Nicotiana attenuata (coyote tobacco): 109210636
Help
Entry
109210636 CDS
T05870
Name
(RefSeq) phytochrome E isoform X1
KO
K12123
phytochrome E
Organism
nau
Nicotiana attenuata (coyote tobacco)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nau00001
]
09190 Not Included in Pathway or Brite
09193 Unclassified: signaling and cellular processes
99995 Signaling proteins
109210636
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PHY
PAS
PAS_2
GAF
PAS_4
HisKA
HATPase_c
PAS_9
PAS_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109210636
NCBI-ProteinID:
XP_019229634
UniProt:
A0A314KMG3
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1140 aa
AA seq
DB search
MEFQSSSKTRRRGRPTSPNLQNKKNSNKDSTFSSSAASNMNNTSKATMAQYNADAKLMDE
FEQSGVSGKSFNYSRSVLYAPQDNANEEEISSYLSRIQRGGLVQPFGCMLAIEEHTFKII
GYSENCFDMLGFKIAESSKLITLIGVDARTLFTPSSGASLAKAMTSREISLLNPIWVHSR
STHKPFYAILHRIDVGIVIDLEPANSSDPALLLAGAVQSQKLAIRSISRLQSLPGGDIGV
LCDMVVEDVQKLTGYDRVMVYKFHDDNHGEVLSEIRRSDLEPYLGLHYPATDIPQAARFL
FKQNRIRMICDCNAQPVKIVQSEELKQPLCLVNSTLRSPHSCHTQYMANMGSISSLVMSV
VINSSDSRKLWGLVVCHHSTPRYVPFPLRYACEFFMQAFGVQLHMELQLASQLAEKKTLQ
MQTLLCDMLLRDVPFGIVTQSPSIMDLVKCDGAALYYGGKCWLLGVTPTEAQVKDIAEWL
LVAHKDSTGLSTDSLADAGYPGATLLGDEVCGMATARITSEDFLFWFRSHTAKEVKWGGA
KHHPDDKDDGGKMHPRSSFNAFLEVVKSRSMPWDVPEINAIHSLQIIMRESIQEFDNSSR
KTMTSSQQNDADGPSMDELSSVAMEMVRLIETATAPIFGVDPSGLINGWNGKIADLTGLQ
ASEAIGKSLINDIAHEDSHETVEKALCKALLGEEDKNVKIKLRIFGKDPPKSVIYLVTNT
CTSRDHKNDVVGVCFVAQDVTPEKAVMDKFIQLQGDYEAIVQSLNPLIPPIFASDENACC
SEWNAAMERLTGWTRYEILGRTLPGEIFGGLCRLRGQDALTKFMILFYQAISGRDTKKLP
FGFFNRTGEFVEVFLTANKRTDEHGNVIGCFCFLQPTLVDPEASDERQDNKESLLKIKEF
SYIRQQMKNPFNGIQFTHKLLEATCVSDNQKQLLETSEACEKQILSVIDNMDFGSIEDGS
KVELNMEEFVLGNVVDAIVSQVMILLKEKNLQLLHDIPDQIKTLPLYGDQIKLQLILSDF
LLSVVHHAPSPDGWVEIKVLPGLKLIQDGNECIHLQFRMTHPGQGLPAALIEDMSGGRNR
GTTQEGIALNFSQKLVNMMNGHVRYVREENRCNFLIDLELKTGKSTHNGPDSDGTEKMEI
NT seq
3423 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagtttcagagcagcagtaaaaccagaagaagaggaagacccacaagccctaatctc
caaaacaagaagaattctaacaaagattccaccttttcttcctctgctgctagtaacatg
aacaacaccagcaaggcaactatggctcagtacaatgctgatgctaagctcatggatgag
tttgaacagtctggtgtctctggtaagtcctttaattattcaagatcagttctttatgca
cctcaggataatgctaatgaagaagaaatctcttcttatctttcaagaattcaaaggggt
gggcttgttcaaccatttggttgtatgcttgctattgaggaacatactttcaagattata
ggttacagtgagaattgctttgatatgttaggttttaagatagctgagtcatcaaagttg
attactttgattggtgttgatgctagaacccttttcaccccttcttctggggcttcattg
gctaaagccatgacctctagggaaatttctttgttgaaccctatatgggttcattctagg
agtacccataagcccttttatgctatacttcacaggattgatgtggggattgtgattgat
ttagagcctgctaattctagtgatcctgcattgctgcttgctggggctgtgcagtcacaa
aaactggctatccggtcgatatctaggttgcagtcactacctggtggagatataggggtt
ctgtgtgatatggtggtggaagatgtgcagaagctgactggatatgatagggtcatggtt
