Candidatus Nanopelagicus abundans: B1sIIB91_04735
Help
Entry
B1sIIB91_04735 CDS
T05091
Name
(GenBank) glycosylhydrolase
Organism
nab
Candidatus Nanopelagicus abundans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_18
GH18_BT1044-like
NOMO1-like_9th
TIM-barrel_EndoS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASY24198
UniProt:
A0A249L523
LinkDB
All DBs
Position
complement(913461..915179)
Genome browser
AA seq
572 aa
AA seq
DB search
MGSRKLLIITTALTFLLSTLSPANANNPPRKILSGWLPDYSLARNLPTVEGNLDLIRDIS
PFWYGLTGESSIKDKYALGKYTTPKEQVIARLKANGVLLLPTITDDNKKFVLANLLANPT
SRSNIVQTIKSLVLKYNYDGIDLDFETFYTQDGRSSWAALKPNWIAFIKELSTALHDQGK
LLSVTTPPDFAPETKRAGNWIYSWAEIGPLIDRLRIMAYDFSTTSPGPIGPLPWTEDGVK
YAINQMPASKVFLGIPGYGRDWITKVEGVCPKDFTSSVVVGAKAAVVMREAPNLAASNNA
LPTYNTTNAESTFTYKKTYVDPTNSASFCTASRTVWYPDERSYAARTNLVGKYRLGGIAV
WTFGMENTAAITAIRDIAKSIAPDQVIGTLSTDLEEIGYGSTFNLTGTFKLPDKTPVPAL
NVRFEIKNSSDNNWRTLSAGVTDLAGVIAFPIILGQKSQIRLVSEGSWERTEGKTIEKVI
SVVPNVSLSLPASIKVATSYTVFGQVLPKVAGIKLVVKQNMKPLGEFITDASGGFSFEIK
AATTGLATYQVVISAGEKNTAAISDEITILVR
NT seq
1719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggatcgcgtaaattattaataattactactgcgctcacttttctgctctcaactctt
tcaccagcaaatgctaataatccaccaagaaaaatactctccggctggctacctgattat
tctttagcaaggaatctgccaactgttgagggtaatttagatttaattagagacatctca
ccattttggtatggcttaactggtgagagttctataaaagataagtatgccctgggtaag
tacaccacaccaaaagagcaggtaatcgccagattaaaagcaaatggagtattactacta
ccaaccattactgatgataataaaaagttcgttttagcaaatcttctagcaaacccaact
tcaagaagtaatattgtgcaaacaattaagtcattagttcttaaatataactatgatggt
attgatttagattttgaaactttttatacccaagatggcagatcaagttgggcagcactg
aaaccaaattggatcgcatttattaaagagctttcaactgctctacatgatcaaggaaaa
cttttatcagttactacaccaccagattttgcacctgaaactaaacgtgctggaaattgg
atttattcatgggcagaaataggaccattaattgatcgactccgaataatggcttatgac
ttctcaactacatcaccaggtccaattgggccgctgccatggacagaagatggcgttaag
tatgcgatcaatcaaatgccagcatcaaaggtatttttaggaattccaggttatggcaga
gactggataactaaagttgaaggtgtttgtccaaaagatttcacatcatcagttgtagtt
ggcgctaaagctgcagttgtaatgagggaagcaccaaatcttgctgcaagtaataatgct
ttacctacttataacaccacaaatgctgaatcaacttttacttataagaaaacctatgta
gatccaactaactcagctagtttctgcacagcttctcgaactgtttggtatccagatgag
cgaagctacgctgctagaactaatttagttggaaaataccgcctaggcggaatagcggtt
tggacctttgggatggaaaatactgcagcaattactgctattagagatatcgcaaaatct
attgcacccgatcaagtgattggaacactttctacagatcttgaagagattggttatggc
tcaacttttaacctaactggcacttttaagctgccagataaaaccccagtaccagctctt
aatgtcagatttgagataaaaaatagtagtgataataattggcgcacattatctgcaggt
gtcactgacttagccggagtgattgcatttccaatcatccttggccaaaaaagtcagatc
agattagtttcagaaggtagttgggagcggactgaaggaaaaactattgaaaaagtgatc
tcagttgtgccaaatgtttccttatccctaccagcctcaatcaaagtcgccacaagctat
accgtttttggccaagtcctgcctaaggttgctggtatcaaattagtcgttaagcaaaat
atgaaaccacttggtgaatttattaccgatgctagtggcggcttctcctttgagatcaag
gcggcaaccaccgggcttgctacatatcaagtagtaatctcagcgggtgaaaaaaatact
gccgcaattagtgatgagataaccattttagttagataa
DBGET
integrated database retrieval system
