Candidatus Nanopelagicus abundans: B1sIIB91_05885
Help
Entry
B1sIIB91_05885 CDS
T05091
Name
(GenBank) penicillin-binding protein
Organism
nab
Candidatus Nanopelagicus abundans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
Transpeptidase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASY24390
UniProt:
A0A249L5L0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1144807..1146762)
Genome browser
AA seq
651 aa
AA seq
DB search
MNNLLAKLPRLGVLITGFSFVAGVFLFGFAYFTVSIPDPNAYVNSQSTIIQYADGSEIGR
IGSENRTVVTLAQIPVQVRNAVMAAEDRGFYSNRAISPTAIIRAVWNNVRGGSLQGGSTI
TQQYAKTAFLTPERSITRKVKELVIAIKLENQFTKDQIFENYLNTIYFGRGSYGVQTASQ
VYFGTTVDKLTTAQSAVLASILRSPGLYDPGFKKENLPRLEKRFTYVLDGMVAQGWLEKE
KAEKIKFPVINPRVTSGALAGPKGYVISWVERELNALGFSDEQLMVGGYIIKTTLVKEAQ
EAAVFAVSKEAPVKVPENLHIGLVAIKPGTGEILAMYGGQDYLKYQFNAATQGITSGGSS
FKAFSLVAALEQGIPLSSIWNGDSPKVYDDGIGRPYPVNNYGGESWGNLDLLTATEKSVN
TIYVPLGMKAGLEKVVDVARRAGIPESVEMVASPSVSLGAASPHVIDLANAYATFAAQGV
YAKPFIINEVQGPNKGILYQGRIQAQEVFRKDVMADLTYAFSKVTTSGTAAVVGARVGRP
TAGKTGTSNDNASAWFNGYTPEVAASVAFYRDDATQSLNGIGGLTSVTGGSFPARIWAEF
VKKYLAKSLIQEFPAPAFIGGTEPVNFINAVPEMDPALIPPSPSPSPKKKK
NT seq
1956 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaataatctgctagcaaaactgccccgccttggggtattaattactggcttctcattt
gttgctggcgtatttttatttggctttgcctatttcaccgtttcaattccagatccaaat
gcttatgtaaattctcagtccacaattattcaatatgcagatggcagtgagattggccga
ataggttctgaaaatagaactgttgtaacacttgctcagattccagttcaggttagaaat
gcagtgatggcagcggaggatcgcggtttttattcaaaccgagcaattagcccaactgca
attataagagcagtttggaataacgtaagaggtggttcactccagggtggctcaacaatt
acgcagcaatatgcgaaaactgcctttttaacaccagagcgctcaataacaagaaaagta
aaagaattagtaattgcgataaaactcgagaaccaatttactaaagatcaaatttttgag
aactacttaaatactatttattttggccgtggttcatacggcgttcaaaccgcatcccag
gtttactttggtacaaccgtagataaattaaccaccgcccaatcagcagtattagcgagt
attttaagaagtccaggcctttatgatcctggatttaaaaaagagaacttaccaaggctt
gaaaaaagatttacatatgtattagatggaatggttgcgcaaggttggcttgaaaaagaa
aaagctgaaaaaataaaatttccagtaattaatcctagggttacatcaggtgcgttagct
ggtcctaaaggttatgtaatctcttgggtagagcgtgagttaaatgcacttgggtttagt
gatgagcaattaatggttggtggctacataataaaaactactctagtaaaagaagctcaa
gaagcagcagtatttgcagttagtaaagaagcaccagttaaagtgccagaaaatcttcat
attggccttgtcgcaattaaacctggtaccggtgagatattggcaatgtatggtgggcaa
gattatttaaagtatcaatttaatgctgccacacaaggaattacctccggtggatcatca
tttaaagccttctcactagttgcagcccttgagcaaggaataccgttatcttcaatttgg
aatggtgattcacctaaagtttatgatgatggaataggccggccatatccagttaataat
tacggtggtgaaagctggggcaatcttgatctacttactgcgactgaaaagtctgttaac
acaatctatgttccacttggcatgaaagcagggttagaaaaagttgtagatgttgctcgc
cgtgctggtattccagagtcagttgaaatggtggcatctccatcagtttcattaggagct
gcaagtccacatgtgattgatttagcaaatgcctatgcaacctttgcagcgcaaggagtt
tatgcaaaaccttttattattaatgaagttcaaggaccaaataaaggaatcttgtatcag
ggaagaattcaagctcaagaggtatttagaaaagatgtaatggcagatttaacttatgcc
tttagcaaagtaactacatctggcactgctgcagtagtgggcgccagagttggcagacct
actgctggcaaaactggaacatcaaatgacaacgcatctgcttggtttaacggctacacc
ccagaggttgcagcctctgttgctttttatcgagatgatgctactcaatctttaaatgga
attggtggcttaacatctgtaactggtggctcctttccagcccgaatttgggcagagttt
gttaaaaaatacttagctaaatcactaattcaagagtttccagccccagcttttattggt
ggaaccgagccagttaactttattaatgcagtgccagagatggacccagctttaatccca
ccatctccttcaccttcacctaagaaaaagaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system