Nocardia asteroides: NCTC11293_02835
Help
Entry
NCTC11293_02835 CDS
T06742
Symbol
embC_3
Name
(GenBank) Probable arabinosyltransferase C
KO
K11387
arabinosyltransferase C [EC:2.4.2.-]
Organism
nad
Nocardia asteroides
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nad00001
]
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
nad01003
]
NCTC11293_02835 (embC_3)
Glycosyltransferases [BR:
nad01003
]
Polysaccharide
Bacterial polysaccharide (excluding LPS)
NCTC11293_02835 (embC_3)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Arabinose_trans
Arabino_trans_C
Arabino_trans_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
VEG34507
LinkDB
All DBs
Position
1:2991950..2995168
Genome browser
AA seq
1072 aa
AA seq
DB search
MRQGHPPEDVSEPARRAAGGWARVVAIVAALIGVLSAVALPFLPVRVDTATVSWPQRGTT
TSVESPLVAYAPAALSATVPCAALGTLAETGGVAVSTIPRQSADMEKYGFVVKVVADTAE
RPGRVDVVSRSTLLWTVPLADVLGSGCAISVRLTPDEAAVTTTGLAASGAVLASDLRPQV
VGVFSELTGAPPADLAVRVVADSRYITSPSAIKLAAIVLCLVATAISLFALHRLDALDGR
SARRFLPQRWWRLRPVDWLVFAVLAVWHFIGANTSDDGYILGMARGARSSGNMSNYYRWF
SVDEGPFYTPYTDIIGWLTHLSAVSPLVRLPALGAGLLTWWLISREVLPRLGMAVRKQRV
VTWTAALVFLAFWLPYNNGLRAEFVVALGVLVTWVSVERAIATRRLLPFAVAVIVAAFTL
TGAPSGLICLGALVAGARVVTAVVLRRAKSVGYLALLLPILAAGTVVLTVVFADRTLAGV
LEMFEVHGKIGPGESWFFEFLRYQYLLQLNADGWLTRRFGVFAMLLGLIVCAATMLRRGG
HIPGTAVGPTRRLLGITLAAMVLMMFSPTKWTHQFGVFAGLATCVAAVTAVAVGPAVLRP
LRNRALFAAAVFFALAMTFVGANGYWYVSSWGIPWWDKPPSVAGFGISTVFAGLTALCLA
VAAWFHVHPRPSTRSSRLSRMPVLAVVAALMVLFELASFAKATVKQYPAYSLAGANLEAA
FGGGCGMADEVLVETDPNASMLAPLSGDTTTALTGESTGFRPGGVAPVLTSDEVESTTGQ
ANSVSDDPDELRDASTSAGSESRQGSLALPFGLDPATTPVLGSYRAGAQEPASLTSGWFR
LPDGPRGPLLAVSVAGRIRSVDEDGVVHPGQELAVEYGTVTADGAVTVTGQVAPIDIGPA
PMWRNLRVPLDQLPADTGVVRLVAQDKDLGADQWLAVTPPRMPRTTTLDALVGHETPVLL
DWAVGLHFPCQNHLPTYNGIAELPAYRILPDRNGATITNLWQGHDGGGPLGWTQLLFTAR
TLPTYLNNAWGRDWGSIEQYLPLDTAAVPARPRVDSENRWGTWTPGPIITAW
NT seq
3219 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcggcaggggcatccgcccgaggatgtttcggagcccgcgcgacgggccgccggcggc
tgggcgcgcgtcgtcgcgatcgtcgccgccctgatcggcgtgctgagcgcggtcgccctg
ccgttcctgccggtgcgggtcgacaccgcgacggtgtcctggcctcagcggggcacgacc
acctcggtcgaatccccgctggtcgcctacgctcccgccgccttgtcggcgaccgtgccg
tgcgccgcgctggggacgctggccgagaccggcggcgtcgcggtgtcgacgattccgcgc
cagtcggccgacatggagaagtacggcttcgtcgtcaaggtcgtcgccgacaccgccgaa
cggcccggccgcgtcgacgtggtgtcgcgctcgacgctgctgtggacggtcccgctggcc
gacgtgctcggcagcgggtgcgcgatctcggtgcggctcaccccggacgaagccgccgtc
accacaacgggtctggccgcctccggcgccgtgctggcgtcggacctgcgcccgcaggtc
gtcggggtgttcagcgagctcaccggtgcaccgcccgccgacctcgcggtgcgggtggtc
gccgactcccgctacatcacctcgccctcggcgatcaagctcgccgcgatcgtgttgtgc
ctggtggcgaccgcgatctcgctgttcgcgctgcaccgcctcgacgccctcgacggccgc
