Maylandia zebra (zebra mbuna): 101484507
Help
Entry
101484507 CDS
T02814
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2 isoform X1
KO
K20995
Notch 3
Organism
mze
Maylandia zebra (zebra mbuna)
Pathway
mze04330
Notch signaling pathway
mze04371
Apelin signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mze00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
101484507
04371 Apelin signaling pathway
101484507
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
EGF_3
Notch
NOD
NODP
Ank_3
Ank_4
Ank_5
cEGF
DL-JAG_EGF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101484507
NCBI-ProteinID:
XP_004552167
LinkDB
All DBs
Position
LG4:complement(19243134..19270713)
Genome browser
AA seq
2464 aa
AA seq
DB search
MEGNIPWILLSFLLFMHVCEGIRCVDQHRPCENGGTCLDSPSRCICRPGFIGPLCQHLDP
CLRSQCQNGAACKSEVLNGVTQYTCVCQRGFRGQDCSLIDACATSPCANGARCVNWNNHY
NCSCPPGFQGKNCRNDIDECRKPGVCLNGGTCINIHGSFRCQCQPGYSGRTCEVSTLPCA
PSQCLNGGTCRQTSDHSYECACLPGFEGHNCENNVDDCPGHKCMNGGICVDGVNTYNCQC
PPEWTGQYCAEDVNECQMQPNACHNGGTCFNTIGGHTCVCVNGWTGDDCSENIDDCAIAV
CFNGATCHDRVASFFCECPVGKTGLLCHLDDACVSNPCNEGAVCDTNPLNGRAICTCPAG
FVGGACNQDMDECSIGANPCEHFGKCVNTEGSFQCQCGRGYAGPRCEIDINECLSMPCQN
DATCLDRIGEFTCICMPGYVGTYCETDVDDCESNPCVNDGICRDMVNGFTCTCQPGFTGT
MCQIDIDECASTPCQNGAKCYDRPNGFECRCAEGYEGILCESNINNCQPDPCHHGTCIDG
IASYTCNCEPGYTGYRCENQLNECHSNPCQNGGKCMDQVNKYICQCQHGTSGTNCEINFD
DCASNPCDYGICKDGINRYDCVCKPGFTGPKCNVEIDECASSPCRNGGKCIDEENGFHCL
CPDGFKPPYCYSQVDECGSGPCVHGSCRDDINGYRCDCEPGWVGKNCDLDRNDCLPSPCQ
NAGTCIDQLNGFTCKCRQGFRGNLCQVNINECESSPCLNKGTCVDGVASFTCLCELPYSG
PTCAEVLTPCSPNPCANHAACIHTPDYMGYQCKCPPGWQGQLCNRDVNECISNPCKNRGT
CANTLGGFVCSCRAGYTGLTCETDINDCSPNPCLSGGSCTDGVNFFHCSCLPGFTGSHCS
VEINECQSSPCKNGGTCTDYVNSYTCTCMPGFTGIHCETNIPDCTESSCFNGGTCTDKIN
GYSCTCRSGFTGSHCQYEVNECDSQPCLNGGICQDALESFRCSCPKGYTGNRCQTPVDWC
RRASPCHNGGRCRQKDASFICECTDGWSGRYCDIPRVSCEAAARQRGLQTDELCHHGGHC
VNTGNTHYCKCPNDYTGSYCENQVDHCEDKPCRNGATCRGYVGGYQCDCMPGYTGKDCEI
EINECQSHPCQNGGTCIDLVGHYICSCPPGTLGVLCEINEDDCAPHPRLRNAPPKCLNNG
TCVDRVGGYRCNCPPGFTGERCEGDINECLSQPCIPSNSLDCIQLPNDYQCVCKPGFTGR
RCQSRFSVCESQPCQNGGVCSITSSSSQGYTCTCQLGYAGPNCERSMSCRELSCYNGGSC
SLTLRGARCTCLPGYGGPQCQHRSNDGCSAMPCRNGGLCTEETSFPFFNCQCLSGWKGRR
CEHSRTTVPPVPSCPLADCDAKAADGFCDKQCNSLPCHWDGGDCSLAMKPWDKCGDPHCW
RVFNNSQCDKSCNNADCLYDNFDCKTKEKVCNPIYEAYCIDHYADGKCDQGCNTEECGWD
GLDCATKVAEKLAENVLVLVVLMPPEELLRTGTVFLQKLSAILRTSVRFRLDSNGKAMIQ
PYTRESARMKRELEVIGSIVYVEIDNRLCTEDCFLTADSAAEYLGALSAVEGLQFPYPLK
EVRGEKINGTIVELPFYLMVVGIASVFLLVILIIGMLIARRKREHSTLWFPEGFFLKKEP
SSNKNRREPVGQDALGMKHMPKTVEESLLGDHSDQWIDTDCPEPKRLKVEEPSMLSDAED
TVDCRQWTQHHLAAADIRVPPTMPLTPPQGEFESDCMDVNVRGPDGFTPLMLASFCGGGL
ESEVADEEENEECSANIISDLIYQGASLAAQTDRTGETALHLAARYARADAAKRLLDAGA
DANAQDNTGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATDLDSRMYDGSTALILAARLAVEGMVE
