKEAMSWKLMLILPELLVLPEFESLKHYLADDQD
DYRLFQLCQKISDTFDQYLVYRPEWIAAWEGGDNIHADTHPWQPLLWRELVAKTEALGQS
HYHRANLYDQFIARLNSSTFDANQLPERIFVFGVSALPPRYLDALQALGMHTEIHFMLSN
PCRLYWGDLIDPKWLLKQRTMVNHNNITLGMSDKVSANDEQTVRALFDEDDAFKVGNPLL
ASMGKLGRDNLALLTGFGCQELDVFVEPSDEGLLASIQRDILDLADRSMEEFNVSQQDAN
ARDSRYKLSINPADTSLELHSCHSPMREIEILHNNLLTMFSENPDLNPRDVVIMMPDVNG
YSPYIQAVFGAMDRYDERYIPFSISDSGAQYDNPILLSFLQLLALPLSRCNVSELLSLLE
VPAVLARFAITPDEFNRLRQWIDESGIRWGLDEDDATRFDLPGMKQNTWLFGLHRMLLGY
AYGGDDIYQGILPYQEVQGIEAELLGKLAQFIEALLDSLASLQNPKLIADWIKLSNTLIE
SFYKINVDDEQSIKIIRDAFSHLDEQLKSASYDKLITPLVLRDYLNNALSQVGSSQKFLA
GQVNFCTLMPMRSIPFKVICLLGMNDGVYPRSIPPMGFDLMANDHKQGDRSRRDDDRYLF
LEALISAQSKLYISYIGSSIRDKSERLPSVLITELLQYCQQSFCVTGDECLSPDESAEKL
LTHLIQHHALQPFDARYFNPEAPCSFAKEWLPALAPVVELRQFLTEPLPALIFNDDMQEV
ELAEILRFYRHPTKYFFNRRLKVYFNQASLDVLDDEPFDVDNLEKYHLKAQLLETELMGG
DISLVTERLVASGSLPLGRFGKISLDKEISTVSQLAQVLMPLLTNSNDDIEVDIPLISGR
LVGWLKQIYNGGLVRHKPSGFNGKDYLQAWLEHLCFCISAKNPTATTLVHLTSGKPVVQR
LRVIEQSRARELLFQLLEVYSDGSCQPLALFPKTGWGWAKTKCTTAEPDDYKLRSEALLN
FEGGYNRMGENADDYLQRSFPRLNDEVYKLMSAFSESVLFPIFEYLEDVE
NT seq 3393 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
gtgtttaatctttatcactcgaatcagttagatattttaaaagagctaatggctcacttt
attgctaaagatccacttgccgacccttttgtcgaagagcaagttttggtacaaagtcca
ggtatggcgcaatgggtgaaaatggagttggcgaagtcgatgggcatatcggctaatatt
acctttccattgcctgcttcttttatttggaagatgttccaaaaggtattacctgacatt
cctgataaaagtgcatttaataaagaggcaatgtcttggaagttaatgctaatcctccca
gagttattagtgctacctgaattcgaatcattaaagcattatttagcggatgatcaagac
gattatcgcttgtttcaactctgccagaaaatatcggacacgtttgaccaatatttagta
taccgacctgagtggatcgcggcttgggaaggtggtgataatattcatgctgatacccac
ccttggcagccattgttatggcgtgaattagttgctaaaaccgaagcattgggtcaatct
cattatcatcgcgccaacttatatgatcaatttattgcccgtctgaatagttcgacgttt
gatgccaatcagctacctgaacgtatatttgtattcggggtatctgcattaccaccgcgt
tatttagatgcattacaagcacttggtatgcataccgaaatacactttatgttatcgaac
ccttgtcgcttgtactggggtgatctgatagaccctaagtggcttttaaagcaacgtaca
atggttaatcataacaatataactcttggcatgagtgataaggtgagtgctaatgatgaa
caaaccgttcgggctctctttgatgaagatgatgcatttaaagttggaaatccactactc
gcgtctatgggtaaactaggtcgtgataatttagcgttattaacgggttttggttgtcag
gagttagatgtttttgttgaaccgagcgatgagggattactggcaagtattcagcgcgat
atattagatttggctgatcgtagcatggaagagtttaatgtttcgcaacaggatgcgaat
gcgcgagatagtcgttataaactatctataaatcctgctgacacttcacttgaactgcac
