Moritella viscosa: MVIS_2082
Help
Entry
MVIS_2082 CDS
T03770
Symbol
pfaA
Name
(GenBank) putative polyunsaturated fatty acid synthase
Organism
mvs
Moritella viscosa
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
Ketoacyl-synt_C
PP-binding
KR
Acyl_transf_1
KAsynt_C_assoc
adh_short
adh_short_C2
PKS_DH_N
BcsE_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CED60045
LinkDB
All DBs
Position
1:2379848..2387482
Genome browser
AA seq
2544 aa
AA seq
DB search
MSIVFSAKRSFRSNNTMAKKNTTSVKHGKDVLSSDEQQLNSRLQECPIAIIGMASVFADA
KNLDQFWDNIVDSVDAIIDVPSDRWNIDDHYSADKKAADKTYCKRGGFIPELDFDPMEFG
LPPNILELTDIAQLLSLIVARDVLSDAGIGSDYDHDKIGITLGVGGGQKQISPLTSRLQG
PVLEKVLKASGIDDDDRAMIIDKFKKAYIGWEENSFPGMLGNVIAGRIANRFDFGGTNCV
VDAACAGSLAAIKMAISDLLEYRSEVMISGGVCCDNSPFMYMSFSKTPAFTTNDDIRPFD
DDSKGMLVGEGIGMLAFKRLEDAERDGDRIYSVLKGIGTSSDGRFKSIYAPRPDGQAKAL
KRAYEDAGFAPETCGLIEGHGTGTKAGDAAEFGGLTKHFGAASDKKQHIALGSVKSQIGH
TKSAAGSAGMIKAALALHHKILPATIHIDKPSEALDIKNSPLYLNSETRPWMPREDGIPR
RAGISSFGFGGTNFHIILEEYRPSHDSAYRLNSVSQTVLISAKNQQSIIVELNNWRTKLA
VETDLQAFAFNDLVTTWPLNTPSADKARLGFVARNANEAIVMIDTALKQFSANADKATWS
APTGVYYRQAGIDANGKVVALFSGQGSQYVNMGRELACNFPSMMHSATTMDKEFSNAGLG
QLSAITYPIPVYTDAERLLQEEQLRLTQHAQPAIGCLSVGLFKTFKQAGFKADFTAGHSF
GELTALWAADVLSDSDYMMLARSRGQAMAAPEQQDFDAGKMAAVVGDPQQVAVIIGAIDD
VSIANYNSNNQVVIAGASEQVAVAITALSHAGFKVVPLPVSAAFHTPLVGHAQKPFSKAV
DSTKFKAPTIPVFANGTGLVHSSKPNEIKKSLKKHMLEPVHFNQEIDNIYADGGRIFIEF
GPKNVLTKLVENILNDKSDAVAIAVNANPKQPADVQMRQAALQMAVLGVSLENLDPYDAV
KRPLAAPKASPMLMKLSAASYVSPKTKKAFADALTDGWTVKQAKAAPVAVPQPQVIEKIV
EVEKIVEKIVEVEKIVYVNADGSYVTPNNNNSTNSAVANNAVANNAISNSDADLVASIER
SVGQFVEHQQQLLNVHEQFMQGPQDYAKTVQSVLAAQTNNELPESLDRTLSMYNEFQSET
LRVHATYLNNQTSNMTSMLTGSEDHEITSSTTPVLDTTQQSVQTASLVIPVVVNDKVESP
VVNTVTHVASNAAVAVQTVAVAPVPVSSPVVAAISAPSLVAVVAEQEVSPAVATVTESVV
IPEVAQVSIDVATINKVMLEVVADKTGYPTDMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGAVQEL
LPNLPELNPEDLAELRTLGEIVDYMNAKAQAIVSTTVPTISASATPAVAGIDLAHIQNVM
LEVVADKTGYPTGMLELSMDMEADLGIDSIKRVEILGAVQEIITDLPELNPEDLAELRTL
GEIVTYMQSKAPVAESVPAVTTESTDAVVTSATPTIDLNHIQTVMMEVVADKTGYPTDML
ELSMDMEADLGIDSIKRVEILGAVQEIITDLSELNPEDLAELRTLGEIVTYMQSKVESPV
VADVVNTVVTTVIDLDRIQNVMMDVVADKTGYPASMLELAMDMEADLGIDSIKRVEILGA
VQEIITDLPELNPEDLAELRTLEEIVTYMQSKVTGSVATNAYSTSEQSSVSDVFMHDSVA