ELITCHADVNAVDELGKSALHWAAAVNNVDATIALLKNGANKDMQDLKEETPLFLAAREG
SCHAVKVLLAHFANREITDHMDRLPRDIAQERMHHDIVQLLDEYNTVRSPQGHGGAGHHL
TGGHTLSPLMCPPSAFLPNLKNTPQGKKNRRPGAKGSSLGGQHAASLKESVKARNKKLTL
DMQSALLESSVTLSPVDSLDSPHGGASNAGYITNPTSPVAMQSPGLFHPSVSVPNTPMVH
GSMLEGGGPFAVSLAQLNDLGSGGMSLQGRVSMTSDINHGYVLNSSQMGLNMGMVSPVSV
PFDWHNRMPPSSQCGQQVVNIVQSSQAGMHPQSPAMQQQGMLMHQQQIYRNPMLQPTPVT
STPTISPVKLPLIAEQQQQQQQQPQQQLMNHNITNQQSMASAPPTPQTSQAPPAFFQQQQ
MPQQSSQPQPPAQVPQAATSAAQPSQALPSQPSGSMAGKEDYPTPPSQHSYSSTMDATPK
HYPHLPSEHPYLTPSPESPEHWSSPSPHCVSDWSDSTPSPAVAVPAQTQITQIPEANGKM
QVFA
NT seq
7395 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagggaatattccatggattcttttgtcatttttattgtttatgcatgtctgtgaa
ggaatccgttgcgtggatcaacacaggccatgtgaaaatggagggacatgcctagattca
ccttctcgatgcatatgtcgtcccggattcattggtcctctctgtcaacacctggatcca
tgtcttcgatcacaatgtcagaatggagcagcatgcaagagcgaggtgctcaatggtgtc
acacagtacacttgtgtgtgccagagagggttcagaggccaagactgctccctcattgat
gcttgtgcgacaagtccctgtgccaacggagcccgatgtgtcaattggaataaccattat
aactgttcctgtccgcctggcttccaaggaaagaactgccgcaatgacattgacgagtgc
cgcaagcctggtgtttgcctcaatggtggaacctgcataaacatccatgggtccttccgc
tgtcagtgccagccaggctacagcgggcgcacatgtgaggtgtccaccttgccctgtgca
ccatctcagtgccttaatgggggcacatgtcgacagaccagcgatcattcctatgagtgt
gcttgcctaccaggttttgaaggacacaactgtgagaacaatgtggatgactgcccaggt
cacaagtgcatgaatggaggaatatgtgtagatggagttaatacatacaactgccagtgt
ccaccagaatggacaggacaatactgcgctgaggatgtaaatgagtgtcaaatgcaaccc
aatgcatgccataatgggggtacttgcttcaacaccattggtggccatacttgtgtctgc
gtcaatggctggactggagatgactgcagtgagaacattgatgactgtgcaatagctgtt
tgcttcaatggcgccacctgtcatgaccgtgtagcatcctttttctgcgagtgcccagtt
ggaaagacaggtttgctatgccaccttgatgatgcatgtgtaagcaacccttgcaatgag
ggagcagtgtgtgacaccaaccctcttaatggccgtgccatttgtacctgtcctgctggc
tttgtagggggtgcctgcaaccaggacatggatgaatgctcaattggtgcaaatccatgt
gagcattttggaaaatgtgtgaacacagaggggtctttccagtgtcaatgtggccgggga
tatgccggcccacgttgtgagattgacatcaatgaatgcttgtccatgccctgccagaat
gatgccacttgtcttgaccggattggagagttcacctgcatctgcatgccaggctacgtg
ggcacatactgcgagactgatgtggatgactgcgagagtaacccatgtgtgaatgatggg
atatgtcgggatatggtcaatggtttcacgtgcacatgccagccagggtttacgggtacc
atgtgtcaaatagacatagacgagtgcgccagcacgccttgtcagaatggagcaaaatgc
tacgatcggcccaatgggtttgagtgccgctgtgctgaaggttatgagggcatactttgt
gaaagtaacatcaacaactgtcagcccgacccatgtcaccatggtacctgcattgatggc
attgccagctacacctgtaactgtgaacctggttacacagggtatcgctgtgagaatcaa
ttaaatgagtgccacagcaacccttgtcagaatgggggcaagtgtatggaccaggtcaac
aagtacatctgccagtgccaacatggaacctcgggtacaaactgcgagataaactttgat
gactgtgccagcaacccatgtgactatggcatctgcaaagatggcattaatcgctatgac
tgtgtttgcaaacctggcttcactggtcccaaatgtaatgtggaaatagatgagtgtgca
tctagcccctgcaggaatggaggaaaatgtatagatgaagagaatggatttcactgcctg
tgtcctgatggctttaagcctccttactgctactctcaggtggatgagtgtggcagtggc
ccatgcgtccatggctcatgcagggacgacattaatggttaccgctgtgactgtgagccg
