Methanolobus zinderi: HWN40_07730
Help
Entry
HWN40_07730 CDS
T06665
Name
(GenBank) PKD domain-containing protein
Organism
mzi
Methanolobus zinderi
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PKD_4
PKD
Beta-prop_FBX42
Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7
Beta-prop_ATRN-LZTR1
Beta-prop_TYW4
DUF6242_C
Kelch_1
Sortilin-Vps10
Kelch_2
Glyoxal_oxid_N
PKD_3
InlK_D3
MG2
BNR_2
MAST
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QLC50137
UniProt:
A0A7D5E927
LinkDB
All DBs
Position
complement(1574021..1578577)
Genome browser
AA seq
1518 aa
AA seq
DB search
MNQKTILSILLAVIAFSIMLSGTAFAATPTADFAANTTSGTFPLIVDFTDLSTNSPTSWT
WYFGDENLSASSWNEINSSAWLERFGHTSVVLPDGIIIVMGGYGGGTRLSDVWRSTDNGT
TWNLMNTSAWPARSYHSSVALSDGSILVMGGKDVDGTNLNDVWKSVDNGATWTQLTTSGT
MWSARNKHSSVVLSDDTILLMGGYDLNFKNDIYKSTDGGTTWSKITDSAIWSTRECQQTV
VLPDDSIVLMGGNRGSLLNDVYRSIDKGVTWEQVSSSAEWSARQYHSSVALPDGTIVLMA
GNDGSYLNDVWTSTDNGTTWEEVSSSAEWSARQYPSSVLLSDGTIVLMGGNNASRLNDVW
SLSTAGSTEQNPVHTYNEAGTYNVTLKVSNSDGSNITTFADLISVTIGAPVADFTSNVTS
GEAPFSVDFTDLSLNGPTGWAWYFGEDNLSDSSWTEVNSNANWTGRSGHSIVTLPDGSIL
LTGGATALSTSKNDTWRSTDNGVTWTLINSSSGWSERRWHDSVALSDGSIVLFGGYDSNT
NFLNDTWRSTDNGLTWTEMNSSSGWLTRKQPSSVVLSDDSILLMGGYTFTDGTSFNDTWI
SEDFGATWTEVNSNANWSARSEHTSVALPDDSIVLMGGIDSNNNFLNDTWRSEDKGITWT
ELNSSSGWSGRFYHSSVALPDSSIVLMGGKDSNGYFNDTWHSNDKGATWTEINSTGDWIG
RRYLNTIALNDGSIMFMGGDDGGSNYFNDVWKLTTASSTEQNPTHAYDGIGTYQVTLQAY
NSKGYNSIIQNIEVAKTPVANFTANVTSGITPLSVNFTDLSTNEPTSWEWDFGNGDISTE
QNPVYTYSEAGTYTVNLTATNAGGNNTTTISDYIIVTDIPVSNFTANVTSGSVPLTVNFT
DISENDPTSWEWDFGDGNNATGQNQIYTYTTAGTYNVSLNASNIAGSNTKTLIGYITVAV
EPVSNFTANVTSGTNPLSVAFTDQSENEPTSWEWNFGDGSTSTEQNPIHTYAAAGTYNVS
LNASNVGGSNNKTVNTYITVADTPVANFTSNVTSGANPLSVAFTDLSENVPTSWEWNFGD
GSTSTEQNPIHTYSEVGTYNVSLNASNIGGSNNKTINSYITVANIPVPDFTSNVTSGALP
LTVSFSDQSTNGPTEWEWNFGDGNTSTEQNPTHTYSTVGAYNVSLNASNVGGNNNISVTD
YITVAVAPVANFTTDITSGTTPLTVTFTDLSTNGPTTWEWDFGDGTTATSQNPTHTYSAA
GTYTVSLNASNVGGSNVTTMTGYIIVNAPVEDSGSSSDSSSRRSIPVSQPSEIVASTHSS
MQHILGGSSIEYDLSQTESPVVSIKFDAKDNEGLVVASVQVLSDSPDNTPSPVGDSYQLL
SIDVGKQGTISSQNAENILINFRVSREWIQENNLDPATIRMARYHEGEWEKLPTDRVNED
DEFLYFVAETQGFSIFSVIGDEVKATTEEEKSAIAEFPEDEPVESMPAEEKSTPGFDTVM
SLVFVTVAFFVSRKIRQN
NT seq
4557 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcaaaaaacaattttatcgatattgttagcagttattgctttttcaataatgctt
tcaggaacagcttttgcagcaactcctacagcagactttgcagcaaacacaacatctggt