TISAVEQKIAFQPAPSATVAITRLSSITKISQDSQGANALIVADGSDSAVLLADKLIQSG
WNVTALQPSWITMNRTKTFAKSVNVVVLNAVDEIEINNIITTNAQLDAVIYLHASTEINH
IEYPQASKQGLMLAFLLAKLSKVTQAAKVRGAFMVVTQQGGSLGVSDSDKPELVNSDLVQ
SGLNGLVKTLSHEWDNVFCRAVDMTTLLTAEQVASFVSDELLDADTTLTEVGYQPADKNG
VERVTLAGVVTDSYALTAGNNIDANSVFLVSGGAKGVTAHCVVRIAKEYQAKFILLGRSK
FSTDEPNWAQGISDEVALKKAAMQALIVAGDKPTPVKVVKLIKPIQANREIAQTLAAITA
VGGQAEYVSADVTNAVNVQAAVKPSIAKFGDITGIIHGAGVLADQFIEQKTLSDFESVYS
TKIDGLLSLLSVTKASNIKQLVLFSSAAGFYGNPGQSDYSIANEILNKTAYRFKSLHPQA
QVLSFNWGPWDGGMVTPELKRMFDQRGVYIIPLDAGAQLLLSELAANDNRCPQILVGNDL
SKDVESDVKSNAVKKPQVSRLSDALVIKSIKATNSNFQVNNNYFLADHMIKGNQVLPTVC
AIAWMSDVAQATYSKRDCTLKYVGFEDYKLFKGVVFDGNEVADYQIQLSPITAVSEQENL
VRIAAKIFSLKSDSNPIFHYAATILLAPQPLEAVKVNLPSLVADIEGCAVNESVAGEAQA
LYSNGTLFHGESLQGIKQILRCDEQGLLFACQVSDVAAAKQGGFPLAANNIFANDLVYQA
MLVWVRKQFNLGSLPSVTAAWTVYREVAINELFYLQLNVVEHDLLTSRGSKACCDIQLIG
ADMQLIAEVKSAQVSVSDILNDMS
NT seq
7635 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcattgtttttagtgcaaaaagatccttcaggagcaataacacaatggctaaaaag
aacaccacatcggttaagcatggcaaggatgtgttaagtagtgatgagcaacagttaaat
tctcgtttacaagaatgcccaattgctatcataggtatggcatcagtttttgctgatgcc
aaaaatcttgatcaattctgggataatatcgtcgattccgttgatgcgattattgatgtg
cctagcgaccgttggaacattgacgaccattattcggcagataaaaaagccgcagacaaa
acatactgtaaacgcggtggtttcattcctgaactcgattttgatccgatggagtttggc
ttgccgccaaatatcttagagttaactgatatagctcaactgctgtcgctaatagttgca
cgcgatgtattaagtgatgctggcattggtagtgattatgatcatgataaaattggtatt
acgctaggtgttggtggtggtcagaaacaaatttcgccgctaacctctcgcctgcaaggt
cctgtgttagaaaaagtattaaaagcgtcgggtattgatgatgatgatcgcgcaatgatc
atcgataaatttaaaaaagcctacataggttgggaagaaaattcattccccggtatgtta
ggtaacgttattgctggtcgaattgctaatcgcttcgattttggtggtacaaattgcgtg
gttgatgcggcgtgtgccggctcccttgctgcaattaaaatggcgatctcagatttacta
gaatatcgttcagaagtaatgatctcgggtggtgtatgctgtgataactcaccattcatg
tatatgtcattctcaaaaacccctgcgtttaccaccaatgatgatatccgtccgtttgat
gacgattcaaaaggtatgctggtgggtgaaggtattggcatgttggcgtttaaacgcctg
gaagatgctgaacgtgatggcgatagaatctattctgtattgaaaggcatcggcacgtct
tccgatggtcgtttcaaatctatttacgcaccacgtccagatggtcaagctaaagcgctt
aaacgagcatatgaagatgctggttttgcacctgaaacatgtggtcttattgaggggcac
ggtacggggacgaaagctggcgatgcggccgagtttggtggtttaactaaacactttggt
