Nicotiana attenuata (coyote tobacco): 109214491
Help
Entry
109214491 CDS
T05870
Name
(RefSeq) transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
KO
K13098
RNA-binding protein FUS
Organism
nau
Nicotiana attenuata (coyote tobacco)
Pathway
nau03015
mRNA surveillance pathway
nau03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
nau00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
109214491
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
109214491
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
nau03041
]
109214491
Spliceosome [BR:
nau03041
]
Complex A
Other components
Complex A specific factors
109214491
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
Zn_ribbon_RanBP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109214491
NCBI-ProteinID:
XP_019233962
UniProt:
A0A1J6IQ75
LinkDB
All DBs
Position
2:88728995..88737872
Genome browser
AA seq
524 aa
AA seq
DB search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NT seq
1575 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctggtaattacgggcacgacggcggcgtatctgacccgccgcctactgacggagga
tacggaggctctggcggtgatggatacggcggctcaggcactggtggatacggtggctcg
ggaggcactggtggatacggtggttcaggaggcactggtggatatgatagttccggcggc
ggaggatatggtggctccggtgtcggtggacacggtggttttgaaggcagtggatacggt
ggtcctggaggaggtggatatgcatcgggcaacagagggggatatggtggatcaggcaac
ggagggggatatggtggatcgggcagcagagggggatatggtggaacaggtggtggaaga
tatggtgcgggaggggctagttacggaggcagcactggaggatatggtaacagtgataga
ggcggtggaagaggaagtggaggatatggtggtggtggttcccgtaatcagggtggtggt
ggatatcaaggaggagatcgtggtggtagcggtggaagaggtggtggtcgcagtggagga
agtgggagggatggtgattggcgttgccctaatccaagttgtgggaacttgaactttgct
agaagagttgagtgtaataaatgtggtgcaccttcgcctgggggtaatgatgatcgtggt
agcagaggtggtagcggttatggtagaggtggaagtggtgggggatatggaaataatcga
gggggaaggggtgataattatgatagagggagtggaggaagcaataggaatgactcgtat
gctggtaatcagggaagagctgatggtggttatggtcagggtcctccagctgctcgtcca
tcttatggaggccctgatagcagctatccaccaccgtccaatacttacggtggcaactca
gacgatgcccctgatgcagttcctccgccagcaagttacagtggtgcgcctccatcatat
cccccttcacatgctagtgctgttggctatggtcggaatatacaatctgatgcacgtggt
gatggtcggggtggcccacaaggaggatatgatgggggatatggtggtggtcctcgaaaa
gaagtaggtagtcatggcagtgctgaggctccagcgaaggtcaagcagtgtgatgagcat
tgtggagattcttgtgacaactcaagaatatacatctcaaatttgccccctgatgtcacc
attgaagaactccaagagctttttggaagcattggacaagtggcaagaatcaagcaaaaa
cgaggttacaaagaccagtggccttggagcataaagatatatacagatgaaaaaggaaat
aacaaaggagatgcagtattgtcatatgaagatccttctgcagcgcactcagctggaggc
ttttttaataattatgacttcagaggttataagatcagtgttgcaatggctgagaagtct
gcaccaaaggatccttcagcatatggttctgggggccgtggtcgaggcggatatggtggt
gaccggtgcagagataactatggttctggtccagaccgaaattttcatggtggaaaccgt
tcacgtccttactga
DBGET
integrated database retrieval system