acttttccgttgatagttgatttcacggatttgtcaactaacagtcctacaagctggaca
tggtattttggtgatgaaaacctgtcagcatcatcctggaatgaaataaattcaagcgca
tggcttgaaagatttggtcacaccagtgttgtcctaccagatggaattataatagtaatg
ggtggctatgggggtggtactcggctgagtgatgtgtggagatcaactgataatggtaca
acctggaatctgatgaatacaagtgcatggcctgcaagatcttaccatagtagtgttgct
ctatctgatggtagtatcttagtaatgggcggtaaagatgttgatggtaccaaccttaat
gatgtctggaaatctgtggataatggtgcaacgtggactcaattaactacttctggtaca
atgtggagtgcaaggaacaagcatagtagcgttgttctctcagatgacactattttactt
atgggtggctatgatttaaattttaaaaatgatatttataagtcaaccgatggtggaaca
acctggtcaaaaataactgattctgccatatggagtacaagagaatgccagcaaacagtt
gtacttcctgatgacagcattgttcttatgggtggaaacaggggttcccttcttaatgat
gtttatcggtcaattgacaaaggtgtgacatgggagcaggttagctcaagtgccgaatgg
tcagcaagacaatatcatagcagtgttgctcttcctgatggcacgatcgtgcttatggct
ggtaatgatggttcttaccttaatgatgtttggacatcaacggataacggtactacatgg
gaagaagttagctcaagtgcagagtggtctgcaagacagtatcctagcagtgtccttctt
tctgatggtacaattgtacttatgggcggtaacaatgcgagccgtttaaatgatgtctgg
agcctttcaactgcaggttctactgagcagaaccctgtgcatacctataatgaagcaggt
acttacaatgttaccttaaaggtatccaactcagacggatctaacattaccacatttgct
gatttgatttctgtaactattggagcacctgtggctgattttacatccaacgtaacgtct
ggtgaagcaccattttcagtagactttaccgatctgtcacttaacggtcctaccggatgg
gcatggtactttggagaggataatctctctgattcttcttggaccgaagtaaactcaaat
gccaactggactggaagatccggacatagcattgttactcttcctgatggcagtatatta
ctcactggtggtgctacagccctcagcacctctaaaaatgacacctggcggtctacagat
aatggagtaacatggaccctaattaattcaagttcaggttggtccgaaagaagatggcat
gacagcgttgctctttccgatggaagtatcgtactttttggtggttatgattccaatacc
aattttttaaatgacacctggcgctcgactgataatggtttaacatggactgaaatgaat
tcaagttcaggttggcttacaaggaagcaaccttccagtgttgtcctctctgatgatagc
atcttactcatgggcggatatacttttaccgatggcacttcttttaacgatacttggatt
tccgaagatttcggtgcaacatggaccgaagtaaactcaaatgccaactggtcagcaaga
tcagaacatactagtgttgcactgcctgatgacagtatagtactcatgggtggaatcgat
tccaataacaattttttaaatgacacctggcgctctgaggataaaggtataacatggacc
gaattaaattcaagttctggctggtcaggaagattctatcactcaagtgttgctcttcct
gatagtagtatagtactcatgggtggcaaggattcaaatggttattttaatgacacctgg
cactcaaatgataaaggtgcaacctggactgagatcaattccacgggcgactggattggt
agacgatatctcaataccattgctcttaacgacgggagcatcatgttcatgggtggcgat
gatggtggatccaattatttcaacgatgtctggaaattgacaaccgcttcttctacagaa
caaaaccccacacatgcctatgacggaatcggtacttaccaggtaactctgcaagcatat