gctgcgagtgataagaaacagcatattgcattaggttcggttaaatcacaaattggccat
actaaatctgcggctggttctgcaggtatgatcaaagcagcattagcactacatcataaa
attttaccagcgactattcatatcgataaaccaagtgaagccttggatatcaaaaatagc
cctttgtatttaaacagtgagactcgtccttggatgccacgtgaagatggtattccacgc
cgtgcgggtattagctcatttggttttggtggcactaacttccatattattttagaagaa
tatcgtccgagtcatgatagtgcttatcgattaaactcagtctcgcaaacagtacttatt
tctgcgaagaatcagcaaagtatcatcgtagaattgaataactggcgtactaagttggca
gtagaaactgaccttcaggcgtttgcatttaatgacttagtgactacctggccattgaat
acgccatcagcagataaagcgcgtttaggttttgttgctcgtaacgccaacgaagccatt
gttatgatcgatacggcgttgaaacaattcagcgcgaatgcagataaagcaacttggtct
gcaccaacaggggtttattatcgccaagcgggtattgatgctaacggtaaagttgtcgcg
ttattctccggacaaggttcgcaatatgtgaacatgggccgtgagttagcttgtaacttt
ccaagcatgatgcacagtgcgacgacaatggataaagaattcagtaatgctggtttaggt
cagttgtctgcgatcacttatccgattcctgtgtacactgacgctgaacgtctgttacaa
gaagagcaattacgtttaactcaacatgcacaacctgcgattggttgcctgagtgtgggt
ctgtttaaaactttcaaacaagcaggttttaaagctgattttacagccggtcacagtttt
ggtgaattaacggcgttatgggctgctgacgtattgagcgatagtgattacatgatgttg
gcgcgtagccgtggtcaagcaatggcagcgccagaacaacaagattttgatgctggcaag
atggctgctgttgtgggcgacccacagcaagtagcggtaatcatcggcgcgattgatgac
gtgtctattgctaactacaattctaataatcaagtagttattgcgggagcgagtgagcag
gttgctgttgctattacagcactgagtcatgccggttttaaggttgttccgctaccagta
tctgctgcgtttcatactccattagttggtcacgctcaaaagccattttccaaagcggtt
gatagcactaagtttaaagcgccgacaattccggtatttgctaacggcacaggtttagtt
cattcaagtaaaccaaacgaaattaaaaaaagcttgaaaaaacatatgttggaacctgtc
catttcaatcaagaaattgacaatatatatgcagacggtggccgtatatttatcgagttt
ggaccgaagaatgtattaaccaaattggttgagaatattcttaatgataaatctgatgct
gtggctatcgcagtaaatgctaatccaaaacaacctgctgatgtgcaaatgcgtcaggca
gccttgcaaatggctgtgcttggtgtttcgttagaaaatcttgacccgtacgacgcggtt
aagcgcccattagctgcgccgaaagcgtcgcctatgttgatgaaactgtctgctgcctcg
tatgtgagtccgaaaaccaaaaaagcgtttgcagatgccttaaccgatggttggacagtg
aaacaagcaaaagctgctccagttgccgttccacagcctcaagttattgaaaaaattgtt
gaagtcgagaaaatagtagaaaaaatcgttgaagtagagaagattgtttacgttaatgcc
gatggttcatatgtaacgccaaataataacaatagcactaatagtgctgttgctaacaat
gctgttgctaacaatgccattagcaatagtgatgccgaccttgttgcctctatcgagcgc
agtgttggtcagtttgttgaacaccagcagcaattattaaatgtgcatgagcagtttatg
cagggaccacaggactatgctaaaacagttcaatcggtacttgcagcgcaaacgaataat