agctgtcatagcccaatgcgtgaaatagaaatattacataataatttacttactatgttt
tcggaaaatccagacctgaatccccgagatgtggttattatgatgcctgatgtaaatggt
tacagtccttatattcaagcggtgtttggtgcgatggaccgttatgatgaacggtatatt
ccgttttctatctcagatagtggcgcgcagtatgataatcctattttactcagtttttta
caattactggctctacctttatcgcgttgtaacgtatctgaattattgtcattattagaa
gtgcctgcggtactggctcgttttgctattacgcctgatgaattcaaccgtttacgtcaa
tggattgatgagtcaggcattcgttggggtttagatgaagatgatgcaactcgttttgat
ttaccgggaatgaaacaaaatacttggctatttggcttgcatcgtatgctgctgggttac
gcttatggtggtgacgatatttatcaaggtatattgccttatcaagaagtgcaaggaatt
gaagctgagttactaggtaagttagcacagttcattgaagcattattagatagtcttgcg
tcattacaaaatcccaaattgatagctgactggatcaagttaagtaatacgctaatagag
agtttttataaaattaatgtggatgatgaacaatccataaaaattattcgagatgctttt
tcgcatttagatgagcaattaaaaagcgcgagctatgacaagttaattacaccattagta
ttacgtgattatttaaataatgcgctttcacaagttgggtctagtcaaaagttccttgcg
ggtcaagttaacttctgtaccttgatgccaatgcgttctatcccatttaaagttatttgt
ttactcggtatgaatgatggtgtttatcctcgctcaattccaccaatgggttttgattta
atggctaatgatcataaacaaggtgatcgtagtcgtcgtgatgatgaccgttatttattt
ttagaagcgcttatttctgcccaaagtaaattatatattagctatattggcagtagtatt
cgtgataagagtgagcgcctaccgtctgtgctgatcactgagttattacagtattgccag
caaagtttttgtgttacaggtgatgaatgtctatctcctgatgagtcagcggaaaaatta
ctgacacatttaattcaacatcatgctttacagccgttcgatgcacgttattttaatccg
gaagcaccttgttcttttgctaaagaatggttacctgcgttagcccctgttgtggagtta
agacaatttctcactgagcctttacctgcgctaatattcaatgatgatatgcaagaggtt
gagctcgctgagatattacgtttttatcgccatccgactaagtacttctttaaccgacgt
ttaaaagtttattttaatcaggctagtcttgatgtacttgatgacgaaccatttgatgtt
gataacctagaaaaatatcaccttaaagcgcaattgttggaaacggaattgatggggggc
gatattagtttggtgactgaacgcttggtcgcatcaggtagccttcctcttggacgtttt
ggaaaaatttccctggataaagaaatcagtactgttagtcagcttgctcaggtattaatg
ccgttattgaccaacagtaatgatgacatcgaagtcgatattcctttgatttcagggcgc
ttagttggttggttaaagcaaatatataacggtggtttagtaaggcataaaccaagtggc
tttaacggtaaggattatctacaggcttggttagagcatttatgtttctgtattagtgct
aaaaatcccacagcgacaacgcttgttcacttaacttcgggtaagcctgttgtacaacgg
cttagagtcatagagcaatctcgggcgagagagttgttgtttcaattacttgaggtttat
agcgatggtagctgtcagcctttagcgttattccctaaaacaggttggggttgggcaaaa
accaaatgtacgaccgcagagcctgatgattataaattaagatcggaagcattattgaat
tttgaaggtggttataaccgcatgggcgaaaatgcggatgactatttacaacgtagtttt
ccacgtttaaatgatgaggtatataaattaatgtcagcattctctgagtcggtgttattt
cctatatttgaatacctagaggatgtcgaataa

DBGET integrated database retrieval system