Marinicella algicola: PN837_006320
Help
Entry
PN837_006320 CDS
T11628
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
mzw Marinicella algicola
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_6
Big_13
Glucodextran_B
bMG3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XJJ46046
LinkDB
All DBs
Position
complement(1532674..1541886)
Genome browser
AA seq
3070 aa
AA seq
DB search
MRKTRTSAGWSLFILFFLLFFMASTAQSAGSNITICSVDGSAGARGGTRALNGTDGANMR
AKLLNSAHFGPTGTVNITFTIVDTFTASGSITASSLASNGCEILVVPNINEAFIPASEAN
IIRDWVVIDGGSLVTFSDNLIEDRVETVFGQAQLTNNTVASFTPVASSPIFSGPFGVVSS
VPVTPPTAYTNASFVGTTVLATGNAAERAIVEIGTNGNGYGVQVGDMDTVSTLVSVGNGN
NTVSDAFALNLFTQLANEFNINNVPPAEPVITSPVAGFINDNTPTVTGTADASVAIDVSV
PSGQGCTTTSNAAGNWSCTISPNLAEGGVVISAEATRGLLTSTADTVAVTVDTIAPSAPI
IATPTNGAPVSGTGEPGAVVSVSSATLAQCSVTVQPDGSWSCTLVPPAGNGETISAFQTD
AAGNTSPTTSVTNGIDTVPPAAANCSVSPNPAQTGAVLTATCTGVETGATVSIPDYSCGS
ESGGQVSCTGLAGAGSVTGDRTATTTDTAGNSNTSNVPFTLDDTAPTAASCTVSPNPANN
GTGLTATCTGVESGATVSILDYSCGAEIGGTVSCIATAGTGAGQVNGDRTATTTDAAGNS
NTSTAAFTLDNTAPTAASCTVSPNPANNGTGLTATCTGVESGATVSIPDYSCGAESGGTV
SCMATAGAGAGQVNGDRTATTTDAAGNSNSSNVAFTLDNTAPTAASCSVSPNPANNGTTL
TATCTGVESGAMVSIPDYSCNAESGGAVSCTATAGAGAGQVNGDRTATTTDAAGNSNSSN
VAFTLDNTAPTAASCSVSPNPANNGTTLTATCTGVESGAMVSIPDYSCNAESGGAVSCTA
TAGAGAGQVNGDRTATTTDAAGNSNTSNVAFTLDNSGPTAASCTVSPNPANNGTTLTATC
TGVESGATVSIPDYSCNAESGGTVSCTATAGAGAGQVDGDRTATTTDTANNTATSNVPFI
LDNDAPPAPTIDAPTNGMPITGTGEPGAMVDVTTPSGSSCTATVQADGTWSCTLSPTPTD
GEDITADQTDPAGNTSPPVTVTGGVDLTAPTPPVIDPVDVNTDPISGTAEPGSTITITGV
VCDNAPVLADANGNWSCDVTTSSPLTSGSVITATATDVAGNESGPATTTVNDITGGQSVS
PTLNPVANGATEITGTAVSGSVINVASITCSNSPVTADISGDWRCDAPNPTPVTNNVVSV
TATQTGLTASAPVTTTVYDPSVTGPAAPQVDPTDGSVVTGSAIANGVVSVLDDNGMLLCT
TTANASGNFSCSPLSPAPGNGDLLTVLVTDANGNDSAPTHVIVDQSPPGAPVITAPANGT
LTNNNTPTVTGTAEVGSTVVVTGPNGETCSDVVDASGNWSCPISPALGEGSNQLDAVATD
VNNNSSAPGSVTITVDTVRPSTPQPDLPSRGTPLTGIGEPGATVNIGTGSGASCSALVQP
DGTWSCSLAPSNVLVNGEPVVASQTDAAGNQSDTVVFTIGIDLVPPTPPVIDPVDVNTNP
VTGLSEADATINITGVVCDNAPVVADANGNWSCDVTTSSPLTAGSVITATATDVAGNESG
PATATVNDVASGQSVSPTLNPVANGATEITGSAVAGSVIDVAGISCSNSPVTAATDGQWR
CDAPAPTPVTDDVVSVTATQSGLTASAPVTTTVYDASVTGIPAPQVDPTDGTVVTGSTEP
NYGVAVFDAVGTVLCTTTADATGNFSCSPLSPLPADGDVLRVLAGNNGQVSPPTFVTVDQ
TAPNVPVITAPTDGALTNDNTPTVTGTAEAGTTVVVTGPNGESCSVVADSGGNWSCDVSP
ALADGSNQLSATATDSIGNTSGPANVTITVDTVPPPPPSPDLPTRGTPVTGTGEPGATVN
IDTDSGASCSALVQPDGTWSCSLAPSNVLVNGESVGASQTDAAGNESNTIGFTVGIDLVP
PTPPVIDPVDVNTNPITGLSEADAIINITGVVCDNAPVMADANGEWSCDVTLSSPLVAGS
VITATATDVAGNESGPASATVNDVANGQSVSPTLNPVVNGATEITGSAVAGSVIDVAGIS
CSNSPVTAASDGQWRCDTPAPTPVTDDVVSVTATQSGLTASAPVTTTVYDAIVTGIPAPQ
VDPTDGTVVTGSTEPNYAIAVFNATGTLLCTVSADVSGNFSCSPLSPAPADGDVLRVLAG
