KEGG   Moritella viscosa: MVIS_4253
Entry
MVIS_4253         CDS       T03770                                 
Name
(GenBank) putative membrane associated signaling protein, GGDEF family protein
  KO
K18765  RNase E specificity factor CsrD
Organism
mvs  Moritella viscosa
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mvs00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:mvs03019]
    MVIS_4253
Messenger RNA biogenesis [BR:mvs03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   Other RNA degradation factors
    Others
     MVIS_4253
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF GAPES4 GGDEF_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: CED62130
LinkDB
Position
1:complement(4874758..4876674)
AA seq 638 aa
MKFTNQLIGFIIVCVLSSIGVVLLGGGVSLRGLAIETQKQNISRLIDVMDEQLAMEDSEP
RFAFWLPELLRAHSVLQLTVEKNGIVSYDFDGRTADVGDDTPFLKEYHFDLKANSDFKAK
VIMLSPYYAMEYPPELFTGVSTGLLIALFGLVIAIWLLKKGMYGAELLSTRSYQILNGDH
IKVAVGSGAEWPKATSRAFDKLIADLEDTKQERSRFDSYMRTNAFVDASTGIGNRDFLLN
QLEAMLSDPGVIAGTIIKIELYELSQLNYNHGVASVDEMVKSVCELLSKFVERFIGSVLA
RYRGDQFIILLPRITGSESEIVMKQLYKLLTRISLFTPVDCDELFYTGVAIYNYAERTEE
VLENVDQALKIAVLQGCSGWFLYEQEEQTPVYAKGTVRWRGLFDRTFKNNAFYYEQQLIL
SMEDKLVLGYEIYPRLKDENDEWVHAGVFLPMAEKCGVLKRIDRLTVERAISNLEQGEPI
SCGLNLDIQSYLDKRFMRAVYLDIIRLPVRLRAMLHFEIHEYQINRNLEMLLEPVKNLKA
LGCCIVVDMVGQDVVDSSYIKKLDVDVIKIHHSLVRDLHKRQINQLAISSILGGTINLST
IVIAVGVESKGEWDVLNKLGVYGAQGYFCNKVSLLNES
NT seq 1917 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaagtttaccaaccaactgattggttttattattgtgtgcgtgctgtcatcgattggt
gtggtattgctgggaggcggcgttagtttacgtggtcttgcgattgagactcaaaagcaa
aatatctcgcgattgatcgatgtgatggatgagcaactggcaatggaagacagtgaaccc
cgttttgcattctggctacccgagttattacgtgcgcattcagtattacaactgacagtc
gaaaaaaatggcattgtcagttacgactttgatggacgaacggcagatgttggggacgat
actccttttctcaaagagtatcatttcgatttaaaagcgaatagtgactttaaagcgaaa
gttattatgctttcaccctactatgcgatggaatacccacctgaattatttactggggta
agcacgggtttactcattgctttatttggtttagtcattgctatctggttgcttaaaaaa
ggcatgtatggcgctgaattactctctacacgcagttatcaaattctcaacggtgatcat
attaaagtggctgttggctcgggagctgaatggccaaaagcaaccagtcgtgcgtttgat
aaattaattgcagacttggaagatactaaacaagagcgcagtcgttttgattcttatatg
cgtactaacgcgtttgttgatgcctcaactggtattggtaatcgtgatttccttttaaat
caattagaagccatgttatctgatcctggggttatcgctggcacgattataaaaatagaa
ctctatgaattatcgcaattaaattataaccatggtgtggcaagtgttgatgaaatggtt
aaatcggtctgtgaactgctaagtaagtttgtggagcgttttattggctctgtacttgct
cgttatcgtggcgatcaatttattattttattgcctcggatcacaggctctgaatctgaa
attgtgatgaagcagttgtacaagttactcactcgaatcagtttgtttacgccggtggat
tgtgatgaattattttatactggtgtcgcaatttataattatgctgaacgcacagaagaa
gtattagaaaacgtcgatcaggcattaaagattgcggtattacaaggctgctctggttgg
ttcttgtacgaacaagaagagcaaacaccagtttatgccaaaggtactgtcagatggcgt
ggactgtttgatcgaaccttcaaaaataatgcattctattatgagcaacaactcatttta
agcatggaagataagctggtattaggttatgaaatctacccaaggttaaaagacgagaat
gatgaatgggttcatgcaggtgtctttttaccaatggcagaaaaatgtggggtacttaaa
cgcattgatcggctaaccgtagagcgggcaatctcgaacctagagcaaggtgaacctatt
tcttgtggactaaacttagatattcagagttatttggataagcgttttatgcgcgctgtt
tacctcgatattatccgcttgccggtgaggttacgcgcgatgctgcattttgaaatccat
gaatatcaaattaatcgtaatttagagatgttattagagcccgttaaaaatctaaaagca
ctaggctgttgcatcgttgtggatatggttggtcaagatgtggttgattcgtcttatatt
aagaaattagatgtcgacgttatcaaaattcaccacagtttagtacgtgatttacataaa
cgtcaaattaatcaactggctattagcagtattcttggtggtacaattaatttgtctact
attgttattgcggttggtgtggaatcgaagggtgagtgggatgtattaaataaactcgga
gtctatggtgctcaaggttatttttgtaataaagtcagtctattgaatgagtcgtga

DBGET integrated database retrieval system