gaattaccagaaagtttagatcgtacgttgtctatgtataacgagttccaatctgaaacc
ctgcgcgtacatgcaacttatttaaataatcagacgagtaatatgacttcaatgctgacg
ggctctgaagatcacgagattacttcgtcaacaacgcctgtattggatacaacacagcag
tctgtacaaactgcatcgctagtaataccggttgtggttaatgacaaggtggaaagtcct
gttgtaaatactgttactcatgttgctagtaatgcagctgttgcagttcaaactgtggct
gtagcgcctgttcctgttagttctccggttgttgccgctatatctgcaccttcattggtt
gctgttgtggctgaacaggaagttagtcctgctgttgcaaccgtgactgaatcagttgtt
atacctgaggttgctcaagttagcattgatgtagcaacgatcaataaagtgatgttagaa
gttgtggctgataaaaccggttatccaacagatatgcttgagttgagcatggacatggaa
gctgacttaggtatcgactctatcaaacgtgttgaaatattgggtgctgtgcaggaactg
ctcccaaatcttccagagcttaaccctgaagatctcgctgaattgcgcacgcttggtgaa
attgttgattacatgaatgctaaagctcaagcgatagtatcaacaacagtaccaacaatc
agcgcatcagctacaccagcagtagctggcattgatttagcccacatccaaaatgtaatg
ctggaagttgttgctgataaaaccggttatccgacaggcatgcttgaactgagtatggat
atggaggcagacttaggtattgattcaatcaaacgtgtcgaaatcttaggtgccgtacag
gagattattactgatttacctgagctaaacccagaagacctagcagaactacgtactcta
ggtgaaattgttacttatatgcaaagcaaggctcctgtagcagaaagtgtacctgcggta
acgacagaatctacagacgctgtcgtaacaagtgctacaccaactatcgacttaaatcat
atccaaacggtaatgatggaagtggttgcagacaagacgggttatccaacagacatgctt
gaactaagcatggatatggaagctgacttaggtattgattcaatcaaacgtgtagaaatc
ttaggtgcagtacaggaaatcatcaccgatttatctgagctaaacccagaagacctagct
gaactacgtactctaggtgaaattgttacctatatgcagagtaaagtggaatctccggtt
gtagctgacgttgttaatactgtagtgactaccgtgattgatttagaccgtattcaaaat
gtaatgatggacgttgttgcggataagacaggttacccagccagtatgctagagctagca
atggatatggaagcggatttaggtattgattcgatcaaacgtgtcgaaatcttaggtgcc
gtacaggagatcattactgatttacctgagttaaatccagaagatttagccgaattgcga
acactagaagaaatcgttacttacatgcaaagtaaggttactggcagtgttgcaactaat
gcttactctacttctgaacaaagttctgtttcagatgtatttatgcatgacagtgttgca
acaatctctgcagtagaacagaaaatagcatttcaaccagccccgagtgccacagttgct
attacgagacttagttctatcactaaaatcagtcaagatagtcaaggtgctaacgcctta
attgtggcggatggtagtgatagtgcagtgctattagcggataagttaattcagtctggc
tggaatgtcactgcattacaaccgagttggatcacaatgaatcgtactaaaacgtttgct
aagtcagtaaatgttgttgtgctaaacgctgttgatgaaattgaaattaacaatatcatt
actactaatgctcaacttgatgcggttatctacctgcatgcaagcaccgagataaaccat
attgaatacccgcaagcatctaagcaaggcttaatgttagcgttcttattagctaaattg
agcaaagtgactcaagcagctaaagtacgtggcgctttcatggttgttactcaacaaggt
