Mycoplasma yeatsii: MYE_01970
Help
Entry
MYE_01970 CDS
T03676
Symbol
recD-1
Name
(GenBank) ATP-dependent RecD/TraA family DNA helicase
KO
K03581
exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
myt
Mycoplasma yeatsii
Pathway
myt03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
myt00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
MYE_01970 (recD-1)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
myt03400
]
MYE_01970 (recD-1)
Enzymes [BR:
myt01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
MYE_01970 (recD-1)
DNA repair and recombination proteins [BR:
myt03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
MYE_01970 (recD-1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_19
AAA_30
Viral_helicase1
AAA_11
UvrD_C_2
SH3_13
SLFN-g3_helicase
OB_YrrC
AAA_22
nSTAND3
AAA_18
RsgA_GTPase
Rad17
Helicase_RecD
AAA_12
NTPase_1
AAA
NPHP3_N
AAA_29
DEAD
AAA_28
T2SSE
ABC_tran
SRP54
AAA_16
cobW
TsaE
AAA_7
NACHT
NB-ARC
PhoH
Mg_chelatase
RNA_helicase
Parvo_NS1
DnaB_C
ATP-synt_ab
Flp_N
PRK
AAA_17
Zeta_toxin
HHH_5
AAA_14
DO-GTPase2
CPT
AAA_5
TrwB_AAD_bind
MeaB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJM71875
LinkDB
All DBs
Position
complement(463645..465861)
Genome browser
AA seq
738 aa
AA seq
DB search
MEKQIKLRGYISKFIYLSGNWGLAIFTSEENEKKTIKIKGQIGLMKTKVLYEITGSVNTH
AKYGSSFDVVNFDFAQIDNKQQIINFLKSDVFPGVGNLTAKKIAEHYSENFIQEILDDKE
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KNNLNNSIDEQTLDKYILEIENEIASSKNIKDFKYDNSQINALKTFAKNNIIIITGGPGT
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LINKHNALSFDLLIVDECSMIDNRLFSQFLQSSLKAKKIVLVGDPEQLPSVNYGNVFFDI
IKTNTIPTINLEHIHRQKENNGIIDLAYMIKNNTFDITKVDQLNNVKFIFNTDKKYCLEQ
IKTNYAKDLDFNNPYNTQIICPMYAGTLGINNLNDLIQSNFNFNINDQQKIYQRAKNKYI
ESDKIMYLKNDSKLNISNGDVGIIDSIIYKNNKFDFAIVNFNNTILEFNNQNFDDLTLSY
ACSVHKTQGSEYDKVILVLDATHFNQFIDKKLLYTAITRAKKELIIITKEDIFIQGINRS
SKKRNTTLQEVIISTLNK
NT seq
2217 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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DBGET
integrated database retrieval system