ggatgggtgggaaagaactgtgacctggacaggaacgactgtctgccaagtccctgccag
aatgctggcacatgcattgatcaactcaatggtttcacctgcaagtgtcgccaaggcttc
agaggtaacctctgccaggtgaacatcaatgaatgtgagtccagtccctgtctgaacaag
ggcacttgtgtagatggcgtggcaagtttcacttgcctgtgtgagcttccttacagtgga
cccacttgtgctgaagtccttactccttgctctcctaatccctgtgccaatcatgctgcc
tgcatccacacaccagattacatgggttatcaatgcaaatgcccaccagggtggcaaggt
cagctgtgtaacagagatgtgaatgaatgtatctcaaacccctgcaaaaaccgtgggact
tgcgctaacacgctcggagggtttgtgtgctcttgcagagcaggatatactgggctaacc
tgcgaaacagacatcaatgactgttcacctaatccctgcctaagtggaggttcctgtaca
gatggtgtgaacttcttccactgtagctgtctgccaggctttacagggtctcattgttct
gtagagatcaatgaatgccaaagttccccttgcaaaaatggaggcacttgcacagattat
gttaactcctacacctgtacctgtatgcctgggtttactggcatccactgcgaaacaaac
atccctgattgtactgaaagctcttgcttcaatggggggacatgcacagataaaatcaat
ggatattcctgtacttgtcgctctggcttcaccgggtcccactgccagtatgaagtcaat
gagtgtgactcccagccctgcctcaatggaggcatttgtcaggatgccctggagtcattc
cgttgctcttgccccaagggctatactggcaaccgttgtcagacgccagttgattggtgc
aggcgcgcatctccatgtcataatggaggacgctgccgtcaaaaggatgcctcattcatc
tgtgaatgtactgatggctggtctggccgttactgtgacatccctagagtctcctgtgaa
gctgctgcccgccaaagagggctccagacggatgaactatgccaccatggtggtcactgt
gttaataccgggaatactcactattgcaaatgtcctaatgactacactggaagctattgc
gaaaatcaagtggatcattgtgaagacaaaccttgccgcaatggcgccacctgcagggga
tatgtgggaggataccagtgtgattgtatgccaggttataccggaaaggactgcgagata
gaaatcaacgagtgccagtctcatccctgccagaatggaggcacttgcattgatttggtg
ggacactatatctgctcctgtccccctggcaccctgggtgttctctgtgagatcaacgaa
gatgactgtgctccacacccaaggctacgcaatgcgcctcctaagtgcctaaacaatggc
acctgtgtggacagagtaggtggatatcgctgcaactgtccccctggtttcacaggagaa
agatgtgaaggagacataaatgagtgtctctctcagccctgcattccttccaacagtctt
gattgcatacagttgcccaatgactaccaatgtgtctgcaagcccggcttcacaggtcgg
aggtgtcagagtaggttcagtgtgtgtgagtctcagccttgtcagaatggaggagtctgt
tcaataactagcagctcttctcagggatacacctgcacatgccaacttggttatgcaggg
cctaactgtgaaagaagcatgtcctgtcgggagctatcctgctacaacggaggtagctgt
tcacttaccctaagaggggctcgttgcacatgtctaccaggttatggtggaccccagtgt
cagcatcgcagcaatgatgggtgctcagccatgccctgccgcaatggaggactatgcact
gaagagaccagcttcccatttttcaactgtcagtgtctcagtggatggaagggcagacga
tgtgagcacagcagaaccactgtccctccagtcccctcatgccctctggcagactgtgat
gccaaagctgcagatggtttttgtgacaaacaatgtaattcattgccttgtcactgggac
ggcggtgactgctctctagcgatgaagccctgggataaatgtggagacccacactgctgg
cgtgtcttcaacaatagccagtgtgacaagtcctgtaacaacgctgactgtctgtatgac
aactttgactgcaaaactaaggagaaagtttgcaatccaatatatgaagcctattgcatc
gaccactatgctgatggaaaatgtgaccagggctgcaacacagaagagtgtggttgggat
ggcctggactgtgcaacgaaagttgcagaaaaacttgctgagaacgtcttggttttggtt
gttctaatgcctccagaggagcttcttcgcaccgggacagtttttctgcagaaattaagt
gctatcctacgcacttcagtccgtttcaggctagacagcaatggaaaagctatgatccaa
ccctacacccgcgaaagcgcacgcatgaagcgggaactggaagtcattggctcgatagtc