NNGQVSPPTFVTVDQTAPNMPVITAPLDGALINDNTPTVSGTAEAGVTVVVMGPNGESCS
AMADSAGNWSCDVTPALNDGSNQLDATASDPVGNTSGADNVTITVDSTIPPPPVINAPTN
GAPVSGSGEVGATVNVTTPSGASCSAVVQANGSWSCSLSPTPLDGEDITADQTDSVGNTS
LPTTVSGGIDLTPPADPVITSPANGALLSTNVVAVIGTGDPGSIITVSGPNGEMCSVVVD
AAGNWSCVKSPNLQDGVNQLDVVANDDAGNNSNTVSVTITIDTTAPDAPVINAPTNGDPV
SGTGEVGAVVTVTTPSGASCTATVQADGSWLCILVPEPIDGEDITATQTDAAGNTSPPTT
VTGGIDTIAPNAPVITSPVNGAVTNDNTPTVTGTAEAGATVTVTALNGETCMVVADTAGM
WNCEIAPALADGVQALTALATDPAGNDSPTNSVTITVDTMAPNAPVITTPTNGSPVSGTG
EIGATVVVTTPSGSTCTATVQVDGTWSCSLSPEPIDGEDITAVQTDEAGNDSDPTTVTGG
IDTVAPDAPVITAPVSGSTIMDATPTVTGTAEVDATVVVTGPNGETCSAVADASGNWSCE
LAPALPDGAVQLSAVATDAAGNDSQPATVDFTVASDTAYDVVVTPGTELVTTEMGGTATF
DIALSLTPSADVTVSLSSSDTTEGTIDTNSITFTPANWNVPVTVTVTGVDDQEFDMDQNY
QILTAAFVSADPNYNGVDPSDVDAINIDDDANPDLSIFLTNCTADVAPGVPVIYRVIVDN
VGNVDITGAQVQTSLTDLMTTPDWVCESQTGGCTATSGTGDLSEMVDLMAGDQVTYTMRG
EVTAQLMEFLDSTATVTMPVSETDTDPSNNMAEDSDLTIQYLFKDNFDCDLPGTIESTTQ
QLEELLRQYE
NT seq
9213 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggaaaacacgaacatcagcagggtggagcttattcattctgttctttttacttttt
tttatggcgtccactgctcagtcagccggttccaacatcacgatttgtagtgtggatgga
tctgctggtgccaggggtggcacgcgcgcgctgaatggcactgatggtgccaatatgcgt
gccaaactactcaacagtgctcattttgggccaacgggtacagtgaatatcacttttact
atcgtagatacttttactgcttcaggtagtattacagcgtcttctctggccagcaatggg
tgtgaaatacttgttgttccgaatatcaatgaagcttttattccggcttcggaggcaaat
atcatcagagattgggttgtgatagatggtggttcgctggttactttttctgataatctt
atcgaggatcgcgttgaaacagtcttcggccaggcacaactaactaacaatactgtagca
tcctttactccggttgcatcatcacctattttcagtggtccttttggtgtcgtcagctcg
gtgccagtaacaccaccaaccgcatataccaacgccagttttgtaggaacaactgtactg
gctacaggaaatgcagctgagcgtgcaatcgttgaaattggcaccaatggcaatggttat
ggtgtccaagtgggtgatatggatacggtatcgacactggtttcggtgggtaatggtaac
aatacggtttcagatgcatttgctttgaatctattcacccagttagccaacgaattcaat
attaacaatgtaccgcctgctgaaccggtgattaccagtccggtagctggatttattaat
gacaatacacccactgtgaccgggacagccgatgccagtgtcgccatcgatgtgagtgtt
ccatcaggtcaaggttgtactacaacatcaaatgccgcaggtaactggtcatgtactatc
agcccgaatttggctgagggtggcgttgtcatcagtgctgaagcaaccagaggtctactg
acatcgacagctgatacagtggctgtaacagttgataccattgcgccatcagcaccaata
attgctacgccaaccaatggcgcacccgtttccggtaccggtgaaccaggcgcagtggtc
agtgtgagcagcgctacattggcgcaatgttcggtcacagtacagcctgatggcagttgg
tcatgtacattagtaccacctgctggtaatggtgaaaccatctcggctttccaaaccgat
gcggcaggaaatacatcgccgacaacatcagtcaccaatggcattgatacggtgcctcca
gcagcagccaattgttcggtatctccgaatccagcacagacgggtgcagtattgactgcg
acttgtactggcgttgaaacaggtgccactgtctcgatccctgactacagttgtggttca
gaatcgggtggccaggtgtcgtgtacaggtttggctggcgcaggcagcgtcacaggcgac
agaacagctaccacaacagatacagcgggtaattcaaacacatcgaatgtgccttttaca
ttggacgacactgcgccaacagcagccagttgtacagtatccccgaatccggccaataat