ggttcattaggagttagcgatagtgataagcctgagttagtaaatagtgacttagtacaa
agtggcttaaacggtttagttaaaacactatcacacgaatgggataacgtattctgtcgt
gcagtcgatatgacaacattattaactgcagaacaagtagctagttttgttagcgatgaa
ttactcgatgctgacactacattaactgaagtcggttaccagcccgcagataaaaatggc
gttgaacgtgtcactttagcaggcgtagttactgacagttatgcactcactgcaggtaat
aacattgatgctaactcagtattcttggttagtggtggtgctaaaggtgttactgcacat
tgtgttgttcgtattgctaaagaatatcaagctaagttcatattattaggacgttcgaag
ttctcaacagacgagccgaattgggcacagggcattagcgatgaagttgcgttaaaaaaa
gctgctatgcaggctttaattgttgctggtgataaaccaacaccagtgaaagtagtgaaa
ctgatcaaacctatccaagctaatcgtgaaatagcacaaactttagcagccattaccgct
gtcggtggtcaagctgagtatgtttctgctgatgtaaccaacgcggtaaatgtacaggca
gcagtgaaaccatctatcgctaaatttggcgatatcacaggtatcattcatggtgctggc
gttttagctgaccaattcattgagcaaaaaacactgagtgatttcgagtctgtttacagc
accaaaattgacggtttgttatcactgctatcagtgactaaggcaagtaacatcaagcaa
ttggtattgttttcgtcagccgcaggtttctacggcaacccagggcagtctgattactca
attgccaatgagatcttaaataaaacagcgtatcgttttaaatcattgcacccacaagca
caggtattgagctttaactggggtccttgggatggtgggatggttacgccagagctgaag
cgtatgtttgatcaacgtggtgtgtatattattccgcttgatgctggcgcgcagttgtta
ctgagtgagttagcagcgaatgataatcgttgtccacaaattctagtgggtaatgattta
tcaaaagatgttgagagtgatgtaaagagtaatgctgtaaaaaagccacaagttagtcgt
ttatcagatgctttagttattaaaagcatcaaagcgactaacagtaatttccaagtcaac
aacaattactttttagctgatcacatgatcaaaggcaatcaggtattacctacggtatgc
gcgattgcttggatgagtgatgtggcacaagcaacttatagtaagcgagactgcacattg
aaatatgttggcttcgaagattataaattgtttaaaggagtggtttttgatggcaacgag
gtggctgattatcaaattcaattgtcgcctataacagctgtttcggaacaggaaaacctt
gtccgtattgctgcaaaaatatttagtctgaaaagtgatagtaatcccatttttcattat
gctgcaacgatattgttagctcctcaaccgctagaagctgtgaaggttaatttaccttca
ttagttgcggatattgagggctgtgccgttaacgaaagcgtggctggtgaagcacaagcc
ttatatagcaatggcaccttatttcatggtgaaagtctgcagggtattaagcagatatta
cgctgtgatgagcaaggactgttatttgcctgtcaggtaagcgatgttgcggcggctaag
cagggcgggttccccttagcagcgaacaatatttttgctaatgacttggtttatcaagct
atgttggtatgggttcgtaagcaatttaacttaggtagtttaccttccgtaacagcagcc
tggactgtatatcgtgaagtggcgattaatgagttgttttatttgcagcttaacgttgtt
gagcatgatctgttgacatcacgaggtagtaaagcctgttgtgatattcaattaattggt
gctgatatgcaattaattgcagaagttaaatcagcgcaagtcagtgtgagtgacatttta
aatgacatgtcttga
DBGET
integrated database retrieval system