aattcaaaaggatacaacagcattatacagaacattgaggtagccaaaactccagtcgct
aatttcactgcaaatgtaacttctggtataactccactctcagttaatttcactgattta
tcaaccaacgaaccaacttcgtgggaatgggatttcggaaacggtgatatttcaaccgaa
caaaacccggtatacacttattcagaagcaggtacttacactgttaatctgactgccact
aatgccggagggaacaatacaactactatatctgattacattatagtaacagacattcct
gtttcaaactttactgcaaatgtaacctctggatcagttccattgacagtcaacttcaca
gatatttctgaaaatgatcctacatcatgggaatgggatttcggtgatggaaataatgca
actggtcaaaatcagatatacacttatacaactgcaggaacctataatgtcagcttaaat
gcaagcaatattgctggaagcaacacaaaaactttaattggctacattacagtagcagtt
gagccggtttcaaattttactgcaaatgtaacctccggaacaaatccactttcggtcgct
ttcacagatcagtctgagaatgaaccaacttcatgggaatggaacttcggagatggaagt
acatctactgaacagaatcctatccatacatatgcagctgcaggtacttacaacgttagc
ttgaacgcaagtaacgtaggtggaagcaacaataaaactgtaaacacttacattacagta
gccgacactccggttgctaacttcacgtccaatgtaacatccggagcaaacccactttcg
gtagctttcacggatctatctgagaatgtgccaacttcatgggagtggaacttcggagat
ggaagtacttccaccgagcagaatccaatccatacttattcagaagtaggtacatacaat
gtcagtctgaacgcaagcaacataggcggaagcaacaataaaactataaatagctacatc
actgtagctaacattccagtacctgacttcacatcgaatgttacttccggagcactcccg
cttaccgtaagctttagtgatcagtccacaaacgggcctactgaatgggagtggaatttc
ggagatggaaacacttcaactgagcagaatcctacacatacctattcaacggtaggagca
tacaatgttagtttgaatgcaagtaacgttggtggaaacaataacatctcagtaacagat
tatataactgtagctgttgctcctgttgccaactttacaaccgatatcacttcaggcaca
actccacttacagtgaccttcactgatctgtcaacaaacggacctactacatgggaatgg
gatttcggtgacggaactacagcaactagtcagaatcctacacatacctattcagctgca
ggtacttacactgtcagtctaaacgcaagcaatgtaggtggcagtaatgtcacaactatg
accggctacatcatcgtgaatgcacctgtagaagattctggcagctcaagtgattccagc
agtcgcaggtctattcctgtcagccagccatctgagatcgttgcatctacccacagctca
atgcagcatattcttggtggttccagtatcgagtatgacctatctcagacagaaagccct
gttgtctctataaaatttgatgcaaaggacaatgaaggtcttgttgttgccagcgtgcag
gtcctctcagattctcctgacaacactccttctccagttggagattcatatcaactcttg
agcattgatgttggaaagcagggaaccatctccagccagaacgctgaaaatatcctgatc
aatttcagggtaagcagagaatggattcaggagaataatcttgaccctgcaacgatccgc
atggcaagatatcatgaaggagaatgggaaaagctgccaaccgacagagttaatgaagat
gatgagttcctctactttgttgcagaaacacagggattctctatcttcagtgtcattggt
gatgaagtaaaagcaactactgaagaagaaaagtctgcaatagcagaatttccagaagat
gaacctgtagagtccatgcctgcagaagagaagagtactcctgggtttgatactgtgatg
agccttgtctttgttactgttgcattctttgtcagtaggaagatcagacagaactaa
DBGET
integrated database retrieval system