ggtacgggtttgacagcgacttgtacgggtgttgagagcggagcaacggtctcaattctg
gattacagctgtggcgctgaaattggtggtacagtgagttgtatagcgactgcaggcact
ggtgctggtcaggttaatggtgacagaacagccaccacaacggatgcagcaggtaacagc
aatacatcaactgcagcctttactctggataacactgccccaacagcagccagctgtacg
gtctcaccaaatccggccaataatggtacgggtttgacagcaacctgtacaggtgttgag
agtggagcaacggtctcaattccagattacagctgtggcgctgaaagtggtggcacagtg
agttgtatggcgactgcgggcgctggtgctggtcaggttaatggtgacagaacagccacc
acaacggatgcagcgggtaacagcaatagctcaaatgtggcctttactttagataatact
gcgccaacagcagccagttgttcggtgtcgccaaatccggccaacaacggtacgactttg
acagcgacttgtacgggcgttgagagcggagcaatggtctcaattccagattacagttgt
aatgctgaaagtggtggcgcagtcagttgtacagcaactgcgggcgctggtgctggtcag
gttaatggtgacagaacagccaccacaacggatgcagcgggtaacagcaatagctcaaat
gtggcctttactttagataatactgcgccaacagcagccagttgttcggtgtcgccaaat
ccggccaacaacggtacgactttgacagcgacttgtacgggcgttgagagcggagcaatg
gtctcaattccagattacagttgtaatgctgaaagtggtggcgcagtcagttgtacagca
actgcgggcgctggtgctggtcaggttaatggtgacagaacagccaccacaacggatgca
gcgggtaacagtaatacctctaatgttgccttcactttagataacagtggtccaacagca
gccagttgtacggtctcaccaaatccggccaataatggtacgactttgacagcgacctgt
acaggtgttgagagcggagcgacggtctcaattccagattacagttgtaatgctgaaagt
ggaggtacagtcagttgtacggcgactgcgggcgctggtgctggtcaggttgatggtgac
agaacagccaccactacggatactgcgaataatacggccacctcaaatgtaccatttatt
ctcgataatgatgcaccgcctgcaccaaccattgatgcgccaaccaatggtatgccaata
acgggtaccggtgagccaggtgctatggttgatgtaacgacaccatccggttccagctgt
acagctacagttcaagccgatggcacatggtcatgtacgttgtcaccgacaccgactgac
ggcgaggacatcactgcggatcaaaccgatccggcgggtaacacttcgccaccagttacc
gtgacaggaggtgttgatctgacagcacccacacctccggtgattgatccggttgatgtg
aatacagatcctatcagcggtacggcagaacctggttcgaccataaccatcaccggtgtg
gtctgcgataatgcaccagtgttagcggatgccaatggtaactggagttgtgatgtgact
acatccagcccattaacctcaggttcggtgattaccgctacagcaacggatgtggcaggt
aatgagtctggtccagcgacaactacagtgaacgatattaccggtggtcaatcggtgagt
ccaaccttgaatcctgtcgccaatggtgcaacagaaattacgggtacggcagtatcaggg
tctgtgattaacgtagcaagcattacctgtagcaacagtccggtcacagcagatatcagt
ggtgattggcgttgtgatgccccgaacccaactccagtaaccaataatgtggttagcgta
actgcaacccaaaccggtttgacggcgagtgcgcctgtcaccacaactgtttatgaccct
agcgtgacagggcctgcggcaccgcaggttgaccccacggacggcagtgtggtgacaggt
agcgccattgccaatggtgtggtttcagtgctggatgataatggtatgttgttgtgtaca
accacagccaatgcctcaggtaatttcagttgttcacccttgtcaccagcgccgggtaat
ggcgatctgttgactgttttggtgacggatgcgaatggtaatgacagtgcgccaacccat
gtgattgtagatcaatcaccgccaggtgcccctgtgattacagcacctgcgaacggtaca
ctgaccaataacaacacgccaacggtgacgggtactgctgaagtgggttccaccgtagtg
gtaaccggtcccaacggtgaaacctgttcggatgttgtagatgccagtggtaactggtcc
tgtcccatcagcccagcgttgggtgagggttcaaatcaactggatgcagtggctactgat