tatgtagaaatagacaaccgcttatgcacggaggactgcttcttaacagctgacagtgct
gcagagtaccttggagctctgtcagcagtagaagggctccagttcccctaccccctcaaa
gaagtccgtggtgaaaaaatcaatggcaccattgttgaattacccttctatctgatggtg
gtggggatagcttctgtttttcttttagtcatccttatcataggcatgctaattgctcgc
agaaaaagagagcacagcaccctgtggttccctgaaggcttcttcctcaagaaggagccc
agcagcaacaaaaaccgcagagaacctgtgggccaggatgctctgggaatgaagcacatg
ccaaaaactgtggaagaatctctcctcggagatcatagtgaccagtggatagatacagac
tgcccagaaccaaaaaggctcaaggttgaggagccaagtatgctttcagacgctgaagat
acagtggactgcagacagtggacacagcatcaccttgcagctgcagatatccgtgtgcct
cccaccatgcccctcactccaccccaaggagaatttgaaagtgactgcatggatgttaat
gtccgaggcccagatggttttacacctctgatgctggcatcattctgtggaggtggctta
gagtctgaggtagcagacgaggaggagaatgaagagtgttctgccaacatcatctctgac
ctaatctaccagggtgcatcccttgcagcccaaacagaccgcactggtgagacagccctt
cacctggctgctcgctacgcacgtgctgatgctgccaagaggctgctggatgctggagca
gatgccaatgctcaggacaacacgggacgcaccccattacatgctgctgtagctgcagat
gcacagggtgtcttccagattctgatcagaaaccgagccacggatcttgactcacgtatg
tacgacggatcaacagcactaatcttggctgcacggctggcagtagagggcatggtagag
gagctcatcacgtgccatgcagatgttaatgcagttgatgagttgggtaaatctgccttg
cactgggctgctgccgtcaacaatgtggatgccactattgccttgctcaagaatggtgca
aacaaagatatgcaagatcttaaggaggaaaccccactgtttcttgcagcccgtgagggc
agctgtcatgctgtgaaggtgttgctggctcactttgcaaacagagaaatcacagaccat
atggacaggctgccaagagacattgctcaagagcgtatgcatcatgacattgtacagctt
cttgatgaatataacacagtgaggagcccccagggccatggcggagcaggtcaccacctc
actgggggacacaccttgtctcctcttatgtgtcctcccagcgcttttctacctaatctg
aagaacaccccacagggtaagaaaaaccgtcggcctggggccaaaggttctagcctagga
ggccagcatgccgctagcctgaaggagtcagtgaaggcccgcaataagaagctaaccctg
gacatgcagagtgccttactggagagctcagttactctgtccccagttgactcactggac
tcacctcatgggggagctagcaatgctggctacatcaccaaccccacgtctccagtcgcc
atgcagtcaccagggcttttccacccatcagtgtctgtcccaaacaccccgatggtacat
ggcagcatgttagagggaggtggcccctttgcagtgtctctagcccaactcaatgatcta
ggaagtggaggaatgtccttgcagggacgcgtctctatgacatcagatatcaaccatggc
tatgtgctgaattcaagccagatggggctaaatatgggcatggtcagtcctgtcagcgtg
ccctttgattggcacaatcgcatgcccccttcatcccaatgtggtcaacaggtagtgaat
attgtgcagagcagccaggcaggcatgcacccccagagtccagccatgcagcaacagggc
atgctgatgcaccaacagcagatctaccgtaatcccatgctgcagccaacacctgttacc
tccacacccactataagccccgtaaagctgcctttgattgctgagcaacagcagcagcaa
cagcagcaaccacagcaacagctcatgaatcacaacattaccaaccagcaaagcatggct
tccgccccaccaacaccccagacatcacaggccccaccagccttcttccagcagcagcag
atgcctcagcagtcctcccagccacagcctcctgctcaggtcccccaggcagccacatca
gcagctcagccatctcaggcgctcccctcccagcctagtggtagcatggcaggaaaggag
gattaccctacccctccctcccagcacagctattcatccacaatggatgccacacccaag
cattaccctcatttgcccagtgagcacccttacctgacaccgtctccagagtctcctgag
cactggtccagtccttctcctcactgcgtctccgattggtcggattccacacccagccca
gcagttgctgtccctgcccagacccaaattactcaaattccagaggccaatggcaagatg
caagtttttgcatga
DBGET
integrated database retrieval system