tataagttccatgatgataatcatggtgaagttttgtctgagattaggagatcagacttg
gaaccttatttgggcttgcattatcctgcaacagatatcccgcaagctgctcgcttcttg
ttcaagcagaacagaattaggatgatatgtgattgcaatgcacagcctgttaagattgtt
cagagtgaagaactgaagcagcctctctgcttggtaaattcgactctgagatcacctcat
agctgccatacacagtatatggccaacatgggatctatttcgtcgttggtgatgtcagta
gttatcaatagcagtgattcgaggaagctttggggtttggttgtttgtcatcacagtact
ccccgctatgtgcctttcccgcttcggtatgcatgtgaattcttcatgcaggcatttggg
gtgcagcttcatatggagctccagttggcatcacagttggctgagaagaaaactctccaa
atgcagaccttattatgtgacatgcttcttcgagatgttccatttggcattgtaacacaa
tcccctagtattatggatcttgtcaagtgcgatggagctgcactttattacggtggaaaa
tgttggttgcttggggtgacaccaactgaagcacaagttaaagatattgcagagtggtta
ctagttgctcataaggactcgacaggtttaagtacggacagtcttgcagatgctggttat
cctggtgcaactttactgggagatgaagtttgtggcatggctactgcgagaattacttct
gaggatttcctattctggttcaggtctcacacagcaaaagaagtcaagtggggaggtgct
aagcatcatccagacgataaagatgatggagggaaaatgcacccacgatcttcatttaat
gcctttcttgaagtggttaaaagtagaagtatgccttgggatgttccggagattaacgcc
attcattctctacaaatcataatgagagaatcaattcaagaatttgacaacagttcccgg
aaaactatgacctcttctcaacagaatgatgctgatggcccaagcatggatgaacttagt
tctgtggcaatggaaatggttaggttgattgagacggccactgctccaattttcggggtt
gatccatctggcttaataaatggatggaatgggaagattgctgacttaacagggttgcaa
gctagtgaagctattggaaaatctctcattaatgatattgctcatgaagattcacatgaa
actgttgaaaaggctctatgtaaagctctgttaggtgaggaggacaaaaatgtgaaaata
aagttgcgaatatttgggaaagatccaccaaaatcagttatataccttgtgactaatacc
tgcacaagcagggaccacaaaaatgatgttgttggtgtgtgctttgtggctcaagatgtc
actcctgagaaagctgtcatggataaatttattcagttgcaaggagattatgaggctatt
gtacaaagtcttaatccactgattccaccaatatttgcttctgatgaaaatgcttgctgt
tcggagtggaatgcagcaatggaaaggttgactggttggacaagatatgagatcctgggg
agaacacttcctggtgaaatttttggtggtctttgtcgtcttaggggacaagatgcgctt
accaaatttatgatccttttctaccaagcaattagtggccgtgacaccaaaaagcttcca
tttggcttttttaataggacaggggagtttgtggaagtgttcttaacagcaaacaagaga
actgatgagcatgggaatgtaattgggtgtttctgcttcttgcagcctacactggtcgac
ccagaggcatcggatgagagacaagacaataaagaatcccttttaaaaattaaagaattt
tcttatatcagacagcagatgaaaaatccattcaatgggatccagtttacccataaactc
cttgaagccacctgtgtttcagataatcagaagcagcttctggagacaagtgaagcctgt
gagaaacagatactgtctgttattgacaatatggattttggaagtatagaggacggcagc
aaagtggagctaaacatggaggaattcgttctaggaaatgttgtggatgctatcgtgagt
caagtaatgattttgctcaaggaaaagaacttacagctgctgcatgatatccctgaccag
atcaaaactcttcctctatatggtgatcaaattaagcttcagcttattctctcagatttc
ttgcttagtgtagttcatcatgcaccttcccccgatggttgggtggaaatcaaggtgtta
cctggtctgaaactcatacaagatggaaatgaatgtatccatctccaattcagaatgact
caccctggccaaggactacctgctgctctaatcgaagacatgtctggaggaagaaataga
gggacaacacaggaaggaattgcgttaaatttttcccagaagcttgtcaatatgatgaat
ggacatgtccgctatgttagagaagaaaatagatgtaatttcctaatagacctggaactc
aaaacagggaaatctacacataatggtccagattcggatggaactgaaaaaatggaaatt
tag
DBGET
integrated database retrieval system