gtgaacaacaacagctctgcacccggttctgtaacgattacagtagacactgtgcgccca
tctacaccacaacctgatctgcccagccgaggcactccgttaaccggtattggtgagccg
ggtgctaccgtgaacatcggcacaggttcaggcgccagttgttcagcattggtgcaaccg
gatggcacatggtcctgttcattggcacccagcaatgtgctggtgaatggtgaaccggtg
gttgcctctcaaactgatgctgcgggtaaccaatcagataccgtagtctttaccatcggc
attgatctggtgccacccacacccccggtgatcgatccggtggatgtgaataccaatcca
gtcactggtctctcagaagccgatgccactatcaatatcacgggtgtggtgtgtgacaat
gcaccagttgttgccgatgccaatggtaactggagttgtgatgtgaccacatccagcccc
ttaacagcaggttcggtaatcactgcgaccgccactgatgtggcaggcaatgagtctggc
ccagctacggccacagtgaatgatgtggctagcggacagtctgtgagtccaacgttgaat
ccagtagccaatggagcgactgaaattacaggttcagctgtggctggttctgtgattgat
gtggcgggtatcagctgtagcaacagtccggtaaccgcagctactgatggtcagtggcgt
tgtgatgcccccgcaccaactccggtaacggatgatgtggtcagtgtgacggcgacacaa
agtggcctgactgccagtgcgccggtgacaaccaccgtgtatgatgcttctgtgacgggt
attcccgcaccacaggttgatccaaccgatggtactgtagtgaccggtagtacggaaccc
aactatggtgtcgcggtatttgatgcggttggcacagtgttgtgtaccaccacagcagat
gcaacgggtaacttcagttgttcaccactgtcaccactaccagcagatggtgatgtgttg
agagtattggcaggtaacaatgggcaggtcagtccgcctacctttgtgacggtggatcaa
accgcaccgaatgtgccggtgatcacagccccaactgatggtgccttaaccaatgacaac
accccaaccgtgacgggtactgccgaggcaggtaccaccgtggtggtgacaggccccaat
ggcgaaagctgttcggtggttgctgattcgggtggtaactggtcttgtgatgtgtcacct
gctttggcagatggcagcaaccagttaagcgctacggccaccgactctatcggcaacact
tcgggcccagccaacgtgaccattacggtggacacagtgcctccaccaccgccatcacct
gatctgcctacaagaggcactccggtaacgggtactggtgagccaggtgctactgtgaac
attgacacggattcaggtgccagttgttcagcattggtgcaacctgatggcacttggtct
tgttctttggcgcctagcaatgtgctggtcaatggcgagagtgttggtgccagtcaaacc
gatgcagcgggtaatgagtcaaacacaattggctttaccgttggtatcgatctggtaccg
cccacacctccagtgatcgatccggtggatgtgaataccaatccaatcactggtctttca
gaagccgatgcgatcatcaacattacgggagtggtgtgtgacaatgcacctgtgatggcc
gatgccaacggtgaatggagttgtgatgtcaccttatccagtcctttggtggcaggttcg
gtgatcactgcgaccgccactgatgtggcaggcaatgagtctggcccagccagcgctaca
gtcaatgatgtggcaaacgggcaatcggtgagtccaacgttgaacccagtagtcaacgga
gcgactgaaattacaggttcagctgtggctggttctgtgattgatgtggcgggcatcagc
tgtagcaacagccctgtaacagctgccagcgatggtcagtggcgttgtgacacccctgca
ccgactccggtaacggatgatgtggtcagtgtgactgcgacacaaagtggtctgactgcc
agtgcgccggtgacaaccaccgtgtatgatgctattgtgacgggtattcccgcaccacag
gttgacccaaccgatggcactgtagtgaccggtagtaccgagcccaactacgccattgct
gtgtttaatgctactggcacattgttgtgtaccgtatctgcggatgtatcgggtaatttc
agttgttcaccgctttcaccagcaccagcagatggtgatgtgttgagggtattggcaggt
aacaatgggcaggtcagtccgcctacctttgtaacggtggatcaaactgcaccgaatatg
ccggtgattacagctcctttggatggtgcattgatcaatgacaacaccccaacagtctca
ggtactgctgaggcgggcgtcacagtagttgtgatggggccaaacggtgaaagctgttca
gctatggctgattcggctggtaactggtcttgtgatgtgactccggctctgaatgatggc
