KEGG   Nosocomiicoccus ampullae: KPF49_04265
Entry
KPF49_04265       CDS       T07372                                 
Name
(GenBank) DEAD/DEAH box helicase
  KO
K03722  ATP-dependent DNA helicase DinG [EC:5.6.2.3]
Organism
namp  Nosocomiicoccus ampullae
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:namp00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:namp03400]
    KPF49_04265
Enzymes [BR:namp01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.3  DNA 5'-3' helicase
     KPF49_04265
DNA repair and recombination proteins [BR:namp03400]
 Prokaryotic type
  Other factors with a suspected DNA repair function
   DNA helicases
    KPF49_04265
SSDB
Motif
Pfam: RNase_T Helicase_C_2 DEAD DEDDh_C Rv2179c-like Helicase_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYA46228
LinkDB
Position
825729..828227
AA seq 832 aa
MLDKRFAVVDLETTGNNPYKDKIIDLSIVFVEGNKIVGDYNHLISDADDIPSFVTELTSI
TLEDIKSGVKFSDIKDEVYELLANCCFVAHNIEFDLNFLKIAFKEVGINFKPNLAIDTVE
LSKIFFPTLNSYQLGALSKSLNLTLDNAHRAYDDAKATAELLIKIINKIQSLDRQTMIRL
YNISKSLDTNVSELLFASLSENNHKDASFLVKSLSIKEVKEDQHIESHITIESLYENFLK
INQFKHRDDQIKLIYTIYNSLKENKALALEAYTGLGKTEAILIASIAFSNETNQQILIST
SKKILQEEMYYRSLKRLLKASNLNKLPIAMLKGKSNYINLNTMLKLLEFKDDNYEIIILK
MKLLVWLTSTKTGDLGEVSLKGPEKLYYDTAHYQISDYDQYFYNRAVDHAKSSHICITNH
YFMQECLTEMDSNYLIVDEAHQVLRAVNSQNETVYKYMDLKFLLSQIGANNKDRILKDYL
DHNHYEKKDYLISMLSQLNKTIDEAFAQLNHQNITLATTQFTHILNLIDIILSSILNTEN
YESLYNYLHHFKLKIHDIVKHLKSNEYRLITDKNFQKTTLLVNNQSKELLYSDLESLKGQ
LLISGTLEVNESFNHLDEWFNGEFDTKIIKNDNLFDSVNLFIPNDVHDLNDREAYIIDLV
DYISMYYSIRQEKMIVLFTNYKLLNDVYQFIIESELFDFPILKQNKNDSANKLLLQYNQL
QNCLLLATESFTEGINFENLNDRTIFLTKLPFPVPTGDGFRHFYKKDLPDAVFMFRQILG
RLKRNENDSGRIILFDNRLLNKPYKNAFLKYFEEENIIYDDRSAFNDMLTRL
NT seq 2499 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttagacaagcgatttgctgttgtagatttagaaacgactggtaataatccatataaa
gataaaataattgatttgagtattgtgtttgttgaaggtaataagatcgttggtgattac
aatcacttaatttctgacgctgacgatataccttcctttgtgacagagctcacttcaatt
actttagaagatattaaatcaggtgtaaagtttagcgatattaaagatgaagtgtatgaa
ttactcgctaactgctgctttgttgctcataatattgaatttgatttaaattttttaaaa
attgcttttaaagaagtaggaattaactttaagcctaatttggcaatagatacggtggaa
ttatcaaaaatattttttccaacattaaactcgtatcaacttggtgctttatcaaaatct
ttaaatttgacgttagataacgcacatcgtgcatatgacgatgctaaagcaacggcagag
cttcttattaaaattataaataaaattcaaagtttagaccgacaaacgatgatacgttta
tataatatttctaaatcattagacacaaatgtcagtgaattattatttgcatcgctaagt
gagaacaaccataaagatgcatcatttttagtaaaatctttaagcattaaagaagttaaa
gaagatcagcatatagaatctcatataacaatcgagtcattatacgagaactttttaaaa
ataaatcaatttaaacatcgtgatgatcaaatcaagttaatctatacaatttataacagt
ttaaaagaaaataaagcactcgctttagaagcatatactggtcttggtaaaactgaagct
atattaattgcgagcattgcgtttagtaatgagacaaatcaacaaattttaatttcaacg
agtaaaaagatattacaagaggaaatgtattatcgtagtttaaagcgtttattaaaagca
tcaaatttaaacaaattacctattgcgatgttaaaagggaagtcaaattatatcaattta
aatacgatgcttaaattgcttgaatttaaagatgacaattacgaaattataattcttaaa
atgaaattacttgtatggctgacatccacaaaaactggtgacttaggtgaagtctcatta
aaaggtcctgaaaaactctattatgacactgcacattatcaaatcagtgattatgatcaa
tacttttataatcgtgcggtagatcatgctaaatctagtcatatatgtattacgaatcat
tattttatgcaagagtgtctaactgaaatggatagtaattatttgattgtcgatgaagcc
catcaagtattaagggcagtaaatagtcaaaatgaaacagtctataaatatatggattta
aagtttttattatcacaaattggagcgaacaataaggatcgtattttaaaagattattta
gaccataatcattatgagaaaaaagattatttaattagtatgcttagtcagttaaataaa
acaattgatgaagcatttgctcaattaaatcatcaaaatataaccttggcaacaacacag
tttacacatattttaaatttaattgacatcattttaagttcaatattaaatactgaaaac
tatgagtccttatataattatctccatcattttaagctaaaaatacatgatattgtaaaa
catttaaaaagcaatgaatatcgattaattactgataaaaacttccaaaagacaacactt
ttagttaataatcagtctaaagaattgttgtacagcgatttagaatctttaaaaggtcaa
ttactcatttctggtacgttagaagtcaatgagtcatttaatcatttagacgaatggttt
aatggtgaatttgacacgaaaattattaaaaatgataatctttttgacagtgtcaattta
tttataccaaatgatgttcatgacttaaatgatagagaagcatatattatagaccttgta
gattatatctcaatgtactacagtattcgacaagaaaagatgattgtattatttacaaat
tataagttattaaacgacgtctatcagtttatcattgagagtgaattgtttgatttcccg
atattaaaacaaaataaaaatgattcagcaaataagttattacttcaatataatcagctt
caaaactgtttattacttgcgacagaaagttttactgaagggattaattttgaaaatcta
aatgatcgtacaatctttttaacaaaattaccattccccgtaccaactggtgatggattt
aggcatttctataaaaaagatttaccagatgcagtatttatgtttagacaaattttagga
cgtcttaaacgtaatgaaaatgacagtggtagaatcattctttttgataatcgattactc
aataagccatataaaaatgcctttttaaagtattttgaggaagaaaatatcatttatgac
gataggtctgctttcaatgatatgttaactagattataa

DBGET integrated database retrieval system