tccgcccgccggttcctgccgcagcgctggtggcggctgcgcccggtggactggctggtg
ttcgccgtgctcgcggtctggcacttcatcggcgccaacacctccgacgacggctacatc
ctcggcatggcgaggggcgcgcgcagttccggcaacatgtcgaactactaccgctggttc
agcgtcgacgaggggccgttctacaccccctacaccgacatcatcggctggctcacccac
ctgtcggcggtcagtccgctggtgcggctgcccgcgctcggcgcgggcctgctgacctgg
tggctgatcagccgcgaggtgctgccccgcctcggcatggccgtgcgcaagcagcgcgtg
gtgacctggaccgcggccctggtgttcctggccttctggctgccctacaacaacggcctg
cgcgcggagttcgtggtcgcgctcggagtgctggtcacctgggtgtcggtggagcgggcc
atcgcgacgcggcggctgttgcccttcgccgtggcggtgatcgtcgccgcgttcaccctc
accggcgcgccgtcgggcctgatctgcctgggcgcgctggtcgccggggcgcgggtggtg
accgcggtggtgctgcgccgggccaagtcggtggggtacctcgcgctgctgctgccgatc
ctggccgcgggcacggtggtgctgacggtcgtgttcgccgaccggacgctggccggagtg
ctggagatgttcgaggtgcacggaaagatcgggccgggggagtcctggttcttcgaattc
ctgcgctaccagtacctgttgcagctcaatgccgacggctggctgacccgccgcttcggt
gtcttcgcgatgctgctcgggctgatcgtgtgcgcggccaccatgctgcgccgcggcggc
cacattccgggcaccgcggtgggcccgacccgcagactgctgggcatcacgctcgccgcc
atggtgctgatgatgttctcgcccaccaagtggacccaccagttcggggtgttcgccggt
ctggccacctgtgtcgccgcggtgaccgccgtcgccgtcggcccggcggtgctgcgtccg
ctgcgcaaccgggcgctgttcgcggccgcggtgttcttcgcgctggcgatgaccttcgtc
ggcgcgaacgggtactggtatgtctcgtcgtggggcatcccctggtgggacaagccgccg
agtgtcgcgggcttcggcatctccacggtgttcgccgggctcaccgcgctgtgcctggcc
gtcgcggcctggttccacgtccacccccgcccctcgacccggtcgagcaggctgtcgcgg
atgccggtgctggccgtcgtcgcggcgctcatggtgctgttcgagctggcctccttcgcc
aaggcgaccgtcaagcagtacccggcgtactcgctggcgggcgccaacctcgaggccgcg
ttcggcggcggctgcggcatggccgacgaggtgctggttgaaaccgaccccaacgcctcg
atgctcgcgccgctgtccggcgacaccaccaccgcgctcaccggtgagtccaccggcttc
cgccccggcggcgtggccccggtcctcacctccgacgaggtggaatcgaccacgggacag
gcgaactcggtctccgacgatccggacgagctgcgcgacgcctccacctcggcgggctcg
gagtcccgccagggttcgctcgcgctgccgttcgggctcgaccccgcgaccacgcccgtg
ctcggcagctaccgggccggcgcgcaggagcccgcgtcgctgaccagcggctggttccgg
ctgcccgacggtccgcgcggtccgctgctcgcggtgtcggtggcgggccggatccgctcg
gtcgacgaggacggggtggtgcatcccggtcaggagctggccgtggagtacggcaccgtg
accgccgacggcgcggtcaccgtcaccggacaggtggcgccgatcgacatcggcccggcg
ccgatgtggcgcaacctgcgtgtcccactcgatcagctgcccgccgacaccggcgtcgtc
cggctcgtcgcccaggacaaggacctcggcgccgaccagtggctggcggtgaccccgccg
cggatgccgcgcaccaccaccctggacgcgctggtcggccacgagacgcccgtgctgctg
gattgggcggtgggcctgcacttcccgtgccagaaccacctgcccacctacaacggcatc
gccgagctgcccgcctaccggatcctgcccgaccgcaacggcgccaccatcaccaacctg
tggcagggccacgacggtggcggcccgctcggctggacccagctgctgttcaccgcccgc
accctgcccacctacctgaacaacgcgtggggccgggactggggctcgatcgagcagtac
ctgccgctggacaccgccgcggtgcccgcccgcccgcgggtcgactccgagaaccgctgg
gggacatggactcccggcccgatcatcaccgcctggtaa
DBGET
integrated database retrieval system