agcaaccaattggatgctacagccagcgatcctgtgggtaatacctcgggtgctgataat
gtgaccattacggttgacagcaccataccgccaccgccagtgattaatgcacctaccaac
ggtgcaccggtatccggtagtggagaagtaggcgcgacagtgaatgtcacaacaccatcg
ggagccagctgttcggcagtggtgcaggccaatggtagttggtcgtgcagcctctcacca
acaccgcttgatggtgaagacattacagcggatcaaaccgattcggtcggtaatacttca
ttgccaaccacagtctcaggtggtattgatctgactccgcctgcggacccggtgattacc
tctcctgcaaatggtgcattactgtctactaatgtggtggcagtcattggtacaggtgat
ccaggttcaatcatcacagtcagcggtccgaatggggaaatgtgtagtgttgtggtggat
gcggccggtaactggtcttgcgtcaagagtccgaacttgcaggatggtgtcaaccagtta
gatgtggttgcgaatgatgatgccggtaacaattccaatacggtcagcgtcaccatcacc
atagatacaacggcaccagatgccccagtgatcaatgcgccaaccaatggtgatccggtc
tcaggaactggtgaagttggtgctgttgttactgtaaccacgccttcaggcgcatcctgt
accgcgactgtgcaggccgatggcagctggttgtgtattctggttcctgaaccaattgac
ggagaagacattaccgcaacgcaaactgatgcagccggtaatacttccccgccaactaca
gtaaccggtggcattgatacgattgctccaaatgcaccagtgattacatcgccagtcaat
ggtgctgtgaccaatgacaacacgccgactgtaacaggcacggctgaagcaggtgcaact
gttacagtgacggccttgaatggtgaaacttgtatggtagtagcggatactgctggtatg
tggaactgcgaaattgcacctgcactggccgatggcgttcaggcattgactgctctggcc
accgatccggcaggtaacgattcacccaccaacagtgtaacgattacggtcgacacgatg
gcacccaatgcgccggtgattacgacaccgaccaatggttctcctgtctctggtactggt
gagattggcgctacagttgttgtgactacaccttctggctcaacctgtactgctacagtt
caggtggatggcacttggtcatgtagtttatcgcctgaaccaattgatggtgaagatatt
accgcagtccagacggatgaagctggtaatgattctgatccaaccacagtaacgggtggt
atagatacagtagcaccggatgcgccggtaatcactgcacctgtgtcaggttcaaccatc
atggatgcaacgccgacggtaacagggactgctgaagttgacgctacagtggtggttaca
ggacctaatggtgaaacctgtagtgcagtggctgatgccagtggtaactggtcttgtgaa
cttgcgcctgcattaccagatggtgcagtccagttgagtgctgtagcaactgatgctgct
ggtaatgattctcagccagcgactgttgattttactgtcgcaagcgacactgcttatgat
gtggttgttacacctggtacagagttagtgactacagagatgggtggtactgctaccttc
gatattgctctgagtctgacgccatctgctgatgtgacagttagtttgagcagttcggat
accacagaaggtacgattgataccaattcgattaccttcacacctgccaactggaatgtg
ccagtaacagtcactgtaaccggggtggatgatcaggaattcgatatggatcagaattat
caaattttgaccgcggcatttgtatcagccgatccaaactacaatggtgtggatccctca
gatgtggatgcgatcaatattgatgatgatgcaaatccggatttgagtatcttcctgacc
aactgtacagcagatgtcgcaccgggtgttccggttatctatcgcgttattgttgataac
gtaggtaacgtggatatcactggtgcacaggtgcaaaccagcctgacggatctgatgact
acacctgattgggtgtgtgaatcgcaaacaggtggttgtacggcaacttcaggtacgggt
gatctgagcgaaatggtcgatctgatggccggtgatcaagttacttacaccatgagaggt
gaagtaacggcacaattgatggagttcctggattcaacagcaactgtaacaatgcctgtg
agtgagacggatacggatccgtctaacaatatggctgaagacagtgatctgacgatacag
tatttgttcaaagacaattttgattgtgatttgccaggtacgattgaatccaccacacag
caattggaggagctgttgcgtcaatacgaataa
DBGET
integrated database retrieval system